Флюоресцентные красители

Данзилхлорид выпускается в виде двух кристаллических форм: кристаллы красного цвета плавятся при 70°, желтые—- при 73°. Они хорошо растворяются в ацетоне. Максимум их пог- лощения в растворе лежит в области 330—360 нм, флюоресцен- ции — 510 нм. Молярная экстинкция E=4,3 · 10⁶.

В щелочной среде, отщепляя ион хлора, данзильный остаток присоединяется к аминокислотам, пептидам и белкам, главным образом, по их концевой аминогруппе. При этом его способность флюоресцировать сохраняется.

97

Данзилирование белков и пептидов позволяет следить эа хо- дом их миграции при электрофорезе путем освещения гелей длинноволновым ультрафиолетовым светом, достаточно хорошо проникающим через пирексовое стекло. Скорость миграции бел- ков при данзилировании практически не изменяется, поэтому не- большие примеси данзилированных препаратов можно исполь- зовать в качестве маркеров при разделении неокрашенных бел- ковых смесей.

Данзилирование не мешает протеолизу белка, что позволяет

проводить пептидный анализ данзилированных белков после их разделения электрофорезом в ПААГ и элюции из геля. При этом удается обнаруживать по флюоресценции не только концевые, но и внутренние пептиды. Дело в том, что Данзилирование, хотя и намного менее эффективно, чем по концевым аминогруппам, происходит (в порядке ослабления) по SH- и ОН-группам цис- теина и тирозина, -NН₃-группам лизина и по гистидину. Цен- ным является то обстоятельство, что автолиз неданзилирован- ных протеаз не создает никаких помех при картировании пепти- дов.

Недавно описано Данзилирование белков для последующего разделения ступенчатым электрофорезом в комплексе с ДДС-Na (в системе Лэммли) [Tijssen, Kurstak, 1979]. Белки растворяют до концентрации 2 мг/мл в 0,1 М Трис-ацетатном буфере (рН 8,2) с 10% ДДС-Na, добавляют 1/15 объема 10%-ного. раствора данзилхлорида в ацетоне и, закрыв пробирку парафильмом, ин- кубируют в течение 15 мин на водяной бане при 50°. Свободный данзилхлорид нерастворим в водном ацетоне и образует мутно- желтую суспензию, тем не менее Данзилирование в ней происхо- дит. Раствор просветляется после добавления 1/15 объема мер каптоэтанола и дополнительной инкубации в течение 15 мин. Меркаптоэтанол связывает и растворяет избыток данзилхло- рида.

Инкубационную смесь можно без дальнейшей очистки под- вергать электрофорезу. Ярко люминесцирующие побочные про- дукты данзилирования быстро отделяются от белков и уходят вперед. В работе описан и препаративный вариант разделения белков под контролем данзилированных аликвот. При этом ис- пользуется электрофоретическая элюция белковых полос из ге- ля. Описан также пептидный анализ разделенных белков элек- трофорезом в системе Лэммли с градиентом пористости рабоче- го геля. Несколько ранее препаративный электрофорез белков под контролем данзилированных аликвот был описан Стефенсом [Stephens, 1975].

Флюоресцамин (иногда поставляется под фирменным наиме- нованием «Fluram») — желтовато-белый порошок, хорошо раст- воримый в ацетоне, диметильсульфоксиде и ацетонитриле. Хра- нить раствор следует не более двух недель: он неустойчив, осо- бенно при рН<4 и рН>10. При взаимодействии с первичными аминами (концевыми аминогруппами, -NH₂-группами лизина)

98

в водной среде флюоресцамин дает сильно флюоресцирующие продукты в соответствии с представленной ниже схемой.

Реакция идет успешнее в щелочной среде. Продукт реакции имеет два максимума поглощения (при 300 и 390 нм) и макси- мум флюоресценции при 480 нм. Замечательно, что ни сам флюо- ресцамин, ни продукты его распада в растворе не флюоресци- руют. При окрашивании белков и пептидов флюоресцамином не создается флюоресцирующего фона и окрашенный продукт мож- но не отделять от красителя, что чрезвычайно удобно. При ис- пользовании флюоресцамина для окраски белков или пептидов перед электрофорезом следует иметь в виду, что он вносит до- полнительный отрицательный заряд (за счет образующегося карбоксила) и этим изменяет электрофоретическую подвижность окрашенного белка. В случае разделения белков, обработанных ДДС-Na, этот единичный заряд практической роли не играет.

В недавней работе [Jackowski, Liew, 1980] флюоресцамин использовали для окраски белков после их двумерного фракционирования влектрофокуси- ровкой и электрофорезом по методу 0'Фаррела. Белки фиксировали в пласти- не геля, вымачивая ее в течение ночи в 10%-ной уксусной кислоте с 50% ме- танола (одновременно вымывались амфолины, которые окрашиваются флюо- ресцамином). Гель споласкивали в 7%-ной уксусной кислоте, помещали на 1 ч в диметилсульфоксид (ДМСО) и на 2ч — в 0,04 М раствор борной кисло- ты в ДМСО, титрованный NaOH до рН 10. Затем добавляли равный объем раствора флюоресцамина (0,5 мг/мл) в ДМСО и встряхивали смесь в течение 8 ч. Белковые пятна проявлялись уже через 2 ч. Их фотографировали при ос- вещении длинноволновым ультрафиолетовым светом.

