ГЛОССАРИЙ

Alu-последовательности. Семейство родственных последовательностей ДНК длиной около 300 пн, содержащих сайт узнавания рестриктазы Alu. Человеческий геном содержит около 1,2 млн копий Alu-последовательностей. Полноразмерный Alu-повтор представляет собой димер размером около 280 пн, за каждым мономером из 120 пн идет короткая А-богатая последовательность. Alu-последовательности асимметричны — повтор справа содержит внутреннюю последовательность из 32 пн, а повтор слева нет.

ARMS. Амплификационная система для идентификации мутаций. Генетический тест, использующий аллелеспецифичную ПЦР.

ASO. Аллельспецифичные олигонуклеотиды.

CD-область. Область связывания с белкоммишенью.

CEPH-семьи. База данных по генотипам трехпоколенных семей (Центр по изучению полиморфизма у человека, Париж), созданная Дж. Доссе в 1986 г.

Cos-участок. Рестрикционный сайт, обеспечивающий расщепление ДНК и упаковку в частицу фага λ.

CpG-островок. Фрагмент генома млекопитающих длиной 1–2 тпн, в котором много неметилированных дуплетов CpG, обычно находится на 5'-конце гена.

CT (или CAAT)-бокс. Регуляторная последовательность ДНК, расположенная в 5'-области эукариотического гена. С этой последовательностью связывается фактор транскрипции.

C-окрашивание. Метод дифференциального окрашивания центромер метафазных хромосом.

D-петля. Последовательность ДНК, формирующаяся после раскрытия двойной спирали

ДНК, например в митохондриальной ДНК или ДНК теломеры.

G6PD. Глюкозо-6-фосфатдегидрогеназа.

G-белки. Связывающие гуаниновый нуклеотид белки, принимающие участие в передаче сигнала.

G-окрашивание. Метод окрашивания метафазных хромосом, используемый для их идентификации.

Hfr-клетка. Бактерия, содержащая последовательности ДНК, которые обеспечивают высокую частоту переноса ДНК при конъюгации.

HGPRT. Гипоксантингуанинфосфорибозилтрансфераза. Фермент пуринового мутаболизма, отсутствие которого можно наблюдать при синдроме Леша–Нихена.

HLA (Доссе и Терасаки, 1954). Система человеческого лейкоцитарного антигена А. Считается, что аббревиатура HLA — это сокращение от human leukocyte antigen.

HMG-белки. Группа белков, обладающих высокой подвижностью при электрофорезе в полиакриламидном геле. Ядерные белки, которые по-разному взаимодействуют с ДНК.

Hox-гены. Кластеры генов млекопитающих, содержащих гомеобоксные последовательности. Играют важную роль в эмбриональном развитии.

In silico. Компьютерное моделирование, например биологического эксперимента.

In vitro. Технология выполнения экспериментов, когда опыты проводятся вне живого организма или в лабораторных условиях.

In vivo. На живом организме.

LINE (длинные диспергированные ядерные повторы). Длинные диспергированные повторяющиеся последовательности ДНК.

MHC (главный комплекс гистосовместимости) (Торсби, 1974). Основная система гистосовместимости, в состав которой входят гены антигенов системы HLA I, II и III классов.

N-связанные олигосахариды. Разветвленные олигосахаридные цепочки, присоединяющиеся к N-концевой боковой цепи аспарагина в гликопротеинах.

qPCR. Количественная ПЦР.

Rho-фактор. Белок, обеспечивающий терминацию транскрипции у Escherichia coli.

SINE (короткие диспергированные ядерные повторы). Короткие повторяющиеся последовательности ДНК (см. LINE).

SMAD. Внутриклеточные белки, которые обеспечивают передачу внеклеточных сигналов от лигандов трансформирующего фактора роста β в клеточное ядро, где происходит индукция транскрипции ниже по цепи от гена TGFβ. Название этой группы белков произошло от белка Sma нематоды Caenorhabditis elegans

и белка Mad (mothers against decapentaplegic) дрозофилы.

S-фаза (Говард и Пелк, 1953). Фаза клеточного цикла, в которой происходит синтез ДНК (репликация ДНК), у клеток эукариот она наступает между фазами G1 и G2.

TATA-бокс. Консервативная некодирующая последовательность ДНК длиной около 25 пн, которая присутствует на 5'-конце большинства генов эукариот. В основном состоит из элементов TATAAAA. Ее также называют боксом Хогнесса (см. Прибнов-бокс).

Y-хроматин (Пирсон и др., 1970). Интенсивно флуоресцирующее длинное плечо Y-хромо- сомы, которое можно увидеть в интерфазном ядре.

Z-ДНК. Вариант конформации ДНК. В отличие от нормальной В-ДНК (модель Уотсона и Крика), она представляет собой зигзагообразную левозакрученную спираль (Z — от слова zigzag).

Австралопитеки (Дарт, 1924). Африканский вид древних гоминид (от слов australis — южный и pithecus — обезьяна).

Автономно реплицируемая последовательность (ARS). Последовательность ДНК, необходимая для индукции репликации.

Авторадиография (Лассанье и Латте, 1924). Метод обнаружения радиоактивного вещества в клетках или тканях. Позволяет изучать распределение снабженного радиоактивной меткой вещества (например, в клетках, тканях или метафазных хромосомах) наложением на объект чувствительной к радиоактивному излучению фотопленки или фотоэмульсии.

