Добавил:
Upload Опубликованный материал нарушает ваши авторские права? Сообщите нам.
Вуз: Предмет: Файл:

Биохимия Р.Марри

.pdf
Скачиваний:
354
Добавлен:
20.05.2015
Размер:
31.31 Mб
Скачать

30 Глава 35

Таблица 35.1. Наследуемые нарушения метаболизма пуринов и связанные с ними изменения активности ферментов

Клинический

Дефектный фермент

Характеристика дефек-

Характеристика клинических прояв-

Тип наследования

синдром

 

та

лений

признака

Подагра

ФРПФ-синтетаза

Повышение активно­

Избыточное образование и уве­

Сцеплен

с

х­

 

 

сти

(увеличение

личение количества экскре­

хромосомой;

 

 

Vmax)

 

 

 

тируемых пуринов

рецессивный

Подагра

ФРПФ-синтетаза

Устойчивость к инги­

"

 

Сцеплен

с

х­

 

 

бированию

ко­

 

 

хромосомой;

 

 

нечным

продук­

 

 

рецессивный

 

 

том

 

 

 

 

 

 

 

 

Подагра

ФРПФ-синтетаза

Низкая

Кт

для

 

 

Вероятно,

 

сце-

 

 

рибозо-5-

 

 

 

плен

с

х­

 

 

фосфата

 

 

 

 

хромосомой;

 

 

 

 

 

 

 

 

рецессивный

Подагра

ггфрт 1 )

Частичная потеря ак­

 

 

Сцеплен

с

х­

 

 

тивности

 

 

 

хромосомой;

 

 

 

 

 

 

 

 

рецессивный

Синдром Леша-

ГГФРТ 1)

Полная

потеря

ак­

Избыточное образование и уве­

Сцеплен

с

х­

Найхана

 

тивности

 

личение количества экскре­

хромосомой;

 

 

 

 

 

 

тируемых пуринов; корко­

рецессивный

 

 

 

 

 

 

вый паралич, членовредите­

 

 

 

 

 

 

 

 

 

льство

 

 

 

 

Иммуннодефицит

Аденозиндезамина-

Большая

потеря

ак-

Комбинированный

иммуноде­

Аутосомный

ре­

 

за

тивности

 

фицит (Т- и В-клетки); дез-

цессивный

 

 

 

 

 

 

оксиаденозинурия

 

 

 

Иммуннодефицит

Пуриннуклеозид-

Большая

потеря

ак-

Иммунодефицит

(Т-клетки);

Аутосомный

ре-

 

фосфорилаза

тивности

 

инозинурия, дезоксиинози-

цессивный

 

 

 

 

 

 

нурия, гаунозинурия, гипоу-

 

 

 

 

 

 

 

 

 

рикемия

 

 

 

 

Почечнокаменная

Аденин­

Полная

потеря

ак-

2,8-дигидроксиадениновые кам-

Аутосомный

ре-

болезнь

фосфорибозил­

тивности

 

ни в почках

 

цессивный

 

трансфераза

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Ксантинурия

Ксантиноксидаза

Полная

потеря

ак-

Ксантиновые камни в почках; ги-

Аутосомный

ре-

 

 

тивности

 

поурикемия

 

цессивный

1) ГГФРТ (англ. НGРRТ)-гипоксантин-гуанин-фосфорибозилтрансфераза

отнести пациентов с повышенным количеством

экскретируемых уратов.

Таблица 35.2. Классифккация пациентов с гиперурикемией

1. Нормальная экскреция уратов; нарушения функции по­

чек, приводящие к повышению содержания уратов в сы­

воротке.

п. Увеличение количества экскретируемых уратов, обу­ словленное их избыточным образованием

А. Вторичное, обусловленное другими заболеваниями (рак, псориаз)

Б. Недостаточность известных ферментов 1) нарушения функционирования ФРПФ-синтетазы

2) недостаточность гипоксантин-гуанин- фосфори­ бозилтрансферазы

3) недостаточность глюкозо-6-фосфазаты В. Причины нарушений не установлены.

Синдром Леша-Найхана и болезнь Гирке

В некоторых случаях гиперэкскреция уратов (бо­ лее 600 мг мочевой кислоты за 24 ч) может носить

вторичный характер, т. е. быть следствием заболева­ ний, характеризующихся усилением обмена в тканях (например, рак или псориаз).

у ряда пациентов идентифицированы дефекты

ферментных систем, например ФРПФ-синтетазы

(устойчивость к ингибированию конечными продук­

тами и повышенная активность), гипоксантин­ гуанин-фосфорибозилтрансферазы (ГГФРТ) (уме­ ньшение количества фермента или его полное отсут­

ствие, синдром Леша-НаЙхана). К этой же катего­

рии можно отнести недостаточность глюкозо-

6-фосфатазы (синдром Гирке). Имеется также груп­

па больных с идиопатической гиперурикемией, кото­

рую следует рассматривать как гетерогенную до тех

пор, пока не будет выяснена молекулярная основа

метаболических дефектов.

