- •Глава1. История развития биоорганической химии …………………………………
- •Глава 2. Лекции по биоорганической химии …………………………………………
- •Глава 1
- •1.. Характеристика химических связей в биоорганических соединениях
- •2. Сопряженные системы
- •2.1. Общие понятия о строении сопряженных систем
- •2 . 3 . Циклические сопряженные системы. Ароматичность
- •1. Устойчивость к действию окислителя перманганата калия в растворе.
- •3. Способность к реакциям замещения в растворе по ионному( катионному,
- •2.3.1. Современные представления о строении бензола
- •2. 3. 2. Медико-биологическое значение карбоциклических ароматических
- •2. 3. 3. Гетероциклические ароматические соединения
- •2.1. Взаимное влияние атомов в молекулах биоорганических соединений.
- •2.2. Кислотно-основные свойства органических соединений
- •2.3. Медико- биологическое значение изучения темы « Кислотно-основные
- •3.1. Виды изомерии
- •3.2. Структурная изомерия.
- •3.2.1. Изомерия скелета
- •3.3. Динамическая изомерия.
- •3. 3.1. Кето-енольная таутомерия.
- •3.3.2. Лактим-лактамная таутомерия
- •3.4 Пространственная изомерия
- •3.4.1 Геометрическая( цис, транс) изомерия
- •3.4.4. Медико-биологическое значение стереоизомерии
- •4.1 Классификация реакций в биоорганической химии
- •4.1.1 Типы разрыва химических связей
- •4.1.2. Гомолитический тип разрыва связей.
- •4.1.3. Гетеролитический тип разрыва связей
- •4.2.1. Реакции электрофильного присоединения в ряду алкенов(а е)
- •4.2.2. Реакции нуклеофильного присоединения
- •7.Реакции у α- углеродного атома в карбонильных соединениях
- •8. Альдольная конденсация
- •1. Реакция нитрования
- •2. Реация сульфирования
- •3.Реакция галогенирования
- •4. Реакция алкилирования
- •4.2.4. Реакции нуклеофильного замещения ( s n )
- •Лекция 5 карбоновые кислоты и их гетерофункциональные
- •5.1. Классификация карбоновых кислот
- •5.2. Строение карбоксильной группы
- •5.2.1. Значение величин рКа некоторых карбоновых кислот :
- •5.3. Химические свойства карбоновых кислот
- •Этилацетат
- •5.4. Характеристика отдельных представителей монокарбоновых кислот ,
- •Масляная кислота ( н- бутановая кислота)
- •5.5. Непредельные монокарбоновые кислоты
- •5.6. Дикарбоновые кислоты
- •5.7. Непредельные ди- и трикарбоновые кислоты
- •5.8. Гидроксикислоты
- •5.8.3. Дигидроксидикарбоновые кислоты
- •5.9. Oксокарбоновые кислоты( альдегидо -, кетокарбоновые кислоты)
- •5.10 Приложение : Происхождение названий карбоновых кислот Сn н2n о2
- •6.1. Определение « липиды»
- •6.3. Основные представители липидов
- •6.3.1.Природные высшие карбоновые кислоты
- •3. Тиоэфиры
- •4. Дегидрирование насыщенной кислоты в активной форме с участием фермента.
- •6.3.2. Триацилглицерины( триглицериды)
- •6.3.3. Фосфатиды ( фосфолипиды ) и фосфатидовая кислота
- •6. 4. Принципы создания липотропных лекарственных препаратов
- •6.5 . Строение и химический состав мембран клеток
- •7.1. Номенклатура, особенности пространственного и структурного строения природных аминокислот
- •7. 2 Классификация природных аминокислот
- •7. 3Физические свойства природных аминокислот
- •7.4 Поведение аминокислот в водных растворах: образование цвиттер-ионов, изменение заряда и электрофоретической подвижности в зависимости от рН-среды. Изоэлектрическая точка
- •7.5. Качественная реакция обнаружения аминокислот
- •7. 6 . Химические свойства аминокислот
- •7 .6. 1 Химические свойства аминокислот in vitro
- •7.6.2. Химические свойства аминокислот in vivo
- •7.7. Строение витамина в6 и механизм реакции с его участием
- •7.8. Реакция поликонденсации, образование полипептидов
- •7. 9. Медико - биологическое значение аминокислот
- •7. 10. Применение аминокислот и их производных в качестве
- •Незаменимые аминокислоты обозначены звездочкой*
- •8.1. Определения « пептид» «белок»
- •8.2. Классификация белков
- •8.3. Строение пептидов и белков.