Акроцентрическая хромосома (Уайт, 1945). Хромосома, центромера которой лежит близко к одному из концов и делит хромосому на длинное и очень короткое плечи.

Актин. Структурный белок, взаимодействующий с множеством других белков. В мышечных клетках взаимодействие F-актина с миозином обеспечивает сокращение.

Алелльные заболевания. Группа заболеваний, возникающих из-за различных мутаций в одном и том же гене.

Аллель (Иогансен, 1909), или аллеломорф (Бейтсон и Саундерс, 1902). Одна из нескольких альтернативных форм гена, расположенных в одних и тех же локусах.

Аллельное исключение. Экспрессия только одного аллеля.

Аллозиготный локус. Генный локус, аллели которого имеют независимое происхождение (см. Аутозиготный локус).

Альтернативный сплайсинг. Образование нескольких мРНК из одного транскрипта.

Альфа-спираль. Одна из форм структуры белка. Линейная аминокислотная последовательность закручивается в спираль (см. Бетаслой).

Амбер-кодон («янтарный кодон»). Стопкодон UAG (игра слов, фамилия открывшего его ученого Бернштейна по-немецки значит «янтарь»).

Аминоацил-тРНК. Транспортная РНК, несущая аминокислоту.

Аминокислота. Органическое вещество, в состав которого входят аминогруппа (–NH2) и карбоксильная группа (–COOH).

Ампликон. Фрагмент ДНК, амплифицированный посредством ПЦР (полимеразной цепной реакции).

Амплификация гена (Браун и Дэвид, 1968). Процесс образования множественных копий отдельного гена, не затрагивающий другие гены.

Амплификация. Процесс получения множественных копий последовательности ДНК.

Анализ сегрегации. Набор различных методов для определения типа наследования.

Анализирующее скрещивание. Скрещивание гетерозиготного животного с одним из его гомозиготных по рецессивным аллелям родителей. Повторное анализирующее скрещивание основано на участии двух гетерозигот.

Анафаза (Страсбургер, 1884). Фаза митоза и мейоза I и II. В анафазе гомологичные хромосомы (сестринские хроматиды) расходятся к полюсам веретена деления.

Анеуплоидия (Такхольм, 1922). Изменение кариотипа в результате приобретения или утраты хромосом (см. Трисомия и моносомия).

Анеусомия. Структурное изменение части хромосомы, приводящее к изменению числа копий отдельного фрагмента по сравнению с нормальным числом. Анеусомия вследствие рекомбинации — это дупликация или недостаточность, возникшая в результате кроссинговера в пределах инверсии (инвертированной области).

Антиген. Молекула, индуцирующая иммунный ответ.

Антикодон. Тринуклеотидная последовательность тРНК, комплементарная кодону специфической аминокислоты в мРНК.

Антипараллельность. Противоположная направленность двух цепей двойной спирали ДНК или РНК.

Антисмысловая РНК. Цепь РНК, комплементарная нормальной мРНК. Природные антисмысловые РНК образуются из не содержащей матрицу цепи гена, они могут регулировать экспрессию гена, не позволяя использовать его в качестве матрицы для нормальной трансляции.

Антитело. Белок (иммуноглобулин), который узнает антитело и связывается с ним, обеспечивая иммунный ответ.

Антиципация. Нарастание тяжести заболевания в ряду поколений.

Апоптоз. Программируемая гибель клетки.

Археи. Архебактерии, одна из трех эволюционных линий ныне живущих организмов, домен, стоящий отдельно от прокариот и эукариот.

Ассортативное скрещивание. Неслучайный выбор партнеров, основанный на общих фенотипических признаках, в отличие от панмиксии.

Ассоциация. Различные аллели встречаются вместе чаще, чем по отдельности (противоположно сцеплению).

Аттенюатор. Последовательность ДНК, регулирующая терминацию транскрипции, участвует в регуляции экспрессии некоторых оперонов у бактерий.

Ауксотрофы (Райан и Ледерберг, 1946). Клетки или клеточные линии, которые не могут синтезировать определенное необходимое для их роста вещество (см. Прототрофы).

Аутосома (Монтгомери, 1906). Любая хромосома, не являющаяся половой хромосомой (половые хромосомы обычно обозначают как X или Y). Аутосомными называют гены или сегменты, расположенные на аутосомах.

Ацентрическая. Термин применяют к хромосоме или хроматиде без центромеры.

Ашкенази. Потомки еврейского населения Восточной Европы и средневековых городов, стоявших на берегах Рейна и на территории Эльзаса (Ашкеназ — это средневековое семитское название данного региона) (см. Сефарды).

Бактериофаг. Вирус, инфицирующий бактерии. Сокращенный вариант — фаг.

Белки WNT. Семейство богатых цистеином секретируемых сигнальных белков, играющих определенную роль в коммуникации между клетками, пролиферации, миграции, обеспечении полярности, выживании и самообновлении.

Белки. Молекулы, выполняющие различные биологические функции, которые состоят из одной или нескольких полипептидных субъединиц с определенными последовательностями аминокислот, образующих определенную трехмерную структуру.

Белок SUMO. Убиквитиноподобный белок. Связывается с другими белками, изменяя их функцию.

Бессмысленный кодон. Кодон, не имеющий подходящей молекулы тРНК. Любой из трех кодонов (стоп-кодонов), обеспечивающих терминацию трансляции (UAG, UAA, UGA).

