Добавил:
kiopkiopkiop18@yandex.ru Вовсе не секретарь, но почту проверяю Опубликованный материал нарушает ваши авторские права? Сообщите нам.
Вуз: Предмет: Файл:
5 курс / Пульмонология и фтизиатрия / Клинико_фармакологический_подход_к_оптимизации_антибактериальной.pdf
Скачиваний:
0
Добавлен:
24.03.2024
Размер:
6.26 Mб
Скачать

68

олигонуклеотидом, содержащим на 5’-конце флуоресцентную группу (5(6)-

карбоксиродамин), а на 3’-конце тушитель флуоресценции (BHQ1, “Синтол”,

Москва, РФ). При эндонуклеазном гидролизе наблюдается увеличение флуоресценции красителя. Для калибровки использовали стандартный раствор ДНКазы 1. Калибровочная кривая связывает величину разгорания флуоресценции красителя с концентрацией ДНКазы 1 в растворе. Результат приводится в единицах ДНКазной активности (ед. акт.) 1 единица соответствует активности ДНКазы1, взятой в концентрации 1 нг/мл (1 час, 37 °С). Относительная стандартная ошибка метода – 5%» [293].

В. Выделение внеклеточной ДНК

Образцы крови собирали в вакутейнеры с гепарином, инкубировали при температуре окружающей среды в течение 30 мин, центрифугировали при

4000 об/мин, затем 2 мл и более плазмы переносили в пробирку и хранили при минус 18 °С – минус 20 °С до проведения анализа. «ВкДНК экстрагировали методом фенольной экстракцией. Концентрацию вкДНК измеряли методом флуоресценции с интеркалирующим красителем PicoGreen (Invitrogen).

Клетки удаляли из крови центрифугированием с последующим смешиванием 3 мл плазмы с 0,3 мл раствора, содержащего 1%-й

лауроилсаркозинат натрия, 0,02 М ЭДТА и 75 мкг/мл РНКазы А (Sigma-Aldrich;

Merck KGaA, Дармштадт, Германия), инкубация в течение 45 мин с воздействием протеиназы К (200 мкг/мл, Promega Corporation, Мэдисон, Висконсин, США) в

течение 24 часов при 37 °С.

После двух циклов очистки насыщенным раствором фенола фрагменты ДНК осаждали добавлением двух объемов этанола в присутствии 2М ацетата аммония. Затем осадок дважды промывали 75%-м этанолом, сушили и растворяли в воде. Концентрацию вкДНК определяли путем измерения интенсивности флуоресценции на 'LS 55' (PerkinElmer, Inc., Уолтем, Массачусетс, США) после окрашивания ДНК PicoGreen (Invitrogen, Thermo Fisher Scientific, Inc., Уолтем).

Относительная стандартная ошибка составила 10±4%» [294].

Рекомендовано к покупке и изучению сайтом МедУнивер - https://meduniver.com/