МетаБОJ1UЗМ nуриновых u nиримидиновых u)'к.lеоnmдов

31

Синдром Леша-Найхана (полное отсутствие

ГГФРТ) наследуется как сцепленный с х­ хромосомой рецессивный признак. Болезнь характе­

ризуется корковым параличом, сопровождающимся

хореоатетозом, судорогами, стремлением к члено­

вредительству и тяжелой гиперурикемиеЙ. Кроме то­ го, наблюдается образование камней мочевой кисло­

ты. Матери больных детей гетерозиготны и мозаич­

ны в отношении ГГФРТазной недостаточности, у них часто обнаруживается гиперурикемия, но без неврологических симптомов. Частичная недостаточ­

ность ГГФРТазы, вызванная мутапиями соответ­

ствующего гена, встречается и у мужчин. Для таких

больных характерна тяжелая гиперурикемия, не со­

провождающаяся существенными неврологически­

ми нарушениями.

Избыточное образование пуринов у пациентов

с недостаточностью ГГФРТ связано с увеличенной внутриклеточной концентрацией ФРПФ, что по­

видимому является результатом уменьшения потре­

бления ФРПФ на пути регенерации пуриновых ну­

клеотидов. Биохимическая основа неврологических

отклонений при синдроме Леша-Найхана неизвест­

на.

Избыточное образование пуринов и гиперурике­

мия при болезни Гирке- явление вторичное. Оно

обусловлено повышением активности гексозомоно­

фосфатного шунта и увеличением образования рибо­

зо-5-фосфата, из которого синтезируется ФРПФ.

ДЛЯ больных с недостаточностью глюкозо-

6-фосфатазы характерен хронический молочноки­

слый аиидоз, приводящий к повышению порога се­ крепии уратов почками; это способствует накопле­

нию уратов в организме.

в плазме. Гипоурикемия у человека может быть

связана с аналогичными нарушениями.

Недостаточность ксантиноксидазы, вызванная

либо генетическим дефектом, либо тяжелым пораже­

нием печени, приводит к гипоурикемии и увеличе­

нию экскреции оксипуринов- гипоксантина и ксан­ тина. При тяжелой недостаточности ксантиноксида­

зы у пациентов часто развивается ксантинурия

иобразование ксантиновых камней.

Впоследние годы описаны два иммунодефицит­

ных заболевания, связанные с недостаточностью

ферментов метаболизма пуринов. С недостаточно­

стью аденозиндезаминазы связано тяжелое иммуно­

дефицитное заболевание, при котором снижается ко­

личество и нарушается функиия как тимусных лим­ фоцитов (Т-клеток), так и лимфоцитов костного

мозга (В-клеток). С недостаточностью пуриннуклео­ зид-фосфорилазы связана более легкая форма имму­

нодефицита, при которой функции В-лимфоцитов остаются нормальными. но сильно нарушены функ­ ции Т-лимфоцитов. Оба заболевания наследуются

по аутосомно-репессивному типу. Метаболические нарушения при рассмотренных иммунных дJlСфУНК­

циях связаны с накоплением дезоксирибонуклеотид­ трифосфатов (dGTP и dAТР), которые аллостериче­

ски ингибируют рибонуклеотидредуктазу, что,

всвою очередь, приводит к снижению содержания

вТ-лимфоцитах пула предшественников синтеза

ДНК, главным образом dCTP. Пуринодефицитные

состояния у человека встречаются редко. Часто они

бывают связаны с недостатком фолиевой кислоты и. вероятно, витамина В 12' что приводит К снижению

синтеза производных фолата.

Все известные дефекты ферментных систем (за исключением глюкозо-6-фосфатазной недостаточно­

сти, для которой соответствующих данных не полу­

чено) приводят к повышению внутриклеточной кон­

центрапии ФРПФ; избыточная продукция пуринов

при глюкозо-6-фосфатазной недостаточности, веро­

ятно, также обусловлена этим обстоятельством. Вполне возможно, что и другие нарушения обмена

пуринов, приводящие к гиперурикемии, в конечном

счете связаны с повышением внутриклеточного

уровня ФРПФ.

Другие нарушения метаболизма пуринов

Гиnоурикемия обусловлена либо усилением экскрепии, либо снижением скорости образования уратов. Известно, что доги-далматинцы, хотя

и обладают, как и другие породы собак. уриказной

активностью, не способны эффективно реадсорбhРО­ вать из клубочкового фильтрата мочевую кислоту.

В связи с этим они экскретируют ураты и мочевую

кислоту в количестве, которое является неадекватно

большим по отношению к содержанию уратов

ЗАБОЛЕВАНИЯ, СВЯЗАННЫЕ

С НАРУШЕНИЕМ МЕТАБОЛИЗМА

ПИРИМИДИНОВ (ТАБЛ. 35.3)

Как отмечалось выше, конечными продуктами

метаболизма пуринов являются хорошо раствори­

мые в воде соединения, такие, как СО2, аммиак, (3-

аланин и пропионат. Вот почему при состояниях, ха­

рактеризующихся избыточным образованием пири­

мидинов, клинические симптомы слабо выражены.

