- •Генная инженерия теория
- •1. Основные открытия современной биологии, послужившие фундаментом для возникновения генетической инженерии
- •2. Предмет и задачи генной инженерии и ее связь с другими биологическими дисциплинами
- •3. Рестрикцирующие эндонуклеазы I, II и III класса
- •4. Особенности ферментов рестрикции II класса
- •5. Другие ферменты нуклеазного действия (s1-нуклеаза, Bal31-нуклеаза, нуклеаза из микрококка, днк-аза)
- •10. Векторы на основе репликонов бактериальных плазмид (pBr322, puc18)
- •11. Векторы на основе бактериофагов (м13, λ)
- •12. Векторы на основе вирусов животных
- •13. Векторы на основе Тi-плазмид
- •14. Основные подходы к получению библиотек днк прокариотических и эукариотических организмов
- •15. Скрининг рекомбинантных днк библиотек
- •16. Получение библиотеки днк с помощью вирусных или плазмидных векторов
- •17. Получение библиотеки днк из отобранных популяций молекул мРнк
- •18. Выявление нужных клонов в генной библиотеке путем гибридизации с радиоактивным днк-зондом
- •19. Выделение перекрывающихся клонов днк («прогулка по хромомсоме») с целью идентификации соседних генов
- •20. Выделение и очистка рекомбинантных клонов
- •21. Секвенирование днк
- •22. Полимеразная цепная реакция (пцр)
- •23. Виды пцр
- •24. Мутагенез клонированной днк
- •25. Методы секвенирования днк
- •26. Использование нерадиоактивных меток при секвенировании. Конструирование делеций для секвенирования.
- •27. Приготовление матриц для секвенирования днк
- •28. Использование для анализа баз данных днк и белковых последовательностей (GenBank, embl, fasta, pir и т.П.)
- •29. Амплификация днк с помощью пцр
- •30. Амплификация рнк с помощью пцр
- •31. Сайт-специфический мутагенез
- •32. Направленный мутагенез с помощью олигонуклеотидов
- •33. Мутагенез с использованием пцр
- •34. Экспрессия белков в e.Coli
- •35. Экспрессия белков с использованием векторов с регулируемыми элементами фага лямбда
- •36. Экспрессия белков с использованием специальных экспрессирующих векторов
- •37. Повышение эффективности систем экспрессии эукариотических белков в клетках e.Coli
- •38. Генно-инженерные системы для получения бав
- •39. Анализ белков
- •40. Генно-инженерная система бактерий рода Bacillus
- •41. Генно-инженерные системы грам-положительных микроорганизмов родов Streptomyces
- •42. Генно-инженерные системы коринеформных бактерий
- •43. Генно-инженерная система дрожжей Saccharomyces
- •44. Системы экспрессии на основе бакуловирусов
- •45. Продукция больших количеств белков в клетках насекомых
- •46. Системы для экспрессии белков в животных клетках
- •47. Векторы экспрессии на основе вирусов животных
- •48. Электрофоретический анализ белков
- •49. Электрофоретический анализ нуклеиновых кислот
- •50. Иммуноблоттинг и иммунодетекция
- •51. Введение днк в клетки животных, растений, бактерий, дрожжей
- •52. Конструирование линий клеток, суперпродуцирующих бав
- •53. Получение трансгенных растений и животных с полезными свойствами
- •54. Генная тераия болезней человека и животных, являющихся следствиями дефектов генетического аппарата и его функций
40. Генно-инженерная система бактерий рода Bacillus
Ответ. Плазмида рВС16 из В. cereus способна реплицироваться и детерминировать устойчивость к тетрациклину в клетках В. subtilis. После гидролиза рВС 16 рестриктазой EcoRl и обработки ДНК-лигазой получена плазмида рВС16-1, реплицирующаяся в клетках В. Subtilis и сохранившая ген tet. Далее рВС16-1 была рекомбинирована in vitro no -EcoRI-участку с критической плазмидой В. subtilis pBS I. Однако, в В. subtilis гибридная плазмида, состоящая из двух репликонов, оказалась нестабильной и диссоциировала на pBS161 и pBS162. Плазмиду pBS161 гидролизовали рестриктазой Hindlll и фрагменты циклизовали с помощью ДНК-лигазы. После трансформации клеток B. Subtilis в устойчивых к тетрациклину клонах выявили новую плазмиду pBS 161-1, которая представляла собой циклизованный Hindlll-A-фрагмент pBS161. Полученная плазмида имеет единичные участки гидролиза рестриктазами EcoRl, Hindlll, Pstl, встройки по которым не повреждают репликатор и ген tet. Это позволяет применять ее в качестве клонирующего вектора. Недостаток pBS161-l – сложность отбора создаваемых на ее основе гибридных плазмид. Одно из самых важных направлений генно-инженерных исследований на В. Subtilis и других бациллах – создание штаммов, секретирующих чужеродные белки из клеток. Бактерии рода Bacillus могут выделять во внешнюю среду различные белки. Хорошо изучена секреция а-амилазы, пенициллиназы и протеаз. Секретируемые белки имеют на N-конце сигнальный пептид, который отщепляется в процессе секреции, давая начало зрелой форме внеклеточного белка. У изученных секретируемых белков Bacillus сигнальные пептиды необычно длинны (29–34 АК) в отличие от встречающихся в грамотрицательных бактериях и клетках животных (15–25 АК). Клонируя гены секретируемых белков и удаляя затем кодирующую последовательность зрелой формы, можно создать молекулярные векторы экспрессии-секреции для грамположительных бактерий рода Bacillus. В первую очередь данный подход был реализован применительно к гену атуЕ. Этот ген кодирует а-амилазу – один из наиболее изученных и имеющих практическое значение секретируемых ферментов многих штаммов бацилл. Бактериальная а-амилаза используется в промышленном расщеплении крахмала до низкомолекулярных легко усваиваемых дрожжами продуктов (амальтозы, а-глюкозы и коротких а-декстринов), которые необходимы для таких микробиологических процессов, как, например, производство этанола. Выявлено не менее шести генов, участвующих в регуляции продукции этого фермента. Кропотливая многоступенчатая селекция позволила создать множество мутантных штаммов Bacillus, наиболее продуктивные из которых превосходят штаммы дикого типа по уровню синтеза а-амилазы в 103 раз. С развитием методов генно-инженерной реконструкции на системе В. Subtilis возникла идея получения нового поколения продуцентов а-амилаз. При этом для промышленности большой интерес представляли термостабильные формы данного фермента, гены которых можно было извлекать из ДНК термофилов и вводить в определенное генетическое окружение такого хорошо изученного мезофила, как В. Subtilis.