6 курс / Клинические и лабораторные анализы / Лабораторная_диагностика_туберкулеза_Ерохин_В_В_ред_
.pdfМЕТОДИЧЕСКИЕ РЕКОМЕНДАЦИИ
вании и закрывании дверей комнаты, при неудачном распределении поступающего в помещение воздуха. В связи с этим, место установки ШББ должно быть отдаленно от входа в рабочую комнату, располагаться в стороне от проходов (движение воздуха от проходящих мимо людей может нарушать «воздушный замок» в ШБб). Этот «замок» весьма подвижный, в связи с чем, открытые окна или оборудование, создающее движение воздуха (к примеру, двигатели, охлаждающие центрифуги и морозильные камеры), не следует располагать вблизи ШББ.
Следует придерживаться правил работы со шкафами биологической безопасности I и II классов определяют следующий минимум практических рекомендаций.
Вытяжные шкафы специализированные
Основным назначением вытяжного шкафа (ВШ) является его механическая способность к устранению вредных испарений непосредственно с настольной (рабочей) зоны, на которой проводятся лабораторные процедуры, включающие использование вредных веществ. В БЛ ПТУ к таким относятся фенол, неорганические кислоты, красители. Вытяжной шкаф не позволяет вредным, химическим соединениям распространяться в помещениях. В вытяжных шкафах производится окраска препаратов для микроскопии и их подсушивание после окрашивания, а также другие манипуляции, например, приготовление реактивов.
Скорость потока воздуха в вытяжных шкафах не нормируется по параметрам биологической безопасности и ламинарности движения. В связи с этим, использование вытяжных шкафов вместо ШББ категорически недопустимо, так как ВШ не обеспечивают своевременное удаление инфекционных аэрозолей и способствуют кросс-контаминации исследуемых образцов.
Включение и работа ВШ не должны нарушать работы других вентиляционных систем лаборатории. Для корректной работы всех вентиляционных систем помещений предпочтительно использовать ВШ, в которых предусмотрен клапан обратного тока воздуха, который перекрывает воздуховод при выключении шкафа и исключает перетоки воздуха между другими системами локальной вентиляции и помещениями.
Вытяжные зонты
В БЛ допускается над ШББ, центрифугами и другими особо опасными зонами устройство вытяжных зонтов (колпаков), которые предназначены для активного удаления воздуха из района рабочей зоны.
138
Вентиляционный воздуховод, к которому подключено ОЛК, должен быть оснащен фильтрами тонкой очистки, предотвращающими выброс инфекционного аэрозоля наружу, а также предохранительным клапаном, обеспечивающим запирание обратного тока воздуха в момент выключения оборудования. Линейная скорость потока воздуха на входе в пространство таких устройств обычно составляет не менее 0,3–1 м/сек.
Адекватное использование поверенного оборудования – шкафов биологической безопасности, вытяжных шкафов, а также другого оборудования локального контроля воздуха, позволяет контролировать движение аэрозолей внутри замкнутых объемов и исключает (или значительно снижает) риск их распространения.