В случаях гиперурикемии, обусловленной избыточ­

ной продукцией ФРПФ, наблюдаются повышенный

синтез пиримидиновых нуклеотидов и соответствен­

но увеличенная экскреция конечных продуктов мета­

болизма, в частности (3-аланина. Поскольку для син­

теза тимидилата необходим N5, NIO-мети-

лентетрагидрофолат. нарушения метаболизма фо­

лата и витамина BI2 приводят к дефициту ТМР (вли­

яние недостатка витамина BI2 реализуется опосре­

Дованно).

Экскреция с мочой (3-аминоизобутирата- ауто­

сомный рецессивный признак. Он распространен

главным образом среди жителей Востока. Это нару-

32 Глава 35

Таблица 3S.3. Наследуемые нарушения метаболизма пиримидинов и связанные с ними измеllения активности ферментов

Клиннческий синдром

Дефектный фермент

Характеристика де-

Характеристика клинических проявлеТип

наследования

 

фекта

ний

ПРИJнака

 

 

р- Аминоизобути-

Трансаминаза

Недостаточность

Без симптомов; распространен на

Аутосомный

ре-

ратацидурия

 

 

 

Востоке

цессивный

 

Оротовая ацидурия

Оротатфосфорибозил-

Недостаточность

Кристаллы оротовой кислоты

Аутосомный

ре-

тип 1

трансфераза и оро­

 

 

в моче; отставание в развитии

цессивный

 

 

тидилатдекарбокси­

 

 

и мегалобластическая анемия

 

 

 

лаза

 

 

(?)

 

 

 

 

 

 

Иммунодефицит. Ремиссия при

 

 

 

 

 

 

пероральном приеме уридина

 

 

Оротовая ацидурия

Оротидилатдекарбокси-

Недостаточность

Оротидинурия и оротовая ациду-

Аутосомный

ре-

тип 11

лаза

 

 

рия, мегалобластическая ане-

цессивный

 

 

 

 

 

мия. Ремиссия при перораль-

 

 

 

 

 

 

ном приеме уридина

 

 

Недостаточность

Орнитинтранскарбамои-

Недостаточность

Белковая нетолерантность, пече­

Сцеплен с

х­

орнитинтран­

лаза

 

 

ночная энцефалопатия, оро­

хромосомой;

скарбамоила­

 

 

 

товая ацидурия

рецессивный

зы

 

 

 

 

 

 

шение не рассматривается как патологическое со­

координированного характера, по крайней мере этих

стояние (об этом уже шла речь при обсуждении ката­

двух ферментов.

 

 

болизма пиримидинов).

 

 

Данные по энзимологии пути биосинтеза пири­

Описаны два типа первичной наследственной 0,0- мидинов позволяют предполагать, что в одной бел­

товой ацидурии. Более распространеlШ3Я форма (хо­

ковой молекуле локализованы активные центры кар­

тя и встречающаяся весьма редко) связана с утратой

бамоилфосфатсинтазы, аспартаттранскарбамоила­

во всех тестированных типах клеток функции двух

зы и дигидрооротазы, а в другой -

активные центры

ферментов- оротат-фосфорибозилтрансферазы

и

оротат-фосфорибозилтрансферазы

и ОМР-декар­

оротидилат(ОМР)-декарбоксилазы (рис. 35.19). боксилазы.

Организм пациентов с этим типом оротовой ациду­

рии можно считать ауксотрофным по пиримидину.

Заболевание легко поддается лечению уридином. В детском возрасте для больных характерны отста­

вание в развитии, мегалобластическая анемия и «оранжевая кристаллоурия» (оротовая кислота).

При отсутствии лечения пиримидиновыми нуклеози­ дами пациенты подвержены инфекциям. Второй тип

наследуемой оротовой ацидурии (тип 11) связан с не­ достатком только ОМР-декарбоксилазы (рис. 35.19).

У пациентов, страдающих оротовой ацидурией пер­

вого типа, основным продуктом экскреции является

оротовая кислота. При обследовании больного аци­

дурией второго типа оказалось, что у него экскрети­

руется главным образом оротидин и лишь неболь­ шое количество оротовой кислоты. В эритроцитах пациентов соротовой ацидурией типа 1 были значи­

тельно повышены удельные активности аспартат­

транскарбамоилазы и дигидрооротазы; они, однако,

возвратились к норме при пероральном приеме па­

циентами уридина. Эти наблюдения свидетель­ ствуют о том, что конечные продукты пути биосин­

теза пиримидинов регулируют активность рассма­

триваемых ферментов. В условиях недостатка конеч­

ных продуктов происходит дерепрессия, вероятно,

у больных с недостаточностью орнитинтранс­ карбамоилазы - митохондриального фермента

клеток печени, ответственного за раннюю стадию

синтеза мочевины и аргинина, наблюдается увеличе­ ние экскреции оротовой кислоты, урацила и уриди­

на. По-видимому, в митохондриях этих пациентов

в результате снижения активности орнитинтранскар­

бамоилазы накапливается карбамоилфосфат. Мито­ хондриальный карбамоилфосфат диффундирует

в цитозоль, где используется как субстрат для синте­

за пиримидиновых нуклеотидов de novo. При избы­

точном образовании оротовой кислоты диагности­

руется оротовая ацидурия. Обычно она проявляется

в легкой форме и не сопровождается образованием

кристаллов. Синтез и экскреция оротовой кислоты

у таких больных усиливаются при употреблении в пищу продуктов богатых азотом, таких, как мясо.

