- •Глава 1 история медицинской генетики
- •Глава 2
- •Типы наследственных болезней
- •Груз наследственных болезней в популяциях человека
- •Глава 3
- •Молекулярные основы
- •Генетический код
- •Информационная рнк и процесс транскрипции
- •Биосинтез полипептидной цепи
- •Тонкая структура гена
- •Общая характеристика генома человека
- •Глава 4 мутации в генах как причина моногенных заболеваний
- •Ггт гццлагцгтц тат цца цгг 7тцг цаг ата
- •Функциональные эффекты мутаций
- •Глава 5 моногенные наследственные болезни
- •Концепция фенотипа
- •Правила наследования менделя
- •Особенности проявления менделевских правил наследования в медицинской генетике
- •Аутосомно-доминантное наследование
- •Аутосомно-рецессивное наследование
- •Сегрегационный анализ
- •Механизмы аутосомной доминантности
- •Наследование, сцепленное
- •Генетические механизмы определения пола
- •Наследственные формы тугоухости
- •Тип наследования, ген, локализация
- •Клинические симптомы
- •Тип наследования, ген, локализация
- •Наследственные глазные болезни
- •Наследственные остеохондродасплазии
- •Наследственные заболевания нервной системы
- •Тип наследования, ген, его локализация
- •Т Белок, функции Клинические симптомы ип наследования, ген, его локализация
- •Тип наследования, ген, его локализация
- •Тип наследования, ген, его локализация Клинические симптомы
- •Клинические признаки (кроме атактической походки)
- •Аномаль
- •5.9.6. Наследственные кожные заболевания
- •Т Белок, функции Клинические симптомы ип наследования, ген, его локализация
- •Клинические симптомы
- •5.10. Молекулярная диагностика моногенных наследственных болезней
- •Глава 6 неменделевское наследование наследственных болезней
- •Глава 7 генетическая инженерия и проект «геном человека»
- •Рестрикционные ферменты
- •Рекомбинация фрагментов днк
- •Внедрение фрагментов днк в клетку хозяина с помощью векторов
- •Скрининг клеток-хозяев на рекомбинантный вектор и отбор интересующих исследователя клонов
- •Создание геномных библиотек
- •Клонирование последовательностей днк с помощью полимеразной цепной реакции (пцр)
- •Создание генетической карты генома
- •Создание физической карты генома
- •Некоторые особенности организации генома человека
- •Глава 8 хромосомы человека. Митоз и мейоз. Хромосомные мутации. Хромосомные болезни
- •50 Нм петли образуются нити диаметром 50 нм.
- •Клеточный цикл
- •Численные хромосомные мутации
- •Структурные хромосомные мутации
- •Пери центрическая инверсия
- •Номенклатура хромосомных мутаций
- •8.6. Хромосомные болезни
- •Глава 9 картирование и клонирование
- •Картирование с помощью гибридизации in situ
- •Гибридизация соматических клеток
- •Заболевание (иногда № в omim, если он отличен от номера в omim для гена, вызывающего заболевание)
- •X Тирозинемия, тип 1
- •9.6. Создание моделей наследственных болезней человека с помощью трансгенных животных
- •Глава 10 медицинская популяционная генетика
- •Равновесие харди-вейнберга
- •Глава и мультифакториальное наследование
- •Моногенный контроль метаболизма лекарственных препаратов
- •Генетический контроль
- •Ассоциации между генетическими полиморфизмами и метаболизмом лекарств
- •12.4. Патологические реакции на прием лекарственных препаратов у больных с некоторыми наследственными болезнями
- •Естественный иммунитет
- •Генетическая основа синтеза
- •Генетика рецепторов т-клеток
- •Тип наследования; символ гена, локализация
- •Тип наследования; символ гена, локализация
- •Механизмы превращения протоонкогенов в онкогены
- •Гены-супрессоры опухолевого роста
- •Медико-генетическое
- •15.4. Лечение наследственных болезней обмена веществ
- •Обмена веществ
- •Болезней обмена веществ
- •15*5. Генотерапия
- •Глава 16 этические, правовые
- •Часть 308 Последовательности днк 48 Потеря импринтинга 138 Правила наследования Менделя 61, 63
Ггт гццлагцгтц тат цца цгг 7тцг цаг ата
ГГУ ГЦЦ АА ГЦ ГУЦ УАУ
Гли Ала Лиз Арг Лей
Одним из механизмов возникновения мутаций является неравный кроссинговер1. По-видимому, именно таким образом возникает, например, большая часть делеций/дупликаций в области локализации гена РМР22 на хромосоме, кодирующего периферический белок миелина 22. Участок хромосомы 17, в котором расположен ген РМР22 протяженностью примерно в 1,5 млн п.н., фланкируется двумя высокогомологичными повторами, каждый длиной около 30 тыс. п.н.