Санитарно-гигиенические и дезинфекционные мероприятия в лаборатории
Меры контроля внутрилабораторной среды включают обеззараживание поверхностей в помещениях, оборудования, аппаратуры и других объектов в лаборатории с помощью химической дезинфекции и технических устройств. Основные правила проведения данных мероприятий сводятся к следующему:
• |
в лаборатории следует использовать дезинфицирующие сред- |
|
|
ства с учетом их туберкулоцидной активности, объема, физико- |
|
|
химических свойств дезинфицируемых материалов и режима |
|
|
применения в соответствии с инструкцией по применению вы- |
|
|
бранного ДС (более подробная информация представлена в |
|
|
р.3.4.); |
|
• |
методы и средства обеззараживания определяются в каждом |
|
|
конкретном случае в зависимости от вида ПБА и характера |
|
|
обеззараживаемого материала; |
|
• все поверхности, лабораторное оборудование и другие объекты |
|
|
|
в «заразной» зоне лаборатории должны рассматриваться как по- |
материалы |
|
тенциально инфицированные и подвергаться регулярной дез- |
|
|
|
|
|
инфекции с использованием средств, обладающих туберкуло- |
|
|
цидным действием; |
|
• полы лаборатории не следует натирать или подметать. Во избе- |
Лекционные |
|
|
инженерных устройств (на основе электромагнитных, электро- |
|
|
жание образования пыли в лаборатории следует регулярно про- |
|
|
изводить только влажную уборку; |
|
• |
дезинфекция воздуха и поверхностей помещений с помощью |
|
|
статических фильтров, ультрафиолетового излучения и т.д.) |
1. |
|
РАЗДЕЛ |
|
|
должна проводиться по завершении влажной уборки и высыха- |
|
|
|
|
|
ния поверхностей в помещениях; |
|
139
МЕТОДИЧЕСКИЕ РЕКОМЕНДАЦИИ
•по окончании работы, все объекты, содержащие ПБА, должны быть помещены в хранилища (термостаты, холодильники, шкафы и пр.);
•контаминированные микобактериями отработанные материалы, лабораторную посуду, твердые отходы и пр. из «заразной» зоны помещают в специальные упаковочные мешки для автоклавирования, биксы или металлические баки с крышками и подвергают автоклавированию (126°С – 60 мин) или дезинфицируют химическими средствами на местах;
•жидкие отходы перед сбросом в канализационную систему подлежат обязательному химическому или термическому обеззараживанию;
•руки следует мыть специальным бактерицидным мылом или обработать кожным антисептиком сразу после работы с потенциально инфицированной лабораторной посудой, после всех микробиологических процедур, снятия защитной одежды, а также перед тем, как покинуть помещение лаборатории. Для вытирания рук после мытья следует пользоваться одноразовыми бумажными полотенцами. Запрещается использовать «воздушные полотенца»;
•одежду персонала (халаты, шапочки) замачивают в растворе дезинфицирующего средства, и после экспозиции стирают, прополаскивают, высушивают. Возможно обеззараживание одежды в процессе стирки в стиральных машинах при использовании в них высокой температуры или дезинфицирующего средства, разрешенного для этих целей, или автоклавирование;
•в рабочих помещениях лаборатории запрещается принимать пищу, пить, курить, применять косметические средства.
Заключительная часть (5 мин)
Следует подчеркнуть, что эффективная работа инженерных мер защиты и дезинфекционных мероприятий может быть достигнута лишь при правильном выполнении всех предписаний сотрудниками лаборатории. Система вентиляции воздуха в рабочих помещениях должна предотвращать распространение инфекционного аэрозоля за пределы помещения при любых режимах работы.
Рекомендуемая литература
1.Приказ МЗ РФ № 109 от 21 марта 2003 г. «О совершенствовании противотуберкулезных мероприятий в Российской Федерации.
140
2.Приказ МЗСР РФ от 29.12.2010 г. №1224н «Об утверждении Порядка оказания медицинской помощи больным туберкулезом в Российской Федерации».
3.СП 1.3.232-08 «Безопасность работы с микроорганизмами III– IV групп патогенности (опасности) и возбудителями паразитарных болезней».
4.СП 1.3.2518-09 «Безопасность работы с микроорганизмами III– IV групп патогенности (опасности) и возбудителями паразитарных болезней дополнения и изменения № 1 к СП 1.3.2322-08»
5.СП 3.1.1295-03 «Профилактика туберкулеза» от 25 июня 2003 года
6.СП 3.1.1275-03 «Профилактика инфекционных заболеваний при эндоскопических манипуляциях» М.2003г;
7.СанПиН 2.1.7.727-99 «Правила сбора, хранения и удаления отходов лечебно-профилактических учреждений». – М., 1999.
8.СанПиН 2.1.3.2630-10 «Санитарно-эпидемиологические требования к организациям, осуществляющим медицинскую деятельность». – М., 2010 г.
