Добавил:
Upload Опубликованный материал нарушает ваши авторские права? Сообщите нам.
Вуз: Предмет: Файл:

КНОРРЕ_3227

.pdf
Скачиваний:
65
Добавлен:
11.03.2016
Размер:
20.35 Mб
Скачать

210

Глава 10. Химический синтез пептидов и белков

ние ангидрида протекает даже при соотношении ДЦК и карбоксильной груп­ пы iV-защищенной аминокислоты 1:1, поскольку карбоксильная группа реа­ гирует с О-ацилизомочевиной быстрее, чем с ДЦК.

Кроме того, происходят побочные реакции, приводящие к нереакционно­ способным побочным продуктам.

 

 

f ,

 

 

О

V

R i-C H — С,

NH

 

Ri—СН— С

NH

I

 

/

\

I

О

-

+ 0=С

 

Hr N ^

 

II -у

 

N^ .

/ °

NH

 

 

N V

 

ЧС=Ю

 

 

 

СН

 

 

 

 

 

 

Р

J

 

9

*

R -I-C H -C . / " ^ N H

R-j—СН-С—N

1 . 4 ^

,

 

 

 

 

 

h h !i

0=6

 

 

С=0

NH

 

 

>

 

^2

Вприсутствии других нуклеофилов протекающие с ними реакции О- ацилизомочевины уменьшают уровень приведенных выше побочных пре­ вращений. Условия, в которых предпочтительно протекает межмолекулярная нуклеофильная атака О-ацилизомочевины, способствуют уменьшению числа побочных реакций и, следовательно, приводят к получению более чистого конечного продукта, содержащего значительно меньшие количества 5(4Н)- оксазолона или TV-ацилмочевины.

Врастворителях с низкими значениями диэлектрической проницаемости (СС14, СН2С12, С6Н6) образуется значительно меньшее количество N- ацилмочевины, чем в полярных средах (Л/^-диметилформамид (ДМФА), ацетонитрил, диметилсульфоксид (ДМСО), Н20). Это объясняется тем, что

внеполярных растворителях карбоновые кислоты находятся преимущест­ венно в виде димеров. Например, константа ассоциации уксусной кислоты

вСС14 имеет порядок 2000, тогда как в ацетонитриле - только 0,5. Димеры реагируют с ДЦК в 30 раз быстрее, чем мономеры, образуя с высоким выхо­ дом ангидриды и почти не давая А^-ацилмочевину.

О-ацилизомочевина, образованная аспарагином, может подвергаться внутримолекулярной циклизации по реакции

 

§10.4. Метод активированных сложных эфиров

211

 

0

 

Z -N h

Z -N H -C H — С

 

+ о=с

NH

II

NH

§10.4. Метод активированных сложных эфиров

Вначале 1950-х годов для активации карбоксильной группы в пептидном синтезе был предложен новый способ, основанный на использовании слож­ ных эфиров с хорошей уходящей группой, т. е. активированных эфиров (ме­ тод активированных эфиров). Впервые этот метод был осуществлен на при­

мере я-нитротиофениловых эфиров аминокислот. В дальнейшем в связи с неприятным запахом «-нитротиофенола, выделяющегося в результате реак­ ции аминолиза, стали использоваться другие нитрофениловые эфиры.

N02

no2 no2

Наибольшее распространение при синтезе пептидов получили «-нитро­ фениловые эфиры. Особых различий в скоростях ацилирования производны­ ми мононитрозамещенных фенолов не наблюдается, однако при их получе­ нии «-нитрофениловые эфиры защищенных аминокислот кристаллизуются лучше других. Высокая стабильность при хранении позволила выпускать коммерчески доступные «-нитрофениловые эфиры защищенных аминокис­ лот. 2,4-Динитрофениловые эфиры оказались чрезвычайно активными и вследствие этого весьма чувствительными к гидролизу.

Широкое распространение в пептидном синтезе получили и другие ари­ ловые эфиры. Структурные формулы арильного остатка и реакционная спо­ собность сложных эфиров (константа скорости ацилирования ко) представле­ ны в табл.15.

