Добавил:
Опубликованный материал нарушает ваши авторские права? Сообщите нам.
Вуз: Предмет: Файл:

С.Дж.Перт

.pdf
Скачиваний:
41
Добавлен:
10.06.2023
Размер:
11.63 Mб
Скачать

Определение биомассы

31

3.6.2. Факторы,

влияющие на количество рассеянного света

На степень мутности суспензии организмов может оказы вать влияние целый ряд важных физических и биологических

факторов, из которых не все поддаются учету. Соотношение между концентрацией организмов х и длиной светового пути l, а также интенсивность света, падающего lo и прошедшего lt,

выражается уравнением

log(/ 0//t) =А· х l.

Значение log (/0//1) называется непрозрачностью, оптической

плотностью или экстинкцией. Коэффициент А - величина по­

стоянная при небольших концентрациях бактерий, но при боль­

ших начинает увеличиваться вследствие вторичного рассеяния,

так как свет наталкивается больше, чем на одну частицу.

В нефелометрии ls - интенсивность рассеянного света, log (lo/fs) = х l, где В - константа. Абсорбциометрия

используется чаще, чем нефелометрия, вероятно, из-за большей

доступности абсорбциометров.

Степень и направление рассеянного света зависят от раз­

мера и формы частицы, длины света.вой волны и разницы между показателем преломления частиц и среды. Эти влияния были

выражены Пауэллом [267] в виде двух законов:

1. Общее количество рассеянного света увеличивается с уве­

личением отношения размера частиц к длине световой волны.

С этой точки зрения следует выбирать свет с наиболее низкой

длиной волны. На практике обычно используется зеленый свет

с длиной волны около 540 нм, так как в случае световых волн

с более низкой длиной волны может быть избыточное поглоще­

ние света.

2. Общее количество рассеянного света тем больше, чем

больше различие между показателем преломления у частиц и

среды. О влиянии показателя преломления свидетельствует раз­

личие в контрасте между колониями разных бактерий и средой

на пластинке arapa. Стафилококки, например, более контраст­ ны, чем Escherichia coli, так как они характеризуются более высоким показателем преломления. 'Концентрация твердых

частиц в среде может значительно влиять на ее показатель пре­

ломления. Гильби и Фью [106] рекомендуют при определении

оптической плотности вносить поправку на показатель прелом­

ления. Осмотическое набухание бактерий в гипотонической сре­

де может привести к значительному уменьшению оптичеrкой

плотности, вероятно вследствие уменьшения показателя прелом­

ления клеток [106, 197]. Набухание указывает на эластичность клеточных стенок некоторых организмов. Например, у Escherichia

32

Глава 3

coli этот эффект наблюдается, а у стафилококковнет (215]. Чтооы избежать влияния коэффициента показателя преломле­

ния и осмотического давления на оптическую плотность, тонич­

нос·1ъ добавляемой жидкости и клеточной суспензии должна

быть одна и та же.

Существует предположение, что оптическая плотность про­

порциональна концентрации клеток независимо от числа клеток.

Однако относительно этой точки зрения нельзя сделать каких­

либо общих утверждений, хотя это, возможно, и справедливо в

некоторых специальных случаях [267].

 

Розенбергер и Элсден

(281] установили, что отношение опти­

ческой плотности к весу

сухой биомассы

Streptococcus faecalis

не зависело от удельной

скорости роста,

которая, казалось бы,

должна изменять это отношение, поскольку с увеличением ско­

рости роста увеличивается и размер клеток. Было установлено, что в периодической культуре Klebsiella aerogenes это отноше­ ние падает на 8% при достижении культурой стационарной фазы [114]. Иногда, прежде чем измерять оптическую плотность,

необходимо добавлять в клеточную суспензию токсичные соединения. Для этой цели часто испоJ1ьзуется раствор форма­

лина ( l %). Обработка формалином предотвращает изменение

оптической плотности при изменении тоничности среды [l 97].

Следовательно, обработка формалином может, по-видимому, быть использована для стабилизации оптической плотности.

Предложен метод определения биомассы в эмульсии угле­

водородов, основанный на измерении мутности. Эмульсия

нефть - вода делается прозрачной при добавлении пропионовой

кислоты [200].

3.7.Подсчет клеток и органелл

3.7.1.Общая картина и общий подсчет

Биомассу можно определять двумя путями: l) подсчетом общего числа индивидуальных организмов или органелл (та­ ких, например, как ядра, присутствующие в образцах) с по­ мощью микроскопов или некоторых электронных приборов или 2) подсчетом жизнеспособных колоний, вырастающих из инди­

видуальных клеток. Недостаток метода подсчета состоит в том,

что если число клеток в пробе мало, то ошибка выборки неиз­

бежна. Преимуществом метода является его специфичность и

более высокая (по сравнению с другими методами) чувствитель­

ность (табл. 3).

