- •Ботаника с основами фитоценологии.
- •4. Характерные признаки высших растений. Ткани высших растений, взаимосвязь структуры и функции. Принципы классификаций тканей.
- •7. Разнообразие анатомической структуры стебля однодольных и двудольных растений.
- •8. Особенности жизненного цикла высших растений: гаметофитная и спорофитная линии. Взаимоотношение спорофита и гаметофита у моховидных, высших споровых и семенных растений.
- •9. Семя как орган размножения и расселения растений. Строение семян голосеменных и покрытосеменных растений.
- •10. Класс хвойные, геологическая история, распространение в современную эпоху, аспекты практического использования. Особенности размножения.
- •11. Общая характеристика покрытосеменных растений, их роль в сложении растительного покрова. Процессы размножения, протекающие в цветке.
- •12. Деление покрытосеменных растений на классы. Сравнительная характеристика однодольных и двудольных растений. Важнейшие семейства.
- •13. Характерные признаки фитоценоза: видовое богатство, флористический и экобиоморфный состав, вертикальная и горизонтальная структура, популяционный состав, биологическая продукция и фитомасса.
- •Зоология.
- •1. Тип Инфузории. Особенности строения и размножения инфузорий как наиболее высокоорганизованных простейших. Отряды инфузорий. Значение. Ресничный и ядерный аппарат. Особенности конъюгации.
- •3. Тип Круглые черви. Класс Нематоды. Особенности организации нематод. Образ жизни и распространение. Размножение и развитие. Паразитические нематоды. Способы заражения. Профилактика гельминтов.
- •5. Тип Моллюски. Класс Брюхоногие моллюски. Особенности строения моллюсков. Развитие асимметрии. Размножение и развитие гастропод. Распространение.
- •8. Основные этапы филогенетического развития позвоночных животных. Эволюционная связь классов подтипа Позвоночные. Основные ароморфозы, характерные каждому классу подтипа Позвоночные.
- •9. Геологические и биологические предпосылки выхода позвоночных животных на сушу. Особенности организации земноводных.
- •5 Отделов мозга: передний, промежуточный, средний, мозжечок, продолговатый.
- •11. Система класса Птицы. Особенности организации птиц. Сложное поведение птиц. Забота о потомстве. Миграции и способы их изучения.
- •12. Размножение птиц. Взаимоотношения полов, гнездостроение, насиживание и инкубация. Птенцовость и выводковость.
- •13. Систематика класса Млекопитающие. Особенности организации млекопитающих. Их размножение и развитие. Характеристика отрядов насекомоядных, приматов, грызунов, парнокопытных. Значение.
- •14. Пойкилотермия и гомойотермия. Физиологические и поведенческие способы регуляции температуры тела. Способы животных переживать периоды года с низкой температурой.
- •Физиология растений.
- •1. Общая характеристика процесса фотосинтеза. Фотосинтетические пигменты: классификация, физико-химические свойства, значение.
- •3. Фотохимическая фаза фотосинтеза: фотосистемы и этц. Накопление «ассимиляционной силы» в хлоропласте.
- •6. Цикл Кребса и дыхательная этц: химизм, энергетика, физиологическое значение.
- •7. Понятие о метаболической энергии и макроэргических соединениях. Роль атф в клеточном метаболизме. Механизмы субстратного и сопряженного синтеза атф.
- •Микробиология.
- •Анатомия и физиология человека.
- •2. Дыхательная система человека. Этапы дыхания. Показатели вентиляции легких. Газообмен в легких и тканях. Транспорт дыхательных газов. Кривая диссоциации оксигемоглобина. Регуляция дыхания.
- •5. Морфологические и функциональные особенности сердечной мышцы. Внутрисердечные и внесердечные механизмы регуляции работы сердца.
- •6. Структура и функции мышц. Структура мышечного волокна. Механизм и энергетика мышечного сокращения. Виды и режимы мышечных сокращений.
- •7. Эндокринная система организма. Гормоны, их роль в организме. Роль гипоталамо-гипофизной системы в регуляции желез внутренней секреции.
- •8. Нейрон – структурно-функциональная единица нервной системы. Структура и функции нервных волокон. Механизмы генерации и проведения нервных импульсов.
- •9. Механизмы межклеточной (симпатической) передачи нервных импульсов. Структура синапса. Медиаторы. Функционирование возбуждающих и тормозных синапсов. Роль торможения в цнс.
