Добавил:
kiopkiopkiop18@yandex.ru Вовсе не секретарь, но почту проверяю Опубликованный материал нарушает ваши авторские права? Сообщите нам.
Вуз: Предмет: Файл:

6 курс / Клинические и лабораторные анализы / Лабораторная_диагностика_туберкулеза_Ерохин_В_В_ред_

.pdf
Скачиваний:
3
Добавлен:
24.03.2024
Размер:
6.25 Mб
Скачать

МЕТОДИЧЕСКИЕ РЕКОМЕНДАЦИИ

вании и закрывании дверей комнаты, при неудачном распределении поступающего в помещение воздуха. В связи с этим, место установки ШББ должно быть отдаленно от входа в рабочую комнату, располагаться в стороне от проходов (движение воздуха от проходящих мимо людей может нарушать «воздушный замок» в ШБб). Этот «замок» весьма подвижный, в связи с чем, открытые окна или оборудование, создающее движение воздуха (к примеру, двигатели, охлаждающие центрифуги и морозильные камеры), не следует располагать вблизи ШББ.

Следует придерживаться правил работы со шкафами биологической безопасности I и II классов определяют следующий минимум практических рекомендаций.

Вытяжные шкафы специализированные

Основным назначением вытяжного шкафа (ВШ) является его механическая способность к устранению вредных испарений непосредственно с настольной (рабочей) зоны, на которой проводятся лабораторные процедуры, включающие использование вредных веществ. В БЛ ПТУ к таким относятся фенол, неорганические кислоты, красители. Вытяжной шкаф не позволяет вредным, химическим соединениям распространяться в помещениях. В вытяжных шкафах производится окраска препаратов для микроскопии и их подсушивание после окрашивания, а также другие манипуляции, например, приготовление реактивов.

Скорость потока воздуха в вытяжных шкафах не нормируется по параметрам биологической безопасности и ламинарности движения. В связи с этим, использование вытяжных шкафов вместо ШББ категорически недопустимо, так как ВШ не обеспечивают своевременное удаление инфекционных аэрозолей и способствуют кросс-контаминации исследуемых образцов.

Включение и работа ВШ не должны нарушать работы других вентиляционных систем лаборатории. Для корректной работы всех вентиляционных систем помещений предпочтительно использовать ВШ, в которых предусмотрен клапан обратного тока воздуха, который перекрывает воздуховод при выключении шкафа и исключает перетоки воздуха между другими системами локальной вентиляции и помещениями.

Вытяжные зонты

В БЛ допускается над ШББ, центрифугами и другими особо опасными зонами устройство вытяжных зонтов (колпаков), которые предназначены для активного удаления воздуха из района рабочей зоны.

138

Вентиляционный воздуховод, к которому подключено ОЛК, должен быть оснащен фильтрами тонкой очистки, предотвращающими выброс инфекционного аэрозоля наружу, а также предохранительным клапаном, обеспечивающим запирание обратного тока воздуха в момент выключения оборудования. Линейная скорость потока воздуха на входе в пространство таких устройств обычно составляет не менее 0,3–1 м/сек.

Адекватное использование поверенного оборудования – шкафов биологической безопасности, вытяжных шкафов, а также другого оборудования локального контроля воздуха, позволяет контролировать движение аэрозолей внутри замкнутых объемов и исключает (или значительно снижает) риск их распространения.

Санитарно-гигиенические и дезинфекционные мероприятия в лаборатории

Меры контроля внутрилабораторной среды включают обеззараживание поверхностей в помещениях, оборудования, аппаратуры и других объектов в лаборатории с помощью химической дезинфекции и технических устройств. Основные правила проведения данных мероприятий сводятся к следующему:

в лаборатории следует использовать дезинфицирующие сред-

 

 

ства с учетом их туберкулоцидной активности, объема, физико-

 

 

химических свойств дезинфицируемых материалов и режима

 

 

применения в соответствии с инструкцией по применению вы-

 

 

бранного ДС (более подробная информация представлена в

 

 

р.3.4.);

 

методы и средства обеззараживания определяются в каждом

 

 

конкретном случае в зависимости от вида ПБА и характера

 

 

обеззараживаемого материала;

 

• все поверхности, лабораторное оборудование и другие объекты

 

 

в «заразной» зоне лаборатории должны рассматриваться как по-

материалы

 

тенциально инфицированные и подвергаться регулярной дез-

 

 

 

инфекции с использованием средств, обладающих туберкуло-

 

 

цидным действием;

 

• полы лаборатории не следует натирать или подметать. Во избе-

Лекционные

 

инженерных устройств (на основе электромагнитных, электро-

 

жание образования пыли в лаборатории следует регулярно про-

 

 

изводить только влажную уборку;

 

дезинфекция воздуха и поверхностей помещений с помощью

 

 

статических фильтров, ультрафиолетового излучения и т.д.)