Материально-техническое обеспечение
Мультимедийная или проекционная демонстрационные системы, экран, лазерная указка; набор тематических слайдов.
РАЗДЕЛ 1. Лекционные материалы
141
МЕТОДИЧЕСКИЕ РЕКОМЕНДАЦИИ
МОДУЛЬ 7. Гены микобактерий и микобактерий туберкулезного комплекса
Тема 7.1. «Введение. Актуальность использования молекулярногенетических методов исследования во фтизиатрии»
Количество аудиторных часов – 1
Примерный план лекции
Основные вопросы, освещаемые в лекции:
•Особенности эпидемиологических показателей по туберкулезу в РФ на современном этапе, проблема повышения выявления ЛУ МБТ;
•Сокращение сроков микробиологической диагностики туберкулеза;
•Совершенствование идентификации микобактерий до вида и штамма.
Вводная часть (5–10 минут)
Туберкулез в Российской Федерации представляет собой большую медико-социальную проблему. Статистический анализ заболеваемости ТБ в 2011 г. выявил 73 новых случая заболевания туберкулезом на 100 000 населения. Смертность от ТБ была зафиксирована у 14,2 на 100 000 населения.
В условиях напряженной эпидемиологической ситуации по туберкулезу в РФ особенно остро стоит проблема модернизации фтизиатрии, которая должна быть направлена на повышение эффективности лечения туберкулеза, совершенствование эпидемиологических исследований и изучение биологических свойств эпидемически значимых групп МБТ.
Основная часть (30 мин)
Использование молекулярных методов позволило по-новому взглянуть на эпидемиологию туберкулеза и оценить генетическое разнообразие штаммов микобактерий, циркулирующих в РФ. Применение методов молекулярной эпидемиологии дало возможность описать штаммы, преимущественно циркулирующие в данной местности, определить пути их передачи и проводить эпидемиологические расследования в клинической практике.
Повышение эффективности лечения основано на ускорении постановки диагноза и своевременной коррекции схем химиотерапии.
Наиболее быстрый классический метод выявления МБТ – микроскопия, позволяет в течение 1–2 дней выявить МБТ в мазке мокроты, однако с крайне низкой чувствительностью. Более чувствительные культуральные исследования на плотных питатель-
142
ных средах занимают от 3–10 недель, после чего проводится постановка тестов на лекарственную чувствительность, которые длятся еще 3–4 недели. В целом весь процесс диагностики ТБ с определением лекарственной чувствительности занимает от 6 до
14недель.
Внастоящее время в лабораторной практике все более широкое применение находят молекулярно-генетические методы, которые позволяют сокращать сроки выявления возбудителя, видовой идентификации микобактерий и определения лекарственной чувствительности.
Для выявления возбудителя широко используется метод ПЦР, основанный на выявлении в геноме микобактерий видоспецифических последовательностей. Метод зарекомендовал себя как высоко специфичный и чувствительный. Предпочтительными являются тест-системы с детекцией результата в режиме реального времени. Получение положительного результата методом ПЦР позволяет в течение 1–2 дней установить наличие МБТ в диагностическом материале. Внедрение ПЦР позволило значительно сократить сроки подтверждения диагноза туберкулеза. Получение положительного результата методом ПЦР не требует дополнительной дифференциации МБТК от НТМБ, т.к. положительный результат однозначно указывает на принадлежность к МБТК. ДНК, выделенная из диагностического материала и использованная для проведения ПЦР, может быть использована для установления ЛУ существующими молекулярно-генетическими тест-системами.
Определение лекарственной чувствительности
ТБ с МЛУ представляет собой сложнейшую проблему с точки зрения борьбы с туберкулезом. В РФ наблюдается крайне высокий уровень распространения штаммов с МЛУ с его неуклонным нарастанием. В 2011 году отмечено 15,5% случаев МЛУ туберкулеза среди новых случаев заболевания туберкулезом, и 34,2% среди ранее леченых.