Бета-слой. Одна из форм структуры белка. Фрагменты полипептидных нитей располагаются параллельно друг другу.

Библиотека. См. ДНК-библиотека.

Бивалент (Хакер, 1892). Пара гомологичных хромосом, связывающихся друг с другом в фазе пахитены мейоза. Как правило, в диплоидных соматических клетках число бивалентов соответствует половине нормального числа хромосом. Образование бивалента необходимо для рекомбинации за счет кроссинговера между несестринскими хроматидами. В клетках-трисомиках образуется тривалент из трех хромосом.

Бимодальное распределение. Распределение частот, при котором у кривой существует два пика (максимума). Они могут соответствовать двум различным фенотипам, различающимся количественными показателями.

Бокс Хогнесса. Азотистая последовательность (5'-TATAAA-3'), расположенная примерно в 25 пн выше по цепи (в направлении 5'-кон- ца) от промоторной области гена эукариот (более известна как TATА-бокс).

Вариация числа копий (CNV). Различия в количестве повторов определенной последовательности ДНК в геномах разных индивидов.

Вектор клонирования. Плазмида, фаг, искусственная бактериальная или дрожжевая хромосома, которые используют для транспорта фрагмента чужеродной ДНК при клонировании (получении множественных копий фрагмента).

Вектор. Молекула, в которую можно встроить ДНК для переноса.

Вектор для экспрессии. Вектор для клонирования, содержащий транскрибируемые и транслируемые последовательности ДНК.

Вестерн-блот. Метод идентификации антител к белкам, имеет много общего с методом Саузерн-блот (Саузерн-гибридизации).

Вид. Природная популяция, представители который способны к взаимному скрещиванию и имеют общий генофонд.

Видообразование (Симпсон, 1944). Образование видов в процессе эволюции. Один из первых этапов видообразования — репродуктивная изоляция, препятствующая обмену генами. Важным механизмом является инверсия хромосом.

Вирион. Полноценная вирусная частица, находящаяся вне клетки.

Вирус. Частица, состоящая из ДНК или РНК определенных размеров с определенной последовательностью, заключенной в белковую оболочку. Такая частица может реплицироваться только внутри клетки-хозяина.

В-клетки. В-лимфоциты.

Водородная связь. Нековалентная непрочная химическая связь между отрицательно заряженным атомом (обычно атомом кислорода или азота) и атомом водорода. Водородные связи необходимы для стабилизации трехмерной структуры белка и спаривания нуклеотидов в молекулах нуклеиновых кислот.

Время дивергенции. Время, прошедшее с момента отделения двух популяций от общего предка (см. Время коалесценции).

Время коалесценции. Время, прошедшее с момента появления самого последнего общего предка (см. Время дивергенции).

Вставка. Встраивание негомологичного хромосомного материала в хромосому без реципрокной транслокации.

Вставка. Инсерционно-делеционный полиморфизм ДНК.

Вставочные последовательности. Последовательности ДНК интронов.

Выраженный мозаицизм. Наличие различных генотипов в пределах одной ткани.

Высококонсервативный. Данный термин применяют к генам или фрагментам хромосом, которые не изменились в процессе эволюции из-за своей функциональной значимости.

Выше по цепи. В направлении 5'-конца гена (см. Ниже по цепи).

Гамета (Страсбургер, 1877). Гаплоидная половая клетка — сперматозоид (мужская клетка) или яйцеклетка (женская клетка). У млекопитающих мужской пол является гетерогаметным (XY), а женский — гомогаметным (XX). У птиц женский пол является гетерогаметным (ZW), а мужской — гомогаметным (ZZ).

Гаплоидность (Страсбургер, 1905). Присутствие в клетке или организме одинарного набора хромосом. Гаплоидными клетками являются гаметы.

Гаплонедостаточность. Явление, при котором у гена в гаплоидном состоянии отсутствует нормальная функция (например, вследствие утраты гомологичного генного локуса).

Гаплотип (Чеппелини и др., 1967). Совокупность аллелей в двух или более тесно связанных локусах одной хромосомы, например в системе HLA.

Гемизиготность. Присутствие в организме только одной копии гена или генного локуса (в том числе из-за утраты гомологичного локуса), например только одной Х-хромосомы в мужских клетках (XY).

Ген (Иогансен, 1909). Структурная и функциональная единица наследственности. Ген пред-

ставляет собой фрагмент ДНК, кодирующий один полипептид (см. Цистрон).

Генетика (Бейтсон, 1906). Наука о наследственности и изменчивости. Закономерности наследственности у живых организмов. От греч. genesis — порождающий, происходящий от кого-то.

Генетическая карта. Положение локусов генов на хромосоме. На физической карте обозначено положение локусов генов с указанием расстояния между ними как числа нуклеотидных пар. На генетической карте расстояние между генетически связанными локусами выражено в частоте рекомбинации между ними.

Генетическая пустыня. Область хромосомы, содержащая меньше генов, чем остальные области.

Генетические заболевания евреев-ашке- нази. Из-за их относительной изоляции среди евреев-ашкенази чаще встречаются некоторые аутосомно-рецессивные заболевания (см. Jewish Genetic Disease Consortium, доступно по ссылке http://www.jewishgeneticdiseases. org/. По состоянию на 6 июля 2017 г.).

Генетический код. Содержащаяся в нуклеотидных триплетах информация, используемая для встраивания определенной аминокислоты в продукт гена.

