- •Перечень сокращений
- •Оглавление
- •Введение
- •Подготовка клинического материала для пцр-диагностики. Подготовка мокроты и мочи для выделения днк
- •Практическое занятие № 1
- •Пцр диагностика. Пробоподготовка
- •Практическое занятие № 2
- •Практическое занятие №3
- •Практическое занятие №4
- •Практическая работа №5
- •Практическая работа №6
- •Пцр в реальном времени
- •Детекция продуктов амплификации.
- •1. Выщепление 5' концевой метки (TaqMan Assay).
- •2. Использование зондов с комплементарными концевыми последовательностями (molecular beacons).
- •3. Применение 2-х зондов с резонансным переносом энергии (LightCycler assay).
- •4. Использование интеркалирующих агентов.
- •Кривые плавления
- •Практическая работа №7
- •Практическая работа №8
- •Пцр в диагностике гепатитов
- •Практическая работа №9
- •Практическая работа № 10
- •Типовые комплектации пцр-лаборатории Комплектация лаборатории №1 Real-time
- •Комплектация лаборатории №2
- •Список литературы
Типовые комплектации пцр-лаборатории Комплектация лаборатории №1 Real-time
(с использованием детектирующего амплификатора ДТ-322)
В комплектацию лаборатории №1 входит оборудование для следующих зон:
1. Зона пробоподготовки
№ |
Наименование |
Кол-во |
1. |
Ламинар II класса защиты |
1 |
2. |
Твердотельный термостат «Гном» |
1 |
3. |
Центрифуга "Mini Spin" (Eppendorf с ротором на 12 пробирок) |
1 |
4. |
Центрифуга (вортекс) Microspin FV 2400 |
1 |
5. |
Дозаторы HTL «VE-series» |
4 |
6. |
Штатив для дозаторов |
1 |
7. |
Штатив рабочее место 200X0,2мл. |
1 |
8. |
Штатив рабочее место 50x1,5 мл. |
1 |
9. |
Штативы для хранения пробирок 100X1,5мл. |
2 |
10. |
Насос с колбой-ловушкой |
1 |
2. Зона приготовления реакционной смеси |
||
№ |
Наименование |
кол-во |
1. |
Ламинар типа «ПЦР-бокс» |
1 |
2. |
Центрифуга (вортекс) Microspin FV 2400 |
1 |
3. |
Дозаторы HTL «VE-series» |
4 |
4. |
Штатив для дозаторов |
1 |
5. |
Штатив рабочее место 200X0,2мл. |
1 |
6. |
Штативы для хранения пробирок 100X1,5мл. |
2 |
3. Отдельно находится: |
||
№ |
Наименование |
Кол-во |
1. |
Детектирующий амплификатор ДТ-322 (Real-time) в комплекте с компьютером |
1 |
Общее количество лабораторного оборудования |
||
№ |
Наименование |
Кол-во |
1. |
Ламинар II класса защиты |
1 |
2. |
Ламинар типа «ПЦР-бокс» |
1 |
3. |
Твердотельный термостат «Гном» |
1 |
4. |
Центрифуга "Mini Spin" (Eppendorf с ротором на 12 пробирок) |
1 |
5. |
Центрифуга (вортекс) Microspin FV 2400 |
2 |
6. |
Дозаторы HTL «VE-series» |
8 |
7. |
Штатив для дозаторов |
2 |
8. |
Штативы для хранения пробирок 100X1,5мл. |
4 |
9. |
Штатив рабочее место 50x1,5 мл. |
1 |
10. |
Штатив рабочее место 200X0,2мл. |
2 |
11. |
Детектирующий амплификатор ДТ-322 (Real-time) в комплекте с компьютером |
1 |
12. |
Насос с колбой-ловушкой |
1 |
продолжение Приложения 1
Комплектация лаборатории №2
(с использованием специализированного детектора флуоресценции «ДЖИН»)
В комплектацию лаборатории № 2 входят:
Зона пробоподготовки
№ |
Наименование |
Кол-во |
1. |
Ламинар II класса защиты |
1 |
2. |
Твердотельный термостат «Гном» |
1 |
3. |
Центрифуга "Mini Spin" (Eppendorf с ротором на 12 пробирок) |
1 |
4. |
Центрифуга (вортекс) Microspin FV 2400 |
1 |
5. |
Дозаторы HTL «VE-series» |
4 |
6. |
Штатив для дозаторов |
1 |
7. |
Штатив рабочее место 200X0,5мл. |
1 |
8. |