■Кроссинговером называется обмен генетическим материалом между гомологичными хромосомами в мейозе I. Подробно о кроссинговере будет сказано в главе 7.
гомологичных
повторов
Рис.
4.1. Механизм
возникновения дупликации или делеции
гена РМР22.
а — нормальное спаривание гомологичных участков хромосомы 17ру в которых расположен ген РМР22. По краям учас*?ка расположены гомологичные повторы длиной около 30 тыс. п.н.; б — негомологичное спаривание участков хромосомы /7/7 за счет гомологичных повторов и неравный кроссинго- вер в спаренных гомологичных участках; в — в результате неравного крое- синговера происходят удвоение гена РМР22 в одном из гомологов и его де- леция во втором гомологе (на рис. 4.1 делеция не показана).
В результате неправильного спаривания гомологичных хромосом по этим фланкирующим повторам и последующего неравного кроссинговера происходит либо удвоение, либо исчезновение участка хромосомы, содержащего ген РМР22, что является причиной развития болезни Шарко—Мари— Туса1 или наследственной нейропатии со склонностью к параличам от сдавления2 соответственно (рис. 4.1).
Неравный кроссинговер, или генная конверсия, может быть причиной мутаций в тех генах, для которых известны высокогомологичные копии в геноме, называющиеся псевдогенами. Генная конверсия — это прямой перенос фрагмента одного аллеля в другой аллель или фрагмента псевдогена в ген. Так как в псевдогене имеется множество мутаций, то такой перенос нарушает структуру нормального гена и может
Рис. 4.2. Механизм генной конверсии.
Ген А и псевдоген В обладают высокой гомологией, однако в псевдогене В накоплено значительное количество мутаций, а — спаривание гомологичных хромосом в мейозе; б — нарушение спаривания гомологичных хромосом: из-за высокой гомологии ген А «незаконно» выстраивается против псевдогена В\ в — в результате генной конверсии происходит внедрение части псевдогена В в ген А.
рассматриваться как мутация. Для осуществления генной конверсии между псевдогеном и геном необходимы их спаривание и последующий атипичный кроссинговер, при котором происходят разрывы в нитях ДНК (рис. 4.2). Наиболее известным примером такого рода мутаций служат мутации в гене 21-гидроксилазы (CYP21B). Эти мутации обусловливают возникновение адреногенитального синдрома, или врожденной гиперплазии коры надпочечников1. Для гена 21-гидроксилазы известен псевдоген. Оба гена располагаются рядом друг с другом. Большинство мутаций при адреногенитальном синдроме — это последовательности псевдогена в гене
гидроксилазы (см. рис. 4.2).
Как выяснилось, достаточно распространенным является еще один класс молекулярных мутаций — мутации сайта сплайсинга, которые нарушают вырезание интронов из пер- винного транскрипта мРНК во время ее созревания. Эти му- тации наблюдаются на границах интронов и экзонов. Они возникают либо в ГТ-последовательности, характерной для донорского 5’-сайта, либо в АГ-последовательности, характерной для акцепторного З’-сайта сплайсинга, либо в консенсусных последовательностях, которые прилежат к донорскому или акцепторному сайтам. Данные мутации, изменяя сайт сплайсинга, нарушают вырезание интронов из первичного транскрипта мРНК, так что вырезается либо часть следующего экзона вплоть до той последовательности в экзоне, которая похожа на обычный сайт сплайсинга (криптический сайт сплайсинга), либо весь следующий экзон. В то же время в зрелую мРНК может включаться часть или даже весь интрон. В табл. 4.1 в качестве примера приведены некоторые мутации в гене трансмембранного регулятора проводимости кистозного фиброза (CFTR). К настоящему времени в этом гене, мутации которого вызывают ,муковисцидоз, известно более 1000 разнообразных мутационных изменений, встречающихся как в 26 экзонах гена, так и сайтах сплайсинга и ин- тронах (http://www.genet.sickkids.on.ca/cftr/).