- •11. Конечный мозг: кора больших полушарий, подкорковые ядра. Строение и функции коры больших полушарий: борозды, доли, извилины. Функциональные зоны коры.
- •12. Учение Сеченова и Павлова об условных рефлексах, их роль. Механизмы формирования временных условных связей. Виды торможения условных рефлексов.
- •13. Структура и функционирование зрительного анализатора у человека. Теории цветового зрения.
- •14. Структура и функционирование слухового анализатора у человека.
- •Цитология.
- •1. Транспорт веществ через плазмолемму. Пассивный транспорт и его разновидности. Активный транспорт, его виды и механизмы. Ионные насосы, генерация потенциалов покоя и действия.
- •Гистология с основами эмбриологии.
- •1. Сравнительная характеристика тканей животных (эпителиальная, опорно-трофическая, мышечная, нервная).
- •3. Половое размножение и его биологическое значение. Половые клетки, их строение и развитие. Оплодотворение, дробление, гаструляция, органогенез. Формирование признаков типа Хордовые. Клонирование.
- •Генетика.
- •4. Закономерности наследования признаков при моно- и полигибридных скрещиваниях. Законы Менделя. Цитологический механизм расщепления. Комбинативная изменчивость.
- •Биохимия
- •3. Ферменты. Общие и особенные свойства ферментов и катализаторов иной природы. Простые и сложные ферменты, особенности их строения и механизм действия. Номенклатура ферментов.
- •Молекулярная биология.
- •Биотехнология.
- •Биогеография.
- •3. Палеарктическое царство. Границы. Связь с другими царствами. Подразделение на области. Эколого-географическая характеристика. Биоразнообразие и охраняемые природные территории.
- •Общая экология.
- •1. Экосистема как центральное понятие экологии. Основные структурные компоненты экосистемы и принципы их взаимодействия. Различие понятий «экосистема» и «биогеоценоз». Примеры природных экосистем.
- •2. Классификация экологических факторов и основные закономерности их действия. Основные законы факториальной экологии и их значение для практической деятельности.
- •3. История развития понятия «биосфера». Учение о биосфере Вернадского. Определение биосферы, ее структура и границы. Виды вещества в биосфере по Вернадскому. Функции живых организмов в биосфере.
- •4. Преобразование энергии в биосфере. Трофические цепи, сети, трофические уровни. Продуктивность. Виды продукции экосистемы. Продуктивность естественных биоценозов и искусственных агроэкосистем.
- •Социальная экология и природопользование.
- •3. Глобальные проблемы человечества: состояние окружающей среды, истощение природных ресурсов, демографическая ситуация. Возможные пути их решения.
- •Теория эволюции
Микробиология.
1. Генетика прокариот. Генетические рекомбинации. Трансформация, трансдукция, конъюгация. Половые жгутики - пили. Внехромосомные факторы наследственности. Плазмиды бактерий. Метод молекулярного клонирования. Получение ценных штаммов микроорганизмов, биотрансформации органических соединений с целью получения метаболитов, микробиологический синтез аминокислот, витаминов.
Генетический материал прокариот представлен молекулой ДНК, сосредоточенной в ограниченных пространствах цитоплазмы, но в отличие от эукариот, не имеющей собственной ядерной мембраны. Генетический аппарат прокариот принято называть нуклеоидом. Молекула ДНК прокариот состоит из двух полинуклеотидных цепей, имеющих форму двойной спирали. Скелет спирали образован чередующимися остатками дезоксирибозы и фосфорной кислоты. Перпендикулярно к оси спирали расположены молекулы азотистых оснований, соединенные между собой водородными связями по принципу комплементарности - аденин (А) с тимином (Т) и гуанин (Г) с цитозином (Ц).
Молекула ДНК бактерий отождествляется одной хромосоме, в которой соредоточена основная генетическая информация. Размер генома прокариот значительно меньше размера генома эукариот. Хромосомы большинства бактерий имеют молекулярную массу (1-3)*109, наименьший размер генома характерен для микоплазм - (0,4-0,5)*109, а наибольший для цианобактерий - 8,5*109.
Помимо хромосом, в клетках обнаружены внехромосомные генетические элементы, получившие название плазмид. Последние представлены небольшими ковалентно-замкнутыми кольцевыми молекулами ДНК, содержащими 1 500-40 000 пар нуклеотидов, способными реплицироваться автономно от хромосомной ДНК. К настоящему времени описано большое разнообразие плазмид. Это плазмиды, контролирующие половой процесс у бактерий, множественную устойчивость к лекарственным препаратам, синтез веществ белковой природы. Плазмиды играют важную роль в эволюционном процессе прокариот, так как нередко они придают бактериальной клетке дополнительные свойства, способствующие ее выживанию.