Генетический маркер. Полиморфная последовательность ДНК, которую можно использовать для определения происхождения аллелей.

Генетическое расстояние. Расстояние на генетической карте, определяемое частотой рекомбинации (доля рекомбинации), измеряемой в сантиморганах (сМ).

Генная конверсия (Уинклер, 1930; Линдгрен, 1953). Нереципрокная передача генетической информации. Один ген выступает в роли донора последовательности, а другой ген получает последовательность и подвергается преобразованию.

Генный банк. Набор клонированных фрагментов ДНК, в котором представлен весь геном организма (см. Библиотека генов).

Генный локус (Морган и др., 1915). Положение гена на хромосоме.

Генный пул. Все гены, присутствующие в определенной популяции.

Геном (Уинклер, 1920). Весь генетический материал клетки или организма.

Геномика. Наука, изучающая структуру и функции геномов живых организмов.

Геномные заболевания. Группа заболеваний, возникающих из-за определенных структурных изменений в человеческом геноме.

Геномный браузер. Электронный банк данных с изображениями генов внутри отрезков ДНК (см. UCSC Genome Bioinformatics, доступно по ссылке https://genome.ucsc. edu/).

Генотип (Иогансен, 1909). Совокупность генов организма или клетки (см. Фенотип).

Ген-репортер. Ген, используемый для анализа другого гена (может участвовать в регуляции анализируемого гена).

Ген-супрессор опухолевого роста. Ген, участвующий в регуляции деления клетки. Если хотя-бы один аллель сохраняет нормальную функцию, ген подавляет развитие опухоли (см. Онкоген).

Гетерогаметный пол (Уилсон, 1910). Пол, определяемый двумя разными половыми хромосомами, например хромосомами X и Y у млекопитающих (мужской пол) и хромосомами Z и W у птиц (женский пол).

Гетерогенность генетическая (Харрис, 1953; Фрезер, 1956). Одинаковый фенотип у двух или более различных генотипов.

Гетеродисомия. Присутствие двух гомологичных хромосом, полученных от одного из родителей (см. Изодисомия; Однородительская дисомия).

Гетеродуплекс. Область двухцепочечной молекулы ДНК или ДНК/РНК с некомплементарными цепями, которые образовались из разных дуплексных молекул ДНК.

Гетерозиготность (Бейтсон и Саундерс, 1902). Наличие двух различных аллелей в определенном генном локусе (см. Гомозиготность).

Гетерозис (Shull, 1911). Увеличение жизнеспособности гетерозиготных организмов по сравнению с гомозиготными родительскими организмами у растений и животных.

Гетерокарион (Эфрусси и Вайс, 1965; Харрис и Уоткинс, 1965; Окада и Мураяма, 1965). Клетка, содержащая два или более ядра с различными геномами.

Гетероплазмия. Различия в последовательности ДНК разных митохондрий в одном организме (клетке).

Гетероплоидность (Уинклер, 1916). Аномальное число хромосом в организме или клетке.

Гетерохроматин (Хайц, 1928). Хромосома или хромосомный сегмент, сохраняющий темную окраску в интерфазе, ранней профазе и поздней телофазе из-за того, что остается конденсированным, так же как весь хромосомный материал в метафазе. Это отличает его от эухроматина, который в интерфазе становится невидимым. Гетерохроматин соответствует хромосомам или хромосомным сегментам, в которых наблюдается слабая активность или полное отсутствие активности генов. Различают конститутивный и факультативный гетерохроматин. Примером факультативного гетерохроматина является неактивный Х-хроматин, возникающий из-за инактивации Х-хромосомы в соматических клетках женских особей млекопитающих. Примером конститутивного гетерохроматина может служить гетерохроматин центромер, который можно визуализировать как С-полосы.

Гибридизация. В генетике так называют слияние двух отдельных комплементарных цепей ДНК (гибридизация ДНК-ДНК), слияние цепей ДНК и РНК (гибридизация ДНК-РНК) или слияние культивируемых клеток разных видов in vitro (клеточная гибридизация).

Гибридизация in situ. Гибридизация одноцепочечных ДНК или РНК непосредственно в ткани (см. FISH).

Гибридизация соматических клеток. Образование гибридов в клеточной культуре.

Гибридома. Клон гибридной клетки.

Гипоморф. Аллель, уровень экспрессии которого ниже нормального.

Гираза. Топоизомераза, способная закручивать спираль ДНК.

Гистон (Коссель, 1884). Ассоциированные с ДНК белки нуклеосом. Нуклеосому образуют гистоны H2A, H2B, H3 и H4.

Гистоновый код. Набор модификаций гистонов (например, метилирование, ацетилирование), имеющих отношение к регуляции активности генов.

Гистосовместимость. Совместимость тканей. Ее определяет главный комплекс гистосовместимости MHC (см. HLA).

Голопрозэнцефалия. Широкий спектр врожденных пороков развития средней линии зародышевого переднего мозга, от циклопии (сращение глазных яблок) и отсутствия носа (наиболее тяжелые формы) до сращения резцов и уплощенного лица с близко посаженными глазами (гипотелоризм). Возникает из-за мутаций в нескольких генах.

Гомеобокс. Высококонсервативная последовательность ДНК, присутствующая в гомеозисных генах.

Гомеозис. Превращение одной части тела в другую.

Гомеозисные гены. Гены эмбрионального развития дрозофилы, мутации в которых могут приводить к замене одной части тела на другую.