Выборки из сосчитанного числа клеток подчиняются закону распределения Пуассона. Если п - число сосчитанных opra•

 

 

Определение биомассы

 

 

33

низмов, то стандартное отклонение б = п½ и с

вероятностью

95%

границы

доверительного интервала лежат

в

пределах

п ± 26. Это означает, что п должно быть больше 400,

если

мы

хотим

иметь

95%-ный доверительный интервал

меньше,

чем

10% среднего значения. Более подробные сведения об ошибках

при методе счета клеток можно найти в работе Мейнелла и

Мейнелл [210].

Визуальные подсчеты имеют то преимущество, что наблю­

датель может различать виды организмов, которые надлежит

подсчитать, и другие типы частиц или организмов в среде.

Число животных клеток определяют подсчетом ядер, выделяю­ щихся из клеток при добавлении О, 1 М лимонной кислоты и окрашивании кристалвиолетом [235, 287, стр. 327].

Электронные приборы для счета, такие, как счетчик Коулте­

ра, удобны при большом числе измерений и уменьшают ошибку выборки, так как дают возможность просчитать большое число проб. При работе с клетками малых размеров, таких, как бак­

терии, следует соблюдать особые предосторожности, чтобы изба­

виться от помех, вносимых фоновым шумом [142].

J.7.2. Подсчет живых клеток

Наиболее важные методы, основанные на способности инди­

видуальных организмов к размножению и образованию колоний,

которые можно подсчитать, описаны Мейнеллом и Мейнелл [210]. Для подсчета живых клеток должны использоваться не

минимальные, а богатые среды, поскольку изолированные ин­

дивидуальные клетки более требовательны к питанию, среде, чем плотная популяция в целом. С помощью метода элективных

сред можно пересчитать организмы разных типов, которые при­

сутствуют в смеси.

Метод подсчета, основанный на разбавленИ,И и используемый

при бактериологическом анализе воды, состоит в учете не про­ росших разведений после высева суспензии организмов в ряд пробирок со средой. Преимущество данного метода состоит в

том, что он дает возможность определять малые концентрации

организмов ( < l клетка/мл). Однако поскольку размер пробы мал, то велика ошибка измерения. Вместо метода подсчета с

помощью разбавления используется метод фильтрации через мембранные фильтры и выращивание видимых колоний на

фильтре.

3.8. Методы окрашивания

Наиболее бесспорный метод определения числа живых и

мертвых клеток состоит в сравнении чи::ла колоний и общего числа клеток. В некоторых случаях мертвые и живые клетки

2 Зак. 737

34

Глава 3

могут быть дифференцированы с помощью окрашивания краси"

телями. Живые клетки млекопитающих непроницаемы для три­

панового синего, а мертвые клетки воспринимают эту окраску.

Для культур дрожжевых клеток аналогично используется эозин.

Красители, окрашивающие только живые клетки, называются

витальными красителями. Окрашенные клетки млекопитающих

в культуре с нейтральным красным используются как количе­

ственный тест для определения клеток, переживающих вирус"

ную атаку [99].

Глава 4

ПЕРИОДИЧЕСКАЯ КУЛЬТУРА И КУЛЬТУРА ПОЛНОГО ВЫТЕСНЕНИЯ (ТУБУЛЯРНАЯ КУЛЬТУРА)

4.1. Открытые и закрытые системы

Культуры микроорганизмов можно подразделять на «откры­

тые» и «закрытые» системы. Открытая система - это система, все компоненты которой могут поступать в систему и покидать ее. Закрытой называют такую систему, в которой хотя бы один

из существенных компонентов не может ни поступать в систему,

ни покидать ее. Следовательно, непрерывные культуры, в кото­

рых происходит, с одной стороны, приток питательной среды, с другой - отток биомассы и других продуктов, являются откры­ тыми системами. Простая периодическая культура, содержащая

ограниченное первоначальное количество питательного субстра­

та, служит примером закрытой системы. В закрытой системе

скорость роста биомассы должна стремиться к нулю либо из-за недостатка субстрата, либо из-за непереносимости продукта при

его дальнейшем накоплении. Следовательно, такие системы всегда находятся в неустойчивом состоянии. В отличие от этого

воткрытых системах всегда есть возможность, что скорость

превращения субстрата в продукты и биомассу сбалансируется

со скоростью выхода, иными словами, всегда может устано­ виться стационарное состояние.