1.

 

РАЗДЕЛ

 

должна проводиться по завершении влажной уборки и высыха-

 

 

 

ния поверхностей в помещениях;

 

139

МЕТОДИЧЕСКИЕ РЕКОМЕНДАЦИИ

по окончании работы, все объекты, содержащие ПБА, должны быть помещены в хранилища (термостаты, холодильники, шкафы и пр.);

контаминированные микобактериями отработанные материалы, лабораторную посуду, твердые отходы и пр. из «заразной» зоны помещают в специальные упаковочные мешки для автоклавирования, биксы или металлические баки с крышками и подвергают автоклавированию (126°С – 60 мин) или дезинфицируют химическими средствами на местах;

жидкие отходы перед сбросом в канализационную систему подлежат обязательному химическому или термическому обеззараживанию;

руки следует мыть специальным бактерицидным мылом или обработать кожным антисептиком сразу после работы с потенциально инфицированной лабораторной посудой, после всех микробиологических процедур, снятия защитной одежды, а также перед тем, как покинуть помещение лаборатории. Для вытирания рук после мытья следует пользоваться одноразовыми бумажными полотенцами. Запрещается использовать «воздушные полотенца»;

одежду персонала (халаты, шапочки) замачивают в растворе дезинфицирующего средства, и после экспозиции стирают, прополаскивают, высушивают. Возможно обеззараживание одежды в процессе стирки в стиральных машинах при использовании в них высокой температуры или дезинфицирующего средства, разрешенного для этих целей, или автоклавирование;

в рабочих помещениях лаборатории запрещается принимать пищу, пить, курить, применять косметические средства.

Заключительная часть (5 мин)

Следует подчеркнуть, что эффективная работа инженерных мер защиты и дезинфекционных мероприятий может быть достигнута лишь при правильном выполнении всех предписаний сотрудниками лаборатории. Система вентиляции воздуха в рабочих помещениях должна предотвращать распространение инфекционного аэрозоля за пределы помещения при любых режимах работы.

Рекомендуемая литература

1.Приказ МЗ РФ № 109 от 21 марта 2003 г. «О совершенствовании противотуберкулезных мероприятий в Российской Федерации.

140

2.Приказ МЗСР РФ от 29.12.2010 г. №1224н «Об утверждении Порядка оказания медицинской помощи больным туберкулезом в Российской Федерации».

3.СП 1.3.232-08 «Безопасность работы с микроорганизмами III– IV групп патогенности (опасности) и возбудителями паразитарных болезней».

4.СП 1.3.2518-09 «Безопасность работы с микроорганизмами III– IV групп патогенности (опасности) и возбудителями паразитарных болезней дополнения и изменения № 1 к СП 1.3.2322-08»

5.СП 3.1.1295-03 «Профилактика туберкулеза» от 25 июня 2003 года

6.СП 3.1.1275-03 «Профилактика инфекционных заболеваний при эндоскопических манипуляциях» М.2003г;

7.СанПиН 2.1.7.727-99 «Правила сбора, хранения и удаления отходов лечебно-профилактических учреждений». – М., 1999.

8.СанПиН 2.1.3.2630-10 «Санитарно-эпидемиологические требования к организациям, осуществляющим медицинскую деятельность». – М., 2010 г.

Материально-техническое обеспечение

Мультимедийная или проекционная демонстрационные системы, экран, лазерная указка; набор тематических слайдов.

РАЗДЕЛ 1. Лекционные материалы

141

МЕТОДИЧЕСКИЕ РЕКОМЕНДАЦИИ

МОДУЛЬ 7. Гены микобактерий и микобактерий туберкулезного комплекса

Тема 7.1. «Введение. Актуальность использования молекулярногенетических методов исследования во фтизиатрии»

Количество аудиторных часов – 1

Примерный план лекции

Основные вопросы, освещаемые в лекции:

Особенности эпидемиологических показателей по туберкулезу в РФ на современном этапе, проблема повышения выявления ЛУ МБТ;

Сокращение сроков микробиологической диагностики туберкулеза;

Совершенствование идентификации микобактерий до вида и штамма.

Вводная часть (5–10 минут)

Туберкулез в Российской Федерации представляет собой большую медико-социальную проблему. Статистический анализ заболеваемости ТБ в 2011 г. выявил 73 новых случая заболевания туберкулезом на 100 000 населения. Смертность от ТБ была зафиксирована у 14,2 на 100 000 населения.