Оротовую ацидурию могут вызывать по крайней

мере два лекарственных препарата. Аллопуринол (4-гидроксипиразолопиримидин) - пуриновый ана­ лог, инrибирующий ксантиноксидазу. Этот препарат

широко используется для лечения некоторых форм

подагры. Аллопуринол может фосфорибозилиро­

ваться оротат-фосфорибозилтрансферазой, конку­ рентно ингибируя фосфорибозилирование оротовой

Метаболиз-м nуриновых и nиримидШЮ6ЫХ Ilук.lеоmидов

33

А

 

 

 

 

 

,

,

......1МочаI

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

~дгOK'" "

 

 

 

,(АК

Наруwение

01\,

 

СО2

,

.. КАФ

 

/o~p

Глутамин

\

 

активности фермента~ • :

 

 

е

 

 

~,

 

 

 

, ,"

 

 

~~"I

,

 

 

'"

 

UMP ()

 

 

 

---- UTP.---"t '--

 

 

 

+

( \

Лечениеуридином

 

 

ТТР"

UTP

СТР

 

 

dCTP.J

 

 

I

 

 

\.----'-G,I

 

 

 

 

 

 

 

Нуклеиновые КИСЛОТы

 

 

 

Б

 

 

 

 

 

 

~I Мочаl~

 

 

~ДГOK~ "

~

....,

 

 

!

\

"

 

 

КАК

 

ОК

\

 

t

 

 

 

оро;;!ин

СО2 --+t-....t...КАф

 

 

 

ОМР." ",

Глутамин

\

 

Нарушение аКТИВНОСТИ---1.~1I

I ----

 

\ \

 

 

,фермента· ~~_

"

 

 

Jf'

А

 

О, ..............

 

.".,,, YM~

...... - )J

 

t

--luтР \

 

 

\. ТТР.:

UTP

СТР ----

 

j.~ dCТP.J

'-~(~--4---------

 

~y

 

 

 

" /'::\J

Нуклеиновые кислоты

 

 

 

V

 

 

Рис. 3S.19. А. Ферментные дефекты и их последствия при оротовой ацидурии типа 1, которая характеризуется недостаточ­ ностью двух ферментов-оротат-фосфорибозилтрансферазы и оротидилат-декарбоксилазы. Б. Недостаточность ороти­ дилат-декарбоксилазы, приводящая коротовой ацидурии типа 11. Пунктирные линии со знаком минус показывают пути ингибирования по принципу обратной связи в нормальных условиях. При оротовой ацидурии типа 1с мочой зкскретирует­ ся оротовая кислота. При оротовой ацидурии типа 11 в роли экскретируемых соединений выступают оротовая КИС.'Iота

и оротидин. Аббревиатуры расшифрованы на рис. 35. 15.{Redrawn and reproduced, with permission, from Smith L. H.lr. Pyrimidine metabolism in тап. N. Ellgl. Med. 1973, 288, р. 764).

кислоты. Более того, образующийся необычный ну­

декарбоксилазы, что приводит к увеличению экскре­

клеотид подавляет оротидилатдекарбоксилазу, вы­

ции оротовой кислоты И оротидина.

зывая тем самым оротовую ацидурию и оротидину­

При специфическом поражении митохондрий

рию. Однако путь биосинтеза пиримидинов, по

клеток печени (синдром Рейе) имеет место вторичная

крайней мере у человека, «приспосабливается» к та­

оротовая ацидурия. Дело в том, что пораженные ми­

кому ингибированию, и «пиримидиновое голода­

тохондрии оказываются неспособными утилизиро­

ние» имеет место только на ранних стадиях лече­

вать карбамоилфосфат, который. как и в случае на­

ния препаратом.

следуемой недостаточности орнитинтранскарбамои­

6-Азауридин после превращения в 6-азауридилат

лазы, вызывает избыточное образование оротовой

функционирует как конкурентный ингибитор омр-

кислоты.

2 1594

34

Глава 35

ЛИТЕРАТУРА

Ames В. N. et а/. Uric acid provides ап antioxidant defense in humans against oxidantand radical-caused aging and сап­ cer: А hypothesis. Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 1981, 78, 6858.

Henderson J. F. Regulation ofPurine Biosynthesis, Monograph, No. 170, American Chemical Society, 1972.

Henderson J. F., Paterson А. R. Р. Nucleotide Metabolism: Ап

Introduction, Academic Press, 1973.

Jones М. Pyrimidine nucleotide biosynthesis in animal celJs, Аппи. Rev. Biochem., 1980, 49. 253.

Кеmре Т. D. et а/. StabIe mutants ofmammalian cells that over-

produce the first three enzymes of pyrimidine nucleotide biosynthesis, СеН, 1976, 9, 541.