212

Глава 10. Химический синтез пептидов и белков

Таблица 15 Сравнение реакционной способности активированных эфиров (23 ± 1 °С)

ROH*

ноч0

Н О ^ ) - no2

o2n

О

НО—N

V

О

X

V

о

о

 

CI

ноЛ ^С|

CI

Н О -{ } -N Q 2

Название

А0х102,

Время аци­

M'V1

лирования

 

 

на 90 %,

 

 

мин

пентафторфенол

40 ±9

2,9

2,4-динитрофенол

18,4 ±3

6,3

N-гидроксисукцинимид

5,4 ± 0,7

2 1

пентахлорфенол

1,72 ±0,03

62

2,4,5-трихлорфенол

0,3 ± 0,03

385

«-нитрофенол

0 , 1 ± 0 , 0 1

1088

* ROH - спиртовый компонент эфира.

Реакционная способность замещенных ариловых эфиров определяется двумя факторами: 1) константой диссоциации фенольного гидроксила и 2) доступностью реакционного центра атома углерода карбонильной груп­ пы для нуклеофильного агента. Последнее зависит от степени пространст­ венного экранирования электрофильного центра за счет введения заместите­ ля в орто-положение к эфирной связи. Так, сложные эфиры на основе 2,4,5-трихлорфенола (р/£а 9,45) по способности к аминолизу примерно анало­ гичны и-нитрофениловым эфирам аминокислот (р/Са 9,27). В то же время, хо­ тя пентахлорфенол (р/Са 5,65) и пентафторфенол (рКг 5,32) имеют близкие величины констант диссоциации ОН-групп, скорость ацилирования пентахлорфениловыми эфирами в результате указанного экранирования в 20 раз ниже, чем соответствующими пентафторфениловыми эфирами. В отличие от атомов хлора, атом F в орто-положении не вызывает пространственного эк­

§10.4. Метод активированных сложных эфиров

213

ранирования атома углерода карбонильной группы, так как ван-дер-ваальсов радиус атома фтора значительно меньше, чем у хлора, и ненамного больше, чем у водорода. В связи с этим лучшими в серии сложных эфиров на основе галогензамещенных фенолов можно считать пентафторфениловые эфиры.

Поскольку атомы фтора проявляют сильный электроноакцепторный эф­ фект и в то же время не создают стерических препятствий, пентафторфени­ ловые эфиры можно применять для проведения реакции в пространственно­ затрудненных условиях, например, при твердофазном синтезе. В настоящее время пентафторфениловые и N-гидроксисукцинимидные эфиры являются наиболее широко используемыми вариантами активации карбоксильной группы в аминокислотах при проведении синтеза на полимерных носителях.

Галогензамещенные фениловые эфиры, в отличие от нитропроизводных, предпочтительно использовать, если в ходе синтеза удаление таких защит­ ных групп, как бензилоксикарбонильные, проводится путем гидрогенолиза, поскольку в противном случае из остаточных количеств «-нитрофенола по­ лучается высокореакционноспособный «-аминофенол.

Активированные эфиры - очень удобные реагенты для синтеза пептидов. Основным их достоинством является то, что, в отличие от смешанных ангид­ ридов, они выдерживают длительное хранение и могут быть приготовлены заранее и поэтому выпускаются как коммерческие продукты. Применяя из­ быток активированного эфира (30-50 %), можно достичь практически коли­ чественного выхода желаемого продукта на каждой стадии процесса. Избы­ ток активированных эфиров можно удалять после окончания реакции добав­ лением А^А^-диметилэтилендиамина. При ацилировании этого амина непро­ реагировавшим эфиром образуется соединение, способное легко растворять­ ся в кислотах и поэтому без труда удаляемое при промывках растворами кислот.

Для получения ариловых эфиров защищенных аминокислот используют ДЦК. Реакция между защищенной аминокислотой, ДЦК и нуклеофилом, на­ пример, «-нитрофенолом, может протекать по двум различным механизмам: 1) через взаимодействие «-нитрофенола с О-ацилизомочевиной и 2) через взаимодействие «-нитрофенола с симметричным ангидридом, образующимся в качестве промежуточного продукта. Если реализуется второй механизм, то аминокислота, освобождающаяся при его реакции с «-нитрофенолом, вновь реагирует с ДЦК, образуя в итоге активированный эфир аминокислоты и Л^ТУ’-дициклогексилмочевину (ДЦГМ). Эти же продукты образуются и при альтернативном механизме.