Гомозиготность (Бейтсон и Саундерс, 1902). Присутствие идентичных аллелей в определенном генном локусе.

Гомологичный. Парные хромосомы или генные локусы, каждый из которых унаследован от одного из родителей, либо эволюционно родственные гены.

Гормон (Бейлис и Старлинг, 1904). Органическое вещество, способное индуцировать специфический ответ в клетках-мишенях (от греч. «двигаю», «побуждаю»).

Горячая точка. Фрагмент хромосомы, на котором часто происходит рекомбинация.

Граница сплайсинга. Экзон-интронное сочленение.

Группа сцепления. Генные локусы, расположенные близко друг к другу на одной хромосоме, обычно наследуются вместе и не подвергаются рекомбинации.

Дальтон. Атомная единица массы, считается соответствующей массе атома водорода (1,66 10–24 г).

Делеция (Пейнтер и Меллер, 1929). Утрата фрагмента хромосомы, целой хромосомы или ряда нуклеотидных оснований.

Денатурация. Обратимое разделение двунитиевой молекулы нуклеиновой кислоты на две отдельных цепи (см. Ренатурация).

Диакинез (Хекер, 1897). Стадия профазы I мейоза.

Дизиготные. Близнецы, развивающиеся из двух разных зигот (неидентичные близнецы), в отличие от монозиготных (идентичных) близнецов, развивающихя из одной зиготы.

Дикий тип. Данный термин применяют к генотипу или фенотипу, встречающемуся в природе либо соответствующему стандартным лабораторным условиям (синоним «нормальный тип»). Термин не применяют к человеку.

Диктиотена. Стадия оогенеза, на которой происходит остановка профазы мейоза. У человека ооциты переходят в фазу диктиотены примерно за 4 недели до рождения. Затем ооциты останавливаются в развитии. Возобновление мейоза происходит в момент овуляции.

Динамическая мутация. Изменение ДНК, для которого характерна экспансия нуклеотидных повторов.

Диплоидность (Страсбургер, 1905). Клетки организма содержат два гомологичных набора хромосом, один из них унаследован от отца (отцовский), а другой — от матери (материнский).

Диплотена. Стадия профазы I мейоза.

Дискордантность. Присутствие признака или заболевания только у одного из пары близнецов (см. Конкордантность).

Дисомия однородительская. Происхождение пары гомологичных хромосом дипло-

идного организма от одного из родителей. Различают изодисомию, при которой хромосомы идентичны, и гетеродисомию, при которой хромосомы различаются.

Диспермия. Слияние яйцеклетки с двумя сперматозоидами.

Дифференцировка. Процесс превращения неспециализированной клетки в специализированную.

Дицентрический (Дарлингтон, 1937). Данный термин применяют к хромосомам с двумя центромерами.

Длинные концевые повторы (LTR). Повторяющиеся последовательности ДНК длиной до 600 пн, которые фланкируют кодирующие области ретровирусной ДНК и вирусных транспозонов.

ДНК (дезоксирибонуклеиновая кислота).

Молекула, содержащая первичную генетическую информацию в виде линейной последовательности нуклеотидов, объединенных в группы по три (триплеты, см. Кодон).

ДНКаза. Фермент, разрушающий связи внутри молекулы ДНК.

ДНК-библиотека. Коллекция клонированных молекул ДНК, представляющих весь геном (геномная библиотека) или фрагменты кДНК, полученные из мРНК в клетках определенного типа (библиотека кДНК).

ДНК-маркирующий сайт (STS). Короткий сегмент ДНК с известной последовательностью.

ДНК-микрочип. Набор из многих тысяч иммобилизованных на субстрате различных азотистых последовательностей. ДНК-микрочипы применяют для одновременного определения экспрессии тысяч генов.

ДНК-полимераза. Фермент, обеспечивающий синтез ДНК. Для запуска синтеза необходим праймер из РНК или ДНК.

Доза гена. Количественный показатель экспрессии гена.

Дозовая компенсация (Меллер, 1948). Механизм, позволяющий выровнять уровень экспрессии аллелей.

Домен. Элемент пространственной структуры белка.

Доминантно-негативный эффект. Мутантный аллель с нежелательным эффектом, напоминающим потерю функции (см. Мутация с потерей функции).

Доминантный (Мендель, 1865). Данный термин применяют к признакам, проявляющимся в гетерозиготном состоянии. В определенной степени это зависит от точности наблюдений (см. Кодоминантный, Рецессивный).

Дорсальный. Синоним слова «спинной» у животных (антоним «вентральный»).

Дрейф генов (Райт, 1921). Ненаправленные изменения частот аллельных вариантов генов в небольших популяциях. При определенных условиях возможно как полное исчезновение аллеля из популяции, так и фиксация аллеля.

Дрожжевая двухгибридная система. Метод анализа взаимодействия генов или белков.

Дупликация (Бриджес, 1919). Добавление хромосомного сегмента в результате ошибки кроссинговера (см. Недостаточность). Термин можно применить и к дополнительным нуклеотидным парам в цепи ДНК. Дупликация (удвоение) генов сыграла важную роль в эволюции эукариот.

Единица транскрипции. Все последовательности ДНК, кодирующие продукт определенного гена (соответствуют гену). Включает промотор, кодирующие и некодирующие последовательности.

Заболеваемость. Общее число случаев ка- кого-либо заболевания в популяции в определенное время (см. Частота).

