Добавил:
kiopkiopkiop18@yandex.ru Вовсе не секретарь, но почту проверяю Опубликованный материал нарушает ваши авторские права? Сообщите нам.
Вуз: Предмет: Файл:

6 курс / Клинические и лабораторные анализы / Лабораторная_диагностика_туберкулеза_Ерохин_В_В_ред_

.pdf
Скачиваний:
3
Добавлен:
24.03.2024
Размер:
6.25 Mб
Скачать

Тема 10.5. «Значение молекулярно-генетической идентификации микобактерий для фтизиатрической клиники»

Количество аудиторных часов – 1

Примерный план лекции

Основные вопросы, освещаемые в лекции:

НТМБ как «маска» ШЛУ ТБ.

Частота выявления НТМБ в клинике с использованием моле- кулярно-генетических методов

 

Вводная часть (5–10 мин)

 

Этиологическим фактором микобактериозов являются нету-

 

беркулезные микобактерии (НТМБ). Несмотря на то, что изучение

 

НТМБ началось вскоре после открытия Робертом Кохом туберку-

 

лезной палочки, их клиническое значение долгое время недооце-

 

нивалось. НТМБ считались практически не патогенными для че-

 

ловека, и до 50-х годов прошлого века в мировой печати

 

встречались только единичные описания случаев заболеваний, вы-

 

званных этими микроорганизмами.

 

В отличие от микобактерии туберкулеза, которые являются

 

облигатными патогенами, НТМБ – сапрофиты, обычные обита-

 

тели различных сред, таких как вода, почва и т. д. Однако эти мик-

 

роорганизмы обладают потенциальной патогенностью и могут вы-

 

зывать патологические процессы в организме человека.

 

Факторами риска являются длительное лечение антибиотиками и

 

кортикостероидами, нарушение защитных механизмов в легочной

 

ткани и генерализованные иммунные дефекты, яркими приме-

 

рами которых могут служить первичные иммунодефициты и

 

СПИД.

 

НТМБ являются причиной локализованных или диссемини-

РЕКОМЕНДАЦИИ

рованных форм заболеваний в зависимости от предрасположен-

ности и иммунного статуса человека. Разные микобактерии могут

 

 

поражать легкие, лимфатические узлы, мягкие ткани, связки,

 

кости, суставы, кожу у иммунокомпетентных людей, вызывать ге-

 

нерализованные процессы у больных лейкемией и у пациентов

 

после трансплантации органов.

МЕТОДИЧЕСКИЕ

В настоящее время отмечается значительный рост заболевае-

мости микобактериозами. Возможно, это связано с совершенство-

 

 

ванием лабораторных методов выделения и идентификации

 

НТМБ, ростом иммунокомпрометированных пациентов, накоп-

 

лением знаний о микобактериозах и НТМБ

198

Статистика по заболеваемости микобактериозами в мире

Заболеваемость микобактериозами в Англии выросла с 0,9 на 100 тыс. населения в 1995 г. до 2,9 в 2006 г. (1608 случаев).

ВИспании за 15 лет (1982–1997 гг.) выделено 7253 культуры кислотоустойчивых бактерий, 11% из них составляли НТМБ.

В2003 г. в Японии обобщены сведения о 938 случаях легочного микобактериоза с 1970 г.

ВБразилии с 1998 по 2003 г. НТМБ были выделены у 19 из 231 пациента.

Заболеваемость микобактериозами населения Дании составила 1,08 на 100 тыс. населения, в период с 1997–2008 гг. она увеличилась с 0,58 до 1,5 на 100 тыс.,

ВНидерландах также отмечен рост заболеваемости микобактериозами в 1999–2004 гг., преимущественно за счет поражения легких, вызванного MAC

На Тайване в 2000–2008 гг. отмечен рост заболеваемости микобактериозами с 2,7 до 10,2 на 100 тыс. населения.

