Добавил:
Upload Опубликованный материал нарушает ваши авторские права? Сообщите нам.
Вуз: Предмет: Файл:

304- Органическая химия_Черных В.П. и др_Х., 2007 -776с

.pdf
Скачиваний:
910
Добавлен:
07.03.2016
Размер:
40.34 Mб
Скачать

БелКИ

701

на. им установлено, что молекула состоит из двух полипептидных цепей, связанных между собой дисульфидными мостиками: а-цепь содержит 21 аминокислотный остаток и дополнительную дисульфидную связь, благодаря которой инсулин

впространстве образует петлю, а б-цепь — 30 остатков (рис. 35.6).

в1963—1964 году были синтезированы обе полипептидные цепи инсулина. инсулин различных ви-

дов животных и человека отличается по строению. Эти структурные различия приходятся на участок 8—10 цепи A. инсулин регулирует содержание глюкозы в крови, недостаток его в организме вызывает сахарный диабет.

к полипептидам относятся некоторые широко применяемые антибиотики. Грамицидин с — циклический декапептид, используемый для лечения заболеваний, вызванных стрептококками, пневмококками и им подобным, содержит, кроме аминокислотных остатков L-ряда, два остатка D-фенилаланина.

35.3. синТеЗ ПеПТидОв

в основе синтеза пептидов лежит процесс образования пептидной (амидной) связи между карбоксильной группой одной -аминокислоты и аминогруппой — другой.

однако из-за диполярной природы -аминокислот (цвиттер-ионная структура) проведение реакции требует высокого температурного режима, что способствует различным нежелательным побочным процессам (например, циклизации с образованием дикетопиперазинов, см. с. 511). в процессе синтеза возникают сложности, связанные с необходимостью соединять остатки -аминокислот в определенной последовательности. например, при взаимодействии глицина и аланина возможно образование четырех дипептидов:

Глава 35

702

Поэтому для проведения целенаправленного синтеза следует создать такие условия, при которых одна из аминокислот реагировала по карбоксильной группе, а другая — по аминогруппе. с этой целью осуществляют защиту функциональных групп (NH2 и COOH), не принимающих участия в образовании пептидной связи. защитные группы выбирают таким образом, чтобы затем каждую из них независимо друг от друга можно было легко удалить, не разрушая при этом пептидной связи.

для защиты аминогрупп используют реакцию ацилирования, чаще всего бензоксикарбонилхлоридом или трет-бутоксикарбоксазидом. важным свойством карбобензокси- и трет-бутоксикарбонильных групп является то, что они надежно защищают хиральный центр аминокислот от рацемизации. карбобензоксигруппу удаляют каталитическим гидрогенолизом, а трет-бутоксикарбо- нильную — с помощью трифторуксусной кислоты. для защиты карбоксильной группы используют реакцию этерификации.

с целью повышения эффективности процесса амидирования, осуществляют активацию карбоксильной группы N-замещенной аминокислоты путем превращения ее в хлорангидрид или в смешанный ангидрид (чаще взаимодействием с этилхлорформиатом).

Схема синтеза дипептида аланил-глицина: 1. защита аминогруппы аланина

2. активация карбоксильной группы N-защищенного аланина

3. защита карбоксильной группы глицина

БелКИ

703

4. образование пептидной связи и снятие защиты

синтез пептидов согласно приведенной схеме достаточно сложный и трудоемкий.

в1962 году роберт брюс Меррифилд предложил более совершенный метод получения пептидов, так называемый твердофазный синтез. сущность последнего состоит в том, что полипептидная цепь наращивается на твердом носителе без выделения промежуточных продуктов синтеза. Пептид, фиксированный на носителе, после каждой стадии тщательно промывают от избытка реагентов и побочных продуктов. отщепляют конечный продукт от носителя с помощью смеси бромоводородной и трифторуксусной кислот.