Мartin D. W. Jr., Gelfand Е. W. Biochemistry of diseases of immunodevelopment, Аппи. Rev. Biochem., 1981, 50, 845.

Smith L. Н. Jr. Pyrimidine metabolism in тап, N. Engl. J. Med., 1973, 288, 764.

Stanbury J. В. et а/. (eds.) ТЬе Metabolic Basis of Inherited Disease, 5th ed., McGraw-НilI, 1983.

The/ander L., Reichard Р. Reduction of ribonucleotides. Аппи. Rev. Biochem., 1979, 48, 133.

Wyngaarden J. В., Kelley W. N. Gout and Hyperuricemia, Gru- пе and Stratton, 1976.

Глава 36

Технология рекомбинантных дик

Дарил Греnnер

ВВЕДЕНИЕ

и при установлении степени риска развития ряда за­

Технология рекомбинантных ДИК, чаще назы­

болеваний.

6. Появилась принципиальная возможность осу­

ваемая генной инженерией, революционизировала

ществления генной терапии таких заболеваний, как

биологию и оказала огромное влияние на клиниче­

серповидноклеточная анемия, талассемия, недоста­

скую медицину. До разработки методов рекомби­

точность аденозиндезаминазы и др. Такой подход

нантных ДИК наследственные болезни человека изу­

был, например, уже реализован в экспериментах на

 

чали с помощью анализа родословных и исследуя

мышах (наследственный гипогонадизм удалось скор­

аномальные белки. Однако во многих случаях, когда

ректировать с помощью инъекции в оплодотворен­

конкретный вид генетического повреждения устано­

ную яйцеклетку гена гонадолиберина).

 

вить не удается, эти подходы оказьmаются ма­

 

лоэффективными. Иовая технология позволяет ад­ ресоваться за нужной информацией непосредственно

к молекуле ДИК. В настоящей главе рассмотрены

основные концепции, на которых базируется техно­ логия рекомбинантных ДИК, ее применение в кли­

нической медицине. В конце главы помещен краткий

словарь-справочник.

БИОМЕДИЦИНСКОЕ ЗНАЧЕНИЕ

Разобраться в сути технологии рекомбинантных

ДИК важно по нескольким причинам.

1. Информационный взрыв в данной области

поистине головокружителен. Для того чтобы сле­

дить за исследованиями в этом направлении, необ­ ходимо усвоить фундаментальные основы генной

инженерии.

2. В настоящее время разработана стратегия изу­

чения молекулярной природы ряда заболеваний, та­

ких, как наследственная гиперхолестеролемия, муко­

висцидоз, талассемия, хорея Гентингтона, серповид­

ноклеточная анемия.

3. С помощью методов генной инженерии можно получать белки человека в количествах достаточных

для терапевтических целей (инсулин, гормон роста,

активатор плазминогена).

4. Генная инженерия открыла новые возможно­

сти получения белковых вакцин (белки вируса гепа­

тита В) и белковых препаратов для диагностических

целей (СПИД и др.).

5. Технология рекомбинантных ДИК оказалась эффективной для решения диагностических задач

ОСНОВНЫЕ СВОЙСТВА ДНК

Структура ДИК

ДИК представляет собой биополимер сложной

структуры, организованный в двойную спираль. Ее основными элементами являются пуриновые (аде­

нин и гуанин) и пиримидиновые (тимин и цитозин) основания. Эти основания присоединены к атому

С-l' углевода (дезоксирибозы). Сами углеводные

остатки соединены между собой по 3'- и 5'-

положениям фосфодиэфирными связями (рис. 37.1). Чередующиеся остатки дезоксирибозы и фосфатные группы образуют остов двойной спирали (рис. 37.2). Направление связей 3' -+ 5' определяет ориентацию

данной цепи, и, поскольку ориентации двух компле­

ментарных цепей противоположны, их называют ан­

типараллельными.

Принцип комплементарных взаимодействий пар оснований (принциn спаривания оснований) лежит

воснове построения и функционирования молекул ДИК. Аденин всегда образует пару с тимином, а гуа­ нин с цитозином. Эти пары оснований называются

комплементарными. Содержание остатков гуанина

влюбом фрагменте ДИК всегда в точности соответ­

ствует содержанmo цитозина. Так же равны друг другу количества аденина и тимина. Две цепи ДИК

удерживаются друг возле друга за счет комплемен­

тарных взаимодействий пар оснований и гидрофоб­ ных «стэкинг»-взаимодеЙствиЙ. Эти взаимодействия могут быть нарушены при нагревании, приводящем

16

Глава 36

к денатурации (плавлению) ДНК. Законы образова­

ния пар предсказывают, что при ренатурации две

комплементарные цепи ДНК должны вновь соеди­ ниться с образованием исходной структуры. Это

и происходит в действительности при медленном

остывании (отжиге) раствора ДНК, подвергнутой

тепловой денатурации.

По температуре денатураuии-ренатурации мо­

жно оценить степень комплементарности нуклеино­

вых оснований в цепях ДНК. Для денатураuии се­ гментов ДНК, характеризующихся высоким уров­ нем комплементарности. требуются соответственно

большие затраты энергии. Расхождение цепей таких фрагментов ДНК происходит соответственно при более высокой температуре. Это физическое явление

используется на практике для определения степени

сродства (гомологии) различных нуклеиновых ки­ слот и лежит в основе метода гибридизации (одного из главных в генной инженерии).