- •8.3.1. Первичная структура белка
- •8.3.2. Вторичная структура белка
- •8.3.3. Третичная и четвертичная структура белка
- •8.4. Физико-химические свойства белка
- •8.4.1. Амфотерность - кислотно- основные свойства белков.
- •8.4.2. Денатурация белка
- •8.5.Качественные реакции обнаружения белков в биологических объектах.
- •8. 6. Приложение. История развития химии белков
- •9. 1. Классификация углеводов
- •9.2. Моносахариды
- •9.3. Изомерия моносахаридов. Стереоизомерия. L- и д- ряды. Диастереомеры, энантиомеры, эпимеры. Значение отдельных представителей
- •9.4 Химические свойства моносахаридов
- •9.4. 3. Фосфорные эфиры
- •9.4.3 Образование гликозидов
- •9.4.4. Реакции восстановления
- •9.4.5Реакции окисления моносахаридов
- •9.5. Биологическое значение моносахаридов и их производных.
- •10.1. Олигосахариды. Дисахариды
- •10.1.1. Нередуцирующие дисахариды
- •10.1.2 Редуцирующие дисахариды.
- •10.2. Полисахариды
- •10.2.1.Гомополисахариды
- •11.1. Классификация нуклеиновых кислот, отличия в строении и составе как следствие различных биологических функций
- •11.2.Азотистые основания нуклеиновых кислот
- •11.2.2. Азотистые основания- производные пурина( аденин, гуанин)
- •11.3. Нуклеозиды
- •11.4. Нуклеотиды
- •11.5.Строение нуклеиновых кислот
- •11.6.Метаболизм пуриновых соединений в клетке
- •11.7. Биологически важные соединения- мононуклеотиды, динуклеотиды- участники важнейших биохимических процессов
- •11.8 Приложение . Справочные материалы к теме лекции
- •1953 – Дж. Уотсон и ф. Крик - модель двухцепочечной структуры днк.
- •12.1 Современная концепция создания биоорганических соединений –
- •12.1.1. Особые химические требования к лекарственному веществу
- •12.1.3. . Пути поиска и создания лекарственных препаратов
- •12.1.4 Классификация лекарственных веществ
- •12.2 Синтез, химические и физическиесвойства лекарственных соединений
- •12.2.1. Производные 4-аминобензойной кислоты
- •12.2.2. Производные 4-аминобензолсульфокислоты
- •Hso3Cl сульфохлорирование h2nr’ амин
- •Ацетиланилин
- •12. 2. 3. Лекарственные средства, производные салициловой кислоты
- •12.2.4. Лекарственные средства, производные 4 –аминофенола
- •12.2.5 Лекарственные средства на основе пиридинкарбоновых кислот
- •12. 2. 6. Производные пиримидина
- •12. 2 .7. Производные пурина- кофеин, теофиллин, теобромин
- •13.1. Номенклатура алкалоидов
- •13.2. Классификация алкалоидов
- •13. 3. Функции алкалоидов
- •13.4. Содержание в растениях
- •13.5. Качественные реакции обнаружения алкалоидов
- •13.6. Фармакологическая активность- общий взгляд
- •13.7. Отдельные представители
- •13. 7.1. Алкалоиды группы фенилэтиламина
- •7.2 Производные пяти – и шестичленных гетероциклических соединений
- •137.3. Группа тропана
- •13.8. Витамины
- •Действие в организме
- •Стадии зрительного процесса на сетчатке глаза
- •14.1. Полимеры-определение. Виды полимеров
- •14. 2. Классификация вмс
- •14.3. Реакции полимеризации
- •14.3.1. Номенклатура полимеров.
- •14.3.2 . Общая характеристика мономеров.