Зародышевая линия. Клеточная линия, из которой появляются половые клетки.

Зародышевый. Данный термин применяют к половым клеткам.

Зигота (Бейтсон, 1902). Диплоидная клетка, образующаяся в результате слияния двух гаплоидных гамет, яйцеклетки и сперматозоида, при оплодотворении. Это клетка, из которой развивается зародыш.

Зиготена (де Винивартер, 1900). Стадия профазы мейоза I.

Зонд. Определенный фрагмент одноцепочечной ДНК или РНК, содержащий флуоресцентную или иную метку, который применяют для идентификации комплементарных последовательностей путем специфичной гибридизации.

Зооблот. Разновидность метода Саузернблот, предназначеная для исследования консервативных последовательностей ДНК родственных генов разных видов организмов. Метод позволяет подтвердить, что указанные последовательности являются кодирующими последовательностями гена.

Идентичность по происхождению. Гомозиготность по аллелям одного генного локуса, идентичность которых обусловлена их происхождением от общего предка (см. Кровное родство).

Изменчивость. Разнообразие признаков среди родственников, например родителей и их потомства, или среди представителей популяции.

Изодисомия. Наличие двух идентичных хромосом, полученных от одного из родителей (см. Гетеродисомия).

Изолят популяционный (Ваклунд, 1928). Физически или социально обособленная популяция, представители которой не скрещиваются с представителями других популяций (панмиксия отсутствует).

Изотипы. Сходные по аминокислотному составу цепочки иммуноглобулинов.

Изоферменты, или изоэнзимы (Маркерт и Меллер, 1959; Веселл, 1959). Различные изоформы или изотипы одного и того же фермента, существующие в одном организме. Изоферменты являются биохимическим выражением генетического полиморфизма.

Изохроматидный разрыв. Повреждение обеих хроматид в одном и том же месте.

Изохромосома (Дарлингтон, 1940). Хромосома, состоящая из двух идентичных плеч, соединенных центромерой (например, из двух длинных или двух коротких плеч Х-хромо- сомы). В результате можно наблюдать дупли-

кацию одного плеча и недостаточность другого. Изохромосома может содержать одну или две центромеры.

Иммуноглобулин. Связывающая антиген молекула.

Иммунопреципитация хроматина ChIP.

Метод обнаружения последовательностей ДНК, связывающихся со специфическим белком хроматина.

Импринтинг геномный. Различия в экспрессии генов, зависящие от происхождения этих генов (от мужской или женской особи).

Инактивация Х-хромосомы (Лайон, 1961). Инактивация генов одной или двух Х-хромосом в соматических клетках самок млекопитающих на ранних стадиях эмбрионального развития за счет образования Х-хроматина.

Инверсия (Стертевант, 1926). Структурное изменение хромосомы, разрыв на двух участках, изменение направления промежуточного сегмента и последующая сборка. При перицентрической инверсии инвертированный сегмент содержит центромеру. Парацентрическая инверсия не затрагивает центромеру.

Инвертированный повтор. Две идентичные развернутые в противоположных направлениях копии последовательности ДНК. Инвертированные повторы являются характерной особенностью ретровирусов.

Индексный пациент (пробанд). Пациент, болезнь которого привлекла внимание к его семье и стала основанием для сбора семейного анамнеза.

Индуцированные стволовые клетки (иСК)

(Яманака, 2006). Индуцированные плюрипотентные стволовые клетки. Дифференцированные клетки, перепрограммированные на экспрессию генов (Oct3, Oct4, SOX2, c-Myc, KLF4), активность которых характерна только для плюрипотентных стволовых клеток, таких как эмбриональные стволовые клетки.

Инсерционная последовательность (IS).

Короткий бактериальный транспозон, в котором находятся обеспечивающие транспозицию гены.

Интеркалирующий агент. Молекулы, способные встраиваться между двумя комплементарными цепями ДНК.

Интерфаза. Период клеточного цикла между двумя клеточными делениями (см. Митоз).

Интрон (Гилберт, 1978). Некодирующий фрагмент цепи ДНК гена (см. Экзон). Он транскрибируется, но удаляется из первичного транскрипта до начала трансляции.

Искусственная бактериальная хромосома (BAC). Синтетическая молекула ДНК, содержащая бактериальные последовательности (см. Искусственная дрожжевая хромосома).

Искусственная дрожжевая хромосома (YAC). Дрожжевая хромосома, в которую встроена чужеродная ДНК, реплицируемая в делящихся дрожжевых клетках. Искусственные дрожжевые хромосомы позволяют встраивать в них относительно длинные (до 1000 тпн) фрагменты ДНК (см. Искусственная бактериальная хромосома).

Кадгерины. Димерные молекулы клеточной адгезии.

Канцероген. Химическое соединение, способное индуцировать канцерогенез.

Кариограмма. Изображение всех хромосом диплоидного набора клетки, разбитых на гомологичные пары.

Кариотип (Левицкий, 1924). Полный набор хромосом клетки, организма или вида.

Картирование по гомозиготности. Картирование генов путем идентификации хромосомных областей, гомозиготность по которым возникает из-за идентичности по происхождению (см. Идентичность по происхождению).

Картирование. Различные методы определения положения гена на хромосоме (физическая карта) или относительного расстояния между генными локусами и порядка генных локусов (генетическая карта).

Каспаза. Белок из семейства специализированных цистеинсодержащих аспартатпротеаз, принимающих участие в обеспечении апоптоза (программируемой гибели клетки).