Гаплоидный набор человека состоит примерно из 3·109 пар нуклеотидов (п. н.). Если размер гена в среднем равен 3000 п. н., то, допустив, что гены не

перекрываются, а транскрипция идет лишь в одном

направлении, можно вычислить, что геном человека

включает до 10 б различных генов. Считается, что их

в геноме человека не более 1О 5 И лишь 10% геном­ ной ДНК непосредственно кодируют белки. О функ­ uиональном значении остальных 900/0 известно край­

не мало.

Двойная спираль упакована в компактную струк­ туру, образованную за счет взаимодействий с целым

рядом белков (главным образом основного характе­

ра). называемых гистонами. Такая компактизация может выполнять регуляторные функции и имеет также определенный «практический смысл». Дело в том, что ДНК ядра клетки при полном расплета­ нии достигает длины 1 м. Хромосомные белки упа­ ковывают гигантскую молекулу в ядро объемом все­ го лишь в несколько кубических микрон.

Организации гена

Как правило, прокариотические гены состоят из небольшого регуляторного участка (100-500 п. н.) и большого кодирующего белок сегмента (50010000 п. н.). Часто несколько генов контролируются

одним и тем же регуляторным элементом. Большин­

ство генов млекопитающих имеют более сложную структуру. Кодирующие области эукариотических

генов прерываются и чередуются снекодирующими

участками. Эти участки, будучи транскрибирован­

ными, удаляются в процессе созревания первичного

транскрипта. Кодирующие области (остающиеся

в зрелой мРНК) называются экзонами. Нуклеотид­ ные последовательности ДНК, находящиеся между

экзонами, называются интронами (рис. 36.1). Интро­

ны удаляются из первичного транскрипта до того,

как происходит перенос РНК в цитоплазму. Процесс удаления интронов и сшивания (лигирования) знача­

щих участков получил название «сплаЙСИНI РНК)). Неправильный сплайсинг может стать причиной бо­

лезни человека (см. ниже), что указывает на важ­ ность этой посттранскрипционной стадии. Регуля­ торные области эукариотических генов обычно ра­ сполагаются с 5'-конца от точки инициации тра­ скрипции (5'-фланкирующая IlOследовательность ДНК). Иногда регуляторные последовательности находятся внутри самого гена или даже в 3'- фланкирующей области. В клетках млекопитающих каждый ген обладает собственным регу­ ляторным элементом. Многие гены эукариот (а

также некоторых вирусов, реплицирующихся в

клетках млекопитающих) содержат специальные участки ДНК, называемые «энхансерамю>, которые повышают уровень транскрипuии. Некоторые гены содержат также «сайленсеры»- участки, ослаб­ ляющие транскрипцию. Гены млекопитающих -

это сложные, многокомпонентные структуры.

Транскрипция генов

Основное направление передачи генетичес­

кой

информации

реализуется

в

цепочке

ДНК -

мРНК - белок (рис. 36.1, см.

также гл. 41).

Процесс этот жестко контролируется и состоит из

ряда сложных этапов, каждый из которых регули­

руется одним или несколькими ферментами или фак­

торами. Ошибка на любом этапе может приводить к заболеванию.

ОСНОВНЫЕ ПОНЯТИЯ

ГЕННОЙ ИНЖЕНЕРИИ

в основе методологии генной инженерии лежит

выделение ДНК и проведение различных манипуля­

ций с ее молекулами, включая получение химер (на­

пример, молекулы ДНК, построенной из фрагмен­

тов ДНК человека и бактерий).

Ферменты рестрикции

Один из важнейших инструментов генной инже­ нерии - эндонуклеазы, ферменты, расщепляющие ДНК по специфическим последовательностям ну­

клеотидов внутри цепи (в противоположность экзо­ нуклеазам, которые расщепляют ДНК с концов мо­

лекулы). Эти ферменты получили название рестрик­

таз, поскольку их присутствие в бактериальной клет­ ке ограничивает рост определенных бактериальных

вирусов, называемых бактериофагами. Рестриктазы расщепляют ДНК на относительно небольшие фраг­

менты в участках последовательности строго опре­

деленной структуры. Этим их воздействие отличает­ ся от большинства других ферментативных, химиче-

 

Технология рекомБullа"mllыx ДНК

 

37

 

 

Участок

 

 

 

 

 

 

ИНИЦИ8ЦИИ

 

 

 

еайт ПОЛИ8дени-

РеГУЛRТОРН8R

ПРОМОТОРН8R транскрипции

 

--

 

 

 

 

оБЛ8СТЬ

оБЛ8СТЬ

t

3КЗ0Н

3КЗ0Н

лиРОВ8НИR

 

 

 

ДНК 5'----t'--

 

--

 

 

 

СААТ НГ-;т.ГАдт;nд~~.JГ=~~ ААТААА ...- 1--- З'

 

 

 

