- •Строение, cвойства и функции белков
- •Строение и свойства аминокислот
- •Классификация аминокислот
- •Пептидная связь. Строение и биологическая роль пептидов
- •Структура белков
- •Первичная структура
- •Методы изучения первичной структуры белка:
- •Вторичная структура
- •Третичная структура белков
- •Гидрофилные радикалы внтури гидрообного ядра:
- •Четвертичная структура белка
- •Формирование трехмерной структуры белка в клетке
- •Структура и функциональная роль шаперонов в фолдинге белков
- •Функционирование белков
- •Вещества влияющие на функционирование белков
- •Многообразие белков Классификация
- •Физико-химические свойства белков и методы их выделения
- •Методы выделения и очистки белков Методы разрушения тканей и экстракции белков
- •Методы отчистки белков
- •Количественное определение белков
- •Особенности функционирования олигомерных белков на примере Гемоглобина
- •Биосинтез нк и белков (Матричные биосинтезы). Основы молекулярной генетики
- •5 Типов гистонов:
- •Негистоновые белки хроматина
Особенности функционирования олигомерных белков на примере Гемоглобина
Гемоглобин |
Миоглобин |
4ая структура (тетрамер) |
3ая структура (мономер) |
Сходное происхождение |
|
Функция |
|
Сходная конформация отдельных цепей |
Структура Миоглобина
Простетическая группа - Гем |
Белковая часть |
|
Глобулярный белок |
|
1 полипептидная цепь |
Клеточная локализация и функции
Р-н в красных мышцах
F: запас кислорода (мыш работа- падение парциального P O2 – О2 освобождается – исп митохондрии- энергия для мышц)
Строение миоглобина
Гем (не белковая часть) |
Апомиоглобин (белковая часть) |
Циклический тетрапиролл |
8 альфа-спиралей |
Протопорфирин 9 |
А-Н с N конца (Гис F8) |
|
3ая стр. -Компактная глобула без св места |
|
Вн ч.- гидрофобные R (не дают проникнуть Н2О тк Fe2+ -Fe3+ - не прис О2) (Кроме 2ух Гис в АЦБ) |
Связывание гема с апомиглобином
Гем- специфический лиганд апомиоглобина
Р-н между F и E
Центр связывания образован:
Гидрофобные остатки АК
2е боковые ионизированные (ph 7.34) гр пропионовых к-т выступают на поверхность (соединены с 2уосновными АК Белковой части)
Гис Е7 (не связан с гемом; для присоединения О2) Гис Е8 (Fe2+ - Атом N имидазольного кольца)
Структура и функции гемоглобина
Р-н: эритроциты чел и позв жив
F:
Перенос О2 из легких в переферические ткани
Перенос СО2 и протонов из периферических тканей
Способность регулировать сродство к О2 в зависимости от тканевых условий
(сильный окислитель)
Гемоглобины человека:
В эритроцитах 90% от всех белков клетки
Гемоглобин А: тетрамер 2альфа2бета 98% у взрослых
Гемоглобин А2: 2альфа2дельта 2% у взрослых
Гемоглобин А1с: гликолизированный гемоглобин А
Гемоглобины во внутриутробном развитии
Эмбриональный гемоглобин: эмбриональный желточный мешок, 2кси2эпсилон - через 2 нед печень Гемоглобин F – 6 мес F заменяет ЭГ
Гемоглобин F- печень костный мозг до рождения- гемоглобин А (8 мес)- после рождения А заменяет F. 2альфа2гамма
Строение Гемоглобина А
Строение протомеров Гемоглобина сходно с апомиоглобином:
Протомер: 8 спиралей плотная глобула внутреннее гидрофобное ядро карман для гема
Соедениение с гемом: гидрофобное окружение гема кроме Гис 7 и Гис 8
Роль Гис Е7 в функционировании миоглобина и гемоглобина:
Гем+СО (в 25000 р сильнее тк атомы Fe2,C,O в одной плоскости)
чем Гем+О2 (под углом)
Гис Е7 рн над Fe2+ в обл присоединения О2=> нарушается оптимальное положение СО в АЦБ и оптимальные условия для присоединения О2
Итого: СО (в 200р) чем О2
Уменьшение сродства с СО связано с эндогенным СО который блокирует гемсодержащие белки (после уменьшения 1%)
Четвертичная структура гемоглобина
2альфа2бета- каждая альфа с 2мя бета
Между Альфа1 и бета 1; Альфа 2 и бета 2- много гидрофобных радикалов –> гидрофобные взаимодействия, а также ионные и водородные -> обр димеры альфа1бета1 и альфа2бета2- между димерами полярные св (ионные и водородные) (при изменении Ph- рвутся св между димерами)
Димеры перемещаются относительно дд