В условиях напряженной эпидемиологической ситуации по туберкулезу в РФ особенно остро стоит проблема модернизации фтизиатрии, которая должна быть направлена на повышение эффективности лечения туберкулеза, совершенствование эпидемиологических исследований и изучение биологических свойств эпидемически значимых групп МБТ.

Основная часть (30 мин)

Использование молекулярных методов позволило по-новому взглянуть на эпидемиологию туберкулеза и оценить генетическое разнообразие штаммов микобактерий, циркулирующих в РФ. Применение методов молекулярной эпидемиологии дало возможность описать штаммы, преимущественно циркулирующие в данной местности, определить пути их передачи и проводить эпидемиологические расследования в клинической практике.

Повышение эффективности лечения основано на ускорении постановки диагноза и своевременной коррекции схем химиотерапии.

Наиболее быстрый классический метод выявления МБТ – микроскопия, позволяет в течение 1–2 дней выявить МБТ в мазке мокроты, однако с крайне низкой чувствительностью. Более чувствительные культуральные исследования на плотных питатель-

142

ных средах занимают от 3–10 недель, после чего проводится постановка тестов на лекарственную чувствительность, которые длятся еще 3–4 недели. В целом весь процесс диагностики ТБ с определением лекарственной чувствительности занимает от 6 до

14недель.

Внастоящее время в лабораторной практике все более широкое применение находят молекулярно-генетические методы, которые позволяют сокращать сроки выявления возбудителя, видовой идентификации микобактерий и определения лекарственной чувствительности.

Для выявления возбудителя широко используется метод ПЦР, основанный на выявлении в геноме микобактерий видоспецифических последовательностей. Метод зарекомендовал себя как высоко специфичный и чувствительный. Предпочтительными являются тест-системы с детекцией результата в режиме реального времени. Получение положительного результата методом ПЦР позволяет в течение 1–2 дней установить наличие МБТ в диагностическом материале. Внедрение ПЦР позволило значительно сократить сроки подтверждения диагноза туберкулеза. Получение положительного результата методом ПЦР не требует дополнительной дифференциации МБТК от НТМБ, т.к. положительный результат однозначно указывает на принадлежность к МБТК. ДНК, выделенная из диагностического материала и использованная для проведения ПЦР, может быть использована для установления ЛУ существующими молекулярно-генетическими тест-системами.

Определение лекарственной чувствительности

ТБ с МЛУ представляет собой сложнейшую проблему с точки зрения борьбы с туберкулезом. В РФ наблюдается крайне высокий уровень распространения штаммов с МЛУ с его неуклонным нарастанием. В 2011 году отмечено 15,5% случаев МЛУ туберкулеза среди новых случаев заболевания туберкулезом, и 34,2% среди ранее леченых.

Вызывающая тревогу динамика роста МЛУ-ТБ, появление туберкулеза с широкой лекарственной устойчивостью (ШЛУ-Тб), потенциальная передача инфекции внутри лечебных учреждений и резкий подъем смертности среди ВИЧ-инфицированных больных с МЛУ-ТБ и ШЛУ-ТБ – все эти обстоятельства привели к неотложной необходимости приступить к внедрению экспресс-ме- тодов скрининга.

Традиционные методы культуральных исследований в области микобактериологии и определения лекарственной чувствительности занимают много времени и трудоемки, требуют соблюдения определенной последовательности процедур для выделения мико-

РАЗДЕЛ 1. Лекционные материалы

143

МЕТОДИЧЕСКИЕ РЕКОМЕНДАЦИИ

бактерий из клинического материала и связаны с идентификацией микобактерий комплекса M.tuberculosis.

За это время пациенты могут проходить неадекватный курс лечения, может продолжаться циркуляция лекарственно-устойчи- вых штаммов и происходить усиление резистентности. Новые технологии для быстрого выявления устойчивости к ПТП стали, таким образом, одной из приоритетных задач в области научных исследований и разработок по проблеме ТБ, и в этом плане наиболее продвинутыми для ускоренного обнаружения устойчивости к рифампицину (только к нему или в сочетании с изониазидом) оказались молекулярно-генетические методы.

Основным достоинством всех молекулярно-генетических методов тестирования ЛУ МБТ является быстрота получения результатов и оперативное выявление больных МЛУ-туберкулезом, так как все указанные тест-системы позволяют выявить ЛУ к рифампицину, которая считается маркером МЛУ. Генотипические методы имеют много важных преимуществ для совершенствования контроля за лекарственно-устойчивым ТБ, особенно в том, что касается скорости получения результата, стандартизации тестов, возможности для высокой производительности и сниженной необходимости в соблюдении биобезопасности. Конечной целью выполнения молекулярных анализов является быстрая первичная идентификация МЛУ ТБ.