5'

Интрон

 

З' ~

 

 

НеКОДИРУЮЩ8R

 

 

НеКОДИРУЮЩ8R

 

 

оБЛ8СТЬ

 

 

 

оБЛ8СТЬ

Ядро

 

 

 

 

 

ТраНСКРИПЦИR

Первичный РНК-транскрипт

 

PPP~

 

 

 

 

 

 

МОДИфИК8ЦИR

 

 

 

 

 

 

5"- и З"-КОНЦОВ

Модифицированный ТР8НСКрипт

 

 

 

 

 

ДАА---Д

 

 

 

 

 

Роlу (А) ХВОСТ

 

 

К3П

 

~

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

УД8ление интронов

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

и сшивание ЭКЗ0НОВ

ПроцесСИРОВ8НН8R АдеРН8А мРНК

 

~AAA---A

 

 

 

 

 

 

цито...: . : - . -- -- - _ . -- - - - - - - --------l---T-~;::::,-;H..~---

мРНК

 

 

~AAД---A

 

 

 

 

 

!

Т_сnяция

Белок

Рис. 36.1. Организаuия транскрипuионной единицы и этапы экспрессии эукариотических генов. Эукариотические гены со­ стоят из структурной и регуляторной областей. Структурная область представлена кодирующей ДИК и некодирующими 5'-и 3'-последовательностями. Кодирующая ДИК включает экзоны-участки ДИК, транскрипты которых остаются в со­ ставе зрелой мРНК, и интроны (транскрипты этих последовательностей удаляются из РНК в ходе процессинга). Струк­ турная область гена ограничена с 5'-конца сайтом инициации транскрипции, а с 3'-конца- полиаденилатным сайтом или

сайтом терминации. Промоторная область, содержащая специфические последовательности, взаимодеЙСТВУЮlцие с бел­

ковыми факторами. рассмотрена в гл. 39 и 41. Первичный транскрипт имеет на 5'-конце специфическую структуру- КЭП

и участок, богатый «А» на 3'-конце. После удаления интронов из первичного транскрипта образовавшаяся зрелая мРИК транспортируется в цитоплазму. где и транслируется с образованием белковой молекулы.

ских или физических воздействий. приводящих к слу­

amilolique.faciens. Первая из трех букв аббревиатуры

чайным разрывам цепей дик. Рестриктазы

соответствует первой букве названия рода (Е). По­

(уже открыто более 200 типов ферментов этого клас­

следующие две буквы являются начальными буква­

са) являются частью защитной системы бактерий,

ми видового названия (со). Буква R говорит о том,

охраняющей собственный геном от чужеродной.

из какого штамма выделен фермент. Римская цифра

главным образом вирусной, дик. Рестриктазы при­

соответствует порядковому номеру рестриктазы

сутствуют только В таких клетках, которые содер­

в ряду аналогичных ферментов, выделенных из это­

жат и специфические метилазы. Роль этих фермен­

го микроорганизма (например. EcoRI. EcoRII). Каж­

тов-метилирование собственной (хозяйской) ДИК

дый фермент узнает определенную 4-7-членную по­

клетки и защита ее таким образом от действия

следовательность в двухцепочечной ДИК. Разреза­

рестриктаз. Сайт-специфические метилазы и рест­

ние ДИК по этим сайтам приводит к образованию

риктазы всегда присутствуют в бактериях одновре­

либо «тупых» (например, при действии рестриктазы

менно.

HpaI), либо «липких», т. е. перекрывающихся (напри­

Рестриктазы принято именовать по названию

мер, BamHI), концов (рис. 36.2). Для конструирова­

бактерий, из которых их вьщеляют (табл. 36.1). Так,

ния гибридных молекул особенно удобны липкие

название EcoRI свидетельствует о том, что этот фер­

концы (см. ниже). Если допустить, что нуклеотиды

мент вьщелен из Escherichia coZi, BamHI - из ВасШus

распределены по молекуле ДНК совершенно случай-

38

Глава 36

Таблица 36.1. Некоторые рестриктазы и расщепляемые ими последовательно­

сти

 

Рестриктаза

Расщепляемая посп. Бактериальны A источник

!

ВamHI GGATCC CCTAGG

f

!

ВgIII AGATCT TCTAGA

f

!

EcoRI GAATTC CTTAAG

t

!

EcoRl1 CCTGG GGACC

f

!

Hindlll AAGCTT TTCGAA

f

!

Hhal GCGC CGCG

f

!

Hpal GTTAAC CAATTG

f

!

Mstll CCTNAGG GGANTCC

f

!

Pstl CTGCAG GACGTC

f

!

