- •2. Работами л. Пастера, Генле, Коха открывается новый этап в развитии микробиологии – физиологический.
- •Русские:
- •2. Бактерии – 19 групп – с описанием всех известных семейств, родов, видов.
- •Принципы систематизации бактерий в определителе Берджи
- •Рибосомы
- •Источники углерода и энергии
- •Аэробные методы культивирования
- •Электричество
- •РН среды
- •Влажность. Вода в клетках
- •Гидростатическое давление
- •Осмотическое давление
- •Химические факторы
- •Температура
- •Молочнокислое брожение
- •Распространение и места обитания молочнокислых бактерий.
- •Потребность в факторах роста.
- •Получение кисломолочных продуктов
- •Получение сычужных сыров
- •Пропионовокислое брожение
- •Спиртовое брожение
- •Производство вина
- •1. Первая группа.
- •Маслянокислое брожение
- •Кислое и бутандиоловое брожение
- •Лимоннокислое брожение
- •Уксуснокислое брожение
- •Анаэробное разложение целлюлозы
- •Размножение фага (вируса)
- •Антибиотики. Патогенность микроорганизмов
- •Применение:
- •Пенициллин
- •Неспецифические механизмы защиты
- •Антигенная структура микробной клетки
- •Фиксация азота
- •Фиксация азота свободноживущими микроорганизмами
- •Нитрификация
- •1879 Г. – Мюнцер и Шлезинг – пропуская сточную воду через колону с СаСо3 и песок получали nо3 из nh3. После стерилизации колоны или дезинфекции этот процесс нарушался.
- •Бактерии, окисляющие серу
- •Круговорот серы.
- •Железобактерии
- •Водная экосистема
- •Метаногены
- •Восстановление микроорганизмами неорганических акцепторов электронов.
- •1925 Г. Левин – восстановление селена, окислов.
Кислое и бутандиоловое брожение
Бактерии кишечной группы Enterobacteriaceae осуществляют смешанное кислое и бутандиоловое (2,3-бутиленгликоль) брожение, при котором образуются: ряд органических кислот, спирты, СО2 и Н2.
Энтеробактерии – факультативные анаэробы, подвижные, не образуют спор.
E.coli – существует в почве, воде, кишечнике человека и животных.
Salmonella typhimurium – кишечная патогенная палочка. Возбудитель кишечных инфекций и пищевых отравлений. Обитает в почве, воде.
Shigella sonnei – возбудитель кишечных инфекций, дизентерии.
E.coli, Salmonella typhimurium, Shigella сбраживают сахара с образованием молочной, уксусной, янтарной, муравьиной кислот и СО2.
Enterobacter, Erwinia, Serratia – с образованием СО2, этанола, 2,3-бутандиола.
Лимоннокислое брожение
По биохимическому механизму является неполным окислением, протекающим в аэробных условиях.
Лимонная кислота широко распространена в природе (лимоны, апельсины, клюква, шиповник). Раньше ее получали из лимонов – 9% (с.в.). Наиболее рациональный способ получения лимонной кислоты из глюкозы при помощи плесневого гриба Aspergillus niger.
Субстрат: сахароза, глюкоза, вводят азот и фосфор. Мицелий аэрофильный. Среда аэрируется. При 10% СО2 в воздухе рост угнетается. Температура 34–37 °С.
Два способа культивирования: глубинный и поверхностный. Засевают спорами 350–400 тыс. на 1мл. При 32 °С брожение идет 14–15 суток. 1м субстрата дает 500–600 г лимонной кислоты.
В промышленности чаще всего гриб выращивают в специальных кюветах на средах с высокой концентрацией сахара (до 20%) и слабой аэрацией стерильным воздухом. Растет на поверхности в виде плотной толстой пленки. Конидии создают пушистость белого цвета. Их собирают специальным вакуумным насосом, концентрируют и прессуют для дальнейшего применения в промышленности. Срок хранения 1–2 года и больше.
Для выделения лимонной кислоты в чистом виде сбраживаемый субстрат подвергают многократной очистке. Кроме лимонной кислоты образуется около 3% глутаминовой и 1% щавелевой кислот.
Уксуснокислое брожение
Осуществляется уксуснокислыми бактериями рода Acetobacter и по своему биохимическому механизму также является неполным окислением. Уксуснокислые бактерии могут развиваться только в субстрате, в котором имеется этанол. Процесс скисания вина это процесс образования уксусной кислоты в субстрате, который стал аэробным.
В промышленности используют Acetobacter acetis, который выращивают в виде биопленки на поверхности древесных опилок или стружки. Лучший носитель – древесина бука.