Квадрирадиальная фигура. Конфигурация, возникающая в случае, когда гомологичные сегменты вовлеченных в реципрокную транслокацию хромосом спариваются в мейозе. В редких случаях квадрирадиальные фигуры могут образовываться во время митоза.

кДНК. Комплементарная ДНК, синтезируемая ферментом обратной транскриптазой на РНКматрице.

Килобаза. 1000 нуклеотидных пар (пн).

Кинетохор. Структура на хромосоме, к которой крепятся волокна веретена деления.

Клада. Группа организмов, произошедших от общего предка.

Кластер генов (Демерек и Хартман, 1959). Группа из двух или более соседних генов, обладающих схожими функциями (например, гены системы HLA или гены иммуноглобулинов).

Клатрин (Пирс, 1975). Белок, который взаимодействует с адаптерными белками, образуя окаймленные пузырьки, выходящие в цитоплазму при эндоцитозе.

Клеточная органелла. Структурно и функционально обособленный компонент клетки (например, митохондрия, рибосома, эндоплазматический ретикулум, аппарат Гольджи, лизосома).

Клеточный гибрид. Соматическая клетка, образовавшаяся в результате слияния двух клеток в клеточной культуре. Она содержит полные или неполные хромосомные наборы родительских клеток.

Клеточный цикл (Говард и Пелк, 1953). Жизненный цикл отдельной клетки. Делящиеся клетки проходят четыре фазы: G1 (интерфаза), S (синтез ДНК), G2 и митоз (M). Клетки, которые не делятся, находятся в фазе G0.

Клон (Уэббер, 1903). Популяция идентичных друг другу молекул, клеток или организмов, произошедших от общего предка.

Клональная селекция и экспансия. Увеличение в организме числа отдельных клеток, например несущих специфичный рецептор антигена лимфоцитов или раковых клеток.

Ковалентная связь. Стабильная химическая связь, которая удерживает молекулы вместе благодаря наличию общей пары электронов (в противоположность слабой нековалентной водородной связи).

Когезин. Белоковый комплекс из четырех субъединиц (Scc1, Scc3, Smc1, Smc3), регулирующий разделение сестринских хроматид в процессе деления клетки.

Кодирующая ДНК. Цепь ДНК, которая содержит ту же последовательность, что и цепь РНК (мРНК), используемая в качестве матрицы для трансляции (смысловая РНК). Другая цепь ДНК представляет собой цепь-матрицу (см. Антисмысловая РНК).

Кодирующая РНК. РНК, участвующая в транскрипции (см. Некодирующая РНК).

Кодоминирование. Взаимодействие аллелей, при котором оба аллеля в полной мере проявляют свое действие, например в случае группы крови АВ (см. Доминантный).

Кодон (Бреннер и Крик, 1963). Последовательность из трех нуклеотидов (триплет) в цепи ДНК или РНК, которая кодирует определенную кислоту или терминацию синтеза полипептидной цепочки.

Колинеарность. Соответствие между последовательностью триплетов ДНК и последовательностью аминокислот полипептидной цепи.

Кольцевая хромосома. Хромосома, имеющая форму кольца. В клетках прокариот кольцевыми являются нормальные хромосомы. У млекопитающих кольцевая хромосома относится к структурным аномалиям, возникающим из-за утраты хромосомного материала.

Комплементарность. Две нуклеиновые кислоты с идентичными последовательностями, развернутыми в противоположных направлениях. Комплементарность позволяет им ренатурировать и образовывать двухцепочечную молекулу.

Комплементация генетическая (Финчем, 1966). Комплементарный эффект двойных мутантов по разным генным локусам (восстановление нормальной функции) (см. Группы комплементации при пигментной ксеродерме или анемии Фанкони).

Конденсация. Данный термин применяют к плотности хроматина хромосомы.

Конденсин. Белковые комплексы (конденсин I и конденсин II), участвующие в сборке хромосом при делении клетки (конденсация хромосом).

Конкатемер. Череда однотипных участков ДНК, представляющих собой тандемный повтор. Образуется при репликации некоторых вирусных и фаговых геномов.

Конкордантность. Присутствие признака или заболевания у обоих близнецов (монозиготных или дизиготных) (см. Дискордантность).

Консенсусная последовательность. Схожие консервативные последовательности ДНК в разных генах или организмах.

Конститутивный ген. Ген, содержащий информацию об основных функциях клетки.

Контиг. Набор перекрывающихся последовательностей ДНК (in silico).

Конформация. Пространственная структура комплексного соединения, необходимого для обеспечения биологической функции.

Конъюгация (Ледерберг, Хейес, Кавалли, 1953). Перенос ДНК из одной бактерии в другую.

Космида. Плазмида, в которой, помимо необходимых для деления последовательностей, присутствует cos-участок фага. Космиды используют в качестве векторов для клонирования фрагментов ДНК длиной до 40 тпн.

Кофактор. Молекула или ион металла, необходимые для обеспечения биологической активности белка.

Коэффициент инбридинга (Райт, 1929). Вероятность того, что два аллеля в определенном генном локусе организма идентичны по происхождению, т. е. являются копиями общего предкового аллеля, присутствовавшего у обоих родителей. Кроме того, это показатель, характеризующий долю локусов, по которым организм гомозиготен.

Коэффициент инбридинга. Показатель вероятности генетических (патогенетических) эффектов, которые могут возникать у организмов из-за близкородственного скрещивания.