Штатив рабочее место 50x1,5 мл. |
1 |
9. |
Штативы для хранения пробирок 100X1,5мл. |
2 |
10. |
Насос с колбой-ловушкой |
1 |
|
2. Зона приготовления реакционной смеси |
|
№ |
Наименование |
Кол-во |
1. |
Ламинар типа «ПЦР-бокс» |
1 |
2. |
Центрифуга (вортекс) Microspin FV 2400 |
1 |
3. |
Дозаторы HTL «VE-series» |
4 |
4. |
Штатив для дозаторов |
1 |
5. |
Штатив рабочее место 200X0,5мл. |
1 |
6. |
Штативы для хранения пробирок 100X1,5мл. |
2 |
Отдельно находятся:
№ |
Наименование |
Кол-во |
1. |
Амплификатор «Терцик» с возможностью программирования и контроля за процессом без использования персонального компьютера |
1 |
2. |
Специализированный флуориметр "ДЖИН" |
1 |
|
Общее количество лабораторного оборудования |
|
№ |
Наименование |
Кол-во |
1. |
Ламинар II класса защиты |
1 |
2. |
Ламинар типа «ПЦР-бокс» |
1 |
3. |
Твердотельный термостат «Гном» |
1 |
4. |
Центрифуга "Mini Spin" (Eppendorf с ротором на 12 пробирок) |
1 |
5. |
Центрифуга (вортекс) Microspin FV 2400 |
2 |
6. |
Дозаторы HTL «VE-series» |
8 |
7. |
Штатив для дозаторов |
2 |
8. |
Штативы для хранения пробирок 100x1,5мл. |
4 |
9. |
Штатив рабочее место 50x1,5 мл. |
1 |
10. |
Штатив рабочее место 200X0,5мл. |
2 |
11. |
ПЦР-детектор "ДЖИН" |
1 |
12. |
Амплификатор «Терцик» с возможностью программирования и контроля за процессом без использования персонального компьютера |
1 |
продолжение Приложения 1
Комплектация лаборатории № 3 (с детекцией методом электрофореза)
В комплектацию лаборатории № 3 входят:
|
1. Зона пробоподготовки |
|
№ |
Наименование |
Кол-во |
1. |
Ламинар II класса защиты |
1 |
2. |
Ламинар типа «ПЦР-бокс» |
1 |
3. |
Твердотельный термостат «Гном» |
1 |
4. |
Центрифуга "Mini Spin" (Eppendorf с ротором на 12 пробирок) |
1 |
5. |
Центрифуга (вортекс) Microspin FV 2400 |
1 |
6. |
Дозаторы HTL «VE-series» |
4 |
7. |
Штатив для дозаторов |
1 |
8. |
Штатив рабочее место 50x1,5 мл. |
1 |
9. |
Штатив рабочее место 200X0,5мл. |
1 |
10. |
Штативы для хранения пробирок 100X1,5мл. |
2 |
11. |
Насос с колбой-ловушкой |
1 |
Комната приготовления реакционной смеси
№ |
Наименование |
Кол-во |
1. |
Ламинар типа «ПЦР-бокс» |
1 |
2. |
Центрифуга (вортекс) Microspin FV 2400 |
1 |
3. |
Дозаторы HTL «VE-series» |
4 |
4. |
Штатив для дозаторов |
1 |
5. |
Штатив рабочее место 200X0,5мл. |
1 |
6. |
Штативы для хранения пробирок 100X1,5мл. |
2 |
|
3. Комната проведения электрос |
эореза |
№ |
Наименование |
Кол-во |
1. |
Блок питания для электрофореза «Эльф 4» |
1 |
2. |
Камера для электрофореза SE-2 |
1 |
3. |
Трансиллюминатор (Vilber Lourmat) ЕСХ-15М |
1 |
4. |
Дозатор HTL «VE-series» |
1 |
5. |
Штатив для дозаторов |
1 |
6. |
Видеосистема для документации результатов электрофореза (Gel Imager) |
1 |
Отдельно находятся
№ |
Наименование |
Кол-во |
1. |
Амплификатор «Терцик» с возможностью программирования и контроля за процессом без использования персонального компьютера |
1 |
|
Общее количество лабораторного оборудования |
|
№ |
Наименование |
Кол-во |
1. |
Ламинар II класса защиты |
1 |
2. |
Ламинар типа «ПЦР-бокс» |
1 |
3. |
Твердотельный термостат «Гном» |
1 |
4. |
Центрифуга "Mini Spin" (Eppendorf с ротором на 12 пробирок) |
1 |
5. |
Центрифуга (вортекс) Microspin FV 2400 |
2 |
б. |
Дозаторы HTL «VE-series» |
9 |
7. |
Штатив для дозаторов |
3 |
8. |
Штатив рабочее место 200X0,5мл. |
2 |