Биомасса уксуснокислых бактерий может накапливаться в среде в виде биопленки и обладает рядом ценных качеств, которые используются в медицине. Такие биопленки на стружке называются биофильмами и применяются при лечении ожогов.
Анаэробное разложение целлюлозы
P. Clostridium – обитают в почве, компостах, навозе, речном иле, сточных водах. Они устойчивы к кислоте и живут в кислых почвах. Типичный представитель, разлагающий целлюлозу при температуре 30–40°С, Cl. omelianski – открытый в 1902 году Омельянским. Это палочка, 4–8 мкм, подвижен, толстые споры, похожа на барабанную палочку.
Разлагать целлюлозу может и другой микроорганизм – Cl. cellobioparum (мезофильный).
Есть и термофилы: Cl. thermocellum, оптимальная температура 60°С, максимальная – 70°С, при 40–45°С растет плохо. Хорошо растут на целлюлозе и плохо на сахарах.
В рубце жвачных есть специфичные целлюлозу разрушающие микроорганизмы.
От целлюлозы до глюкозы: уксусная, пропионовая, масляная, муравьиная, янтарная кислоты, СO2 и Н2.
Кокки и палочки: Ruminococcus albus
Ruminobacter parvum
p. Butyrovibrio
Целлюлоза – полимер с неразветвленной цепью.
этап – целлюлаза (фермент) – переводит целлюлозу в дисахарид – целлобиозу;
этап – в-глюкозидаза – переводит целлобиозу в глюкозу.
Конечные продукты образуемые некоторыми культурами:
Cl. omelianski: этиловый спирт, уксусная кислота, молочная кислота, муравьиная кислота, СО2 и Н2.
Cl. cellobioparum: этиловый спирт, уксусная кислота, муравьиная кислота, СО2 и Н2.
Термофилы:
Cl. thermocellum: этиловый спирт, уксусная кислота, молочная кислота, муравьиная кислота, СО2 и Н2. СН4 не образуют.
Разложение гемицеллюлозы
Гемицеллюлозы – входят в состав межклеточного вещества растительных тканей. Это гетерополисахариды: состоят из пентоз (ксилозы, арабинозы) или гексоз (глюкозы, манозы, галактозы).
Ксилан – полимер ксилозы – второй после целлюлозы.
Разлагаются неспецифичными микроорганизмами: Bacillus, Clostridium, Vibrio, Rhizopus, Streptomyces.
Ферменты – гемицеллюлазы.
Разложение лигнина
Лигнин – межклеточный компонент древесины (составляет 3–6% от сухого вещества, а древесина 15–30%). Не встречается в свободном виде. Молекулярная масса лигнина 1000–10 000, не растворим в воде и в органических растворителях.
Представляет собой трехмерный полимер фенольной природы. Очень устойчив к воздействию микроорганизмов. Разлагается очень медленно. Окисляется до альдегидов.
Разлагают: грибы – Fusarium lactis
Pseudomonas (термофилы)
Clostridium
В почве лигнин разлагается медленно до ванилина. Является основой образования гумусовых веществ.
Разложение пектиновых веществ
Пектины – межклеточные вещества растительных тканей. Это полисахариды – полигалактурониды, состоящие из б-D-галактуроновых кислот, соединенных 1,4-связями.
Есть три вида пектинов:
пропектин – водонерастворимая часть клеточной стенки;
пектин – водорастворимый полимер галактуроновой кислоты с метилэфирными связями;
пектиновая кислота – водорастворимый полимер галактуроновой кислоты без метилэфирных связей.
Большой активностью в разложении пектинов обладают Bacillus polymyxa, Clostridium pectinovorum, грибы.
Ферменты: пектиназа, пектинэстераза (гидролизует метилэфирные связи), пропектиназа.
Продукты разложения пектиновых веществ: ксилоза, арабиноза, галактоза, метиловый спирт, уксусная кислота, галактуроновая кислота.
Брожение пектина наблюдается при мочке лубоволокнистых растений – льна, конопли, джута. Замачивают в чанах при 32–38 °С в течении 3–5 суток.
Анаэробное разложение белков
Расщепление белков до пептидов осуществляют ферменты протеазы. Расщепление пептидов до аминокислот – пептидазы.
Пути расщепления:
дезаминирование;
декарбоксилирование.
Далее происходит расщепление до СО2 и органических кислот, аммиака, сульфатов, H2S и Н2О.
Из органических соединений: меркаптаны, индол, скатол – обладают неприятным запахом.
Сопряженное сбраживание двух аминокислот (реакция Стикленда)
Пептидолитические клостридии гидролизуют белки и затем используют аминокислоты.
