- •Розділ 1. Організація вірусологічних лабораторій.
- •Обладнання вірусологічних лабораторій
- •Правила роботи в учбових вірусологічних лабораторіях
- •Практична частина
- •Контрольні питання та контрольні завдання
- •Література
- •Тема 1: Використання лабораторних тварин у вірусологічних дослідженнях
- •Природні інфекційні хвороби деяких лабораторних тварин, збудники яких є патогенними для людини
- •Індикаторні тварини
- •Гнотобіотичні тварини
- •Показники мікроклімату в приміщеннях для лабораторних тварин
- •Густота посадки в клітках лабораторних тварин та птахів
- •Причини канібалізму та заходи його профілактики
- •Основні показники нормальної життєдіяльності різних видів тварин
- •Зв’язок тропізму вірусу зі способом ураження чутливого організму та видом патологічного матеріалу
- •Допустимі дози досліджуваного матеріалу, що вводиться лабораторним тваринам, мл
- •Методи зараження через травний тракт
- •Перкутанне (нашкірне) зараження
- •Кутанне (шкірне) зараження
- •Субкутанне (підшкірне) зараження
- •Інтракутанне (внутрішньошкірне) зараження
- •Інтравенозне (внутрішньовенне) та інтракардіальне (внутрішньосерцеве) зараження
- •Інтрамускулярне (внутрішньом’язеве) зараження
- •Інтраперітонеальне (внутрішньочеревинне) зараження
- •Субокципітальне (каркове) зараження
- •Інтрацеребральне (внутрішньомозкове) зараження
- •Зараження в периферичний нерв
- •Інтратестикулярне (внутрішньосім’яникове) зараження
- •Інтраокулярне зараження
- •Корнеальне зараження
- •Інтракорнеальне зараження
- •Кон’юнктивальне зараження
- •Забір крові
- •Антикоагулянти
- •Лабораторне заняття
- •Тема 2. Курячі ембріони та їх використання у вірусології
- •Теоретична частина
- •Практична частина
- •Будова курячого ембріону
- •Практична частина Лабораторне заняття
- •Тема 3. Клітинні культури у вірусології
- •Теоретична частина
- •Класифікація тваринних культур клітин
- •Одношарові культури клітин
- •Чутливість первинних культур клітин до вірусів людини
- •Характеристика деяких із відомих клітинних ліній
- •Переваги та недоліки використання постійних культур клітин
- •Чутливість постійних клітинних культур до вірусів
- •Суспензійні культури клітин
- •Зберігання культур клітин
- •Умови культивування клітин in vitro
- •Поживні середовища
- •Середовище 199 (Морган, Мортон, Паркер; 1950 р.)
- •Контамінація культур клітин
- •Взаємодія вірусів із клітинами
- •Методи виявлення та ідентифікації вірусів у клітинних культурах
- •Цитопатична дія
- •Внутрішньоклітинні включення
- •Титрування вірусів у одношарових культурах клітин
- •Практична частина Лабораторне заняття
- •Хід роботи
- •Контрольні завдання
- •Контрольні запитання
- •Література
- •Розділ 3. Віруси бактерій
- •Теоретична частина Загальна характеристика вірусів бактерій
- •Практична частина Методи титрування бактеріофагів
- •Титрування фагу за методом Аппельмана (рідке середовище)
- •Хід роботи:
- •Практична робота: Виділення фагів із лізогенних культур
- •Розділ 4. Дослідження вірусів рослин
- •Теоретична частина
- •Практична частина
- •Тема. Способи передачі вірусів рослин. Рослини-індикатори.
- •Практична частина Лабораторне заняття
- •Тема. 2. Виділення, очистка та концентрування вірусів рослин
- •Практична частина
- •Теоретична частина
- •Розділ 5. Використання електронної мікроскопії у вірусологічних дослідженнях.
- •Практична частина Хід роботи
- •Розділ. 6. Методи діагностики вірусних інфекцій та ідентифікації вірусів
- •Тема 1. Серологічні методи досліджень
- •Теоретична частина Реакція гемаглютинації
- •Імунологічні методи дослідження
- •Імунодифузійні тести.