4.2.Фазы роста простой периодической культуры

Впростой гомогенной периодической культуре все ее части

находятся в одинаковых условиях. На рис. 6 изображены раз­ личные фазы роста такой культуры. Эти фазы отражают изме­ нения в биомассе и в окружающей среде. После лаг-периода

(гл. 19) наблюдается максимальная скорость роста, затем рост

прекращается либо из-за недостатка источников питания, либо из-за накопления ингибирующих продуктов, либо из-за некото­ рых изменений в физических свойствах среды. После того как

биомасса достигнет максимума, наступает стационарная фаза, в

которой количество биомассы остается постоянным. Затем, рань­

ше или позже, количество биомассы уменьшается в результате

метаболических процессов, связанных с поддержанием жизне­

деятельнuсти, или автолиза.

2*

36

Глава 4

Продолжительность экспоненциального роста частично зави­

сит от начальной концентрации субстрата, лимитирующего tуест.

Рассмотрим

случай, когда эта

концентрация равна I r/л, а

Ks= 4 мr/л.

Тогда из уравнения

(2.21) следует, что µ > 0,95 µт

до тех пор, пока не поглощаются 92% субстрата, лимит,ирующе­ rо рост. Следовательно, период, когда недостаток источников

питания влияет на рост, ограничен лишь небольшой частью

 

 

 

 

 

i

I

Jl

Jll

IY

V

1 VI

 

 

 

 

 

1

 

 

 

 

 

 

I_

 

 

 

 

 

1

 

 

 

 

 

 

1

 

Время

Рис. 6 Шесть фаз на кривой роста периодической культуры.

/-лаг-фаза; /l-фаза ускорения роста; //J-фаза экспоненциального роста; /V-фаза

замедления роста: V-стацнонарная фаза: V/-фаза отмирания.

последней генерации. Это поведение типично для простых перио­

дических культур и говорит о том, что для них характерен ре­

жим питания экстремального типа, т. е. рост при избытке суб­

страта внезапно сменяется rолоданием. Следовательно, периоды

роста при скоростях ниже максимальной недостаточно длинны

для того, чтобы организм мог приспособить свою структуру к

оптимальной для данной скорости роста. Это ограничение ТV!О­

жет быть отчасти преодолено с помощью специально разрабо­ танного ведения периодического культивирования (гл. 21), а

полностью снять его возможно только в хемостатной культуре.

Поведение нерастущей биомассы, которая представляет со­

бой стационарную фазу роста и фазу отмирания, описано в

гл. 18. Кажущееся замедление роста, стационарная фаза и фаза

отмирания могут наступить, если возникнут некоторые условия,

летальные для организмов. При этом наблюдаемая скорость

роста будет определяться разностью между действительной ско­

ростью роста и скоростью отмирания клеток (гл. 7).

Периодическая культура и культура полного вытеснения

37

4.3. Оценка роста по одной точке

Иногда длительность роста в периодических культурах

сравнивают не по кривым роста, а по одной-единственной точке

роста, определяя ее после некоторого произвольного промежутка

времени. Следует отметить, что разность результатов, соответ­

ствующих этой единственной точке, можно интерпретировать

несколькими способами. Эта разность может отражать разли­

чия в длительности лаг-периодов, максимальной удельной ско­ рости роста, максимальной плотности популяции, концентрации ингибирующих продуктов или скорости отмирания биомассы.

Следовательно, пока из других данных не станет ясно, какие

из этих возможностей следует исключить, оценку роста по од­

ной точке следует принимать как комбинацию всех этих эффек­

тов. Такая оценка не дает возможности вычислить какие-либо

параметры роста.

4.4. Математическая модель

простой периодической культуры

Если рост периодической культуры ограничен только лишь начальным количеством субстрата, то кривую роста можно

предсказать, исходя из параметров роста. В модели, впервые

предложенной Моно (216, стр. 123], мь1 имеем

dx/dt . µх,

(4.1)

 

µ .;,...µms/(s+Ks),

(4.2)

х -

х0 = У (s0 - s),

(4.3)

где хо и so - начальные

концентрации биом,ассы

и лимитирую­

щего рост субстрата соответственно. Подста~ляя значение µ и s

3 уравнение (4.1), получаем

dx/dt = µт (У_~+.,х0 - х) x/(KsY +s0Y +Хо - х).

(4.4)

При интегрировании получим х в зависимости от t

 

х

 

 

t

 

f (К5У + s0Y + Хо -

х) dx _

\ cft

(4.5)

J

(rs 0 +xo-x)•,X

-µт~- ·

х,

 

..

О·.

