- •Перечень сокращений
- •Оглавление
- •Введение
- •Подготовка клинического материала для пцр-диагностики. Подготовка мокроты и мочи для выделения днк
- •Практическое занятие № 1
- •Пцр диагностика. Пробоподготовка
- •Практическое занятие № 2
- •Практическое занятие №3
- •Практическое занятие №4
- •Практическая работа №5
- •Практическая работа №6
- •Пцр в реальном времени
- •Детекция продуктов амплификации.
- •1. Выщепление 5' концевой метки (TaqMan Assay).
- •2. Использование зондов с комплементарными концевыми последовательностями (molecular beacons).
- •3. Применение 2-х зондов с резонансным переносом энергии (LightCycler assay).
- •4. Использование интеркалирующих агентов.
- •Кривые плавления
- •Практическая работа №7
- •Практическая работа №8
- •Пцр в диагностике гепатитов
- •Практическая работа №9
- •Практическая работа № 10
- •Типовые комплектации пцр-лаборатории Комплектация лаборатории №1 Real-time
- •Комплектация лаборатории №2
- •Список литературы
Пцр в диагностике гепатитов
В настоящее время известно как минимум 5 вирусов, способность которых вызывать поражение печени доказана. Это вирусы гепатита А, В, С, D, Е. В редких случаях гепатит может быть вызван вирусом Эпштейна-Барр, вирусом простого герпеса. Способность поражать печень таких агентов как вирус ТТ, вирус гепатита G сегодня признается не всеми. Все вышеперечисленные вирусы относятся к различным семействам, имеют разные биологические свойства и соответственно, тактика лечения будет тоже значительно отличаться в зависимости от этиологии гепатита.
Учитывая вышеизложенное, весьма актуальной проблемой является адекватная этиологическая диагностика вирусных гепатитов, которая невозможна без использования современных молекулярно-биологических методов, одним из которых является ПЦР.
Итак, в чем же состоит достоинство ПЦР в диагностике гепатитов? Попробуем разобраться:
Вирусный гепатит А (ВГА): ПЦР используется для обследования контактных лиц и более раннего выявления заболевших гепатитом А в очагах инфекции (например, в детском коллективе), т.к. РНК вируса гепатита А (030002) появляется в крови больного гепатитом А гораздо раньше, чем антитела (anti-HAV IgM) (040002). И еще один важный момент! Считается, что через неделю после появления клинических симптомов, больной гепатитом А перестает быть заразным… Но это касается только фекально-орального пути передачи вируса. В крови больного гепатитом А вирус присутствует гораздо дольше (иногда до нескольких месяцев), т.е. возможность заражения гепатитом А через кровь не ограничивается вышеуказанными сроками, и ПЦР единственный метод, с помощью которого возможно осуществлять мониторинг вирусемии (наличия вируса в крови).
Вирусный гепатит В (ВГВ): в диагностике вирусного гепатита В ПЦР имеет свои неоценимые достоинства:
Качественное обнаружение ДНК ВГВ (030102):
Ранняя диагностика острого гепатита В – ДНК вируса гепатита В начинает обнаруживаться в крови больного гепатитом В в среднем на 20 дней раньше, чем HBsAg («Австралийский» антиген).
Выявление мутантных штаммов вируса гепатита В.
Выявление скрытых форм вирусного гепатита В.
Количественная оценка уровня ДНК HBV (030104):
Диагностика хронического гепатита В (вирусная нагрузка более 100000 является признаком хронического гепатита В).
Мониторинг активности вирусной репликации у носителей HBsAg.
Контроль эффективности противовирусной терапии.
Определение YMDD мутации (устойчивости вируса гепатита В к ламивудину (030105)) - в многочисленных исследованиях установлено, что у ряда пациентов, находящихся на монотерапии зефиксом (ламивудином), возможно появление мутантного штамма вируса, устойчивого к препарату, поэтому актуальной задачей является раннее выявление таких штаммов для коррекции схемы лечения.
Вирусный гепатит С (ВГС). Гепатит С редко протекает с ярко выраженными клиническими симптомами, чаще всего это случайные находки во время лабораторного обследования (обнаружение anti-HCV IgG). Учитывая всю серьезность этого заболевания (частую хронизацию процесса (85%) и возможность развития цирроза печени), становится понятным, насколько важна лабораторная диагностика в решении этого вопроса. И именно ПЦР играет ведущую роль в диагностике гепатита С позволяя:
Установить факт инфицированности гепатитом С. Во-первых, это важно при обследовании контактных лиц, т.к. РНК ВГС появляется в крови больного гепатитом С гораздо раньше чем антитела, которые появляются как минимум через 2-3 месяца с момента инфицирования (период серологического окна). Во-вторых, определение anti-HCV IgG методом ИФА в некоторых случаях (часто у беременных) дает «ложноположительные» результаты, поэтому обнаружении антител к вирусу гепатита С, рекомендуется подтверждать качественным обнаружением РНК (030202), и в зависимости от результатов ПЦР определяется тактика ведения пациента.
Установить наличие показаний к противовирусному лечению, а также выбрать оптимальную схему лечения. Решить эти вопросы помогают количественное определение уровня РНК ВГС (030204) (при низкой вирусной нагрузке эффективность лечения выше) и определение генотипа ВГС (030205) (генотип 1 хуже отвечает на противовирусную терапию по сравнению с генотипами 2 и 3).
Своевременно оценить эффективность проводимого лечения. Так, наиболее эффективными препаратами для лечения хронического гепатита С на сегодняшний день остаются препараты интерферона в комбинации с рибавирином. Курс лечения гепатита С (генотип 1) составляет 48 недель, но уже на 12 неделе лечения врач может оценить эффективность проводимой терапии, сопоставляя результаты анализов до начала лечения и на 12 неделе лечения.
Оценить устойчивость ответа на лечение. Для этого проводят обнаружение РНК ВГС после окончания лечения, через 24 недели и через 72 недели после окончания лечения.