- •Строение, cвойства и функции белков
- •Строение и свойства аминокислот
- •Классификация аминокислот
- •Пептидная связь. Строение и биологическая роль пептидов
- •Структура белков
- •Первичная структура
- •Методы изучения первичной структуры белка:
- •Вторичная структура
- •Третичная структура белков
- •Гидрофилные радикалы внтури гидрообного ядра:
- •Четвертичная структура белка
- •Формирование трехмерной структуры белка в клетке
- •Структура и функциональная роль шаперонов в фолдинге белков
- •Функционирование белков
- •Вещества влияющие на функционирование белков
- •Многообразие белков Классификация
- •Физико-химические свойства белков и методы их выделения
- •Методы выделения и очистки белков Методы разрушения тканей и экстракции белков
- •Методы отчистки белков
- •Количественное определение белков
- •Особенности функционирования олигомерных белков на примере Гемоглобина
- •Биосинтез нк и белков (Матричные биосинтезы). Основы молекулярной генетики
- •5 Типов гистонов:
- •Негистоновые белки хроматина
Физико-химические свойства белков и методы их выделения
Растворимость зависит от:
Форма молекул
Молекулярная масса
Суммарный заряд
Соотношение полярных и не полярных групп на поверхности нативных молекул белков
Состав растворителя
Методы выделения и очистки белков Методы разрушения тканей и экстракции белков
Гомогенизация биоматериала |
PH, C солей, сосуд в котором растирает пестик |
Метод замораживания и оттаивания тканей |
Кристаллизация разрушает ткани, центрифугированием осаждают осадок |
Экстракция белков св с мембранами на протомеры |
Детергенты (разрушают гидрофобные св в олигомерных белках) |
Удаление из раствора небелковых в-в |
Используя физ-хим св-ва |
Методы отчистки белков
Проводится при низко температуре (избежать денатурации)
Избирательная денатурация |
50-70 С или PH 5.0 удаляет большинство белков |
Высаливание |
(NH4)2SO4, чем больше р-сть тем больше конц соли. Соли щм щзм вызывают обратимое осаждение |
Гель фильтрация или метод молекулярных сит |
|
Ультрацентрифугирование |
|
Электрофорез |
|
Ионообменная хроматография |
|
Аффинная хроматография или хроматография по сродству |
|
Количественное определение белков
Оптические методы основаны на оптических свойствах белков. К ним относятся:
спектрофотометрические методы, оценивающие интенсивность поглощения белками УФ лучей в диапазоне около 200 нм и 260 нм. Степень УФЛ - поглощения пропорциональна концентрации белка;
рефрактометрические методы основаны на способности растворов белков преломлять свет пропорционально их концентрации;
нефелометрические методы основаны на способности растворов белков рассеивать свет пропорционально их концентрации;
поляриметрические методы основаны на способности растворов белков вращать плоскость поляризованного света пропорционально их концентрации.
Колориметрические методы основаны на цветных реакциях белков
Биуретовая реакции. Метод основан на биуретовой реакции, образующей в щелочной среде окрашенные в фиолетовый цвет комплексы пептидных связей с ионами меди (II). Он известен в двух модификациях: макрометод и микрометод. Макрометод (макроопределение) применяют в случаях, когда содержание белка в исследуемом образце достаточно велико (1-10 мг/мл); Микрометод позволяет определить в 4 мл щелочного раствора 0,1-2 мг белка. На окраску, даваемую белками, оказывают влияние соли аммония, сахароза, глицерин и др. Ниже приведено описание макрометода.
метод Лоури. В щелочной среде ионы Cu+2 образуют комплекс с пептидными связями, переходя в Cu+. Одновалентные ионы меди реагируют с реактивом Фолина (фосфомолибденовая кислота с фенолом), образуя нестабильный продукт, переходящий в молибденовую синь, с максимумом адсорбции при 750 нм. Увеличение адсорбции при 750 нм пропорционально концентрации белка. Метод очень чувствителен к наличию в растворе посторонних восстановителей (что затрудняет его использование при определении белка в неочищенных препаратах), чувствительность к белку — 10 — 100 мкг/мл.
Метод Бредфорда. Метод основан на реакции красителя кумасси (coomassie) с аргинином и гидрофобными аминокислотными остатками. Связанная форма имеет голубую окраску с максимумом поглощения при 595 нм. Таким образом увеличение адсорбции раствора при длине волны, равной 595 нм, пропорционально количеству белка в растворе. Метод даёт хорошее значение концентрации белка в пределах от 2 мкг/мл до 120 мкг/мл (в этих границах соблюдается линейная зависимость увеличения адсорбции от концентрации, в целом чувствительность метода зависит от соотношения концентраций определяемого белка и красителя: чем больше красителя, тем чувствительней метод), менее «капризный» по сравнению с методом Лоури.
метод сорбции белками определённых красителей. Интенсивность окраски определяется концентрацией белкового раствора.
3 % р-р сульфосалициловой кислоты дает помутнение
Пирогаллоловый метод ( краситель пирогаллоловый красный связывается с + заряженными аминогруппами- красное окрашивание)
Азотометрические методы основаны на определении содержания азота и пересчёте его на концентрацию белка (в белках 16% азота).
Навеску анализируемого материала кипятят с концентрированной серной кислотой. При этом углерод органических веществ окисляется до диоксида углерода, водород – до воды; азот (отрицательно заряженный трехвалентный) превращается в аммиак, который с серной кислотой, взятой в избытке, образует сульфат аммония. Минерализованную пробу затем подщелачивают, аммиак отгоняют в раствор кислоты, где определяют титрованием.
Азот нитратов и нитритов, ядер гетероциклических соединений в ходе этого процесса в аммонийную соль не превращается.
ДРУГИЕ: Гравиметрические методы (выделения; осаждения; отгонки)
Гравиметрические (весовые) методы определения общего белка сыворотки основаны на высушивании белков до постоянной массы и взвешивании на аналитических весах. Методы трудоемки и в настоящее время практически не используются для определения общего белка сыворотки. Гравиметрический метод продолжает использоваться в некоторых лабораториях для определения фибриногена в плазме крови.
Титриметрический метод- на основе всех видов реакций (перенос водорода эелектрона эл пары и процессы осаждения)