вкачестве твердого носителя используют зерна полимерной смолы, содержащей хлорметильные (CH2Cl) группы, называемые якорными группами, с которыми реагирует карбоксильная группа N-защищенной -аминокислоты. в результате взаимодействия происходит фиксация C-конца будущего полипептида на поверхности носителя. аминогруппу, как правило, защищают трет-бутоксикар- бонильной группой (бок), которая легко удаляется действием трифторуксусной

кислоты. Пептидная связь образуется в присутствии активатора карбоксильной группы — N,N -дициклогексилкарбодиимида (дцГк) C6H11N=C=NC6H11. широкое применение этого вещества связано с легкостью получения, простотой применения, а также скоростью и эффективностью протекания реакции конденсации в его присутствии:

в настоящее время твердофазный синтез пептидов проводят в специальных синтезаторах, где все этапы осуществляются автоматически с запрограммированной подачей соответствующих -аминокислот.

рис. 35.7. денатурация белка:
а -спираль; б — денатурированный белок

Глава 35

704

35.4. слОжные БелКи (ПрОТеиды)

в зависимости от структуры белки делят на простые (протеины) и сложные (протеиды). Последние, кроме белка, содержат в своей структуре химически свя-

занную с ним простетическую группу — небелковую часть молекулы. По природе простетической группы протеиды делят на липопротеиды, нуклеопротеиды, гли-

копротеиды, хромопротеиды, фосфопротеиды и металлопротеиды.

липопротеиды в качестве простетической группы содержат липиды, нуклеопротеиды — нуклеиновые кислоты, гликопротеиды — углеводы, хромопротеиды — пигменты, фосфопротеиды — фосфорную кислоту, металлопротеиды — металлы.

существуют также сложные белковые комплексы, в состав которых одновременно входят белки, липиды и углеводы, называемые гликолипопротеидами. они содержатся в соединительной ткани, клеточных стенках бактерий и др.

в зависимости от пространственной формы молекул белки делят на глобулярные и фибриллярные. Глобулярные белки имеют сферическую или эллипсоидную форму, фибриллярные — состоят из вытянутых нитевидных макромолекул, назы-

ваемых протеноидами.

Глобулярные белки (альбумин, глобулин) малоустойчивы к действию температуры, кислот и щелочей, а фибриллярные (белки волос, ногтей, эпидермиса; белки соединительной, костной, хрящевой ткани и др.) весьма устойчивы.

Под влиянием многих факторов (повышенная температура, изменение рн среды, уф- и -излучение и др.) происходит разрушение пространственной формы белков при сохранении первичной структуры. Этот процесс называется денатурацией бел-

ка (рис. 35.7).

денатурация является, как правило, необратимым процессом и приводит к потере биологических функций белков. Примером тепловой денатурации является «свертывание» яичных белков при варке яиц. При денатура-

ции происходит разрыв водородных связей, стабилизирующих пространственную форму белка. денатурированный белок теряет растворимость, в результате чего первоначальная пространственная форма его не может быть восстановлена. денатурация может быть также вызвана образованием нерастворимых солей белков. Это происходит при отравлении солями тяжелых металлов (ртути, свинца и др.). в качестве противоядия в таких случаях применяют белки с повышенным содержанием кислотных групп, например, яичный альбумин. выступая в качестве конкурента, эти белки связывают металлы с образованием нерастворимых солей, которые выводятся из организма.

глава 36

нуКлеинОвые КислОТы

Нуклеиновыми кислотами (полинуклеотидами) называют биополимеры, осу-

ществляющие хранение и передачу генетической информации во всех живых организмах, непосредственно участвующие в биосинтезе белка.

нуклеиновые кислоты (от лат. nucleus — ядро) впервые обнаружены в 1868 году швейцарским химиком иоганном фридрихом Мишером в ядрах клеток. Позже аналогичные вещества найдены в протоплазме клеток.

они входят в состав сложных белков — нуклеопротеидов, содержащихся во всех клетках организма человека, животных, растений, бактерий и вирусов. количество нуклеиновых кислот в различных нуклеопротеидах, кроме вирусных, колеблется в пределах от 40 до 65 %.