214

Глава 10. Химический синтез пептидов и белков

+ R-COOH

\

 

>- О Н 0 К n o 2

< 3 - n= c- nh- Q

 

 

О ~ н о 2

R—С

 

 

\О

+ ДЦГМ

- о - О -

R—С/

 

 

+ ДЦГМ

 

 

§ 10.5. Защитные группы в пептидном синтезе. Блокирование ог-аминогрунп

При проведении ступенчатого синтеза пептидов по а-аминогруппам ис­ ходных или активированных по карбоксильным группам аминокислот долж­ ны вводиться временные защиты. За период становления и развития работ по пептидному синтезу было разработано и применено большое число различ­ ных временных защит. Наиболее широкое применение нашли защитные группы уретанового типа. Подобные группы в кислой среде легко гидроли­ зуются с последующим самопроизвольным декарбоксилированием образо­ вавшегося на N-конце остатка карбаминовой кислоты по схеме

О

о

0 ^

 

0

F ^ O -C - N H - C H 'C f

+ Н+ ------► H 0 - C - N H - C H - C f + R?

'

'ОН

/

I

ОН

ГЧ2

 

/

г\2

 

со

Первой нашедшей широкое применение временной защитной группой этого типа была бензшоксикарбонтьная группа (Cbz или Z). Она вводится обработкой аминокислоты карбобенилоксихлоридом. Последний может быть получен путем насыщения бензилового спирта фосгеном.

§ 10.5. Защитные группы в пептидном синтезе. Блокирование а-аминогрупп

215

С У с н 2он +С0С12— 0

 

01

 

_ с н 2 °" сС + сГ+ н+

 

v==/

j

о

 

О

V,

о

 

H zN -C H 'C -N H 'A /

-------< ^ > - C H 20 -C -N H -C H -C -N H 'A /

R

 

O R

 

В настоящее время этот тип защиты по а-аминогруппам практически не используется, поскольку более удобным оказалось применение третбутипоксикарбонилъной (Вое) группы, которая вводится обработкой амино­ кислоты отре/я-бутилпирокарбонатом (ВосгО). Поскольку реакция проходит только с депротонированной аминогруппой, ее проводят в присутствии силь­ ного основания.

о о с — СН—NH2

 

О

СН3

Н3С—С-О—С-г-О- JОС-ОV/—СV/—СНЧ-мiQ3

 

I

 

 

W

I

 

 

СНз

 

 

R

 

 

СН3

 

основание

ди-трет-бути лпирокарбонат

 

 

 

 

СН3

О

 

О

СН3

 

 

/

 

II

I

 

H3C - C - O - C - N H - C H

 

-о -с -о —С-СН3

н+

I

V

СОО

 

I

СН3

 

 

СН3

СН3

Бос-аминокислота

 

 

со21 + НО-С-СНз

 

 

 

 

 

СН,

Эта защита удаляется при более мягких условиях, чем Cbz-группа. Второй широко используемой защитной группой является 9-флуоренш-

метшоксикарбонтъная (Fmoc). Она вводится с помощью 9-флуоренил- метилазидоформиата.

Fmoc-группа стабильна в кислой среде, но отщепляется основаниями: пи­ перидином, морфолином и др. В результате сильного электроноакцепторного эффекта бензольных колец атом водорода, находящийся в девятом положе­ нии, приобретает кислый характер и легко отрывается основаниями. Это ве­ дет к возникновению карбаниона. Легкость деблокирования определяется в данном случае стабильностью карбаниона, который образуется путем Р-элиминирования. Стабильность карбаниона обусловлена делокализацией

216

Глава 10. Химический синтез пептидов и белков

I

R

9-флуоренилметилазидоформиат

отрицательного заряда по всей ароматической дибензоциклопентадиенильной системе. Карбанион быстро распадается, образуя свободный аминокомпонент и дибензофульвен, который дает аддукт с основаниями.

фульвен-пиперидиновый аддукт

В 1970 году для защиты N-конца растущего пептида в практику пептид­ ного синтеза была введена защитная группа, удаляемая фотохимически -

§ 10.5. Защитные группы в пептидном синтезе. Блокирование а-аминогрупп

217

6-нитровератрилоксикарбонильная защита (NVOC). NFOC-аминокислоты синтезируют путем взаимодействия 6-нитровератрилоксикарбонил-хлорида со свободной Л^-аминогруппой аминокислоты:

 

О

+

11

H,N—С Н -С —ОН _____ _

н . с < А ^ ° ' см' С1

2 I

R

О

 

NVOC-защитная группа удаляется при облучении соответствующего пеп­ тида светом с длиной волны 350 нм с выделением С02 и образованием про­ изводного о-нитробензальдегида. Последнее при дальнейшем облучении мо­ жет димеризоваться в азосоединение:

+ С О Л*

+ H ,N - C H - C11- N H “ ^V

2

2 !