Taql TCGA

AGCT

t

8acillus аmу/оПquеfасiеns

8acillus g/obigii

Escherichia соП АУ13

Escherichia соП А245

" R

HiJemophilus influenzae d

Haemophilus haemo/yticus

Haemophi/us parainfluenzae

Microco/eus strain

Providencia stuartii 164

Thermus aquaticus VTI

А -аденин; С -цитозин; G - гуанин, I I-ИМИН. Стрелки указывают на сайты расщепле­ ния. В результате рестрикции могут формироваться «липкие» (Ват HI) или «тупые» (Нра 1) концы. Длина узнаваемой последовательности варьирует и составляет 4 п. н. для Taq 1, 5 п. н. для Есо RП, 6 п. н. для Есо RI и 7 п. н. для Mst 11. Согласно принятым правилам, верхняя цепь последовательности-мишени представлена в ориентации 5'-+ 3',а нижнJUl- в ориента­

ции 3'-+5'.Обратите внимание, что больщинство последовательностей является палиндро­

мами (т. е. читаются одинаково в противоположных направлеНИJlХ по разным цепям). Остаток, обозначенный N, означает любой нуклеотид.

ным образом, можно рассчитать частоту встречае­

узнающий четырехзвенную последовательность, бу­

мости участка узнавания для данной рестриктазы.

дет находить одну МИIПень на 256 пар оснований

В каждой нуклеотидной позиции молекулы ДИК

(44). В то же время фермент, различающий шести­

с одинаковой вероятностью может оказаться один

звенную последовательность, будет находить специ­

из 4-х нуклеотидов (А, G, С, Т). Поэтому фермент,

фический участок узнавания 1 раз на 4096 пар ОСНО-

Технология рекомбuнантных ДНК

39

А ""Липкие"" концы

 

 

 

--1J<з G Д ТС с1ham н'.-!/G

~Д т С с-1J---

~tсСТАGGI~

'1tCCTAG

G11--

Б "'Тупые"" концы

 

 

д д C-/J---

G

1.

 

--I/ Т ТД Д c1~Hpa

~fG тт

 

 

~fСААттqF

ifCAA

+

т т G(J--

Рис. 36.2. Расщепление ДНК рестрицирующими эндонуклеазами (рестриктазами). В результате рестрикции образуются

фрагменты (рестрикты) либо с «липкими» (А), либо с «тупыми» (Б) концами.

ваний (46). Любой фрагмент ДИК обладает харак­

терным расположением сайтов узнавания различных

рестриктаз, что позволяет строить так называемые

рестриктазные карты. При расщеплении ДИК какой­

либо одной рестриктазой получают смесь фрагмен­

тов, каждый из которых имеет одни и те же концевые

участки. Такие фрагменты можно разделить мето­

дом электрофореза в агарозном или полиакрил­ амидном геле (о методах блоттинга см. ниже). Эта

процедура, основанная на применении рестриктаз,

представляет собой важнейший этап клонирования

генов.

Другие ферменты

Ряд других ферментов, использующих ДИК в ка­

честве субстрата, также имеет важное значение для генной инженерии. Иа некоторых из них мы остано­

вимся в этой и последующих главах (табл. 36.2).

Конструирование химерных молекул ДИК

Ковалентное соединение (в дальнейшем мы бу­

дем ПОЛЬЗОJJаться термином «лигирование») липких

концов фрагментов ДИК-процедура технически не

Таблица 36.2. Ферменты, используемые в работе с рекомбинантными днк. (Adapted and reproduced, with permission, [гот

Emery А. Е. Н. Page 41 in: Ап introduction to Recombinant DNA, Wiley, 1984.)

Фермент Реакция Область приложения

Щелочная фосфатаза

Дефосфорилирует 5'-концы РИК и ДИК

Удаление 5'-РО4 групп перед введением метки

 

 

методом кинирования, а также для предот­

 

 

вращения лигирования молекул вектора по

 

 

типу «сам на себя»

BAL-31 нуклеаза

Деградация как 5'-, так и 3'-концов ДНК

Введение концевых делеций в молекуды ДИК

ДИК-лигаза

Катализирует образование связей между моле­

«Сшивание» молекул ДИК

 

кулами ДНК

 

ДИК-полимераза 1

Синтез двухцепочечной ДНК по ДНК-матрице

Синтез двухцепочечной кДНК; ник-трансляция

ДНКаза 1

В соответствующих условиях вносит одноцепо­

Ник-трансляция, картирование гиперчувстви­

 

чечные разрывы в ДНК

тельных участков в ДИК

Экзонуклеаза 111

Удаляет нуклеотиды с 3'-концов ДНК

Секвенирование ДИК, картирование ДИК­

 

 

белковых взаимодействий

л-Экзонуклеаза

Удаляет нуклеотиды с 5'-концов ДИК

Секвенирование ДИК

Полинуклеотидкиназа

Переносит терминальный (в у-положении) фо­

Введение 32Р в ДНК и РНК

 

сфат АТР на У-ОН-группы ДНК и РИК

 

Обратная транскрип-

Синтезирует ДИК по РНК-матрице

Синтез кДНК по мРНК; картирование РНК (с

таза

 

5'-конца)

Нуклеаза Sl

Деградирует одноцепочечную ДИК

Удаление шпильки при синтезе кДНК: РНК­

 

 

картирование (как с 5'-, так и с 3'-конца)

Терминальная транс-

Добавляет нуклеотиды к 3'-концу ДИК

Создание гомополимерных «хвостов»

фераза

 

 

Соседние файлы в предмете [НЕСОРТИРОВАННОЕ]