Транспозон - последовательность ДНК, способная реплицироваться и внедрять одну из копий в новое место генома. Они переносят "экзогенные гены", то есть, гены, кодирующие некоторые функции, не имеющие отношения к транспозиции. Бактериальные транспозоны обозначаются буквами Tn, за которыми следует номер типа. Некоторые из них являются комплексными (или композиционными), т.к. каждый из них способен к независимой транспозиции, образует один или более "экзогенных гена".
Некоторые бактериофаги фактически являются транспозонами. Например, бактериофаг Mu, который кодирует не только ферменты, ответственные за транспозицию, но также и большое число структурных белков, необходимых для упаковки его ДНК.
Фимбрии (пили) - тонкие нитевидные структуры. По размерам они короче и тоньше жгутиков. Длина их составляет 0,3-0,4 мкм при диаметре 5-10 нм. Фимбрий - прямые полые цилиндры, отходящие от цитоплазматической мембраны. Они образованы специфическим белком пилином. Фимбрий имеют кокковидные, палочковидные, подвижные и неподвижные бактерии. Функции фимбрий не связаны с движением клетки. 2 типа: 1) Фимбрий первого типа выполняют функцию прикрепления клетки к поверхности субстрата или сцепления клеток. 2) Фимбрий второго типа - половые фимбрий, или F-пили. F-пили образуются на клетках-донорах в количестве 1-2. При конъюгации конец половой фимбрий клетки-донора прикрепляется к белку наружной мембраны клетки-реципиента. По цитоплазматическому мостику через канал F-пили происходит передача материала ДНК из клетки-донора в клетку-реципиент. Половые пили способны отрастать за 4-5 мин и также быстро сбрасываться клеткой, что свидетельствует об активности данной структуры.
Генетические рекомбинации. Генотипическая изменчивость прокариот наблюдается в результате рекомбинаций генетического материала за счет частичного объединения геномов двух клеток и проявляется в фенотипе бактерий. К рекомбинативной изменчивости генетического материала прокариот приводят трансформация, трансдукция и конъюгация.
В отличие от эукариот, у которых при половом процессе происходит образование истинной зиготы, объединяющей генетический материал обоих родителей, у прокариот при всех трех вышеуказанных процессах наблюдается лишь частичный перенос генетического материала из клетки-донора в клетку-реципиент, что приводит к образованию неполноценной зиготы - мерозиготы. Таким образом, прокариотная клетка-реципиент становится частично диплоидной, сохраняя в основном генотип клетки-реципиента и приобретая лишь отдельные свойства клетки-донора. Ответственность за рекомбинации несут специальные гены клетки-реципиента, получившие название rec-генов. Механизм рекомбинаций включает ряд последовательных стадий: разрыв нитей ДНК клетки-реципиента; встраивание фрагментов ДНК, привнесенных из клетки-донора в геном клетки реципиента; репликация рекомбинативной ДНК, дающей начало потомству клеток с измененным геномом.
Трансформация - изменение генома в результате переноса информации при проникновении фрагмента свободной ДНК из среды в клетку. При трансформации не требуется непосредственного контакта между клеткой-донором и клеткой-реципиентом. Источником трансформирующей ДНК может служить свежеубитая культура бактерий или чистые препараты ДНК. Явление трансформации у бактерий впервые наблюдал Гриффите в 1928 г. Он обнаружил, что при совместном введении в организм мышей убитого вирулентного капсульного пневмококка S-типа с живым авирулентным бескапсульным пневмококком R-типа все животные погибают. При этом из крови погибших мышей наряду с бескапсульными пневмококками R-типа выделяются вирулентные капсульные пневмококки S-типа. Гриффите не сумел объяснить явление трансформации. Лишь в 1944 г. Эвери, Мак-Леод выделили трансформирующее вещество из убитых клеток капсульных пневмококков и показали, что им является ДНК, чувствительная к ДНК-полимеразе.
