КНОРРЕ_3227
.pdf280 Глава 13. Биоорганическая химия углеводов
Для проектирования цепь из трех атомов располагается так, чтобы плос кость, на которой лежат три атома С, была перпендикулярна горизонтальной плоскости, на которую осуществляется проектирование, и чтобы наимень ший угол, образуемый этими тремя атомами, был обращен в сторону гори зонтальной плоскости. Прямая, образованная пересечением этих плоскостей, на бумаге обычно изображается как вертикальная линия, на которой разме щены эти три атома углерода. При этом атом 'С располагается сверху. Тогда заместитель, находящийся справа от вертикальной плоскости, на которой располагается углеродная цепь, окажется справа от линии, а расположенный слева заместитель - слева.
Ниже представлены проекционные формулы Фишера изомеров глицери нового альдегида. Изомер, у которого в проекционной формуле группа ОН при асимметрическом атоме С располагается слева от вертикальной линии, называют L-изомером, а противоположный - D-изомером.
Н С =0 НС =0
I |
I |
но—с—н |
н—с—он |
I |
I |
сн2он |
сн2он |
L-глицериновый альдегид |
D-глицериновый альдегид |
Для соединений с двумя асимметрическими атомами углеродную цепочку располагают в пространстве так, чтобы она представляла собой выпуклую ломаную линию (рис. 85). Концы этой линии помещают на горизонтальной плоскости, а выпуклую часть - на перпендикулярной плоскости. При проек тировании выпуклая ломаная линия даст на плоскости вертикальную прямую линию, на верхнем конце которой располагается первый углеродный атом. При этом заместители, расположенные справа от плоскости, на которой ле жат углеродные атомы, на проекции окажутся справа от вертикали, а нахо дящиеся слева - слева.
Для соединений, содержащих более двух асимметрических атомов угле рода, данный метод применяют последовательно ко всем парам атомов.
При таком проектировании перестановка двух заместителей при любом из асимметрических атомов С соответствует обращению конфигурации у данного атома углерода.
Проекционные формулы Фишера дают возможность изображать всю сте реохимию моносахаридов. Они правильно отображают взаимоотношение стереоизомеров, но в то же время не дают четкого представления о взаимном пространственном расположении ОН-групп и других заместителей при со седних атомах углерода. Последнее существенно при рассмотрении реакций углеводов, протекающих при одновременном участии двух ОН-групп (§ 13.3).
§ 13.1. Моносахариды. Номенклатура. Способы изображения |
281 |
Рис. 85. Проектирование по Фишеру молекулы с двумя асимметрическими ато мами С
Моносахариды, которые теоретически могут быть получены из D- глицеринового альдегида путем последовательного удлинения его цепи в сторону альдегидной группы, независимо от конфигурации остальных ато мов углерода, относят к D-ряду. Иначе говоря, если асимметрический атом углерода с наибольшим порядковым номером имеет ту же конфигурацию, что и D-глицериновый альдегид, то данный моносахарид относится к D-ряду. Аналогично могут быть определены моносахариды L-ряда.
13.1.2. Альдозы и кетозы
Ниже представлены проекционные формулы всех альдоз и кетоз D-ряда, содержащих не более шести атомов углерода, и их тривиальные названия.
|
НС=0 |
НС=0 |
нс=о |
I |
I |
н—с—он но—с—н |
||
I |
I |
I |
н—с—он |
н—с—ОН |
н—с—ОН |
I |
I |
I |
СН2ОН |
СН2ОН |
СН2ОН |
D-глицериновый альдегид |
D-эритроза |
D-треоза |
282 |
Глава 13. Биоорганическая химия углеводов |
НС=0 |
НС=0 |
I |
I |
н—с —ОН |
но—с—н |
I |
I |
н - с - о н |
н—с—он |
н - сI - о н |
н - сI - о н |
I |
I |
сн2он |
сн2он |
D-рибоза |
D-арабиноза |
НС=0 |
НС=0 |
I |
I |
н—с—он |
н о - с —н |
н—с —он |
н—с —он |
н - сI- о н |
н—сI —он |
н - сI- о н |
н - сI- о н |
I |
I |
сн2он |
сн2он |
D-аллоза |
D-альтроза |
НС=0 |
НС=0 |
I |
I |
н—с—ОН |
но—с—н |
н—с—он |
I |
н—с—он |
|
I |
н о - с —н |
но—с—н |
|
н - сI- о н |
н—с—он |
I |
I |
сн2он |
сн2он |
D-гулоза |
