- •Т.В. Честнова, о. Л. Смольянинова,
- •Раздел 1 Систематика, классификация и морфология микроорганизмов.
- •Краткая история развития микробиологии.
- •Систематика и номенклатура микроорганизмов
- •Особенности строения и формы бактерий.
- •Раздел 2 Физиология микроорганизмов. Рост и размножение бактерий
- •Питание бактерий
- •Дыхание бактерий.
- •Метаболизм бактериальной клетки
- •Виды пластического обмена
- •Строение, классификация и физиология грибов.
- •Строение, классификация и физиология простейших.
- •Строение, классификация и физиология вирусов.
- •Рнк-содержащие вирусы:
- •Днк- содержащие вирусы:
- •Бактериофаги, их строение, классификация, применение.
- •Раздел 3. Экология микроорганизмов.
- •Нормофлора, ее значение для микроорганизма. Понятие о транзиторной флоре. Понятие о дисбиотических состояниях. Их оценка. Методы коррекции.
- •Дисбактериоз
- •Влияние условий внешней среды на микроорганизмы. Влияние физических, химических факторов на микроорганизмы.
- •Понятие о стерилизации, дезинфекции, асептике и антисептике. Методы стерилизации, аппаратура. Контроль качества дезинфекции.
- •Влияние биологических факторов.
- •1) Полезные взаимоотношения:
- •Раздел 4. Генетика микроорганизмов. Строение бактериального генома.
- •Понятие о генотипе и фенотипе. Фенотипическая и генотипическая изменчивость микроорганизмов. Мутации. Модификации. Рекомбинации.
- •Генетическая инженерия и область ее применения в биотехнологии.
- •Раздел 5. Химиотерапевтические препараты. Антибиотики.
- •Антибиотики. Принципы классификации. Способы получения.
- •Основные осложнения химиотерапии. Лекарственная устойчивость, меры борьбы. Основы рациональной антибиотикотерапии.
- •Методы определения чувствительности к антибиотикам
- •Раздел 6. Учение об инфекции.
- •Формы инфекционного процесса
- •Патогенность и вирулентность. Факторы патогенности.
- •Понятие об эпидемиологическом надзоре за инфекционным процессом. Понятие о резервуаре, источнике инфекции, путях и факторах передачи.
- •Раздел 7 Иммунитет Понятие об иммунитете. Виды иммунитета
- •Неспецифические факторы защиты
- •Центральные и периферические органы иммунной системы
- •Клетки иммунной системы
- •Формы иммунного ответа
- •Свойства и типы антигенов
- •Антигены микроорганизмов
- •Антитела Структура иммуноглобулинов
- •Классы иммуноглобулинов и их свойства
- •Иммунопатология Иммунодефицитные состояния
- •Аллергические заболевания.
- •Аутоиммунные процессы.
- •Иммунный статус макроорганизма. Методы оценки.
- •Иммунодиагностика.
- •Иммунопрофилактика.
- •Иммунотерапия.
- •Список литературы
- •Оглавление
Систематика и номенклатура микроорганизмов
Систематика - распределение микроорганизмов в соответствии с их происхождением и биологическим сходством. Систематика занимается всесторонним описанием видов организмов, выяснением степени родственных отношений между ними и объединением их в различные по уровню родства классификационные единицы - таксоны. Основные вопросы, решаемые при систематике (три аспекта, три кита систематики) - классификация, идентификация и номенклатура.
Классификация - распределение (объединение) организмов в соответствии с их общими свойствами (сходными генотипическими и фентипическими признаками) по различным таксонам.
Таксономия - наука о методах и принципах распределения (классификации) организмов в соответствии с их иерархией. Наиболее часто используют следующие таксономические единицы (таксоны) - штамм, вид, род. Последующие более крупные таксоны - семейство, порядок, класс.
Идентификация – установление видовой принадлежности микроорганизма по морфологическим, тинкториальным, культуральным, биохимическим и антигенным свойствам.
Номенклатура - название микроорганизмов в соответствии с международными правилами.
Все микроорганизмы подразделяются на неклеточные и клеточные формы. К неклеточным формам относятся: прионы, вироиды, вирусы. К клеточным формам относятся три домена: «Bacteria», «Archaea» - прокариоты, «Eukarya» - эукариоты. К прокариотам относятся бактерии и архебактерии, к эукариотам - грибы и простейшие.
Решением Международного кодекса для бактерий рекомендованы следующие таксономические категории: класс, отдел, порядок, семейство, род, вид. Название вида соответствует бинарной номенклатуре, т.е. состоит из двух слов. Например, возбудитель дифтерии пишется как Corynebacterium diphtheriae, возбудитель менингита - Neisseria meningitides, возбудитель туберкулеза - Mycobacterium tuberculosis. Первое слово – название рода и пишется с прописной буквы, второе слово обозначает вид и пишется со строчной буквы.