Хранить гель в ДМСО следует в темноте: на свету способ- ность к флюоресценции за 24 ч падает до нуля. Чувствитель- ность и разрешающая способность окраски флюоресцамином примерно такие же, как и СВВ R-250, но линейный участок за- висимости интенсивности окраски (флюоресценции) от количе- ства белка больше — вплоть до 7 мкг белка на 1 см² в пятне или полосе. Для окраски СВВ R-250 линейность сохраняется не да- лее, чем для 3 мг/см².

Окрашивание белка флюоресцамином перед электрофорезом было использовано значительно раньше [Eng, Parkers, 1974]. Белок, обработанный ДДС-Na, растворяли до концентрации

99

0,5—1 мг/мл в 0,017 М Na-фосфатном буфере (рН 8,5) с 5% ДДС-Na. К 100 мкл этого раствора добавляли 5 мкл раствора флюоресцамина в ацетоне и встряхивали. Затем без дальнейшей очистки 10 мкл этой смеси вносили в трубку для электрофореза. Замечено, что ДДС-Na уменьшает эффективность окраски флюоресцамином. По-видимому, он создает препятствия для контакта красителя с аминогруппами белка. Аналогично исполь- зовали флюоресцамин и для окраски пептидов перед электрофо- резом [Rosemblatt et al., 1975]. В 1976 г. было описано исполь- зование для окрашивания белков перед электрофорезом родст- венного флюоресцамину препарата МДФФ (2-метокси-2,2-ди- фенил-3-фуранона) [Barger et al., 1976]. Как и флюоресцамин, этот препарат реагирует с первичными аминами, давая сильно флюоресцирующие продукты, в то время как сам он в растворе не флюоресцирует. Схема реакции представлена ниже.

В отличие от флюоресцамина МДФФ не привносит с собой дополнительного заряда. Он хорошо растворим в ацетоне и абсолютном метаноле. Максимум возбуждения флюоресцирую- щего продукта — при 390 нм, флюоресценции — при 745 нм. Реакция идет лучше в щелочной среде (рН 9,5.) Продукт устой- чив в интервале рН 2—10. Интенсивность флюоресценции—в 2,5 раза выше, чем при окраске флюоресцамином. Она лишь не- значительно уменьшается в случае предварительной обработки белка ДДС-Na и -меркаптоэтанолом при 100°. Чувствитель- ность метода очень высока: по утверждению авторов, им удава- лось обнаруживать до 0,001 мкг белка в полосе. В отличие от флюоресцамина окраска не ослабевает в течение нескольких ме- сяцев. Однако есть данные, что с длинными полипептидными цепями МДФФ реагирует слабее, чем флюоресцамин. Окраши- вание ведут в 0,01 М боратном буфере (рН 9,5), энергично пере- мешивая раствор белка с избытком раствора МДФФ в ДМСО.

Недавно [Chen, Thomas, 1980] МДФФ был использован для окраски бромциановых пептидов альдолазы перед их разделе- нием электрофорезом в 15%-ном ПААГ с ДДС-Na. Пептиды, обработанные ДДС-Na и р-меркаптоэтанолом, окрашивали в 0,1 М Li-боратном буфере (рН 9,5), добавляя к ним в пятикрат- ном избытке МДФФ, растворенный в абсолютном метаноле.

100

Ортофталевый альдегид (ОФА) в присутствии -меркапто- этанола реагирует с первичными аминами белков и пептидов, давая сильно флюоресцирующий продукт в соответствии с при- веденной ниже схемой.

ОФА растворим в воде, но лучше—в метаноле, этаноле, аце- тоне и диоксане. Реакция присоединения хорошо идет при рН 8—9. При использовании ОФА его сначала растворяют в одном из перечисленных органических растворителей, а потом смешивают с избытком водного буфера нужной концентрации и значения рН. Максимум возбуждения флюоресцирующего про- дукта — при 340 нм, флюоресценции — при 445 нм. Раствор са- мого ОФА не флюоресцирует. Чувствительность метода — выше, чем в случае флюоресцамина, но и фон флюоресценции побочных продуктов выражен сильнее.

Использование ОФА для окрашивания комплексов белок— ДДС-Na перед их электрофорезом описано еще в 1973 г. [Wei- dekamm et al., 1973]. Реакцию проводили в 0,025 М Na-фосфат- ном буфере (рН 8,5) в присутствии 5% ДДС-Na и 2% -меркап- тоэтанола. Сначала белок растворяли в этой смеси и прогревали при 100° для полной денатурации и восстановления, затем туда добавляли 1/5 объема 1%-ного раствора ОФА в метаноле и вы- держивали в темноте 2—3 ч.