36.1. сТрОение нуКлеинОвыХ КислОТ

нуклеиновые кислоты, подобно белкам, представляют собой высокомолекулярные органические соединения, но в отличие от белков, образующих при гидролизе -аминокислоты, мономерными единицами нуклеиновых кислот являются нуклеотиды. Поэтому нуклеиновые кислоты называют еще полинуклеотидами.

Мономеры нуклеиновых кислот — нуклеотиды — имеют также достаточно сложное строение. При гидролизе нуклеотидов образуется углевод, ортофосфорная кислота и гетероциклические основания.

Химическая структура, состоящая из углевода и гетероциклического основания,

называется нуклеозидом.

в целом гидролиз нуклеиновых кислот можно представить схематически:

в зависимости от природы углевода, входящего в состав нуклеотидов, нуклеиновые кислоты подразделяют на два вида — дезоксирибонуклеиновые кислоты (Днк), содержащие углевод 2-дезокси-D-рибозу и рибонуклеиновые кислоты (Рнк), включающие углевод D-рибозу.

2-дезокси-D-рибоза и D-рибоза входят в состав нуклеиновых кислот в -фу- ранозной форме:

Глава 36

706

Входящие в состав нуклеиновых кислот гетероциклические основания являются производными пурина и пиримидина. К основаниям группы пурина отно-

сятся аденин (А)1 и гуанин (G):

Основаниями группы пиримидина являются урацил (U), тимин (T), цитозин (C):

В состав ДНК входят аденин, гуанин, цитозин и тимин, в состав РНК — аденин, гуанин, цитозин, урацил. Для гуанина, урацила, тимина и цитозина харак-

терна лактам-лактимная таутомерия:

В состав нуклеиновых кислот могут входить гипоксантин, метильные производные урацила и гуанина, гидрированные производные урацила и др.

1 Для удобства нуклеиновые основания принято обозначать однобуквенными символами.

нУКлеИнОВЫе КИСлОТЫ

707

внуклеиновых кислотах органические основания связаны N-гликозидной связью с остатком D-рибозы или 2-дезокси-D-рибозы. Гликозидная связь осуществляется за счет полуацетального гидроксила моносахарида (C-1 )1 и атома водорода при N-1 в пиримидиновых или N-9 в пуриновых основаниях.

N-Гликозиды, состоящие из остатков нуклеиновых оснований и D-рибозы или 2-дезокси-D-рибозы, называют нуклеозидами.

взависимости от природы углеводного остатка различают рибонуклеозиды

идезоксирибонуклеозиды.

названия нуклеозидов образуют аналогично названиям гликозидов. так, нуклеозид, состоящий из рибозы и урацила, называют -урацилрибофуранозидом, нуклеозид из дезоксирибозы и аденина — -адениндезоксирибофуранозидом и т. д. однако чаще применяют названия, которые для рибонуклеозидов образуют из тривиальных названий соответствующих нуклеиновых оснований с окончанием -идин у пиримидиновых и -озин у пуриновых нуклеозидов:

1 для отличия углеродных атомов рибозы и дезоксирибозы от углеродных атомов, входящих в состав пуриновых кислот и пиримидиновых оснований, первый принято обозначать символом «штрих», например с-3 .

Глава 36

708

в названиях дезоксирибонуклеозидов дополнительно вводится префикс дезок- си-: дезоксиаденозин, дезоксигуанозин, дезоксицитидин. исключение составляет название нуклеозида, состоящего из дезоксирибозы и тимина — тимидин (вместо дезокситимидина).

являясь N-гликозидами, нуклеозиды в кислой среде подвергаются гидролизу. Пуриновые нуклеозиды гидролизуются очень легко, пиримидиновые — труднее.

внуклеиновых кислотах гидроксильная группа у с-5 или с-3 пентозного остатка нуклеозида этерифицирована ортофосфорной кислотой.