Процесс трансформации проходит в несколько этапов: 1) адсорбция трансформирующей ДНК на поверхности компетентной клетки-реципиента; 2) ферментативное расщепление трансформирующей ДНК с образованием фрагментов; 3) проникновение фрагментов ДНК в клетку-реципиент, сопровождающееся деградацией одной из цепей ДНК и образованием одноцепочечных фрагментов; 4) интеграция - включение фрагментов трансформирующей ДНК в ДНК клетки-реципиента путем генетического обмена; 5) экспрессия - интенсивное размножение трансформированных клеток, потомство которых будет иметь измененный ген в молекуле ДНК.
Трансдукция заключается в переносе генетического материала из клетки-донора в клетку-реципиент умеренным бактериофагом. Явление трансдукции в 1952 г. открыли Циндер и Ледерберг на примере двух штаммов сальмонелл. По механизму взаимодействия с бактериальной клеткой фаги подразделяются на вирулентные и умеренные. Вирулентные фаги, проникая в клетку, обусловливают формирование новых фагов и лизис бактерий. Заражение клеток умеренными фагами не всегда сопровождается лизисом бактерий, часть их выживает и становится лизогенными. В лизогенных бактериях ДНК фага включается в ДНК клетки и умеренный фаг превращается в профаг, утрачивая при этом способность лизировать бактериальную клетку. Профаг ведет себя как часть бактериальной хромосомы и репродуцируется в ее составе в течение ряда поколений. В процессе репродукции некоторых умеренных фагов небольшой фрагмент бактериальной хромосомы, содержащей один ген включается в геном фага. Трансдуцирующий фаг переносит фрагмент ДНК предыдущего хозяина в новую чувствительную к нему бактериальную, клетку. Таким образом бактериальная клетка-реципиент становится частичной зиготой.
У бактерий различают трансдукции: специализированную и общую. При специализированной трансдукции в геном фага включаются строго определенные гены ДНК бактерии-донора, расположенные на хромосоме бактерии непосредственно рядом с профагом. Прилегающие к профагу гены выщепляются из бактериальной хромосомы, а часть генов профага остается в ее составе. Освобождающиеся из клетки-донора трансдуцирующие дефектные фаги вызывают лизогенизацию клетки-реципиента. ДНК дефектного фага включается в состав хромосомы клетки-реципиента, привнося в нее и гены бактерии-донора. Общая трансдукция отличается от специализированной тем, что в состав ДНК фага включается любой фрагмент ДНК бактерии-донора. Таким образом, при общей трансдукции трансдуцирующие фаги переносят из хромосомы бактерии-донора любые гены, контролирующие различные признаки, в клетку бактерии-реципиента.
Трансдукция в эксперименте показана на кишечных бактериях, псевдомонадах, стафилококках, бациллах и актиномицетах. Трансдукция определяет появление разновидностей бактерий с новыми свойствами, устойчивость к лекарственным препаратам, синтез ферментов, аминокислот.
Конъюгация происходит при непосредственном контакте бактериальных клеток и предусматривает направленный перенос генетического материала из клетки-донора в клетку-реципиент. Феномен конъюгации в 1946 г. описали Ледерберг и Тейтум на примере кишечной палочки (Escherichia coli). Способность бактерий к конъюгации связана с наличием у них полового F-фактора, относящегося к числу конъюгативных плазмид. Клетки, несущие F-фактор, обозначаются F+; клетки, лишенные F-фактора, F-. F-фактор в клетках F+ обычно находится в изолированном состоянии от бактериальной хромосомы и является цитоплазматической структурой. Бактериальные клетки, содержащие F-фактор, отличаются от остальных клеток рядом свойств: измененным поверхностным зарядом и способностью синтезировать дополнительные поверхностные структуры F-пили. Процесс конъюгации начинается с прикрепления конца F-пили клетки-донора к клетке-реципиенту. В течение нескольких минут клетка-донор и клетка-реципиент сближаются и вступают в непосредственный контакт. Через цитоплазматический мостик происходит передача полового F-фактора, независимо от бактериальной хромосомы, из цитоплазмы клетки-донора F+ в цитоплазму клетки-реципиента F-. Среди популяции клеток F+ имеются бактерии, способные при конъюгации передавать не F-фактор, а фрагмент бактериальной хромосомы. Эти клетки бактерий обозначаются Hfr, что означает бактерии с высокой частотой рекомбинации. Рекомбинации между клетками Hfr и клетками F происходят в тысячу раз чаще, чем между клетками F+ и F-. Половой F-фактор у них включен в бактериальную хромосому. Во время конъюгации в клетке-доноре Hfr идет процесс репликации ДНК. При этом одна из реплицирующихся цепей ДНК через конъюгационный мостик проникает в клетку-реципиент F , вторая остается в клетке-доноре Hfr, затем каждая из этих цепей достраивается комплементарной нитью. Конъюгационный мостик непрочен, он легко разрывается, поэтому из клетки-донора Hfr в клетку-реципиент F- передается не вся хромосома, а лишь ее фрагмент. Между перенесенным из клетки Hfr фрагментом хромосомы и гомологичным участком хромосомы клетки F- происходит генетический обмен. В результате часть донорной ДНК встраивается в ДНК реципиента, а соответствующая часть реципиентной ДНК исключается из нее.