D-идоза |
НС=0 |
НС=0 |
н - сI - о н |
н о - сI —н |
н о - сI —н |
н о - сI —н |
н - сI- о н |
н - сI- о н |
I |
I |
сн2он |
сн2он |
D-ксилоза |
D-ликсоза |
НС=0 |
НС=0 |
I |
I |
н—с—он |
но—с —н |
н о -с —н |
I |
но—с —н |
|
н - сI- о н |
н - сI- о н |
I |
I |
н - сI- о н |
н - сI- о н |
сн2он |
сн2он |
D-глюкоза |
D-манноза |
НС=0 |
НС=0 |
I |
I |
н—с—ОН |
н о - с —н |
н о -с —Н |
но—с —н |
н о -сI — н |
н о - с —н |
I |
I |
н—сI—он |
н - сI- о н |
сн2он |
сн2он |
D-галактоза |
D-талоза |
§ 13.1. Моносахариды. Номенклатура. Способы изображения |
283 |
СН2ОН
|
I |
|
|
|
с=о |
|
|
|
I |
|
|
н—с—он |
|
||
|
I |
|
|
|
СН2ОН |
|
|
D-тетрулоза (она же эритрулоза) |
|||
СН-ОН |
|
|
СН. ОН |
I 2 |
|
|
I 2 |
С = 0 |
|
|
С = 0 |
I |
I |
но—с—н |
|
н—с—он |
I |
||
I |
|
н-с-он |
|
н-с-он |
|
|
|
I |
I |
|
н—с—он |
н—с—он |
|
|
|
сн2он |
|
|
сн2он |
D-псикоза |
|
|
D-фруктоза |
СН2ОН
I
с=о
I
н — с — ОН
I
н—с—он
I
СН2ОН
D-рибулоза
СН. ОН
I 2 С = 0
I
н—с—он но-Iс-н
I
н—с—он
сн2он
D-сорбоза
СН2ОН
С = 0
I
н—с—ОН
I
но—с—н
I
сн2он
D-ксилулоза
сн2он
I С = 0
I но—с—н I но-с-н
I н—с—он
СН2ОН
D-тагатоза
Из моносахаридов наиболее распространены в природе пентозы и гексозы, среди последних чаще всего встречаются D-глюкоза и D-фруктоза. Глю коза присутствует во всех живых организмах, от вирусов до высших расте ний и животных, и входит в состав олиго- и полисахаридов, таких как саха роза, целлюлоза, крахмал, а также в состав смешанных биополимеров (гли копротеинов и протеогликанов). Среди гексоз часто встречаются также D-галактоза и D-манноза. Из пентоз чаще всего встречаются L-арабиноза и D-ксилоза, входящие в состав ряда полисахаридов и гликозидов, а также D-рибоза, входящая в состав полимерных цепей рибонуклеиновых кислот.
Тривиальные названия моносахаридов часто используются для обозначе ния конфигурации асимметрических атомов фрагментов молекул. Например, L-трео-, D-рибо-, D-глюко- и L-галакто- означают, что в молекуле имеются фрагменты
284 |
Глава 13. Биооргантеская химия углеводов |
|
|
|
|
-ОН |
НО- |
-О Н |
-О Н |
НО- |
-О Н |
но- |
-О Н |
-О Н |
-О Н |
|
-О Н |
-О Н |
НО- |
L-трео |
D-рибо |
D-глюко |
L-галакто |
13.1.3. Циклические формы моносахаридов. Перспективные формулы Хеуорса
Карбонильные группы моносахаридов могут внутримолекулярно реаги ровать с одной из ОН-групп с превращением их соответственно в цикличе ские формы - полуацетали и полукетали. При этом образуются шестиили пятичленные циклы. Первые называют пиранозами, а вторые - фуранозами. При образовании цикла в молекуле возникает новый хиральный атом С при атоме ’С у альдоз и атоме 2С у кетоз. Два стереоизомера, различающихся конфигурацией у этого атома, называют аномерами. Если конфигурация ато мов 'С у альдоз и 2С у кетоз совпадает с конфигурацией атома С, определяю щего отнесение моносахарида к D- или L-ряду, то это а-аномер, если не сов падает - то это Р-аномер. На рис. 86 представлены структуры аномеров для пиранозных форм D- и L-глюкозы.
Витоге моносахарид может находиться в пяти изомерных формах - ли нейной, а- и (3-пиранозной и а- и Р-фуранозной формах. Эти пять форм могут находиться в равновесии. Изображение циклических структур в проекциях Фишера ненаглядно, поэтому их принято представлять в перспективных формулах Хеуорса (см. рис. 86), причем атом О цикла изображается как наи более удаленный от наблюдателя. Связи между атомами С, образуемые ато мами 2С и 3С, часто изображаются жирными линиями. Заместители, распо ложенные в формулах Фишера справа, т. е. находящиеся при углеродных атомах с D-конфигурацией, помещают под кольцом; сверху располагают за местители при атомах углерода с L-конфигурацией. Не входящий в цикл или «боковой заместитель», находящийся при атоме С-5 у пираноз и атоме С-4
уфураноз, располагается в формуле Хеуорса над плоскостью, если эти атомы имеют D-конфигурацию, и под плоскостью - если L-конфигурацию.