- •Радіоімунологічний аналіз (ріа)
- •Імунофлуоресцентний аналіз (іф)
- •Імуноферментний аналіз
- •Практична частина Практична робота №1
- •Хід роботи
- •Практична робота №2
- •Хід роботи
- •Список літератури
- •Тема 2. Застосування полімеразної ланцюгової реакції у вірусологчних дослідженнях
- •Обладнання для плр
- •Компоненти реакції.
- •Параметри температурних циклів
- •Аналіз плр-ампліфікованої днк
- •Real-time pcr (прл у реальному часі) та її застосування у вірусологічних дослідженнях.
- •Словник використаних термінів
- •Верхній агар
- •Нижній агар
- •Цитратний буфер, 0,1м, рН 3,0 –6,2
- •Ацетатний буфер,0,1м , рН 3.6-5,6 Розчин а
- •0,1М оцтова кислота
- •С) Солі та інші речовини, г/л
Розділ 4. Дослідження вірусів рослин
Тема. 1 Способи передачі вірусів рослин. Рослини-індикатори.
Зміст
Теоретична частина
Способи передачі вірусів рослин.
Рослини-індикатори
Практична частина
Лабораторне заняття
Мета заняття
Матеріальне забезпечення
Хід роботи
Контрольні завдання
Контрольні запитання
Тема. Способи передачі вірусів рослин. Рослини-індикатори.
Зовнішня поверхня рослин має захисні шари кутикули та пектину, крім того кожна клітина рослини оточена клітинною оболонкою. На сьогодні не відомо, щоб віруси рослин використовували специфічні клітинні рецептори, як це роблять віруси тварин та бактерій. Віруси рослин використовують порушення механічної цілісності клітинної оболонки, це досягається шляхом передачі вірусу механічно, або за допомогою вектору. Передача вірусів рослин здійснюється за допомогою насіння, вегетативно, переносниками (грибами, нематодами, членистоногими).
Фітовіруси викликають у рослин різні патологічні зміни, тому що вірусна інфекція може зачіпати практично всі сторони життя рослини. Найбільш часто спостерігається зміна забарвлення (пожовтіння, хлороз), відмирання тканин (некроз) або деформація вегетативних органів рослин.
Розрізняють чотири основні типи реакцій рослин на ураження їх вірусом:
-
імунність- коли рослини не уражуються вірусом (синонім – стійкість)
-
надчутливість – коли рослини уражуються з утворенням місцевих некрозів, які з”являються внослідок відмирання клітин біля точки зараження
-
толерантність – коли вірус транспортується по тканинам рослини, але симптоми захворювання слабо виражені або не виражені зовсім (замасковані)
-
системне ураження – коли вірус транспортується по всіх тканинах рослини і репродукується в них з чітким проявом симптомів захворювання
Вірусне ураження рослини може проявлятися як системно, так і носити локальний характер (рис.17-20 (кольорова вклейка)).
Локальні ураження проявляються на листку поряд з місцем ураження, це – хлоротичні місцеві ураження, ураження некротичного типу та кільцева плямистість. Симптоми системного ураження поширюються по рослині; серед них затримка росту (карликовість), наприклад викликана вірусом жовтої карликовості ячменю. Крім карликовості рослини, що інфіковані вірусом, можуть мати і інші типи аномального росту, такі як енації, деформації листової пластинки, пухлинні нарости у вигляді бородавок. У порівнянні з листковими пластинками корені і стебла рідше підлягають змінам під впливом вірусної інфекції, проте при зараженні вірусом коротковузля винограду часто спостерігаються фасціації стебел, а вірус деформації пагонів какао викликає здуття на стеблах і коренях цих рослин.
Одним з найбільш розповсюджених симптомів на листках є поява світло- і темно-зелених ділянок, що утворюють мозаїчний візерунок. Границі між темними і світлими ділянками можуть бути або чіткими, або розпливчатими. У залежності від розміщення мозаїчних плям розрізняють прижилкову, міжжилкову, жовту мозаїки.