Англия: с 2,9 на 100 тыс. населения в 2006 г. Дания: 1,5 на 100 тыс. населения в 2008 г. Тайвань: 2,7 до 10,2 на 100 тыс. населения

Испания: за 15 лет (1982–1997 гг.) выделено 7253 культуры кислотоустойчивых бактерий, 11% из них составляли НТМБ

Япония: выявлено 938 случаев легочного микобактериоза с 1970 по 2003 гг.

Основная часть (30 мин)

 

Проблемы диагностики микобактериозов в России:

 

1. Идентификация культур микобактерий до вида почти не

 

проводится в отечественных баклабораториях с большим потоком

 

анализов. Грамотная идентификация проводится только в крупных

 

исследовательских центрах.

 

2. Практически не производится отечественных молекулярно-

материалы

аналоги дороги.

генетических тест-систем (например, ПЦР) для быстрой и деше-

 

вой идентификации кислотоустойчивых палочек, а зарубежные

Лекционные1.

– кто должен лечить таких больных?

3. Проблема микобактериозов слабо освещена в специальной

 

литературе, статистических данных по заболеваемости найти очень

 

трудно.

 

Никто не знает, что делать с больными, выделяющими НТМБ

РАЗДЕЛ

– где должны лечиться такие больные?

 

– как и чем нужно лечить таких больных?

 

199

МЕТОДИЧЕСКИЕ РЕКОМЕНДАЦИИ

Все вместе эти проблемы порождают «порочный круг», приводящий к несвоевременной диагностике микобактериозов.

Сейчас врачи-фтизиатры могут руководствоваться редкими отечественными научными статьями, посвященными диагностике и лечению микобактериоза, а также зарубежной специальной литературой и нормативными документами.

НТМБ как «маска» ШЛУ ТБ

Симптомы микобактериозов весьма разнообразны и неспецифичны. Большинство пациентов предъявляют жалобы на длительный или периодически возникающий кашель, чаще сухой, иногда с мокротой. Больных беспокоят слабость, недомогание, умеренная одышка, иногда эпизоды кровохарканья, боли в грудной клетке, субфебрилитет, потеря массы тела. Картина очень похожа на заболевание туберкулезом. Чаще всего больные с микобактериозами попадают в противотуберкулезные учреждения с подозрением на туберкулез. Поэтому очень важно проводить грамотную идентификацию полученных культур. Ведь основным методом диагностики НТМБ в настоящее время остается посев на плотные и жидкие питательные среды, используемые и для выявления микобактерий туберкулеза. Без проведения идентификационных тестов быстрорастущие или пигментированные микобактерии могут быть приняты за постороннюю флору и удалены из анализа, а медленнорастущие НТМБ могут быть признаны за M.tuberculosis, поставлен тест на лекарственную устойчивость и результаты выданы врачам-фтизиатрам.

Нетуберкулезные микобактерии (НТМБ), несмотря на то, что принадлежат к роду Mycobacterium, в подавляющем числе случаев имеют природную устойчивость к большинству противотуберкулезных препаратов. Ошибочная диагностика может привести к постановке диагноза «туберкулез с широкой лекарственной устойчивостью».

Установление лекарственной чувствительности НТМБ

По опыту зарубежных исследователей (Японии и США) для лечения микобактериозов, наряду с противотуберкулезными препаратами, применяются антибиотики широкого спектра действия: кларитромицин, тобрамицин, амоксициллин/клавулоновая кислота, импинем, тайгециклин, доксициклин и т.д. Поэтому необходимо для НТМБ проводить тест на определение ЛЧ не только к противотуберкулезным препаратам, но и к препаратам широкого спектра действия. Критических концентраций препаратов для

200

НТМБ не разработано, поэтому для каждого препарата определяется минимальная ингибирующая концентрация (МИК).