Вызывающая тревогу динамика роста МЛУ-ТБ, появление туберкулеза с широкой лекарственной устойчивостью (ШЛУ-Тб), потенциальная передача инфекции внутри лечебных учреждений и резкий подъем смертности среди ВИЧ-инфицированных больных с МЛУ-ТБ и ШЛУ-ТБ – все эти обстоятельства привели к неотложной необходимости приступить к внедрению экспресс-ме- тодов скрининга.
Традиционные методы культуральных исследований в области микобактериологии и определения лекарственной чувствительности занимают много времени и трудоемки, требуют соблюдения определенной последовательности процедур для выделения мико-
РАЗДЕЛ 1. Лекционные материалы
143
МЕТОДИЧЕСКИЕ РЕКОМЕНДАЦИИ
бактерий из клинического материала и связаны с идентификацией микобактерий комплекса M.tuberculosis.
За это время пациенты могут проходить неадекватный курс лечения, может продолжаться циркуляция лекарственно-устойчи- вых штаммов и происходить усиление резистентности. Новые технологии для быстрого выявления устойчивости к ПТП стали, таким образом, одной из приоритетных задач в области научных исследований и разработок по проблеме ТБ, и в этом плане наиболее продвинутыми для ускоренного обнаружения устойчивости к рифампицину (только к нему или в сочетании с изониазидом) оказались молекулярно-генетические методы.
Основным достоинством всех молекулярно-генетических методов тестирования ЛУ МБТ является быстрота получения результатов и оперативное выявление больных МЛУ-туберкулезом, так как все указанные тест-системы позволяют выявить ЛУ к рифампицину, которая считается маркером МЛУ. Генотипические методы имеют много важных преимуществ для совершенствования контроля за лекарственно-устойчивым ТБ, особенно в том, что касается скорости получения результата, стандартизации тестов, возможности для высокой производительности и сниженной необходимости в соблюдении биобезопасности. Конечной целью выполнения молекулярных анализов является быстрая первичная идентификация МЛУ ТБ.
Применение молекулярно-генетических тест-систем позволяет проводить определение лекарственной чувствительности МБТ непосредственно из диагностического материала. В этом случае получение результата о наличии у больного МЛУ ТБ возможно через 1–2 дня после поступления материала.
Молекулярно-генетические тест-системы на определение ЛУ представлены четырьмя основными вариантами: биологические микрочипы, ПЦР в режиме реального времени, ДНК-стриповая технология, набор Xpert MTB/RIF.
Наличие ПЦР тест-систем, определяющих в течение 1–2 дней устойчивость к основным ПТП, позволяет разделить потоки больных с МЛУ и не-МЛУ туберкулезом, направить их в МЛУ-центр, где имеется возможность изоляции больного и назначения химиотерапии резервными препаратами.
Определить устойчивость к изониазиду и рифампицину позволяют как отечественные тест-системы "ТБ-биочип" (ООО «БИОЧИП», Россия), в основе которой лежит технология биологических микрочипов, набор реагентов для проведения ПЦР в режиме реального времени (ЗАО "Синтол"), так и зарубежные, такие как
144
набор GenoType® MTBDRplus (HAIN Lifescience, Германия), представляющий собой ДНК-стриповую технологию, основанную на множественной обратной гибридизации (позволяет определять ЛУ МБТ к рифампицину и изониазиду).
Отдельно стоит упомянуть тест, выполняемый с помощью набора реагентов Xpert MTB/RIF на анализаторе GeneXpert, который позволяет в течение 2–3 часов выявить наличие в мокроте МБТ и определить их устойчивость к рифампицину. Использование этой системы позволяет непосредственно из нативной мокроты в очень короткие сроки, в один этап выявлять возбудителя, определять принадлежность к МБТК и определять лекарственную чувствительность (к рифампицину). Чувствительность метода как по выявлению, так и по установлению лекарственной чувствительности не уступает системе BACTEC MGIT960 и культуральным исследованиям на плотных питательных средах.