Наблюдается у кишечной палочки, шигеллы, сальмонеллы, ризобия, псевдомонаса.
Метод молекулярного клонирования. Вшивают в растение чужеродный ген. В качестве переносчика используют плазмиды. Их обрабатывают ферментом – рестректазой, которая разрезает по липким концам ДНК. На липких концах имеется фермент лигаза, которая соединяет фрагменты. Полученную плазмиду вводят в организм путем трансформации, при ее размножении образуется клон.
2. Вирусы: строение, взаимодействие с клеткой. Вирион и внутриклеточная вегетативная форма. Процесс лизогении. Значение вирусов. Фаги и явление фагии. Открытие фагов в 1915 г. Туором и в 1917 г. Эррелем. Умеренные фаги, лизогения. Гемипаразитизм.
Вирусы – внутриклеточные паразиты, в большинстве случаев вызывающие заболевания человека, животных, растений, микроорганизмов. Ивановский в 1892 г. открыл вирусы. В 1898 самостоятельно повторно открыл вирусы Беринг. 1898 – Гамалей открыл фаги. 1917 – Эррель открыл фаги повторно. Вирусы на питательных средах не растут, изучение шло теоритическим путем.. 1935 – Стеци получил вирус табачной мозайки в чистом кристаллическом виде. Вирусы поражают все группы органов. У человека 75% заболеваний – вирусы. Вирусы существуют в двух состояниях: 1) вирион – внеклеточная, когда вирус находится в состоянии покоя. 2) вегетативное – внутриклеточная активная форма, включает весь цикл репродукции вируса в клетке хозяина. Вирионы вирусов состоят из нуклеиновой кислоты и белковой оболочки. Последняя носит название капсида (футляр). Вирионы более сложноорганизованных вирусов на поверхности белкового капсида имеют дополнительную внешнюю оболочку - суперкапсид. Капсиды образован белками – капсогенами, уложенными строго определенным образом. Капсиды вирионов различных вирусов животных, растений и бактерий могут быть построены по одному плану, в основе которого лежит относительно простой геометрический принцип - спиральной или изометрической симметрии (спиральные и изометрические). Наиболее хорошо изученным вирусом, имеющим спиральный капсид, является вирус табачной мозаики. Капсид вируса табачной мозаики насчитывает 130 витков. Внутри капсида образуется полый канал диаметром 4 нм. Генетическим материалом вируса табачной мозаики является одноцепочечная РНК, плотно уложенная в желобке спирального капсида. Капсиды вирионов многих вирусов имеют форму симметричного многогранника, чаще всего икосаэдра - изометрические.
Нуклеиновая кислота вируса совмещает в себе функции обеих кислот - ДНК и РНК. Нуклеиновые кислоты вирусов отличаются крайним разнообразием. Вирусы содержат как обычные природные формы нуклеиновых кислот - двухцепочечную ДНК и одноцепочечную РНК, так и одноцепочечную ДНК и двухцепочечную РНК.
Суперкапсид вирусов представлен двойным слоем липидов, в который погружены молекулы специфических белков. Липиды суперкапсида, состоящие из нейтральных жиров, фосфолипидов, холестерина, сфингомиелина, имеют клеточное происхождение и вирусный геном не кодирует их синтез. Обычно суперкапсид вируса формируется путем модификации участков цитоплазматической мембраны клетки хозяина в момент сборки вириона и выхода его из клетки.
Репродукция вируса. Вирусы, в отличие от всех про- и эукариотных организмов, не способны размножаться бинарным делением. Размножение вирусов осуществляется путем репродукции их в клетке хозяина. Цикл репродукции можно подразделить стадии: I) стадия - хемосорбция вируса на поверхности клетки хозяина. Хемосорбция возможна лишь при условии, если клетка несет на своей поверхности чувствительные рецепторы, комплементарные рецепторам данного вируса. II) стадия - проникновение вируса в клетку хозяина. Пути проникновения могут быть различны. Многие проникают в клетку путем пиноцитоза. При пиноцитозе в районе хемосорбции вируса клеточная мембрана образует инвагинацию и заглатывает вирус. Некоторые вирусы проникают в клетку за счет слияния клеточных и вирусных мембран. В результате вирусная нуклеиновая кислота оказывается в цитоплазме клетки, а белковый капсид вируса остается на ее поверхности.