На отечественном рынке продается тест-система планшетного формата для определения МИК для быстрорастущих и для медленнорастущих НТМБ Sensititre производства Trek Diagnostic Systems, Magellan Biosciences, UK.

В 96-луночном планшете на дне лунок лиофилизированы препараты в разных концентрациях. В лунки добавляется среда с исследуемой культурой НТМБ. Планшет инкубируется при 35°С в течение 3–7 дней для быстрорастущих видов НТМБ и от 7 до 14 дней для медленнорастущих. Результаты роста культуры на среде с различными концентрациями препаратов считываются или вручную под инвертированным микроскопом, или с использованием автоматического анализатора Sensititre Vizion System®.

Спектры лекарственной устойчивости к препаратам разных видов НТМБ: Устойчивость к большинству ПТП микобактерий, выделенных у больных микобактериозом, существенно ограничивает терапевтические возможности, и речь может идти только об индивидуализированном лечении, основанном на определении лекарственной чувствительности к широкому спектру антибактериальных препаратов.

Примеры спектров лекарственной устойчивости к ПТП и антибиотикам широкого спектра действия представлены на слайдах.

Как видно из приведенных данных, микобактерии, выделенные от пациентов с диагнозом микобактериоз НТМБ, особенно быстрорастущие, были устойчивы к большинству антибактериальных препаратов

Частота выявления НТМБ в клинике с использованием молекулярно-генетических методов

К сожалению, очень мало отечественных статистических данных о выявлении микобактериозов и НТМБ в лабораториях, потому что отсутствуют точные критерии соответствия микробиологических данных и клинических проявлений. Следует помнить, что источником НТМБ является окружающая среда, поэтому выявление НТМБ в диагностическом материале может быть результатом контаминации. Для предотвращения контаминации необходимо соблюдать санитарные нормы и правила, предусмотренные для противотуберкулезных лабораторий (регулярная обработка помещений и рабочих мест дезинфицирующими растворами, дезинфекция многоразовых инструментов). Однократное выделение

РАЗДЕЛ 1. Лекционные материалы

201

МЕТОДИЧЕСКИЕ РЕКОМЕНДАЦИИ

НТМБ в образце от больного также не может являться критерием для постановки диагноза микобактериоз.

Для регламентации процесса установления диагноза и лечения микобактериозов Американское торакальное общество (ATS) совместно с Американским обществом по инфекционным болезням в 2007 г. опубликовало руководство, посвященное заболеваниям, вызываемых НТМБ, и выделило основные диагностические критерии. Одним из основных микробиологических критериев является неоднократное выделение от больного одного и того же штамма НТМБ

Можно привести данные по частоте выявляемости НТМБ в бактериологических лабораториях двух крупных противотуберкулезных центров:

Центральный НИИ туберкулеза РАМН. Из 1605 выделенных культур 84 были отнесены к НТМБ, что составило 5,2%.

МНПЦБТ. Провели 117579 посевов, выделили 15786 (13,4%) культур микобактерий, из них к M.tuberculosis complex отнесено 15333 (97,1%) культуры и 490 культур – к НТМБ, что составило 3,1% от общего числа культур микобактерий.

Заключительная часть (5 мин)

«Недостаточная осведомленность врачей-фтизиатров в вопросах диагностики, клиники и лечения микобактериоза приводит к несвоевременному его выявлению.

…Своевременность диагностики микобактериоза зависит от

полноценного бактериологического обследования больного и быстроты получения результатов идентификации выделенных культур. Поздняя диагностика заболевания и несвоевременно начатая специфическая терапия приводит к развитию тяжелого, прогрессирующего процесса с деструктивным поражением легких»

Т.Ф. Оттен, А.В. Васильев. «Микобактериоз», С-Пб., 2005

В добавление к цитате хотелось бы отметить, что только настороженность врачей на обнаружение данного заболевания, а также правильный подход к микробиологической диагностике НТМБ может позволить поставить верный диагноз и быстро начать адекватную химиотерапию.

