14. Лабораторная диагностика тб. Молекулярно-генетические методы (GeneXpert, tb-Lamp, проба на стрипах) – описание методов, преимущества, недостатки, ограничения.

Полимеразная цепная реакция (ПЦР) является одним из наиболее быстрых и информативных методов выявления МБТ

Принцип метода состоит в увеличении в 106—108 раз числа копий специфического участка ДНК МБТ, катализируемого in vitroRH К-полимеразой в автоматическом режиме

В искусственных условиях воспроизведение процесса репликации специфического или определенного вида или рода возбудителей участка генома возможно при условии знания его нуклеотидной последовательности

Применение методов детекции продуктов репликации таких участков (ампликоны) позволяет констатировать наличие возбудителя в исследуемой пробе

Метод обладает высокой чувствительностью – он позволяет обнаруживать возбудитель при содержании всего нескольких сотен микроорганизмов в 1 мл исследуемого материала (мокроты, крови, плеврального выпота и т.д.)

Результат исследования можно получить в течение 5–6 ч.

Этот высокочувствительный метод в ряде случаев может давать ложноположительные результаты, что ограничивает достоверность исследования

Достоинства метода ПЦР

⎯ Прямое определение наличия возбудителей

⎯ Быстрота проведения анализа ПЦР можно проводить с любым диагностическим материалом

⎯ Высокая специфичность

⎯ Высокая чувствительность

⎯ Внедрение ПЦР позволило: значительно сократить сроки подтверждения диагноза туберкулеза контролировать эффективность химиотерапии у больных туберкулезом

DNA-STRIP технология

Принцип метода

На ДНК-стрипы нанесены специфические пробы, которые комплементарны амплифицируемым нуклеиновым кислотам (ампликонам). После денатурации одноцепочечные ампликоны специфически связываются с пробами на стрипах (гибридизация) и затем визуализируются в последовательной энзиматической реакции (со стрептавидином и щелочной фосфатазой).

———————————————————————————————————————————

15.Тест лекарственной чувствительности микобактерии туберкулёза – описание методов, преимущества, недостатки, ограничения.

1. Метод абсолютных концентраций;

2. Метод соотношения резистентности;

3. Метод пропорций.

Метод абсолютных (предельных) концентраций заключается в следующем. Микобактерий выращивают на питательных средах, содержащих противотуберкулезные препараты (ПТП) в различных концентрациях. Определение лекарственной чувствительности МБТ может быть

• прямым (посев на среды с противотуберкулезными препаратами патологического материала) Позволяет значительно ускорить процесс получения результата, но им можно пользоваться только тогда, когда микобактерий обнаруживаются в исследуемом материале бактериоскопически и содержатся в нем в значительном количестве.

• непрямым (посев на среды с противотуберкулезными препаратами выделенных культур микобактерий).

Лекарственную чувствительность можно определять на плотных и жидких питательных средах. В современной лабораторной практике ее обычно определяют на среде Левенштейна-Йенсена, не содержащей крахмала. При определении лекарственной чувствительности на плотных питательных средах результат учитывают через 3 недели после посева по макроросту МБТ на поверхности среды, на жидких питательных средах — через 10-12 дней по наличию микроколоний в виде переплетающихся жгутов и кос в мазках из осадка.

Плюсы: На плотных средах можно получить более четко сравнимые результаты. Определение лекарственной чувствительности на жидких средах более трудоемко, требует микроскопии препаратов, но результат может быть получен в более короткие сроки. Недостатком этого способа является то, что больные, леченные антибактериальными препаратами, могут выделять микобактерий, лишенные корд-фактора, не дающие при размножении жгутов или паукообразных микроколоний, наличие которых служит критерием устойчивости к препарату.

Метод соотношения резистентности заключается в определении соотношения минимальных ингибирующих концентраций противотуберкулезных препаратов для тестируемого штамма и референс-штаммаH37R.V, чувствительного ко всем препаратам. Величина соотношения 2 и менее характеризует штамм как чувствительный, 8 и более — как устойчивый.

Вариантом метода минимальных ингибирующих концентраций является E-test. Лекарственная устойчивость микобактерий с использованием этого метода определяется на чашках с агаровой средой, на которые помещают полоски, содержащие градиент концентраций противотуберкулезных препаратов. Чувствительность микобактерий к препаратам оценивается по наличию зоны ингибирования роста микобактерий вокруг полоски. ИспользованиеE-test позволяет определять лекарственную чувствительность МБТ в течение 5-10 дней.

Метод пропорций заключается в определении соотношения числа колоний, выросших на среде, содержащей противотуберкулезный препарат, и числа колоний в контрольной пробирке, не содержащей препарата. Это соотношение является отражением пропорции резистентных бактерий в популяции. Метод позволяет количественно оценить степень резистентности штамма МБТ, однако широкое применение его в классическом варианте затруднено вследствие большой трудоемкости. Определение лекарственной чувствительности микобактерий методом пропорций может проводиться с использованием автоматических системВАСТЕС, MGIT, Esp Culture Systemи др.

В качестве критериев для отнесения штаммов МБТ к категории чувствительных или устойчивых используют пороговые значения минимальных ингибирующих концентраций (МИК) ПТП, избранные на основе комплекса микробиологических, фармакокинетических и клинических показателей.

Данные о величине МИК ПТП в отношении штаммов МБТ, выделенных от больных, служат микробиологическим критерием для определения величины пороговых концентраций.

Кроме того, при определении пороговых МИК учитывают данные по фармакокинетикс ПТП.

Основным показателем при этом является максимальная концентрация ПТП, которая создается в сыворотке крови после приема ПТП в среднетерапевтической дозе.

Четкая зависимость между этим показателем и величинами пороговых МИК отсутствует.

В самом общем виде можно лишь сказать, что пороговые МИК не могут быть выше максимально достижимых в сыворотке крови.

И, наконец, третьим критерием для определения пороговых значений МИК служат данные о клинической эффективности ПТП при заболевании, вызываемом микроорганизмами с различными МИК. Таким образом, предложенные в разных странах пороговые значения МИК ПТП являются плодом консенсуса между ведущими экспертами, а не результатом точных расчетов. По мере накопления опыта их периодически пересматривают. Несмотря на определенную условность рекомендованных пороговых значений МИК ПТП, они являются единственной основой для первого этапа интерпретации результатов оценки чувствительности МБТ к ПТП.

———————————————————————————————————————————