Врастворе моносахариды существуют в различных таутомерных формах,
находящихся в равновесии. Взаимное превращение а- и Р-аномеров называ ется мутаротацией. Обычно равновесие сдвинуто в сторону а- и Р-пираноз. Ниже приведены все таутомерные равновесия для D-глюкозы.
§ 13.1. Моносахариды. Номенклатура. |
Способы изображения |
285 |
|
СН2ОН |
|
СН2ОН |
|
|
|
) — О ОН |
|
НО |
С Н =0 |
НО |
|
о н \ |
•он S |
он |
|
o-D-глюкопираноза |
но- |
/Ю-глюкопираноза |
|
|
|
|
-ОН
гон
он
-ОН ^ |
СН2ОН |
СН2ОН |
НО -|— / О ^ ОН |
D-глюкоза |
он |
|
a-D-глюкофураноза |
^■D-глюкофураноза |
Рис. 86. Таутомерные формы D-глюкозы
Наряду с моносахаридами в природе широко распространены, главным образом в виде компонент полисахаридов, амины, причем обычно амино группа находится при атоме 2С и ацетилирована. Название этих ацетаминов происходит от названий соответствующих моносахаридов. Чаще всего в ка честве компонентов полисахаридов встречаются N-ацеттглюкозамин и N-
ацетилгалактозамин.
|
СН2ОН |
|
|
Н 0 /1 |
°чО Н |
он |
.О Н |
N |
ч ч '1 |
||
NHCO CH 3 |
|
NHCO CH 3 |
Из производных моносахаридов в природе, особенно в виде фрагментов олиго- и полисахаридов, широко распространены N-ацетилмурамовая (3-0- лак-тил-Ы-ацетилглюкозамин) и нейраминовая (2-кето-3,5-дидезокси-5- амино-4,6,7,8,9-пентагидроксинонановая) кислоты. Последняя является представителем группы распространенных природных соединений, которые называют актовыми кислотами.
286 |
Глава 13. Биоорганическая химия углеводов |
|
НзС—СН |
NH-C -C H 3 |
|
|
|
|
)с-он |
|
|
|
|
о ' |
|
|
|
N-ацетилмурамовая кислота |
СОСНз |
||
|
|
|
|
|
о |
n h 2 |
о н |
|
|
и |
|
|
|
|
НООС-С-СН2-СН-СН-СН-СН-СН-СН2ОН |
|
|||
z I |
I |
I |
^ |
|
он |
он |
он |
|
(рнон |
|
|
|
|
|
N-ацетилнейраминовая или сиаловая кислота |
CHOH |
|||
|
|
|
|
СН2ОН |
Остальные сиаловые кислоты отличаются набором заместителей при NH2- и ОН-группах.
13.1.4. Конформация фуранозных циклов
Система из пяти атомов помимо трех поступательных и трех вращатель ных имеет еще девять степеней свободы. Поэтому построить циклическую структуру с заданными длинами связей и углами между связями, т. е. с деся тью заданными геометрическими параметрами, в общем случае нельзя. Пя тичленные циклы, в том числе фуранозный, существуют вследствие того, что возможны отклонения значений валентных углов от оптимальных, свойст
венных аналогичным линейным структурам. |
Вариации этих отклонений |
в определенных пределах допускаются и для |
торсионных углов в цикле, |
в результате чего возможно существование нескольких конформаций. Каче ственно их принято характеризовать расположением атомов цикла относи тельно некоторой плоскости, определяющей общую ориентацию цикла. При этом можно представить себе 10 идеализированных конформаций, у которых четыре атома из пяти находятся в одной плоскости, а пятый выступает из неё либо в ту же сторону, что и СНг-группа (эндо-конформация), либо в противо положную (экзо-конформация). Эти конформации имеют форму конверта.
§ 13.1. Моносахариды. Номенклатура. Способы изображения |
287 |
Такие конформации обозначаются буквой Е (от англ. envelope - конверт). Все остальные мыслимые конформации таковы, что никакие четыре атома не находятся в одной плоскости. Их называют твист-конформациями (от англ. twist - скрученный) и обозначают буквой Т. В случае этих конформаций два любых соседних атома лежат по разные стороны от плоскости, образуемой тремя остальными атомами кольца. Отклонения от этой плоскости могут быть практически одинаковыми. В этом случае «твист»-конформацию рас сматривают как симметричную. Номера выступающих атомов ставят справа от символа Т, причем верхний номер соответствует атому, занимающему эк зо-положение, а нижний - атому в эндо-положении. Симметричная С-2’-экзо- С-3’-эндо-конформация при этом обозначается как Т32. Однако Т- конформация может быть и несимметричной. Это означает, что один из двух выступов существенно больше, чем другой. В этом случае номер атома, обра зующий малый выступ, ставится справа от символа Т. «Твист»-конформация с главным эндо-выступом С-3’ и минорным выступом С-2’-экзо в этой сим волике будет записываться в виде 3Т2.