III) стадия - депротеинизация вируса. Процесс депротеинизации вируса предусматривает освобождение его нуклеиновой кислоты от белков капсида. Как только вирусная нуклеиновая кислота освобождается от белков капсида, наступает скрытый период - период эклипса, вирусная нуклеиновая кислота проходит по цитоплазме клетки в район ядра. IV) стадия - синтез компонентов вируса. Три этапа: Первый этап - подготовительный. Преследует две цели: подавить функционирование генетического аппарата клетки, прекратить синтез клеточных белков и нуклеиновых кислот, перевести белок-синтезирующий аппарат клетки под контроль генома вируса; подготовить условия для репликации нуклеиновой кислоты и синтеза белков капсида вируса. Второй этап - репликация нуклеиновой кислоты вируса. Третий этап - синтез белков капсида. Прекращается синтез своей ДНК белка, за их счет синтезируется белок фага. V) стадия - сборка вирионов, или морфогенез вируса. Как только содержание составных компонентов нуклеиновых кислот и белков вируса достигает в клетке определенного предела, начинается процесс сборки вирионов. Фаговая НК соединяется с белком капсида, образуется зрелый вирус. НК наполняет капсид и запечатывается. Сборка при t+25 градусов, а при +43 латируют. VI) стадия - выход вирусов из клетки. Этот процесс у разных вирусов осуществляется по-разному.
Фаг (бактериофаг, бактериальный вирус) - вирусы, хозяевами которых являются бактерии. Фаги обычно называют по наименованию основных бактериальных хозяев. Термин введен Эррелем в 1917 г. Бактериофаги - это вирусы, обладающие способностью проникать в бактериальные клетки, репродуктироваться в них и вызывать их лизис. Фаги широко распространены в природе - в воде, почве, сточных водах, в кишечнике животных, человека, птиц, в раковых опухолях растений. Структура и морфология фагов: большинство фагов состоит из головки, воротничка и хвостового отростка, заканчивающегося базальной пластинкой, к которой прикреплены фибриллы. Содержание головки - это ДНК (иногда РНК). Хвостовой отросток имеет цилиндрический стержень, окруженный сократительным чехлом. В оболочку фаговой частицы и отросток входит белок, состоящий из полиаминов: спермин, путресцин, кислоторастворимый пептид.
Фаги более устойчивы во внешней среде, чем бактерии. Выдерживают давление до 6000 атм., устойчивы к действию радиации. Некоторые вещества, например, хлороформ и ферментативные яды (цианид, флорид), не оказывают влияния на фаги, но вызывают гибель бактерий. Однако фаги быстро погибают при кипячении, действии кислот, УФ-лучей.
Фаги обладают строгой специфичностью, т. е. способны паразитировать только в определенном виде микроорганизмов: стрептококках, стафилококках. По механизму взаимодействия с клетками фаги подразделяются на вирулентные и умеренные.
Феномен бактериофагии, вызываемый вирулентными фагами, проходит в 5 фаз: 1) адсорбция - с помощью нитей хвостового отростка; 2) проникновение в клетку; 3) репродукция белка и нуклеиновой кислоты внутри клетки; 4) сборка и формирование зрелых фагов; 5) лизис клетки, выход фага из нее.
Умеренные фаги не лизируют все клетки, а с некоторыми вступают в симбиоз. Клетка выживает. Умеренный фаг превращается в профаг, который не обладает литическим действием.
Лизогения (от греч. lysis - растворение - способность фага вызывать лизис бактерий) - явление, характеризующееся постоянной связью между геномами фага и бактериальной клетки. Фаги вызывающие лизис клетка – вирулентные, которые заражают клетку хозяина, но не размножаются (не вызывают лизиса клетки) – умеренные.
3. Участие микроорганизмов в биологическом круговороте азота (азотфиксация, нитрификация, аммонификация, денитрификация). Азотобактер, цианобактории, азомонас, клостридиум, клебсиелла и другие микроорганизмы. Nif -гены азотфиксации.
