- •Векторные системы теория
- •1. Принципы и понятия технологии рекомбинантных молекул. Основные открытия молекулярной биологии, обосновавшие возможность конструирования рекомбинантных молекул.
- •2. Матричные процессы. Репликон и типы репликации днк. Стабильность наследования генетических структур.
- •3. Механизмы реализации генетической информации.
- •4. Молекулярное клонирование как способ исследования структурной организации генетических элементов и систем экспрессии чужеродной генетической информации.
- •5. Понятие вектора. Характеристика основных генетических элементов про- и эукариотических клеток, претендующих на роль векторов.
- •6. Общие свойства клонирующих векторов. Принципы клонирования днк in vivo и in vitro.
- •7. Рестрикционные нуклеазы и их характеристика.
- •8. Способы объединения фрагментов днк. Днк-лигазы. Днк-полимераза
- •12. Концевая трансфераза и ее применение при создании рекомбинантных молекул.
- •13. Векторные молекулы днк. Развитие представлений о векторных молекулах.
- •14. Введение молекул днк в клетки.
- •15. Требования к клеткам-хозяевам рекомбинантных молекул.
- •16. Структурно-генетическая организация полового фактора.
- •17. Плазмиды бактерий и их общие свойства.
- •18. Сегрегационная и структурная нестабильность плазмид.
- •19. Классификация плазмид.
- •20. Плазмиды бактериоциногенности и векторы на их основе.
- •21. Плазмиды лекарственной устойчивости бактерий.
- •22. Конструирование и структура «искусственных» векторов (плазмиды pRsf2124 и рМв9).
- •23. Принцип модульной организации плазмид.
- •24. Мигрирующие элементы и конструирование векторов для клонирования хромосомных генов бактерий in vivo.
- •25. Трансдуцирующие бактериофаги.
- •26. Организация генома бактериофага лямбда.
- •27. Общая и генерализованная трансдукция.
- •28. Характеристики pBr322, ее преимущества и недостатки.
- •29. Векторы на основе репликонов бактериальной плазмиды puc18, puc19.
- •30. Свойства бактериофага лямбда как универсальной системы для клонирования in vivo и in vitro.
- •31. Молекулярные векторы на основе генома бактериофага лямбда.
- •32. Космиды.
- •33. Фазмиды.
- •34. Искусственные хромосомы (рас, вас, yac)
- •35. Конструирование библиотек и клонотек.
- •36. Нитевидные фаги в качестве клонирующих векторов.
- •37. Конструкция и использование векторов на основе нитевидных фагов.
- •38. Векторы, предназначенные для изучения регуляции экспрессии генов.
- •39. Векторы для Bacillus.
- •40. Проблемы плазмидных векторов.
- •41. Челночные векторы.
- •42. Генетическая организация дрожжей.
- •43. Внехромосомные элементы сахаромицетов.
- •44. Введение днк в дрожжевые клетки.
- •45. Векторы для дрожжевых клеток. Требования к вектору.
- •46. Селективные маркеры дрожжей. Принципы клонирования.
- •47. Введение молекул днк в клетки млекопитающих.
- •48. Организация генома вируса sv40. Векторы на основе вируса sv40.
- •49. Основные проблемы при конструировании векторов млекопитающих.
- •50. Векторы для клонирования в растениях.
- •51. Молекулярная биология Ti-плазмиды Agrobacterium tumefaciens.
- •52. Структура т-днк. Использование Ti-плазмиды в качестве векторов для создания трансгенных растений.
- •53. Бинарные системы.
- •54. Вирусы как векторы для растений.
51. Молекулярная биология Ti-плазмиды Agrobacterium tumefaciens.
Ответ. Одной из основных проблем при получении трансгенных растений был способ введения чужеродных генов в хромосомы растений, т. е. трансформация растительных клеток. Значительный прорыв был сделан при открытии возможности использования природной системы трансформации растений Ti-плазмидами почвенных агробактерий. Ранее было известно, что некоторые виды почвенных бактерий (Agrobacleria) могут заражать двудольные растения и вызывать при этом образование специфических опухолей – корончатых галлов. Опухоли состоят из дедифференцированных клеток, интенсивно делящихся и растущих в месте заражения. При культивировании in vitro клетки опухоли могут расти в отсутствие гормонов, необходимых для роста нормальных растительных клеток. Помимо повышенного синтеза фитогормонов, опухолевые клетки корончатых галлов начинают синтезировать необычные для растения соединения – опины (производные аминокислоты аргинина), которые используются агробактериями в качестве источника азота и углерода. Агробактерии сами синтезировать опины не могут, так как промежуточные продукты синтеза ингибируют рост бактериальной клетки и используют растительные клетки как «фабрики» по производству опинов. При заражении растения агробактерией происходит перестройка метаболизма трансформированных растительных клеток, и они начинают синтезировать соединения, необходимые только для бактерий. Опины не могут утилизироваться растительной клеткой и выделяются в межклетники, где и поглощаются агробактерией. Также ряд бактерий могут содержать агропиновые Ti-плазмиды, кодирующие агропин, также относящийся к опинам. Молекулярно-генетические исследования показали, что все Ti-плазмиды имеют сходное строение и содержат последовательности, которые можно поделить на две группы: необходимые для метаболизма самой агробактерии (гены катаболизма опинов, точка начала репликации плазмиды и т. д.); необходимые для трансформации растительной клетки. Гены первой группы имеют прокариотический тип промотора, т. е. могут функционировать только в бактериальной клетке, а второй группы – могут экспрессироваться в эукариотической растительной клетке. Ко второй группе относятся гены, ответственные за индукцию опухоли и синтез опиновых аминокислот. Трансформация растения в результате агробактериального заражения происходит в несколько этапов. Сама агробактерия не входит в растительную клетку, она располагается в межклетниках. Не входит в клетку растений и Ti-плазмида, но часть Ti-плазмиды переносится в ядро растительной клетки и может встраиваться в растительный геном. Этот фрагмент Ti-плазмиды был назван Т-ДНК (трансформирующая ДНК). На концах Т-ДНК находятся прямые высоко консервативные повторы (25 н.п.), составляющие, так называемые, левый и правый пограничные районы, которые необходимы для вырезания ее из состава плазмиды и интеграции в геном растений. Непосредственно границы области Т-ДНК, а также последовательности, примыкающие к этим районам, оказывают влияние на результативность трансформации. При этом, именно последовательность правой границы необходима для интеграции Т-ДНК в геном растения. Деления левой границы не оказывала существенного эффекта на перенос Т-ДНК. Также рядом с правой границей внутри области Т-ДНК располагается специфическая область, влияющая на вирулентность Ti-плазмиды. Деления этой области приводит к тому, что такие Ti-плазмиды не способны индуцировать опухолеобразование.