Рекомендуемая литература

1.Литвинов В.И., Макарова М.В., Краснова М.А. «Нетуберкулезные микобактерии». – М.: МНПЦБТ. – 2008. – 256 с.

2.Оттен Т.Ф., Васильев А.В. Микобактериоз. – СПб: Медицинская пресса. – 2005. – 224 с.

202

3.An official ATS/IDSA statement: diagnosis, treatment and prevention of Nontuberculous Mycobacterial diseases // Am. J. Respir. Crit. Care Med. – 2007. – Vol. 175. – P. 367–416.

4.Daley C.L., Griffith D.E. Pulmonary non-tuberculous mycobacterial infections // Int. J. Tuberc. Lung Dis. – 2010. – Vol. 14, № 6. – Р. 665–671.

5.David L., Heyman М. Diseases due to other mycobacteria. – Washington: American Public Health Association. – 2004. – Р. 572–573.

6.Falkinham J.O. Nontuberculous Mycobacteria in the environment. // Clin Chest Med. – 2002. – Vol. 23. – P. 529–551.

7.Griffith D.E., Aksamit T., Brown-Elliott B.A. et al. An official ATS/IDSA statement: diagnosis, treatment, and prevention of Nontuberculous Mycobacterial diseases. // Am J Respir Crit Care Med. – 2007. – Vol. 175. – P. 367–416.

8.Sato A. Geographic distribution of MAIC serovars isolated from patients in five cities of Japan // Kansenshogaku Zasshi. – 2000. – Vol. 74. – № 1. – P. 64–72.

9.Susceptibility testing of Mycobacteria, Nocardiae and other aerobic Actinomycetes; Approved Standards. – M 24–A. – Vol. 23. – №18.

10.Von Rhein C.F., Arbeit R.D., Horsburgh R., Ristola M.A., Waddell R.D., Tvaroha S.M. et al. Sources of disseminated Mycobacterium avium infection in AIDS. // J Infect. – 2002. – Vol. 44. – Р.166–170.

11.Von Rhein C.F., Waddell R.D., Eaton T. et al. Isolation of Mycobacterium avium complex from water in the United States, Finland, Zaire, and Kenya. // J Clin Microbiol. – 1993. – Vol. 12. – P. 3227– 3230.

Материально-техническое обеспечение

Мультимедийная или проекционная демонстрационная системы, экран, лазерная указка; набор тематических слайдов.

РАЗДЕЛ 1. Лекционные материалы

203

МЕТОДИЧЕСКИЕ РЕКОМЕНДАЦИИ

МОДУЛЬ 11. Молекулярно-генетические основы резистентности микобактерий

Тема 11.1. «Гены микобактерий, ответственные за устойчивость к ПТП»

Количество аудиторных часов – 1

Примерный план лекции

Основные вопросы, освещаемые в лекции:

Гены, ответственные за устойчивость к ПТП первого ряда

Гены, ответственные за устойчивость к некоторым ПТП второго ряда

Механизмы возникновения лекарственной устойчивости к основным препаратам

Вводная часть (5–10 мин)

ВОЗ продекларировал, что одна треть мировой популяции инфицирована микобактериями туберкулеза – 2 миллиарда человек.

Случаи туберкулеза во многих индустриальных странах увеличились в последние два десятилетия и, похоже, продолжают увеличиваться.