- •14.3.3. Механизмы реакции полимеризации
- •14.4. Радикальная полимеризация
- •14.5. Ионная полимеризация
- •14.5.1. Катионная полимеризация
- •14.5.2. Анионная полимеризация
- •14.6. Координационная полимеризация
- •14.7.1. Блочная полимеризация
- •14.7.2. Эмульсионная полимеризация
- •14.7.3. Полимеризация в растворе
- •14.8. Конфигурация полимеров
- •14. 10. Физическое состояние полимеров
- •14.10.1. Аморфные полимеры
- •14 10.2. Кристаллические полимеры
- •14.11. Натуральный каучук
- •14.12 . Конденсационные полимеры
- •14. 13 Основные представители вмс
- •2. Структурные формулы биоорганических соединений
- •Сопряженные соединения
- •Карбоновые кислоты (указаны тривиальные названия)
- •Незаменимые аминокислоты обозначены звездочкой -*
- •Углеводы и их производные
- •Азотистые основания и их производные
- •1. Теоретические положения строения и свойств биоорганических
- •2. Важнейшие биополимеры организма
- •3. Липиды и низкомолекулярные регуляторы метаболизма.Важнейшие группы лекарственных средств
- •Курс лекций по биоорганической химии
- •060103 – Педиатрия
- •060104 –Медико-профилактическое дело
- •060105 - Стоматология
2.2. Кислотно-основные свойства органических соединений
Ключевые слова к разделу 2.2 :
теория Бренстеда-Лоури, кислота, основание, сопряженная кислота, сопряженное основание .
В 1928г. ученые Бренстед и Лоури выдвинули протолитическую теорию сопряженных кислот и оснований применительно к органическим соединениям. С этой точки зрения, фактически, любое органическое соединение амфотерное, т.е. обладает кислотными и основными свойствами в зависимости от условий.
Кислоты в соответствии с теорией Бренстеда-Лоури
Кислотойбыло предложено называть соединение, способное отдавать протон( Н+),
основанием- соединение, способное присоединять протон.
Кислота при удалении протона превращается в сопряженное основание, основание после присоединения протона - в сопряженную кислоту.
Н А + В А - + ВН+
Кислота Основание Сопряженное сопряженная
Основание Кислота
Кислота Н-А(Аозначает сокращение отacid) содержит поляризованную связь.
Атом водорода связан с более электроотрицательными атомами: кислородом, азотом, галогенами, серой, углеродом. Чем больше электроотрицательность атома, тем сильнее поляризована связь.
Органические соединения АНможно подразделить на несколько типов зависимости от природы кислотного центра:
НО-кислоты, HS-кислоты, NH- кислоты, СН-кислоты
Карбоновые кислоты R-СООН, фенолы Аг-ОН, спиртыR-ОН , относятся к группе
ОН- кислот. В ряду названных соединений кислотные свойства убывают.
Силу кислоты( acid ) НХв воде, т.е. степень ее диссоциации , можно определить, рассматривая равновесие:
Н2О + Н- Х Н3О++ Х-
Константа равновесия выражается уравнением :
[ Н3О+] [ Х-]
Ка=- ---------------------
[ Н- Х ]
Обычно пользуются величиной рКа = -lg Ка
Чем больше кислотные свойства, тем меньше значение величины рКа .
Кислоты, у которых рКа > 7, не изменяют цвета нейтральной индикаторной бумаги,
если рКа > 10, то такие вещества не имеют кислого вкуса.
Кислотные свойства зависят от нескольких факторов:
полярности связи в кислотном центре
устойчивости образующегося сопряженного основания
природы растворителя.
На полярность связи влияет природа гетероатома и природа заместителя в углеводородном радикале.
Полярность связи уменьшается в ряду( при условии одинакового радикала):
R–О - Н >R–N- Н >R-S-Н >R– С -Н
Присутствующие в радикале акцепторные заместители всегда увеличивают, а донорные всегда уменьшают кислотные свойства. Поэтому в гомологическом ряду кислотные свойства всегда убывают.
СН 3О Н > С2Н5ОН > С3Н7ОН
НСООН > СН 3СООН > С2Н5СООН
НООС-СН2-СН2-СООН < НООС-СН2-СООН < НООС-СООН
СН 3СООН < НООС-СН2-СООН
CН3-CН2-СООН < СН3- СН-СООН < СН-С-СООН
| ||
OHO
Устойчивость сопряженного основания
Донорные заместители увеличивают величину отрицательного заряда аниона, и этим увеличивают способность присоединять протон – степень диссоциации. уменьшается, кислотные свойства убывают
Д Х -
группадонор кислотный центр
локализация
отрицательного заряда
Акцепторные заместители уменьшают величину отрицательного заряда аниона и
этим уменьшают способность присоединять протон – степень диссоциации увеличивается, кислотные свойства увеличиваются.
- Х А
Кислотный центр группа акцептор
Локализация отрицательного заряда
Способность делокализовать (распределять отрицательный заряд в анионе ) носит название поляризуемость атома-), связана с увеличением радиусом атома и наличием свободных электронных орбиталей.