Применение молекулярно-генетических тест-систем позволяет проводить определение лекарственной чувствительности МБТ непосредственно из диагностического материала. В этом случае получение результата о наличии у больного МЛУ ТБ возможно через 1–2 дня после поступления материала.

Молекулярно-генетические тест-системы на определение ЛУ представлены четырьмя основными вариантами: биологические микрочипы, ПЦР в режиме реального времени, ДНК-стриповая технология, набор Xpert MTB/RIF.

Наличие ПЦР тест-систем, определяющих в течение 1–2 дней устойчивость к основным ПТП, позволяет разделить потоки больных с МЛУ и не-МЛУ туберкулезом, направить их в МЛУ-центр, где имеется возможность изоляции больного и назначения химиотерапии резервными препаратами.

Определить устойчивость к изониазиду и рифампицину позволяют как отечественные тест-системы "ТБ-биочип" (ООО «БИОЧИП», Россия), в основе которой лежит технология биологических микрочипов, набор реагентов для проведения ПЦР в режиме реального времени (ЗАО "Синтол"), так и зарубежные, такие как

144

набор GenoType® MTBDRplus (HAIN Lifescience, Германия), представляющий собой ДНК-стриповую технологию, основанную на множественной обратной гибридизации (позволяет определять ЛУ МБТ к рифампицину и изониазиду).

Отдельно стоит упомянуть тест, выполняемый с помощью набора реагентов Xpert MTB/RIF на анализаторе GeneXpert, который позволяет в течение 2–3 часов выявить наличие в мокроте МБТ и определить их устойчивость к рифампицину. Использование этой системы позволяет непосредственно из нативной мокроты в очень короткие сроки, в один этап выявлять возбудителя, определять принадлежность к МБТК и определять лекарственную чувствительность (к рифампицину). Чувствительность метода как по выявлению, так и по установлению лекарственной чувствительности не уступает системе BACTEC MGIT960 и культуральным исследованиям на плотных питательных средах.

Для установления ЛЧ молекулярно-генетическими методами

кболее широкому спектру препаратов применяются тест-системы "ТБ-биочип-2" (ООО "Биочип"), позволяющую определять на микрочипе чувствительность к фторхинолонам, и "GenoType® MTBDRsl" (HAIN Lifescience, Германия), основанную на технологии ДНК-стрипов и позволяющую определять устойчивость к фторхинолонам, этамбутолу, аминогликозидам.

Последний, несмотря на довольно низкую чувствительность при установлении устойчивости к этамбутолу и аминогликозидам / капреомицину, позволяет получать ориентировочные сведения о чувствительности МБТ и является на сегодняшний день тест-си- стемой, позволяющей проводить одновременное тестирование ЛУ

кнаибольшему числу ПТП.

Однако, применение молекулярно-генетических методов в настоящее время не устраняет необходимости проведения традиционных культуральных методов, т.к. иногда в диагностическом материале оказывается недостаточное количество МБТ. Поэтому определение ЛУ возможно после культивирования на питательных средах. Кроме того, современные молекулярно-генетические методы определения ЛУ охватывают гораздо меньший спектр ПТП, чем культуральные методы.

При росте числа больных, инфицированных НТМБ, большое значение имеют молекулярно-генетические тест-системы для видовой идентификации микобактерий. В случае ускоренной диагностики туберкулеза видовая идентификация является актуальной для быстрых культуральных методов, таких, как ВАСТЕС MGIT 960. Нетуберкулезные микобактерии резистентны к большинству

РАЗДЕЛ 1. Лекционные материалы

145

 

противотуберкулезных препаратов. Видовая идентификация ми-

 

 

кобактерий позволяет дифференцировать микобактериозы и

 

МЛУ/ШЛУ туберкулез.

 

Молекулярные методы дифференциации МБТ от НТМБ осно-

 

ваны на выявлении видоспецифических структур в геноме или

 

белковом спектре возбудителя. Ряд методов направлен только на

 

то, чтобы дифференцировать МБТ от НТМБ, ряд – пригоден для

 

точной видовой идентификации возбудителя.

 

К методам, дифференцирующим МБТ от НТМБ, относятся

 

ПЦР IS6110, выявляющая вставочную последовательность, при-

 

сутствующую только у микобактерий туберкулезного комплекса.

