- •1. Аминокислоты. Классификация(по структуре, по характеру r-групп, заменимые и незаменимые).
- •4.Вторичная структура белка. Альфа- спираль и бета – складчатый слой.
- •5. Третичная структура белка и силы ее стабилизирующие.
- •6. Четвертичная структура белка. Понятия о денатурации и деструкции.
- •7.Кооперативный эффект связывания кислорода гемоглобином.
- •8. Отличия ферментов от неорганических катализаторов.
- •9. Классификация ферментов с примерами реакций на каждый класс.
- •10. Влияние температуры, pH и концентрации фермента на скорость ферментативной реакции.
- •11.Влияние концентрации субстрата на скорость ферментативной реакции. Вывод уравнения Михаэлиса-Ментен.
- •13. Ингибирование ферментов. Неконкурентное ингибирование.
- •14.Аллостерические ферменты.
- •15.Активный центр фермента и его свойства.
- •16. Кофакторы и коферменты. Классификация.
- •17.Молекулярные механизмы ферментативного катализа.
- •18. Способы определения активности фермента. Единицы измерения. Понятие об удельной и молярной активности.
- •19. Изоферменты.
- •20. Моносахариды. Представители и свойства. Функции углеводов.
- •22. Гомо- и гетерополисахариды.
- •23.Липиды. Классификация липидов и их функции.
- •24. Жирные кислоты. Их роль в организме.
- •26. Сфинголипиды. Церамиды. Ганглиозиды
- •27. Неомыляемые липиды. Холестерин и его свойства.
- •28. Воски
- •29. Пути превращения углеводов. Реакции гликолиза и его регуляция.
- •30. Пентозофосфатный путь и его значение.
- •31. Путь Энтнера-Дудорова
- •32. Работа пируватдегидрогеназного комплекса
- •33.Работа цикла трикарбоновых кислот(цтк). Анаплеротические реакции цтк.
- •34.Реакции глюконеогенеза
- •35. Распад и синтез гликогена. Гормональная регуляция.
- •36.Глюкозо-аланиновый и глюкозо-лактатный путь, роль в организме человека.
- •37.Дыхательная цепь митохондрий. Характеристика переносчиков
- •38. Хемиоосмотическая модель п.Митчелла (основные постулаты и доказательства).
- •39.Ингибиторы и разобщители дыхательной цепи митохондрий.
- •40. Витамины, классификация. Антивитамины. Несовместимость витаминов. Особенности водо- и жирорастворимых витаминов.
- •41. Жирорастворимые витамины(a, d, e, k).
- •42. Водорастворимые витамины группы b (b1, b2, в12)
- •43. Фолиевая кислота и пантотеновая кислота
- •44. Витамины с и н.
- •57. Окисление жирных кислот с нечетным числом углеродных атомов.
- •58.Окисление ненасыщенных жирных кислот.
- •59. Реакции синтеза жирных кислот.
- •60. Жирные кислоты. Механизм действия моющих средств.
- •61. Глиоксилатный цикл и его биологическая роль.
- •62. Метаболизм глицерина.
- •63.Пути катаболизма углеродного скелета аминокислот. Пути обмена аминокислот.
- •64. Реакции трансаминирования. Использование трансаминаз в медицине.
- •65.Прямое и непрямое дезаминирование аминокислот.
- •66.Особенности дезаминирования аминокислот в скелетных мышцах
- •67.Метаболизм аммиака.
- •68. Цикл мочевины.
- •69.Химический состав нуклеиновых кислот. Правила Чаргаффа.
- •70.Структурная организация олиго и полинуклеотидов. Характеристика первичной структуры днк.
- •71.Вторичная структура днк. Формы двойной спирали.
- •72.Третичная структура днк.
- •73.Структура и свойства рибосомальных, матричных и транспортных рнк.
- •74. Биосинтез белка. Стадии активации и инициации.
- •75. Биосинтез белка. Стадии элонгации и терминации.
- •76. Ингибиторы биосинтеза белка. Механизм действия дифтерийного токсина.
- •77. Антибиотики-ингибиторы биосинтеза белка.
- •80. Распад липидов в желудочно-кишечном тракте.
- •Переваривание и всасывание
- •Переваривание холестерина
- •Всасывание
72.Третичная структура днк.