Поверх протомеров не ровная => В центр области- центральная полость ч-з всю молекулу
Связывание гемоглобина с О2 в легких и его диссоциация из комплекса в тканях
Оксигемоглобин – Hb(O2)4
Отщепление при высоком порциальном давлении
Регуляция сродства Г с О2 от потребностей тканей
Кооперативные изменения конформации протомеров
НАПОДОБИЕ МИОГЛОБИНА: О2 связывается с протомерами через Fe2+ который соединен с 4 атомами N а томом азота Гис 8 с кислородом по другую сторону плоскости в области гис 7
В дезоксигемоглобине Fe2+ выступает из гема в напр Гис 8 (тк ковалентная связь с белковой ч) -> +О2 к Fe2+ одного протмера вызывает его перемещение+гис8+полипептидная цепь в плоскость гема- протомеры связаны между собой и обладают коформационной лабильностью- происходит изменение конформации всего белка (кооперативное изменение конформации протомеров -изменение конформации и функции белка при присоединении лиганда) облегчают присоединение О2 (4ая мол О2 в 300 р легче)
Аналогично: диссоциация каждой мол О2 изменяет конформацию всех протомеров и облегчает отщепление последующих молекул
Кривые диссоциации О2 для миоглобина и гемоглобина
Степень насыщения белков кислородом- отношение занятых о2 уч связывания белка к общему числу таких участков
Кривая диссоциации для миоглобина: вид гиперболы; связывает О2 который освобождает гемоглобин и сам может его высвобождать; имеет высокое сродство с О2 и при 1-2 мм рт ст остается связанным с 50% О2
Кривая диссоциации для гемоглобина: вид сигмовидной формы, тк кооперативная работа протомеров (чем больше отдали- тем легче отдают); меньшее сродство с О2
F:
Миоглобин: +О2 который отдает гемоглобин; отдача в случае необходимости
Гемоглобин: +О2 в легких; отдавать в капиллярах тканей в зависимсти от порциального давления
Перенос H+ и CO2 из тканей в легкие с помощью гемоглобина. Эффект Бора
Оксигемоглобин – оксиление в мит-ях – Со2+Н2О- эритроциты- карбангидраза- H2Co3 = H+ + HCO3- - смещается вправо тк протоны идут к 6 участкам АК – приобретают сродство к Н+ (локальное изменение АК окружения вокруг этих участков за счет приближения карбоксо групп (-)) - теряют сродство к О2 - >отдача О2 (эффект Бора- увеличение отдачи О2 в зависимости от конц Н+)-в каппилярах легких высокое порциальное давление О2 (оксигенирование и отдача Н+)- р-ия смещается влево – СО2 удаляется с выдыхаемым воздухом
В легки СО2 может переносится как:
>CO2 транспортируется в виде НСО3-
<СО2 как R-NH2+CO2= R-NH-COO- (так же снижает сродство к О2) + H+ 15-20%
2.3-бифосфоглицерат- аллострический регулятор сродства гемоглобина к О2 (БФГ)
В норм условиях в эритроцитах С (БФГ=Г)
Центральная полость-место присоединения БФГ
Отщепление О2: образование ионных св между димерами => структура более жесткая полость расширяется
Поверхность полости с положительными R- БФГ присоединяется к ним ионными связями= еще сильнее стабилизирует структуру = уменьшает сродство с О2
Аллострический лиганд- БФГ присоед в иной участок присоед гема
Аллострический центр- центр связывания аллострического лиганда
Оксигемоглобин: разрыв ионных связей между димерами- уменьшение центральной полости- вытеснение БФГ
Изменение концентрации БФГ как механизм адаптации организма к гипоксии
При уменьшении парциального давления в высокогорье или при эмфиземе легких –> увеличевается БФГ –> уменьшает сродство с О2- повышает О2 в тканях
В консервированной в некоторых средах крови снижено БФГ – при переливании тяжелобольным- гипоксия тканей- через часа вост лишь на половину- нельзя вводить тк высокий (-) заряд не пропускается через мембрану, поэтому вводится в-ва которые проникают и регулируют БФГ
ИТОГ Благодаря воздействию регуляторных лигандов олигомерные белки способны приспосабливать свою конформацию и функции к изменениям
Особенности строения и функц гемоглобина плода:
См выше
+ Гемоглобин Ф имеет более высокое сродство чем ГА тк не имеет БФГ в следствие отсутствия (+) заряда R в 2ух Гамма цепях. При отсутствии БФГ: ГА=ГФ (высокое сродство)