 

R

СООН ОСН 3

Эта защитная группа может быть использована для получения чипов, со­ держащих набор пептидов, методом фотолитографии, подобно получению олигонуклеотидных чипов, описанному в разд. 5.4.2.

218Глава 10. Химический синтез пептидов и белков

§10.6. Блокирование а-карбоксильных групп

Блокирование С-концевых карбоксильных групп в современных методах пептидного синтеза имеет существенно меньшее значение, чем блокирование а-аминогрупп, и необходимо лишь при гомогенном синтезе коротких пепти­ дов. Образование новых пептидных связей проводится путем реакции акти­ вированной карбоксильной группы С-компонента с незащищенной амино­ группой N-компонента, и, естественно, активируемая карбоксильная группа защите не подлежит. При твердофазном пептидном синтезе (§ 10.9) С-конце- вая карбоксильная группа синтезируемого пептида используется для связы­ вания его с полимерным носителем, т. е. защищена самим носителем. Только при получении коротких пептидов, в том числе для их последующего ис­ пользования в блочном синтезе, С-концевая СООН-группа должна быть снабжена какой-либо временной защитой.

Для защиты С-концевого карбоксила широко используется его этерификация. Это достигается пропусканием безводного хлористого водорода через раствор аминокислоты в абсолютном метаноле или этаноле. Согласно обще­ принятому механизму реакции на первой стадии карбоксильная группа протонируется. Это повышает чувствительность к нуклеофильному реагенту, т. е. к соответствующему спирту.

 

 

+

он

+

//

/

H3 N -C H -C

 

 

 

Оон

 

 

 

 

 

 

сн3он

 

 

 

 

н

 

 

 

+

 

 

НКО+

^

 

3

 

+

 

H N -C H -C

 

 

 

 

 

R

О -С Н 3

H3 N - сн -с—о-н

R +0-C H ,

 

 

 

 

R 0-С Н 3

I 3

+

н+ +

н20

 

н

 

 

 

 

Более удобным является этерификация в присутствии хлористого тионила по схеме:

§ 10.7. Блокирование боковых групп в аминокислотах

219

 

II

Г К

-2 0

°С

 

 

 

СН3ОН +

SOCI2

H3C-^HD^S—CI

г

 

 

 

 

 

 

 

 

HCI

 

+

//

+

HCI + s o 2f

 

bLN -CH —C

 

 

R

Ч° С Н 3

 

 

 

Омыление метиловых и этиловых эфиров проводят при комнатной тем­ пературе в водно-спиртовых растворах едкого натра или в смеси NaOH с та­ кими органическими растворителями, как ацетон, метанол, диоксан. Предпо­ лагается, что реакция идет по следующему механизму:

II

Z - N H - C H - C - O C b L

*1

'ОН

§ 10.7. Блокирование боковых групп в аминокислотах

Степень блокирования боковых групп - важный вопрос при планирова­ нии синтеза. Его решение зависит от растворимости индивидуальных пепти­ дов и от выбора методов конденсации. Боковые функции аспарагина, глута­ мина, серина, треонина, тирозина, аргинина и гистидина могут оставаться незащищенными (например, при использовании метода активированных эфиров). Боковая аминогруппа лизина, сульфгидрильная группа цистеина, индольный гетероцикл триптофана и боковые карбоксильные группы аспартата и глутамата должны защищаться при любой стратегии синтеза.

Полное блокирование всех функциональных групп, т. е. максимальная защита, оптимально способствует предотвращению нежелательных побоч­ ных реакций и обеспечивает свободу выбора методов конденсации. Однако некоторые используемые в настоящее время защитные группы вызывают та­ кой нежелательный эффект, как понижение растворимости крупных пепти­ дов в органических растворителях. В то же время одно из главных преиму­ ществ минимальной защиты, особенно важное для промышленного произ­ водства пептидов и для синтеза крупных пептидов и белков, состоит в боль­ шей легкости удаления небольшого количества защитных групп при получе­ нии желаемого свободного пептида в конце синтеза.