Третичная структура РНК — это расположение различных элементов вторичной структуры РНК — спиральных дуплексов, трехцепочечных участков, шпилек и петель — в пространстве. Третичная структура тРНК напоминает перевёрнутую букву L
(см. Рис. 48). Дополнительное сворачивание цепи происходит за счет об-
разования водородных связей между азотистыми основаниями, а также между атомами кислорода (участвующими в образовании фосфодиэфирных связей) и 2’- гидрокисльными группами рибозы,
координационных связей с ионами металлов и сил Ван-дер-Ваальса. По-
мимо этого, в третичной структуре водородные связи могут возникать между 3 азотистыми основаниями.
Стоит отметить, что, например,
в тРНК присутствуют ковалентно Рис. 48. Третичная структура
модифицированные азотистые осно-дрожжевой тРНКвания (их доля может достигать 25%), которые иногда образуют «не- уотсон-криковские пары». Однако эти модификации нисколько не стабилизируют саму молекулу тРНК и даже не участвуют в её связывании с рибосомой. Их роль — в усилении кодон-антикодонового взаимодействия (в трансляции) и в связывании корректной аминокислоты (процесс, который называется аминоацилированием).
73.Структура и свойства рибосомальных, матричных и транспортных рнк.
ДНК представляет собой двухцепочечную нуклеиновую кислоту, которая содержит генетическую информацию, получаемую нами от родителей и передаваемую от нас нашим детям. РНК — подобная структура, облегчающая экспрессию данной информации в наших клетках. Основное различие между ДНК и РНК: РНК (обычно) имеет только одну цепь, дезоксирибоза в ней замещена на рибозу, а тимин — на урацил. У эукариот (организмов с «настоящим ядром», или высших существ) существует девять основных типов РНК: информационная РНК (иРНК или мРНК) и её предшественница— гяРНК, транспортная РНК (тРНК), рибосомная (рРНК), малая ядерная РНК (snPHK), малая ядрышковая РНК (snoPHK), сигналраспознающая РНК (srpPHK), микро-РНК (miPHK) и митохондриальная РНК (т+ РНК). ГяРНК свойственна исключительно эукариотам, её нет у прокариот («доядерные» организмы, например бактерии и вирусы). Некоторые вирусы для хранения и передачи генетической информации следующим поколениям используют РНК вместо ДНК. Гетерогенная ядерная и информационная РНК ГяРНК и её производное — информационная (или матричная) РНК переносят генетическую информацию от ядерной ДНК к цитоплазме. Количество видов гяРНК равно количеству генов, так как она служит прямой копией кодирующих последовательностей генома. В процессе транскрипции РНК с ДНК ключевую роль играет фермент РНК-полимераза II. Информационная РНК образуется в результате процессинга гяРНК, при котором происходят вырезание некодирующих участков (интронов) и склеивание кодирующих экзонов. Таким образом, в состав иРНК входят кодирующая информация соответствующих видов гяРНК, а также фланкирующий лидерный и трейлерный участки, по этой причине она значительно короче. Транспортная РНК Каждая молекула тРНК состоит примерно из 75 связанных между собой нуклеотидов, образующих длинную цепь. В результате взаимодействия входящих в её состав оснований тРНК имеет конформационную структуру «клеверный лист», который затем скручивается в L-форму. Очень часто в состав тРНК помимо Ц, Г, А и У входит ряд редких оснований, некоторые из которых модифицированы путём метилирования. Важная особенность тРНК: «заряженная» молекула несёт на своём 3'-конце аминокислоту, а посередине конформационной структуры «клеверный лист» находятся три специфических основания, именуемые антикодоном. Последовательность оснований в антикодоне напрямую зависит от вида аминокислоты, прикреплённой к 3'-концу. Так, например, тРНК, антикодон которой имеет последовательность 5'-ЦЦА-3', может нести только аминокислоту триптофан. Следует отметить, что данная зависимость лежит в основе передачи генетической информации, носителем которой выступает тРНК. Транскрипция молекул тРНК происходит с кодирующих её последовательностей в ДНК при участии фермента РНК-полимеразы III. Различают более 40 семейств тРНК, которые, в свою очередь, подразделяют на несколько