 

Особенно удобен для точной идентификации МБТ быстрый

 

иммунохроматографический метод (TBc ID-test, Becton Dickin-

 

son), который отличается простотой выполнения и обеспечивает

 

идентификацию за 15–20 минут. Тест основан на обнаружении

 

фракции микобактериального белка MPT64, которая выделяется

 

из клеток МБТ в процессе культивирования.

 

В случае получения отрицательного результата на МБТ, пред-

 

полагается наличие НТМБ, и проводится точная видовая иденти-

 

фикация. Кроме того, точная видовая идентификация может быть

 

рекомендована при получении отрицательного результата ПЦР

 

при выявлении возбудителя в диагностическом материале. В этом

 

случае работа ведется с диагностическим материалом.

 

К методикам, обеспечивающим точную видовую идентифика-

 

цию НТМБ, относится ДНК-стриповая технология (Hain Life-

 

science), включающая два вида тестов:

 

– GenoType® Mycobacterium CM позволяет идентифицировать

 

следующие виды микобактерий: M.avium ssp., M.chelonae, M.absces-

 

sus, M.fortuitum, M.gordonae, M.intracellulare, M.scrofulaceum, M.inter-

 

jectum, M.kansasii, M.malmoense, M.peregrinum, M.marinum, M.ulcer-

 

ans, M.xenopi и M.tuberculosis complex.

РЕКОМЕНДАЦИИ

– GenoType® Mycobacterium AS, который позволяет идентифи-

Этим методом можно исследовать культуры с плотной и жидкой

 

цировать M.simiae, M.mucogenicum, M.goodii, M.celatum, M.smegmatis,

 

M.genavense, M.lentiflavum, M.heckeshornense, M.szulgai, M.inter-

 

medium, M.phlei, M.haemophilum, M.kansasii, M.ulcerans, M.gastri,

МЕТОДИЧЕСКИЕ

M.asiaticum и M.shimoidei.

питательной среды, а также работать непосредственно с диагности-

 

 

ческим материалом (в случае получения отрицательного результата

 

ПЦР на выявление МБТ), и получить результат в течение 1–2 дней.

 

Также идентификация микобактерий до вида может прово-

 

диться с помощью MALDI-ToF масс-спектрометрии, позволяю-

 

 

 

146

щей получить белковые спектры, которые являются уникальными

 

для каждого вида микобактерий. Однако, этот метод широко не

 

распространен, поскольку требует дорогостоящего оборудования

 

и высокой квалификации персонала, и пригоден только для ра-

 

боты с чистой культурой.

 

 

 

 

В целом, для ускоренной лабораторной диагностики туберку-

 

леза рекомендуется следующая схема обследования (рис. 1). При-

 

менение данной схемы исследования сокращает сроки выявления

 

возбудителя, видовой идентификации и определения лекарствен-

 

ной чувствительности микобактерий, приводя к ускорению поста-

 

новки диагноза и своевременному назначению адекватных схем

 

химиотерапии, что, в свою очередь, повышает эффективность

 

лечения туберкулеза.

 

 

 

 

Алгоритм молекулярной диагностики туберкулеза и микобактериозов

 

 

Диагностический материал

GenoType® Mycobacteria Direct

 

ТБ-биочип

Рост на Bactec MGIT 960

Mycobacterium avium complex

 

 

M.malmoense

 

 

 

 

 

 

M.kansaasii

 

 

 

 

 

 

M.tuberculosis complex

 

GenoType® MTBDRplus

Идентификация

 

 

 

 

 

 

 

 

GenoType® MTBDRsl

 

 

 

 

 

Мазок по Цилю-Нильсену

 

ПЦР IS6110, ТBс ID

 

 

+

МТК

+

 

 

 

GenoType® Mycobacteria CM/AS

 

 

 

 

Масс-спектрометрия

 

 

 

Идентификация клинически значимых и дополнительных

 

 

 

нетуберкулезных микобактерий

 

 

 

 

Определение ЛЧ НТМ (Margellan Biosciences)

 

материалы

Рис. 1. Алгоритм проведения ускоренной диагностики туберкулеза и микобактериозов

 

 

 

 

 

 

Заключительная часть (5 мин)

 

 

 

Лекционные

Подводя итог, обращается внимание слушателей на то, что ука-

занная стратегия лабораторных исследований позволяет при

поступлении больного в стационар в короткие сроки определять

лекарственную устойчивость микобактерий, выявлять нетуберку-

1.

РАЗДЕЛ

лезные микобактерии и назначать адекватный режим химиотера-

пии, что сокращает сроки абациллирования (показано прекраще-

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

147