14.Аллостерические ферменты.

Аллостерические ферменты – это ферменты, активность которых регулируется не только концентрацией субстрата, но и другими веществами (аллостерическими регуляторами).

Активность таких ферментов регулируют вещества, действующие подобно неконкурентным ингибиторам. Эти вещества присоединяются к ферментам в особых участках, удаленных от активного центра, и меняют активность фермента, вызывая обратимое изменение в структуре активного центра. В результате меняется и способность субстрата связываться с ферментом (чем данное явление и отличается от неконкурентного ингибирования). Действующие таким образом вещества называются аллостерическими ингибиторами.

15.Активный центр фермента и его свойства.

Активный центр — это область фермента, где молекулы субстрата связываются и подвергаются химической реакции. Активный центр состоит из аминокислотных остатков, которые образуют временные связи с субстратом (сайт связывания), и остатков, которые катализируют реакцию этого субстрата (каталитический сайт).

В активном центре условно различают так называемый каталитический центр, непосредственно вступающий в химическое взаимодействие с субстратом, и связывающий центр, или контактную («якорную») площадку, которая обеспечивает специфическое сродство к субстрату и формирование его комплекса с ферментом.

Существует ряд общих закономерностей формирования активных центров:

1) на активный центр приходится относительно малая часть объёма фермента (5-10 аминокислотных остатков). Роль остальных аминокислот, состоит в том, чтобы обеспечить молекуле фермента правильную конформацию для оптимального протекания химической реакции;

2) активный центр – это сложная трёхмерная структура, в образовании которой принимают участие группы, принадлежащие разным частям линейной последовательности аминокислот. Радикалы аминокислот, образующих активный центр, оказываются вблизи друг от друга в результате формирования третичной структуры белка. Поэтому при воздействии физических и химических факторов, вызывающих денатурацию (нагревание, концентрированные кислоты и щёлочи) утрачивается конформация активного центра и фермент теряет свою активность;

3) активный центр имеет форму узкого углубления или щели, в которую ограничен доступ воде, за исключением тех случаев, когда вода является одним из реагирующих веществ. В этом углублении присутствует несколько полярных аминокислотных остатков, необходимых для связывания субстрата и катализа;

4) в составе активного центра можно условно выделить две части:

а) контактный или якорный участок, где происходит связывание субстрата в нужной ориентации;

б) каталитический участок, обеспечивающий протекание реакции. Четкую грань между каталитическим и субстратным центром провести можно не всегда – у некоторых ферментов они совпадают или перекрываются

5) размеры ферментов намного превышают размеры их низкомолекулярных субстратов;

6) субстраты относительно слабо связываются с ферментами.

16. Кофакторы и коферменты. Классификация.

Сложн ферменты сост из белкового компонента(апофермента) и небелкового (кофактора). Кофактор может быть неорг (металлы) и орг природы и в зависимости от прочности связи с апоферментом делятся на простетические группы (прочно, ковал связаны с апоферментом) и коферменты (слабо, нековал связаны с апоферментом). Сложн фермент (апофермент + кофактор) - холофермент.

Коферменты: производные витаминов, гемы (в составе цитохромов), нуклеотиды (донор и акцептор фосфорн к-ты), убихинон (коферм Q перенос электронов и протонов), фосфоаденозилфосфосульфат (перенос остатков фосфорн к-ты), S-аденозилметионин (донор метильной группы), глутатион (уч-т в ОВР), аскорбин к-та (р-ции окисления субстратов), коэнзим-А (перенос ацильных групп), тиаминпирофосфат (ТПФ, активирует альдегиды и кетоны и переносит их в виде ОН-алкильных групп к другим молек-м), биотин (работа в цикле кребса, биосинтез ЖК, утилизация пропионов к-ты).