видов. Рибосомальная РНК Существует несколько субъединиц рРНК, которые различаются по коэффициенту седиментации (осаждения), измеряемому в единицах Сведберга (S). Данный коэффициент зависит от скорости осаждения субъединиц при центрифугировании в насыщенной водной среде. Каждая рибосома состоит из большой и малой субъединиц. Они содержат большое количество белков, синтезированных посредством трансляции иРНК, а также РНК, которая не подвергается трансляции. Термин «рибосомальная РНК» относят именно к нетранслируемому материалу. В малой субъединице находится 18S рРНК, а в большой — 4S, 5,8S и 28S рРНК. Траскрипция рРНК с ДНК происходит при помощи двух дополнительных РНК-полимераз. РНК-полимераза I транскрибирует 5S, 5,8S и 28S в виде одного длинного 45S-тpaнскрипта, который затем разделяется на необходимые части. Таким образом обеспечивается равное количество молекул. В организме человека в каждом гаплоидном геноме присутствует примерно 250 копий последовательности ДНК, кодирующей 45S-транскрипт. Они расположены в пяти кластерных тандемных повторах в коротких плечах хромосом 13, 14, 15, 21 и 22. Данные участки известны как ядрышковые организаторы, так как их транскрипция и последующий процессинг 45S-транскрипта происходят внутри ядрышка. Не менее чем в трёх кластерах хромосомы 1 существует 2000 копий 5S-pPHK гена. Их транскрипция протекает в присутствии РНК-полимеразы III снаружи ядрышка. Затем они доставляются к местам сборки рибосом при помощи рибосомальных белков. В рРНК насчитывают около 95 псевдоуридиновых участков, образованных посредством изомеризации уридина малой ядрышковой РНК. Малая ядерная РНК. Превращение гяРНК в иРНК путём удаления интронов проходит в ядерном комплексе РНК-белков, называемом сплайсомой. У каждой сплайсомы есть ядро, состоящее из трёх малых (низкомолекулярных) ядерных рибонуклео-протеинов, или снурпов. Каждый снурп содержит хотя бы одну малую ядерную РНК и несколько белков. Существует несколько сотен различных малых ядерных РНК, транскрибируемых в основном РНК-полимеразой II. Считают, что их основная функция — распознавание специфических рибонуклеиновых последовательностей посредством спаривания оснований по типу РНК—РНК. Для процессинга гяРНК наиболее важны Ul, U2, U4/U6 и U5. Малая ядрышковая РНК. Малая (низкомолекулярная) ядрышковая РНК в основном участвует в направлении или проведении модификаций оснований в рРНК и малой ядерной РНК, таких, как, например, метилирование и псевдоуридинизация. Большинство малых ядрышковых РНК находятся в интронах других генов. Сигналраспознающая РНК. Сигналраспознающая РНК распознаёт сигнальную последовательность белков, предназначенных для экспрессии, и участвует в их переносе через цитоплазматическую мембрану. Микро-РНК. Существует примерно 200 микро-РНК человека длиной в 22 основания, производных расщепления рибонуклеазой Н их предшественников (двухцепочечных «зашпиленных» РНК) в соответствии с инвертированными повторами. Они контролируют трансляцию структурных генов путём комплементарного связывания с З'-концами нетранслируемых участков иРНК. Митохондриальная РНК Митохондриальная ДНК представляет собой непрерывную петлю и кодирует 13 полипептидов, 22 тРНК и 2 рРНК (16S и 23S). Большинство генов находятся на одной (тяжёлой) цепи, однако некоторое их количество расположено и на комплементарной ей лёгкой. При этом обе цепи транскрибируются в виде непрерывных транскриптов при помощи митохондриоспецифической РНК-полимеразы. Данный фермент кодируется ядерным геном. Длинные молекулы РНК затем расщепляются на 37 отдельных видов, а мРНК, рРНК и тРНК совместно транслируют 13 мРНК. Большое количество дополнительных белков, которые поступают в митохондрию из цитоплазмы, транслируются с ядерных генов. У пациентов с системной красной волчанкой обнаруживают антитела к снурп-белкам собственного организма. Кроме того, считают, что определённый набор генов малой ядерной РНК хромосомы 15q играет важную роль в патогенезе синдрома Прадера—Вилли (наследственное сочетание олигофрении, низкого роста, ожирения, гипотонии мышц).