Для установления ЛЧ молекулярно-генетическими методами
кболее широкому спектру препаратов применяются тест-системы "ТБ-биочип-2" (ООО "Биочип"), позволяющую определять на микрочипе чувствительность к фторхинолонам, и "GenoType® MTBDRsl" (HAIN Lifescience, Германия), основанную на технологии ДНК-стрипов и позволяющую определять устойчивость к фторхинолонам, этамбутолу, аминогликозидам.
Последний, несмотря на довольно низкую чувствительность при установлении устойчивости к этамбутолу и аминогликозидам / капреомицину, позволяет получать ориентировочные сведения о чувствительности МБТ и является на сегодняшний день тест-си- стемой, позволяющей проводить одновременное тестирование ЛУ
кнаибольшему числу ПТП.
Однако, применение молекулярно-генетических методов в настоящее время не устраняет необходимости проведения традиционных культуральных методов, т.к. иногда в диагностическом материале оказывается недостаточное количество МБТ. Поэтому определение ЛУ возможно после культивирования на питательных средах. Кроме того, современные молекулярно-генетические методы определения ЛУ охватывают гораздо меньший спектр ПТП, чем культуральные методы.
При росте числа больных, инфицированных НТМБ, большое значение имеют молекулярно-генетические тест-системы для видовой идентификации микобактерий. В случае ускоренной диагностики туберкулеза видовая идентификация является актуальной для быстрых культуральных методов, таких, как ВАСТЕС MGIT 960. Нетуберкулезные микобактерии резистентны к большинству
РАЗДЕЛ 1. Лекционные материалы
145
|
противотуберкулезных препаратов. Видовая идентификация ми- |
||
|
|||
|
кобактерий позволяет дифференцировать микобактериозы и |
||
|
МЛУ/ШЛУ туберкулез. |
||
|
Молекулярные методы дифференциации МБТ от НТМБ осно- |
||
|
ваны на выявлении видоспецифических структур в геноме или |
||
|
белковом спектре возбудителя. Ряд методов направлен только на |
||
|
то, чтобы дифференцировать МБТ от НТМБ, ряд – пригоден для |
||
|
точной видовой идентификации возбудителя. |
||
|
К методам, дифференцирующим МБТ от НТМБ, относятся |
||
|
ПЦР IS6110, выявляющая вставочную последовательность, при- |
||
|
сутствующую только у микобактерий туберкулезного комплекса. |
||
|
Особенно удобен для точной идентификации МБТ быстрый |
||
|
иммунохроматографический метод (TBc ID-test, Becton Dickin- |
||
|
son), который отличается простотой выполнения и обеспечивает |
||
|
идентификацию за 15–20 минут. Тест основан на обнаружении |
||
|
фракции микобактериального белка MPT64, которая выделяется |
||
|
из клеток МБТ в процессе культивирования. |
||
|
В случае получения отрицательного результата на МБТ, пред- |
||
|
полагается наличие НТМБ, и проводится точная видовая иденти- |
||
|
фикация. Кроме того, точная видовая идентификация может быть |
||
|
рекомендована при получении отрицательного результата ПЦР |
||
|
при выявлении возбудителя в диагностическом материале. В этом |
||
|
случае работа ведется с диагностическим материалом. |
||
|
К методикам, обеспечивающим точную видовую идентифика- |
||
|
цию НТМБ, относится ДНК-стриповая технология (Hain Life- |
||
|
science), включающая два вида тестов: |
||
|
– GenoType® Mycobacterium CM позволяет идентифицировать |
||
|