Таблица 4.1. Некоторые мутации в гене регулятора трансмембранной проводимости муковисцидоза
Название |
Нуклеотидные изменения |
Экзон |
Последствия |
-741Т->Г |
Т на Г в -741 |
Фланкирующая 5’-область |
Мутация в промоторе? |
-47Ые1АГГ |
Делеция АГГ с -471 |
То же |
То же |
S4X |
Ц на А в 143 |
1 |
Сер на стоп в 4-м кодоне |
S10R |
Ц на А в 160 |
1 |
Сер на Apr в 10-м кодоне |
S13F |
Ц наТ в 170 |
1 |
Сер на Фен в 13-м кодоне |
К14Х |
А на Т в 172 |
1 |
Лиз на стоп в 14-м кодоне |
174delA * |
Делеция А между 172 и 174 |
1 |
Сдвиг рамки считывания |
185Н-1Г —>Т |
Г на Т в 185+1 |
1 интрон |
Дефект сплайсинга мРНК |
W19C |
Г на Т в 189 |
2 |
Три на Сер в 19-м кодоне |
21 IdelG |
Делеция Г в 211 |
2 |
Сдвиг рамки считывания |
G27X |
Г на Т в 211 |
2 |
Гли на стоп в 27-м кодоне |
G27E |
Г на А в 212 |
2 |
Гли на Глу в 27-м кодоне |
Q30X |
Ц на Т в 220 |
2 |
Глн на стоп в 30-м кодоне |
R31C |
Ц на Т в 223 |
2 |
Apr на Цис в 31-м кодоне |
Название |
Нуклеотидные изменения |
Экзон |
Последствия |
232dell8 |
Делеция 18 п.н., начиная с 232 |
2 |
Делеция 6 аминокислот, начиная с Лей-34 до Глн-39 |
237insA |
Инсерция 2А после 237 |
2 |
Сдвиг рамки считывания |
241 del AT |
Делеция 2АТ, начиная с 241 |
2 |
То же |
Q39X |
Ц на Т в 247 |
2 |
Глн на стоп в 39-м кодоне |
S42F |
Ц на Т в 257 |
2 |
Сер на Фен в 42-м кодоне |
D44G |
А на Г в 263 |
2 |
Асп на Гли в 44-м кодоне |
Недавно открыт новый и совершенно неожиданный тип мутаций, который проявляется увеличением числа повторов (чаще всего тринуклеотидных), но описаны также случаи увеличения числа повторов, состоящих из 5 и даже 12 нуклеотидов, расположенных как в экзонах генов, так и интро- нах или даже нетранслируемых областях генов. Эти мутации называются динамическими, или нестабильными. Большинство заболеваний, обусловленных мутациями, связанными с расширением зоны повторов — наследственные неврологические заболевания. Это хорея Гентингтона, спинальная и бульбарная мышечная атрофия, типа 4 (1, 2, 3 и 6) спиноце- ребеллярные атаксии, миотоническая дистрофия, атаксия Фридрейха, синдром ломкой хромосомы X и еще некоторые заболевания. Механизм расширения зоны повторов до конца не выяснен. В популяции у здоровых индивидуумов обычно наблюдают некоторую изменчивость по числу нуклеотидных повторов, обнаруженных в различных генах. Число нуклеотидных повторов наследуется как в поколениях, так и во время деления соматических клеток. Однако после того, как число повторов, разное для разных генов, превысит определенный критический порог, который также различен для разных генов, они обычно становятся нестабильными и могут увеличиваться в размерах либо во время мей- оза, либо в первых делениях дробления оплодотворенной яйцеклетки. По крайней мере для некоторых нуклеотидных повторов после того, как их число превысит критический порог, характерно постоянное расширение зоны повторов в последующих поколениях, что коррелирует с увеличением тяжести заболевания (так называемый феномен антиципации).