Любой переход между конформациями «конверта» можно представить себе как результат одного или нескольких перемещений, при каждом из ко торых пара соседних атомов постепенно изменяет свое положение относи тельно плоскости, образованной тремя остальными атомами фуранозного цикла. Суть перемещения заключается в том, что атом, выступающий из плоскости в исходной конформации «конверта», перемещается в одном на правлении от этой плоскости, а соседний атом - в противоположном. Это пе ремещение заканчивается образованием новой конформации «конверта», причем в силу характера перемещения экзо-конформация переходит в эндо, а эндо-конформация - в экзо. Такой переход получил название псевдовращение
(рис. 87).
В рамках концепции псевдовращения каждой конформации приписыва ется некоторый угол Р, при изменении которого от 0 до 360 градусов прохо дится весь набор конформаций. При этом значение 0 приписывается кон формации, при которой атомы С-3’ и С-2’ в равной степени выступают из плоскости, образованной атомами С-Г, С-4’ и 0-4’, причем атом С-3’ в ту же сторону, что и 5’-СН2-группа, а атом С-2’ - в противоположную. Такая конформация называется С-2’-экзо, С-3’-эндо. Она является промежуточной между С-2’-экзо, которой приписывают Р = 342 и С-3’-эндо с Р = 18. Даль нейшее увеличение угла Р соответствует взаимному перемещению атомов С-3’ и С-4’, причем через 36° достигается следующая Е-конформация, С-4’- экзо. Последующее увеличение Р связано со взаимным перемещением ато мов С-4’ и 0-4’ и т. д. В составе нуклеиновых кислот чаще всего встречают ся С-2’-эндо- и С-3’-эндо-конформации, которым соответствуют значения углов псевдовращения 162 и 18.
288 |
Глава 13. Биооргантеская химия углеводов |
С-З'-эндо |
С-2'-эндо |
Т
С-2'-экзо |
С-2'-экзо |
С-З'-эндо |
|
С-З'-эндо |
|
Рис. 87. Конформации полинуклеотидной цепи. Экзо- и эндо-конформации фуранозного цикла. Переход от С-2’-экзо- к С-3’-эндо-конформации
13.1.5. Конформация пиранозных циклов
Атомы пиранозного кольца обладают 18-ю степенями свободы, 6 из них приходятся на поступательные и вращательные. Если бы все шесть связей и шесть валентных углов в такой структуре были жестко фиксированы, то из менения торсионных углов были бы невозможны, и конформация такой сис темы была бы жестко фиксирована. Однако из-за возможных отклонений от стандартных значений углов и длин связей такие циклы существуют в не скольких конформациях. Типичными для шестичленных циклов являются конформации «ванны», или «лодки», обозначаемые буквой В (от англ. boat - лодка) и конформации «кресла», обозначаемые буквой С (от англ. chair - кресло) (рис. 88).
конформация |
конформация |
ванны (лодки, В) |
кресла (С) |
Рис. 88. Два основных типа конформаций пиранозного цикла
§ 13.1. Моносахариды. Номенклатура. Способы изображения |
289 |
У пиранозных форм моносахаридов стерически более выгодными явля ются конформации «кресла». Две возможные конформации кресла обозна чают как С1 (атом 'С расположен под плоскостью, образованной атомами О, 2С, 3С и 5С) и 1C (атом 1С расположен над этой плоскостью). В некотором приближении каждую из пар связей, образуемых пятью атомами С, можно рассматривать как параллельную и перпендикулярную базовой плоскости. Направления этих связей называют соответственно экваториальным (е) и ак сиальным (а).
Между соседними ОН-группами действуют силы отталкивания между электроотрицательными атомами О. Предпочтительным является их эквато риальное расположение, при котором они несколько более удалены друг от друга. Поэтому у моносахаридов преобладающей конформацией является та, у которой наибольшее число ОН-групп расположено в экваториальном на правлении. Например, у P-D-глюкозы преобладает конформация 4Ci (или Cl), поскольку у нее все пять заместителей находятся в экваториальном положе нии. В конформации же 1С4 (или 1C) заместители находятся на более близ ком расстоянии друг к другу (рис. 89).
С1 |
1C |
Рис. 89. Конформации С1 и 1C p-D-глюкозы
Наоборот, у a-D-идозы преобладает 'С4 конформация (рис. 90), поскольку при этом все четыре ОН-группы располагаются в экваториальном положе нии.