Многие аминокислоты сбраживаются только вместе с какими-нибудь другими. Как установил Стикленд (1934г), Cl. sporogenes быстро сбраживает смесь аланина и глицина, но не может использовать ни ту, ни другую из этих аминокислот в отдельности.
Пример: аланин – донор водорода глицин – акцептор
Ацетат + СО2 + NH3
Источником энергии служит сопряженная реакция окисления-восстановления.
Доноры: лейцин, валин, глицин, метионин, изолейцин. Акцепторы: аргинин, триптофан, пролин.
Разложение хитина
Хитин – азотсодержащий полисахарид, полимер ацетилглюкозоамина. Он содержится в наружном скелете беспозвоночных животных, панцирных покровах насекомых, в клеточной стенке грибов.
Способностью разлагать хитин обладают бактерии родов: Pseudomonas, Flavobacterium, Bacillus, Streptomyces, Nocardia. Грибы: мукоровые, аспергиллы.
Фермент – хитиназа.
Хитин с помощью хитиназы превращается в хитобиозу, которая хитобиазой расщепляется до уксусной кислоты, аммиака и глюкозы.
ЛЕКЦИЯ №8
Вирусы
Вирусы – группа ультрамикроскопических внутриклеточных паразитов, размножающихся только в клетках живых организмов.
История вирусологии
Ивановский Дмитрий Иосифович (1892). Табак на Украине и Молдавии (рябуха – болезнь табака). В Никитском ботаническом саду, лаборатория Академии наук (1891) Ялта. «О двух болезнях табака». Вывод: бактерии, проходящие через фильтр Шамберлена, не способны расти на искусственных питательных средах – «фильтрующиеся бактерии». 1903 г. – защитил докторскую диссертацию в Киевском университете.
Леффер и Фрош в 1898 г. установили возбудителя болезни животных – ящура.
Размер самых мелких оказался 20–30нм, а наиболее крупных 300 нм. Хламидии и риккетсии относили к вирусам.
Три группы феноменов:
мозаичные болезни листьев растений;
болезни животных и человека;
явление бактериофагии.
Связанны причинно с деятельностью мельчайших микроорганизмов – вирусов.
Место вирусов в биосфере
Организм хозяина – это среда обитания вирусов, поэтому влияние внешних условий опосредовано, через организм хозяина. Есть температурочувствительные вирусы, которые размножаются при 32–37°С и гибнут при температуре 38–40°С.
Все вирусы паразиты. Каждый вирус имеет свой круг хозяев. Он может быть очень широкий, как, например, при бешенстве, или узкий – некоторые РНК-геномные фаги (лишь отдельные бактерии кишечной палочки). Циркуляция вируса может идти по горизонтали (в популяции) и по вертикали (от родителей к детям).
Строение вирусов
Введение термина «вирион» – 1966 г. Львов А., Турниер Р. – удачно заменило: особи, вирусные индивидуумы, вирусные частицы.
Изучение архитектуры вирусов показало, что генетическим веществом является нуклеиновая кислота, которая заключена в капсид – футляр из белковых молекул – икосаэдр (кубический тип симметрии), либо палочковидное тело. У некоторых вирусов – сложных – может быть суперкапсид. состоящий из белков и липидов (вирусы гриппа). Генетический материал представлен ДНК и РНК, одно- и двуспиральными, непрерывными и фрагментарными.
Virus – яд. Вирус отличается от микроорганизмов следующими особенностями:
содержат только одну нуклеиновую кислоту ДНК или РНК;
для репродукции необходима только нуклеиновая кислота;
они не способны размножаться вне живой клетки.
Вирусы не являются самостоятельными организмами.
Развитие вируса приводит к гибели клетки-хозяина.
Клеточные механизмы нужны для репликации нуклеиновой кислоты и синтеза белковой оболочки. Вне клетки вирус существует в виде вирусной частицы (вириона) или нуклеокапсидом.
Вирусы растений – фитопатогенные вирусы. Заражение происходит через повреждения, а не в результате активного внедрения. Переносчиками являются насекомые, в пищеварительном тракте которых происходит размножение. Генетическим материалом фитопатогенных вирусов является РНК.
Патогенные для человека и животных (оспа, ветрянка, корь, бешенство, полиомиелит (детский паралич), грипп, ящур и т.д.). переносятся насекомыми. Генетический материал ДНК или РНК. ДНК всегда двойная, РНК – из одной спирали.
Вирусы бактерий – бактериофаги. Геном – ДНК или РНК. «Стерильные пятна» (бляшки). Исследование фагов E.coli дало возможность изучить механизмы передачи генетического материала от клетки к клетке. Биологическая борьба с бактериями.
головка с ДНК
воротничок
стержень
чехол
хвостовые нити
базальная пластина
Есть:
голая спираль
с оболочкой