 

Сгруппировав члены левой части уравнJния (4.5), получим

х

 

х

 

 

 

 

р f

dx

f

dx

х '

 

Jх +Q .} Уs0

+

х0-

(4.6)

 

 

 

 

 

 

,;де Р= (K.,Y+soY+xo)/(Yso+xo)

и

Q=KsY/(Yso+xo).~

 

Решение уравнения (4.5) дает

·

 

 

 

 

Р ln (х/х0) -

Q \п {(Ys0 + х0 -

x)/Ys0} = µmt.

(4.'l)

Периодическая культура и культура полного вытеснения

39

Обычные вариации кривой роста показаны на рис. 7. Если

~актериальную массу измеряют по мутности, то часто наступ­

лению стационарной фазы предшествует небольшое уменьше­ _ние- UТТТТТЧе-СRой-п..iютности -(р-йс: 7, АJ:-Этб-можёт -бь1ть -артефак­

том, вызванным изменением отношения биомассы к оптической

плотности. Другим отклонением от идеальной формы кривой

роста, представленным на рис. 7, Б, является более быстрое

увеличение числа организмов во время первого удвоения, что

может быть обусловлено синхронным делением популяции

одноклеточных организмов. Обычно деление становится полно­

стью асинхронным примерно после двух генераций. Третий ва­

риант (рис. 7, В), называемый дuауксuей, свидетельствует о

последовательном использовании субстратов. Классическим при­

мером такого случая служит использование сначала глюкозы,

потом лактозы у Escherichia coli. Перегиб на кривой роста или

даже уменьшение биомассы соответствует моменту, когда исчерпывается первый субстрат и индуцируется новая фермент­ ная система, атакующая второй субстрат. Изучение этого явле­ ния при определенных обстоятельствах позволяет внести неко­ торую ясность в механизмы синтеза белка.

4.6.Культура полного вытеснения (тубулярная культура)

4.6.1.Общие положения

Культура полного вытеснения моделирует периодическую

культуру в открытой системе (рис. 8, А). В идеале инокулят и

среда перемешиваются на входе в систему, затем культура без

перемешивания с постоянной скоростью течет через ферментер.

Таким образом, все элементы культуры должны были бы иметь

одно и то же «время удержания» в сосуде при прохождении

через сосуд.

Если

V - объем (л) сосуда для культивирования,

F - скорость

(л/ч)

течения культуры через ферментер, то время

«удержания» культуры, или время «замещения>> (replacemeпt),

дается формулой tr = V/F. В культуре полного вытеснения

неизбежно происходит некоторое перемешивание; это вызвано градиентом скорости в любом сечении сосуда с наибольшим значением скорости в центре сосуда. Если при прохождении культуры вдоль ферментера происходит некоторое перемешива­

ние, то время удержания распределено около среднего значе­

ния tr по закону Гаусса (рис. 9).

4.6.2. Культура без возврата биомассы

Эта система представлена на рис. 8, А. Если начальная кон­

центрация лимитирующего рост субстрата S,x » Ks, то рост био­

массы в каждом малом элементе культуры (dv на рис. 8, А).

40 Глава 4

может быть представлен с помощью уравнения периодического

роста. При этом µ = µт, до тех пор пока не исчерпан лимити-

рующий субстрат, тогда

 

 

 

 

 

 

 

 

(4.8)

. где Ха, - начальная

 

концентрация

биомассы, а

х- концентра­

ция биомассы во время t. Если v -

объем культуры, полученный

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

1

1

 

 

 

 

 

 

:

1

 

 

Ку.Аьтура

 

 

 

 

 

 

иноку.лят

 

dv

 

 

 

 

 

 

 

 

 

-

 

 

 

 

 

 

 

 

А

 

 

 

 

 

~~

 

~~

 

с

 

x=j"

 

 

x=iw

/

s=Sw

t

 

 

 

 

f

r

:схх,·

F

 

 

 

___._~

- t

 

Cpe-=ila'"'•--,.f--.--i,

 

 

_,

____

..

 

, _[§____.~F

'--

 

 

 

 

 

 

 

Рис. 8. Культура полного вытесиеиия (тубулярная, схематически).

А. Без возврата биомассы. Б. С возвратом биомассы F, F5 н аF8-скорости потока в раз•

личных точках; х-концентрацня биомассы; s-концt-нтрацня лимитирующего рост суб­ страта; У-объем культуры; dv-малый элемент объема культуры; С-устройство для

концентрирования биомассы.

оВремя

Рис. 9. Распределение времени удержания в почти идеальной культуре

полного вытеснения.

Аf-частнца первоначально впрыснутого малого объема материала, появляющаяся из

сосуда в каждый интервал времеин дt.

Соседние файлы в предмете Биотехнология