В чем отличие анаэробного дыхания от аэробного?
Нитрификация - процесс окисления аммиака до нитритов и нитратов. Осуществляют этот процесс нитрифицирующие бактерии в строго аэробных условиях. Аммиак, образующийся в процессе аммонификации в почве и воде, сравнительно быстро окисляется нитрифицирующими бактериями до нитритов и нитратов. О микробиологической природе процесса нитрификации впервые высказал предположение Л. Пастер. Позднее, в 1890-1892 гг., С. Н. Виноградский выделил нитрифицирующие бактерии в чистую культуру и показал, что процесс нитрификации протекает в две фазы.
1) окисление аммиака или солей аммония до нитритов - ведут нитрозные бактерии, относящиеся к родам Nitrosomonas, Nitrosococcus, Nitrosolobus: NH4+ + 1 '/2 O2 -> NO2 + H2O + 2H. На первом этапе аммиак окисляется до гидроксиламина при участии фермента монооксигеназы, катализирующей присоединение к молекуле аммиака одного атома кислорода: NH3 + О2 + НАД*Н2 -> NH2OH + Н2О + НАД+
Далее гидроксиламин под действием фермента гидроксила-миноксидоредуктазы окисляется до нитрита через промежуточный продукт - нитроксил.
Энергия, освобожденная в реакциях окисления и аккумулированная клеткой в АТФ, расходуется для фиксации СО2 и других биосинтетических процессов. Q=+274 кДж.
Вторую фазу нитрификации - окисление нитритов в нитраты - осуществляют нитратные бактерии родов Nitrobacter, Nitrospina, Nitrococcus: NO2 + '/2 О2 -> NO3
Аммонификация – процесс разложения м.о. белка и др. азотсодержащих органических соединений до аммиака. Белки состоят из а/к, они разрушаются до протеинов, затем протеазами до а/к.
Денитрификация - процесс восстановления нитритов и нитратов денитрифицирующими бактериями до свободного азота. Этот процесс вреден для сельского хозяйства, так как приводит к частичному выносу (приблизительно 20%) азота из почвы.
Следует различать денитрификацию прямую и косвенную. Под прямой понимают биологическое восстановление нитратов и нитритов, осуществляемое микроорганизмами. Косвенная - это чисто химический процесс взаимодействия нитритов с аминокислотами, в результате которого образуется молекулярный азот. В природе более распространена прямая денитрификация. Она подразделяется на ассимиляционную и диссимиляционную. При ассимиляционной нитраты потребляются в качестве источника азота и восстанавливаются до аммиака, который расходуется клеткой в процессе биосинтеза. В процессе диссимиляционной денитрификации нитраты и нитриты выступают в роли акцепторов электронов в реакциях катаболизма денитрифицирующих бактерий. Диссимиляционную денитрификацию ведут хемоорганогетеротрофные бактерии, относящиеся к родам Pseudomonas, Bacillus, Corynebacterium.
В зависимости от вида микроорганизма, ведущего процесс, конечными продуктами восстановления нитратов являются молекулярный азот, оксид азота (I) или оксид азота (II). Процесс денитрификации состоит из 4 восстановительных стадий, каждая из которых катализируется соответствующей нитратредуктазой. На первой стадии восстановление нитратов в нитриты: NO3 + 2е + 2Н -> NO2 + Н2О. Далее нитриты восстанавливаются до оксида азота (II), затем до оксида азота (I)и в конечном итоге до молекулярного азота: NO2 + e + Н+ -> NO + ОН; 2NO + 2е + 2Н -> N2O + Н2О; N2O + 2е + 2Н -> N2 + Н2О.
Помимо хемоорганогетеротрофных бактерий, диссимиляционную денитрификацию способны вести и некоторые хемолитоавтотрофные бактерии: Thiobacillus denitrifleans и Paracoccus denitrificans. В анаэробных условиях они получают энергию в процессе окисления серы, восстанавливая при этом нитраты до молекулярного азота: 5S + 6KNO3 + 2Н2О = 3N2 + K2SO4 + 4KHSO4
По способности усваивать азот микроорганизмы делятся на 2 группы: аминоавтотрофы и амоногетеротрофы. Аминоавтотрофы - для синтеза белка клетки используют молекулярный азот воздуха или усваивают его из аммонийных солей. Аминогетеротрофы - получают азот из органических соединений - аминокислот, сложных белков. Сюда относятся все патогенные микроорганизмы и большинство сапрофитов.