Особую и весьма значительную роль в обострении ситуации с туберкулезом играет появление и все большее распространение штаммов микобактерий, устойчивых к лекарственным препаратам. Наибольшую опасность представляют штаммы M.tuberculosis, обладающие множественной лекарственной устойчивостью – МЛУ (Multidrug Resistant, MDR – устойчивые к двум основным противотуберкулезным препаратам: рифампицину и изониазиду) или широкой лекарственной устойчивостью – ШЛУ (т.н. Extensively Drug-Resistant, XDR – устойчивые к рифампицину, изониазиду, фторхинолонам и одному из инъекционных противотуберкулезных препаратов второй группы). По некоторым данным, в мире около 4% случаев туберкулеза вызываются МЛУ-штаммами, а среди ранее леченных больных частота выявления МЛУ-штам- мов доходит до 40%. ШЛУ-штаммы распространены пока не столь широко, однако в мире наблюдается устойчивая тенденция к их распространению. Таким образом, в недалеком будущем современная медицина, лишенная эффективных химиотерапевтических средств, воздействующих на микобактерии, может оказаться безоружна перед лицом возрастающей угрозы повсеместного распространения устойчивых штаммов M.tuberculosis.

204

Очевидно, что в сложившейся ситуации весьма актуальны исследования, направленные на решение проблемы быстрой диагностики заболевания, своевременного выявления устойчивых форм, а также на проведение адекватных противоэпидемических мероприятий, ориентированных на предупреждение распространения штаммов микобактерий (в том числе и устойчивых) в человеческой популяции.

Большие перспективы и возможности в этом направлении открывают современные достижения молекулярной биологии. На их основе в настоящее время активно разрабатываются и внедряются в клиническую практику новые молекулярно-генетические методы, позволяющие осуществлять быструю диагностику туберкулеза. Однако разработка новых методов невозможна без понимания механизмов возникновения лекарственной устойчивости микобактерий туберкулеза.

Основная часть (30 мин)

Молекулярные механизмы возникновения лекарственной устойчивости. В основе действия практически всех антибиотиков лежит связывание их с жизненно необходимыми белками бактериальных клеток и блокирование их функций. Белки кодируются генами. Если в гене бактерий возникнет мутация, структура синтезируемого белка изменяется. Препарат больше не может связаться с таким измененным белком (или связь с белком слишком слабая) и не блокирует его. Таким образом, мутации в геноме микобактерий ответственны за возникновение лекарственной устойчивости.

Появление устойчивых штаммов. Мутации в геноме микобактерий возникают спонтанно и связаны с ошибками редупликации ДНК при делении клеток. Мутировавшие клетки не имеют преимуществ перед немутировавшими. Наоборот, некоторыми работами показано, что такие мутанты имеют сниженную жизнеспособность. Однако, при селективном давлении антибиотиков, т.е. при лечении больного, мутантные клетки, которые не погибают от ПТП, сразу получают большие преимущества. В то время как популяция немутировавших микобактериальных клеток вымирает, мутанты выживают и размножаются в организме.

РАЗДЕЛ 1. Лекционные материалы

205

МЕТОДИЧЕСКИЕ РЕКОМЕНДАЦИИ

Гены, ответственные за устойчивость к ПТП первого ряда

Препараты

Гены

Продукты генов

Частота встречаемо-

сти среди устойчи-

 

 

 

вых штаммов

Рифампицин

rpoB

b-субъединица РНК-полиме-

Более 96%

 

 

разы

 

 

katG

Каталаза-пероксидаза (KatG)

До 85%, по некото-

 

рым данным до 90%

 

inhA

Еноилкислая фосфатредук-

Менее 10%

 

таза (InhA)

 

 

 

Изониазид

 

 

 

oxyR-ahpC

Алкилгидроксипероксидре-

Менее 10%

 

 

дуктаза (AhpC)

 

 

 

 

 

 

 

 

acpM-kasA

Комплекс ацилнесущего

Мене 5%

 

белка AcpM и b-кетоацилки-

 

 

слой фосфатсинтетазы (KasA)

 

Пиразинамид

pncA

Пиразинамидаза (PncA)

70–95%

 

 

 

 

Этамбутол

Область

Арабинозилтрансфераза

Около 70%

embCAB

(EmbCAB)

 

 

 

 

 

 

Стрептомицин

rpsL

Рибосомальный белок S12

60%

 

 

 

rrs

16S рибосомальная РНК

Менее 10%

 