Поляризуемость атома серы больше, чем атома кислорода. Поэтому тиолы всегда обладают более сильными кислотными свойствами, чем спирты, так же как сероводород обладает более сильными кислотными свойствами по сравнению с водой.
Сравнительный ряд изменения кислотных свойств соединений, содержащих различные кислотные центры и одинаковые радикалы:
С2Н5SН > С2Н5О Н > С2Н5NH2
Обратите внимание, что ряд изменения кислотноститиолов, спиртов и аминовне совпадает с рядом изменения полярности связи Х-Н в этих соединениях.
Основания( в соответствии с теорией Бренстеда-Лоури)
Основание( В- сокращение отbase) присоединяет протон, потому что в молекуле имеется атом с неподеленной парой электронов ( азот, кислород, сера ), двойная связь или вся частица несет отрицательный заряд ( ОН -,RО -,RS -).
Протон присоединяется к атому с неподеленной парой электронов за счет донорно-акцепторной связи, молекула приобретает положительный заряд. Чем выше основные свойства, тем легче протекает протонирование.
( В слове осн'овные ударение следует сделать на букве «о» во втором слоге)
| |
-N- +H+ —> —N + —H( аммониевое основание )
|
- О - + H +—> — О+— Н ( оксониевое основание )
|
-S- +H + —> —S+—H( сульфониевое основание )
|
С = С + H + —> > С =|=С< ( π -основание )
H +
Силу основания В ( base )в воде можно оценить, рассматривая равенство:
В + НОН ВН + + ОН –
Константа равновесия выражается уравнением
[ ВН +] [ ОН –]
КВ=- --------------------рК В = -lg К В
[ В ]
Величину рК В в воде можно перевести в рКа .
рК В + рКа = 14 ( при 250 С )
Чем больше основные свойства , тем меньше значение величины рКВ .
Основные свойства зависят от нескольких факторов:
Электроотрицательности атома, несущего неподеленную пару электронов.
Чем больше электроотрицательность, тем выше основные свойства.
Так как электроотрицательность О > S, то основные свойства
С2Н5О Н > С2Н5SН
2. Устойчивости сопряженной кислоты, возникающей после присоединения протона к основанию.
RNH2 + H + —> RN H3 +
ROH + H + —> R O+ –H
|
H
Ион аммония более устойчив, чем ион оксония , поскольку присоединение про-
тона Н +к электронной паре энергетического уровня 2s2 атома азота энергетически более выгодно, чем к паре электронов энергетического уровня 2 р2атома кислорода ( хотя атом кислорода обладает большей электроотрицательностью).
Влияние природы заместителя
Заместители- доноры увеличивают электронную плотность в основном центре и этим увеличивают основные свойства.
СН3 NH 2 < C 2H 5 NH2 < ( C 2H 5 ) 2 NH
Заместители акцепторы уменьшают электронную плотность в основном центре и
уменьшают основные свойства.
НО-СН2- СН2-NH2<СН 3- СН2-NH2
акцептор донор
Основные свойства ароматических аминов ниже, чем алифатических, поскольку неподеленная пара электронов атома азота взаимодействует с электронной системой бензольного цикла, и электронная плотность на атоме азота снижается.
С6Н5-NH2< СН3NH2
анилин метиламин
Таким образом, спирты , амины обладают кислотными и основными свойствами.
У спиртов преобладают кислотные над основными, а у аминов- основные над
кислотными.
Следует помнить :
кислотные и основные свойства одного вещества изменяются всегда в
противоположных направлениях.
Можно составить ряды закономерных изменений :
А. кислотные свойства : R-СООН > R-SH > R-OH > R-NH2
Б. основные свойства : R-NH2 > R-OH > R-SH
В амидах R-СОNH2 аминогруппа практически теряет основные свойства.
Важное биологически активное вещество мочевина NH2 - CO - NH2 - однокислотное основание.
По современным данным протон присоединяется к атому кислорода и положительный.
заряд равномерно распределяется( делокализуется) между четырьмя атомами.
Мочевина –конечный продукт обмена пищевых белков, белков организма и аминокислот. Содержится во всех биологических жидкостях организма, стабилизирует структуры белков, нуклеиновых кислот, участвует в поддержании постоянства значения рН внутренней среды организма. Выделяется в составе мочи в количестве до
30 г/ сутки
R- С=ОNH2 -C- NH2 + НNO3 —> NH2 -C- NH2
| || || .NO3-
NH2O+ОН
амид мочевина ( карбамид) соль нитрат мочевины
хорошо растворима плохо растворима
в воде