Согласно второму изданию (2001г.) Руководства Берджи по систематической бактериологии, бактерии делят на 2 домена: «Bacteria» и «Archaea». В домене «Bacteria» можно выделить следующие бактерии: 1) бактерии с тонкой клеточной стенкой – грамотрицательные; 2) бактерии с толстой клеточной стенкой – грамположительные; 3) бактерии без клеточной стенки (микоплазмы). Архебактерии не содержат пептидогликан в клеточной стенке. Термин «архебактерии» появился в 1977г. Это одна из древних форм жизни, на что указывает приставка «архее». Среди них нет возбудителей инфекционных заболеваний.
Домены включают царства, типы, классы, порядки, семейства, роды, виды.
Основной таксономической единицей систематики бактерий является вид.
Вид – это совокупность особей, объединенных по близким свойствам, но отличающихся от других представителей рода.
Вид не является конечной единицей систематики. Внутри вида выделяют варианты микроорганизмов, отличающиеся отдельными признаками. Так, различают:
1) серовары (по антигенной структуре);
2) хемовары (по чувствительности к химическим веществам);
3) фаговары (по чувствительности к фагам);
4) ферментовары;
5) бактериоциновары;
6) бактериоциногеновары.
Бактериоцины – вещества, продуцируемые бактериями и губительно действующие на другие бактерии. По типу продуцируемого бактериоцина различают бактериоциновары, а по чувствительности – бактерициногеновары.
Для видовой идентификации бактерий необходимо знать следующие их свойства:
1) морфологические (форму и структуру бактериальной клетки);
2) тинкториальные (способность окрашиваться различными красителями);
3) культуральные (характер роста на питательной среде);
4) биохимические (способность утилизировать различные субстраты);
5) антигенные.
В домен «Bacteria» входят 22 типа, из которых медицинское значение имеют следующие:
Тип Proteobacteria
Класс Alphaproteobacteria. Роды: Rickettsia, Orientia, Ehrlichia, Bartonella, Brucella.
Класс Betaproteobacteria. Роды: Burkholderia, Alcaligenes, Bordetella, Neisseria, Kingella, Spirillum.
Класс Gammaproteobacteria. Роды: Francisella, Legionella, Coxiella, Pseudomonas, Moraxella, Acinetobacter, Vibrio, Enterobacter, Callimatobacterium, Citrobacter, Edwardsiella, Erwinia, Escherichia, Hafnia, Klebsiella, Morganella, Proteus, Providensia, Salmonella, Serracia, Shigella, Yersinia, Pasteurella.
Класс Deltaproteobacteria. Род Bilophila.
Класс Epsilonproteobacteria. Роды: Campylobacter, Helicobacter, Wolinella.
Тип Firmicutes (главным образом грамположительные)
Класс Clostridia. Роды: Clostridium, Sarcina, Peptostreptococcus, Eubacterium, Peptococcus, Veillonella.
Класс Mollicutes. Роды: Mycoplasma, Ureaplasma.
Класс Bacilli. Роды: Bacillus, Sporosarcina, Listeria, Staphylococcus, Gemella, Lactobacillus, Pediococcus, Aerococcus, Leuconostoc, Streptococcus, Lactococcus.
Тип Actinobacteria
Класс Actinobacteria. Роды: Actinomyces, Arcanodacterium, Mobiluncus, Micrococcus, Rothia, Stomatococcus, Corynebacterium, Mycobacterium, Nocardia, Propionibacterium, Bifidobacterium, Gardnerella.
Тип Clamydiae
Класс Clamydiae. Роды: Clamydia, Clamidophila.
Тип Spirochaetes
Класс Spirochaetes. Роды: Spirochaeta, Borrelia, Treponema, Leptospira.
Тип Bacteroidetes
Класс Bacteroidetes. Роды: Bacteroides, Porphyromonas, Prevotella.
Класс Flavobacteria. Роды: Flavobacterium.
В микробиологии часто используется и ряд других терминов для характеристики микроорганизмов.
Штамм – чистая культура микроорганизмов, выделенных от одного источника и отличающихся от других представителей вида по антигенным, биохимическим, биологическим и др. свойствам.
Колония - видимая изолированная структура при размножении бактерий на плотных питательных средах. Может развиваться из одной или нескольких родительских клеток. Если колония развилась из одной родительской клетки, то потомство называется клон.
Культура - вся совокупность микроорганизмов одного вида, выросших на плотной или жидкой питательной среде.