 

 

 

 

Гены, ответственные за устойчивость к некоторым ПТП второго ряда

Препараты

Гены

Продукты генов

Частота встречаемо-

сти среди устойчи-

 

 

 

вых штаммов

Аминогликозиды

rrs

16S РНК

От 35 до 70% по раз-

(амикацин, канами-

ным данным

цин)

 

 

 

 

 

Циклические

rrs

16S РНК

От 35 до 70% по раз-

ным данным

пептиды

 

 

(капреомицин)

 

 

 

tlyA

рРНК-метилтрансфераза

 

 

 

 

 

 

 

 

gyrA, gyrB

a- и b-субъединицы

Более 95%

Фторхинолоны

ДНК-гиразы

 

 

 

 

 

 

nor

Efflux протеин

Нет данных

 

 

 

 

Молекулярные механизмы формирования устойчивости к ПТП Рифампицин (1 ряд). Оказывает бактерицидное действие на ак-

тивно делящиеся микобактерии, локализованные как внеклеточно, так и внутриклеточно, а также на микобактерии в неактивном состоянии. Проникая через клеточныеβ оболочки микобактерии, рифампицин связывается с -субъединицей бактериальной РНК полимеразы и блокирует таким образом процесс транскрипции.

206

Было обнаружено, что нуклеотидные замены, приводящие к устойчивости, в основном встречаются между 507 и 533 кодонами гена rpoB – до 96 % всех рифампицин-резистентных штаммов имеют мутации в этой области, так называемом регионе, определяющем устойчивость к рифампицину (англ. rifampin resistance determinant region (RRDR)). Наиболее часто (до 86 % случаев) встречаются замены в 531, 526 и 516 кодонах. Также была выявлена взаимосвязь между локализацией мутаций с уровнем устойчивости микроорганизма: мутации в 531, 526 и 513 кодонах приводят к устойчивости высокого уровня, замены в других кодонах связаны с умеренной устойчивостью. 4% фенотипически устойчивых к рифампицину штаммов M.tuberculosis не несут мутаций в гене rpoB. Механизм устойчивости таких штаммов остается пока неизвестным. Вероятнее всего, существует добавочный механизм устойчивости к рифампицину, возможно, связанный с нарушением проницаемости клеточной стенки для препарата или мутациями в других субъединицах РНК-полимеразы.

Изониазид (1 ряд). Изониазид ингибирует биосинтез миколовых кислот клеточной стенки. МБТ становятся чувствительными к активным кислородным радикалам и другим воздействиям окружающих факторов. Активный INH+ продукт образуется при окислении изониазида ферментом каталазой-пероксидазой KatG (продукт гена katG). Мутации в гене katG приводят к образованию дефектного или отсутствию фермента KatG. Это делает невозможным перевод неактивной формы изониазида в активную INH+, следовательно, возникает устойчивость МБТ к изониазиду.

Такой механизм был выявлен у 85% INH-устойчивых штаммов. Наиболее часто в гене katG встречается замена Ser315>Thr (у 40% МБТ). При этом 50% активности каталазы-пероксидазы сохраняется. Такая каталаза-пероксидаза теряет способность активировать изониазид, однако сохраняет свою способность детоксицировать органические перекиси.

Результатом этого является высокий уровень резистентности к изониазиду (>90 мкг/мл). Штаммы МБТ с другими мутациями в гене katG редко встречаются и демонстрируют различный уровень резистентности к изониазиду. Изониазид действует только на МБТ, т.к. только у МБТ каталаза-пероксидаза имеет побочную функцию

– окисляет изониазид, превращая его в активную форму INH+. При возникновении мутаций в гене katG и нарушении синтеза

каталазы-пероксидазы, отвечающих у всех бактерий за детоксикацию клетки от органических перекисей, у МБТ включается защит-

РАЗДЕЛ 1. Лекционные материалы

207