Структурная единица нуклеиновых кислот, состоящая из остатков нуклеозида

ифосфорной кислоты, называется нуклеотидом.

взависимости от природы пентозы различают рибонуклеотиды и дезоксирибо-

нуклеотиды.

в номенклатуре нуклеотидов используют два подхода. с одной стороны, их рассматривают как сложные эфиры — монофосфаты, а с другой — как кислоты

(табл. 36.1).

 

 

Таблица 36.1

номенклатура нуклеотидов

 

 

 

 

названия нуклеотидов как монофосфатов

 

названия нуклеотидов как кислот

 

 

 

аденозин-5 -монофосфат (аМф)

 

5 -адениловая кислота

 

 

 

Гуанозин-5 -монофосфат (ГМф)

 

5 -гуаниловая кислота

 

 

 

цитидин-5 -монофосфат (цМф)

 

5 -цитидиловая кислота

 

 

 

уридин-5 -монофосфат (уМф)

 

5 -уридиловая кислота

 

 

 

дезоксиаденозин-5 -монофосфат (даМф)

 

дезоксиадениловая кислота

 

 

 

дезоксигуанозин-5 -монофосфат (дГМф)

 

дезоксигуаниловая кислота

 

 

 

дезоксицитидин-5 -монофосфат (дцМф)

 

дезоксицитидиловая кислота

 

 

 

тимидин-5 -монофосфат (тМф)

 

тимидиловая кислота

 

 

 

нУКлеИнОВЫе КИСлОТЫ

 

 

 

70

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

При гидролизе

нуклеиновых кислот,

наряду

 

 

 

 

 

 

 

 

 

с нуклеозид-5 -фосфатами, образуются также нук-

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

леозид-3 -фосфаты.

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Положение остатка фосфорной кислоты оп-

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

ределяется местом разрыва фосфодиэфирной связи

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

между соседними нуклеотидами.

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

нуклеиновые кислоты

представляют

 

собой

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

продукты полимеризации мононуклеотидов. нук-

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

леотиды связываются в длинные цепи с помощью

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

фосфодиэфирных

связей,

которые образуются

 

 

 

 

 

 

 

 

 

с участием гидроксила при с-3 предыдущего нуклеотидного звена и гидроксила при с-5 последующего нуклеотидного звена:

Мононуклеотиды, динуклеотиды и их производные присутствуют в клетках также в свободном виде и играют важную роль в обмене веществ. во всех тканях организма, наряду с нуклеозидмонофосфатами, содержатся ди- и трифосфаты нуклеозидов.

особенно широко известны аденозин-5 -фосфат (аМф), аденозин-5 -дифос- фат (адф) и аденозин-5 -трифосфат (атф). Эти нуклеотиды способны взаимопревращаться путем фосфорилирования (присоединение одного или двух остатков фосфорной кислоты к аМф), либо дефосфорилирования (отщепление одного или двух остатков фосфорной кислоты от атф). При дефосфорилировании выделяется значительное количество энергии, использующееся в организме для протекания тех или иных биологических процессов, например, в биосинтезе белка.

Глава 36

710

связь ор между остатками фосфорной кислоты в молекулах нуклеозидполифосфатов является макроэргической связью1, при разрыве которой выделяется значительное количество энергии. Поэтому атф во многих биохимических процессах выполняет роль поставщика энергии.

36.2. риБОнуКлеинОвые (рнК) и деЗОКсириБОнуКлеинОвые (днК) КислОТы

нуклеиновые кислоты представляют собой высокомолекулярные гетерополимеры, состоящие из чередующихся остатков ортофосфорной кислоты и рибозы или дезоксирибозы, связанных с нуклеиновыми основаниями, которые выступают в полимерной цепи как «боковые группы» (рис. 36.1).

Определенная последовательность нуклеотидных звеньев в полинуклеотидной цепи называется первичной структурой нуклеиновых кислот.

1 Макроэргическими принято считать те связи, при разрыве которых выделяется энергия не менее 20 кдж/моль.