При деяких вірусних захворюваннях (жовтуха цукрового буряку, ксантоз суниці) характерним є хлоротичне забарвлення листкової пластинки, що зумовлено змінами у хлоропластах. У темно-зелених ділянках листка хлоропласти розміщуються рівномірно, в більш світлих ділянках агрегують, а в самих світлих зливаються і руйнуються. Для деяких груп вірусів показано, що в темно-зелених ділянках міститься значно менше вірусу, ніж у світло-зелених.
Віруси відрізняються по здатності інфікувати різні рослини: кількість сприятливих рослин варіює у різних вірусів. Коло господарів вірусу і симптоми, які вони викликають, є характерними ознаками для даного вірусу і використовуються поруч із іншими для ідентифікації вірусу. Вірусна інфекція проявляється на зовнішньому вигляді рослини, хоча це є відображенням внутрішньоклітинних змін, викликаних вірусом. Симптоми ураження можуть бути різними і залежать від рослини-господаря, тривалості інфекції, штаму вірусу та умов зовнішнього середовища. Наприклад, симптоми захворювання найбільш чітко виражені у рослин, які вирощені при яскравому світлі при помірній температурі. Для ідентифікації вірусів за візуальним симптомами використовують так звані рослини-індикатори.
Рослини-індикатори – це рослини, які дають чітку специфічну реакцію на даний вірус, що легко відрізняється від реакції цієї рослини на інший вірус.
Як індикатори в фітовірусології найчастіше використовують рослини таких родин (таб. 4.1.).
Пасльонові (Solanacea) – Nicotiana tabacum, N. clevelandii, N.glutinosa, N. debneyi, Petunia hybrida, Lycopersicon esculentum, Datura stramonium, Physalis floredana.
Лободові (Chenopodiaceae) – Chenopodium amaranticolor, Ch. quinoa.
Бобові (Fabaceae) - Phaseolus vulgaris, Vicia faba, Vigna sinensis, Melilotus officinalis.
Злакові (Poaceae) - Zea mays.
Гарбузові (Cucurbiaceae) – Cucurbita maxima, Cucumis sativus.
Щирицеві (Amaranthaceae) – Gomphrena qlobosa.
За допомогою рослин-індикаторів можна вирішити такі завдання:
-
визначити інфекційну природу збудника;
-
визначити коло рослин-господарів;
-
відокремити вірус із суміші при змішаних вірусних інфекціях;
-
визначити концентрацію вірусів у рослинах;
-
накопичити вірус з метою подальших фізико-хімічних досліджень;
-
встановити видову приналежність патогену.
Таблиця 4.1.
Реакція рослин-індикаторів на віруси
Вірус |
Рослини-індикатори |
Реакція рослин |
Вірус тютюнової мозаїки (ВТМ) |
Тютюн клейкий – Nicotiana glutinosa L. Тютюн – Nicotiana tabacum L. Дурман – Datura stramonium |
Локальна реакція, некрози
Локальна реакція, некрози Локальна реакція, некрози |
Х-вірус картоплі (ХВК) |
Гомфрена головчаста –Gomphrena globosa L.
Дурман – Datura stramonium L. |
Локальна реакція, некрози В залежності від штаму вірусу – системна реакція, мозаїка Локальна реакція, некрози Комплексна локальна та системна реакції |
У-вірус картоплі (УВК) |
Тютюн – Nicotiana tabacum L.