4. Фототрофия и хемотрофия. Характеристика автотрофного и гетеротрофного типов питания. Открытие хемосинтеза Виноградским. Хемоорганотрофные и фотолитоавтотрофные бактерии: краткая характеристика процессов, основные представители, участие в биологическом круговороте веществ. Сапрофиты, комменсалы и паразиты.
По источнику углерода прокариоты являются автотрофами, если они получают углерод в результате фиксации углекислого газа, и гетеротрофами, если источником углерода для них служат органические соединения. По источнику энергии прокариоты, использующие солнечный свет, называются фототрофами, а получающие энергию за счет окислительно-восстановительных реакций - хемотрофами.
По донору электронов прокариоты подразделяются на литотрофы, обладающие способностью использовать неорганические доноры электронов (Н2, NH3, H2S, Fe2+, CO), и органотрофы, использующие в качестве доноров электронов органические соединения.
По трем вышеуказанным критериям выделяют 4 основных типа питания прокариот:
1. Фотолитоавтотрофы – Источник углерода - СО2 , источник энергии – свет. Донор электронов - Н2О, неорг. соед. серы. Представители – Цианобактерии, зеленые, серные пурпурные бактерии. В основе процесса бактериального фотосинтеза лежит превращение световой энергии, поглощаемой фотосинтетическими пигментами, в биохимическую энергию макроэргических связей (АТФ) и далее использование этой энергии для усвоения и восстановления углекислого газа в процессе биосинтеза. В клетках всех фотосинтезирующих бактерий содержатся фотосинтетические пигменты. К ним относятся особые хлорофиллы, получившие название бактериохлорофиллов а, b, с, d, и каротиноиды. По строению бактериохлорофиллы близки к хлорофиллу а растений. Помимо бактериохлорофиллов в клетках фотосинтезирующих бактерий открыты более 20 дополнительных каротиноидных пигментов. Это пигменты серии спириллоксантинов, такие, как родопин, дигидродопин, родовибрин. В процессе фотосинтеза зеленых и пурпурных бактерий в качестве доноров электронов выступают различные соединения: сероводород, элементарная сера, сульфит, тиосульфат, молекулярный водород и органические вещества. Кислород при фотосинтезе зеленых и пурпурных бактерий не выделяется. Они являются облигатными анаэробами. Для восстановления одной молекулы углекислого газа зеленые и пурпурные бактерии затрачивают один квант энергии. СО2+2H2S->СН2О+2S+Н2О.
2. Фотоорганоавтотрофы - СО2 и орг. соед. Свет. Донор e - Органические соединения (спирты, органические кислоты). Представители - Некоторые пурпурные бактерии.
3. Хемолитоавтотрофы - СО2 , энергию получают при окислении неорганических веществ (Н2, H2S, NH3, Fe2+). Представители - Нитрифицирующие, тионовые, водородные бактерии; ацидофильные железобактерии. В корневищах растений, главным образом, бобовых, живут особые клубеньковые бактерии. Они способны усваивать недоступный растениям атмосферный азот и обогащать почву аммиаком. Нитрифицирующие бактерии окисляют аммиак клубеньковых бактерий до азотистой кислоты и далее - азотистую до азотной. В результате растения получают соли азотной кислоты, необходимые для синтеза аминокислот и азотистых оснований.
4. Хемоорганогетеротрофы – энергия из окисления орг. соед. Донор электронов – органические соединения. Большинство бактерий (аммопификаторы, азотфиксаторы, пектино-разрушающие, клетчат-коразрушающие, молочнокислые, уксуснокислые, маслянокислые). Поступление питательных веществ в клетку: а) диффузия, пассивная – под действием разной концентрации, облегченная – осуществляется белками-переносчиками (пермеазы) б) активный транспорт – клетка затрачивает энергию, переносят против градиента концентрации. К ним относится большинство прокариот. Источником углерода для них являются самые разнообразные органические соединения. Энергию для жизнедеятельности они получают за счет окислительно-восстановительных реакций органического субстрата, и донором электронов в реакциях метаболизма также выступают различные органические вещества. Хемоорганогетеротрофы наиболее широко распространены в природе. Им принадлежит роль санитаров нашей планеты, так как они ведут процессы минерализации самых разнообразных, подчас сложных органических веществ. Хемоорганогетеротрофные микроорганизмы подразделяют на сапрофитов и паразитов. Сапрофиты потребляют органические вещества опада. Паразиты живут за счет органических веществ живой клетки.