следующие виды микобактерий: M.avium ssp., M.chelonae, M.absces- |
||
|
sus, M.fortuitum, M.gordonae, M.intracellulare, M.scrofulaceum, M.inter- |
||
|
jectum, M.kansasii, M.malmoense, M.peregrinum, M.marinum, M.ulcer- |
||
|
ans, M.xenopi и M.tuberculosis complex. |
||
РЕКОМЕНДАЦИИ |
– GenoType® Mycobacterium AS, который позволяет идентифи- |
||
Этим методом можно исследовать культуры с плотной и жидкой |
|||
|
цировать M.simiae, M.mucogenicum, M.goodii, M.celatum, M.smegmatis, |
||
|
M.genavense, M.lentiflavum, M.heckeshornense, M.szulgai, M.inter- |
||
|
medium, M.phlei, M.haemophilum, M.kansasii, M.ulcerans, M.gastri, |
||
МЕТОДИЧЕСКИЕ |
M.asiaticum и M.shimoidei. |
||
питательной среды, а также работать непосредственно с диагности- |
|||
|
|||
|
ческим материалом (в случае получения отрицательного результата |
||
|
ПЦР на выявление МБТ), и получить результат в течение 1–2 дней. |
||
|
Также идентификация микобактерий до вида может прово- |
||
|
диться с помощью MALDI-ToF масс-спектрометрии, позволяю- |
||
|
|
|
146
щей получить белковые спектры, которые являются уникальными |
|
||||||
для каждого вида микобактерий. Однако, этот метод широко не |
|
||||||
распространен, поскольку требует дорогостоящего оборудования |
|
||||||
и высокой квалификации персонала, и пригоден только для ра- |
|
||||||
боты с чистой культурой. |
|
|
|
|
|||
В целом, для ускоренной лабораторной диагностики туберку- |
|
||||||
леза рекомендуется следующая схема обследования (рис. 1). При- |
|
||||||
менение данной схемы исследования сокращает сроки выявления |
|
||||||
возбудителя, видовой идентификации и определения лекарствен- |
|
||||||
ной чувствительности микобактерий, приводя к ускорению поста- |
|
||||||
новки диагноза и своевременному назначению адекватных схем |
|
||||||
химиотерапии, что, в свою очередь, повышает эффективность |
|
||||||
лечения туберкулеза. |
|
|
|
|
|||
Алгоритм молекулярной диагностики туберкулеза и микобактериозов |
|
||||||
|
Диагностический материал |
GenoType® Mycobacteria Direct |
|
||||
ТБ-биочип |
Рост на Bactec MGIT 960 |
• Mycobacterium avium complex |
|
||||
|
• M.malmoense |
|
|
||||
|
|
|
|
• M.kansaasii |
|
|
|
|
|
|
|
• M.tuberculosis complex |
|
||
GenoType® MTBDRplus |
Идентификация |
|
|
|
|||
|
|
|
|
|
|||
GenoType® MTBDRsl |
|
|
|
|
|
||
Мазок по Цилю-Нильсену |
|
ПЦР IS6110, ТBс ID |
|
||||
– |
|
+ |
МТК |
+ |
– |
|
|
|
|
GenoType® Mycobacteria CM/AS |
|
|
|||
|
|
Масс-спектрометрия |
|
|
|||
|
Идентификация клинически значимых и дополнительных |
|
|||||
|
|
нетуберкулезных микобактерий |
|
|
|||
|
|
Определение ЛЧ НТМ (Margellan Biosciences) |
|
материалы |
|||
Рис. 1. Алгоритм проведения ускоренной диагностики туберкулеза и микобактериозов |
|||||||
|
|
|
|
|
|
||
Заключительная часть (5 мин) |
|
|
|
Лекционные |
|||
Подводя итог, обращается внимание слушателей на то, что ука- |
|||||||
занная стратегия лабораторных исследований позволяет при |
|||||||
поступлении больного в стационар в короткие сроки определять |
|||||||
лекарственную устойчивость микобактерий, выявлять нетуберку- |
1. |
||||||
РАЗДЕЛ |
|||||||
лезные микобактерии и назначать адекватный режим химиотера- |
|||||||
пии, что сокращает сроки абациллирования (показано прекраще- |
|||||||
|
|
|
|
|
|
||
|
|
|
|
|
147 |
|