Дурман – Datura metel |
Локальна реакція, просвітлення жилок Локальна реакція, смугастість жилок, закручення листків, епінастії |
S-вірус картоплі (SВК) |
Тютюн Дебней – Nicotiana debneyi L. Лобода біла – Chenopodium album |
Локальна реакція, некрози
Локальна реакція, некрози |
М-вірус картоплі (МВК) |
Дурман – Datura metel Тютюн Дебней – Nicotiana debneyi L. |
Локальна реакція, хлоротичні плями на листках. Локальна реакція, коричневі, кільцеподібні некрози |
F-вірус картоплі (FВК) |
Лобода різнокольорова – Chenopodium amaranticolor Перець однорічний – Capsicum annuum L. |
Локальна реакця, світлі некротичні плями або кільця Локальна реакція, некрози у вигляді кілець, або системна – просвітлення жилок, деформації листкової пластинки |
Вірус плямистого зів’янення томатів (ВПЗТ) |
Петунія – Petunia hybrida Hort Тютюн клейкий – Nicotiana glutinosa L. |
Локальна реакція, некрози Локальна реакція, некрози. Системна реакція |
Вірус жовтухи буряків (ВЖБ) |
Лобода – Chenopodium capitatum L.
Chenopodium foliosum (Moench Aschers) |
Системна реакція , затримка росту, хлоротичність, просвітління жилок Cистемна реакція, некроз листків, затримка росту, хвилястість листків |
Вірус мозаїки яблуні (ВМЯ) |
Огірки – Cucumis sativus L. Квасоля – Phaseolus vulgaris L. |
Локальна реакція, некрози Системна реакція, мозаїка Локальна реакція, некрози
|
Оскільки віруси є облігатними паразитами, а термін життя окремої рослини обмежений, то необхідною умовою виживання вірусу є його перехід від однієї рослини до іншої. Враховуючи відсутність у вірусів активного транспорту та масивну кутикулу листку, віруси не можуть проникати через непошкоджену кутикулу. Для вирішення цієї проблеми необхідно або уникнути проникнення через непошкоджену кутикулу (наприклад передача вірусів за допомогою пилку, насіння, вегетативним розмноженням), або використавувати деякі способи передачі, пов”язані з пошкодженням кутикули, що спостерігається при механічній інокуляції рослин та передачі вірусів за допомогою переносників.
Передача за допомогою насіння може відбуватися кількома способами, а саме вірус може знаходитись в середині насіння (наприклад, вірус кільцевої плямистості тютюну, вірус штрихуватої мозаїки ячменю, вірус мозаїки квасолі, вірус кільцевої плямистості сливи та інші) або вірус може знаходиться на поверхні насінневої шкірки (наприклад ВОМ, ВТМ). Передача вірусів в процесі вегетативного розмноження рослин може здійснюватись за допомогою бульб (наприклад, Х-вірус картоплі), цибулин, черенків та ін.
В іншому випадку віруси можуть потрапляти в рослину за допомогою переносників, таких як членистоногі, нематоди та гриби. У свою чергу членистоногі переносники підрозділяються на рівнокрилих (цикадки, білокрилки, попелиці), напівжорсткокрилих (клопи), жорсткокрилих (жуки), трипсів та кліщів. Тип трансмісії вірусів за допогою переносників може характеризуватися станом переносника за персистентністю (стан, при якому переносник залишається інфекційним після того, як залишить джерело інфекції (неперсистентний, напівперсистентний, персистентний) та базуватися на поведінці вірусу у переноснику (циркулятивні та нециркулятивні віруси). Циркулятивні у свою чергу поділяться на пропагативні (віруси здатні до розмноження як у клітинах рослини-господаря, так і в клітинах переносника) та непропагативні (віруси, що циркулюють, але не здатні репродукуватися у векторі, розмножуються тільки в клітинах рослини-господаря). Прикладом нециркулятивних вірусів є вірус гравіровки тютюну, вірус огіркової мозаїки, прикладом циркулятивних вірусів є вірус слабкої плямистості томату, вірус жовттої карликовості ячменю, У-вірус картоплі. Крім того, віруси можуть передаватися через грунт за допомогою таких переносників, як нематоди (вірус кільцевої плямистості тютюну, вірус кільцевої плямистості малини, вірус чорної кільцевої плямистості томату) та мікроскопічні гриби (вірус некрозу огірку, вірус некрозу тютюну, вірус некротичного пожовтіня жилок буряку, моп-топ вірус картоплі, вірус жовтої мозаїки ячменю, вірус мозаїки вівса).