Коэффициент отбора. Количественный (от 0 до 1) показатель преимущества определенного генотипа (по сравнению со стандартным типом) при передаче генов следующему поколению. Коэффициент отбора (s) характеризует интенсивность снижения воспроизведения мутантного аллеля по сравнению с исходной формой. Коэффициент отбора, равный 1, соответствует полному отсутствию жизнеспособности.

Коэффициент сходства. Доля аллелей у двух сравниваемых организмов, произошедших от общего предка.

Кровное родство. Двух или более индивидов считают кровными (связанными кровью) родственниками, если у них есть как минимум один общий предок. Количественным показателем кровного родства служит коэффициент инбридинга.

Кроссинговер (Морган и Кеттелл, 1912). Обмен генетической информацией между двумя гомологичными хромосомами благодаря формированию хиазмы в фазе диплотены мейоза I; приводит к генетической рекомбинации в соседних (сцепленных) генных локусах. Неравный кроссинговер (Стертевант, 1925) происходит из-за неправильного спаривания гомологичных сегментов ДНК в области рекомбинационного сайта. Он приводит к появлению структурно измененных сегментов ДНК или хромосом, в которых могут возникать дупликации или делеции. Кроссинговер может происходить и в соматических клетках (Штерн, 1936).

Ксеногенный. Данный термин применяют к трансплантату, полученному от представителя другого вида.

Ламины. Белки промежуточных филаментов, образующие структурный белковый слой (ядерную ламину) на внутренней поверхности оболочки ядра.

Лариат. Промежуточная форма РНК, образующаяся при сплайсинге. Образование связи между 5'- и 3'-концами приводит к формированию кольцевой структуры с хвостом.

Лейциновая молния. Специфический связывающий ДНК белок, который выполняет функцию фактора транскрипции.

Лептотена. Стадия мейоза.

Летальный фактор (Бауэр, 1908; Хадорн, 1959). Геномная аномалия, приводящая к внутриутробной гибели плода (например, многочисленные хромосомные аномалии).

Летальный эквивалент (Мортон и др., 1956). Ген или комбинация генов, которые в гомозиготном состоянии летальны для 100% организмов. Это может быть один ген, летальный в гомозиготном состоянии, два разных гена, летальность каждого из которых составляет 50%, три разных гена с летальностью 33% и т. д. Считается, что в организме каждого индивида присутствует около пяти-шести летальных эквивалентов.

Лигаза. Фермент, устраняющий разрывы цепи ДНК.

Лиганд. Молекула, способная связываться с рецептором и индуцировать сигнал в клетке.

Лидерный пептид. Короткая N-концевая последовательность белка, необходимая для нацеливания белка на мишень.

Лизогения. Способность фага встраиваться в бактериальные хромосомы.

Лизосома (де Дюв, 1955). Цитоплазматическая органелла, содержащая гидролитические ферменты.

Лимфоциты. Клетки иммунной системы, которые подразделяют на В-лимфоциты (образуются в костном мозге) и Т-лимфоциты (образуются в вилочковой железе).

Линкерная ДНК. Синтетический двухцепочечный фрагмент ДНК, содержащий сайт узнавания эндонуклеазой рестрикции. Кроме того, линкерной ДНК называют участок ДНК между двумя нуклеосомами.

Литическая инфекция. Фаговая инфекция, приводящая к разрушению бактериальных клеток.

Локус. То же самое, что и генный локус.

Локусы с варьирующим числом тандемных повторов (VNTR). Тандемные повторы с разным числом мономеров, один из видов полиморфизма ДНК.

Ломкий сайт. Специфический сайт, который на цитогенетическом препарате метафазных

хромосом выглядит как разрыв из-за разницы

вконденсации хроматина. Возможна индукция

вклеточной культуре.

Маркер генетический. Аллель, используемый для выявления определенного генотипа.

Маркерная экспрессируемая последовательность (EST). Секвенированный сайт из экспрессируемого гена, который «метит» участок несеквенированной кДНК рядом с ним; его используют для картирования генов (см. ДНК-маркирующий сайт).

Матрица. Цепь, определяющая нуклеотидную последовательность новой идентичной (комплементарной) цепи (см. ДНК, РНК).

Мегабаза. 1 млн нуклеотидных пар (млн пн).

Мейоз (Страсбургер, 1884). Редукционное деление ядра половой клетки, приводящее к образованию двух гаплоидных клеток из одной диплоидной клетки. Профаза первого мейотического деления особенно важна, она состоит из следующих стадий: лептотена, зиготена, пахитена, диплотена, диакинез.

Менделевское наследование (Касл, 1906). Наследование признаков в соответствии с законами Менделя. Противоположный вариант — нехромосомное наследование, которое связано с цитоплазматическими наследственными факторами (с митохондриальной ДНК).

Метаболическая кооперация (Субак-Шарпе и др., 1969). Коррекция метаболического дефекта культивируемых клеток при контакте с нормальными клетками или клеточными продуктами.

Метафаза (Страсбургер, 1884). Стадия митоза, в которой становятся видны сконденсировавшиеся хромосомы.

Метацентрическая. Данный термин применяют к хромосомам, которые поделены центромерой на два плеча примерно равной длины.

Метилирование ДНК. Присоединение метильных групп в процессе превращения цитозина в 5-метилцитозин.

МикроРНК (miRNA). Малые молекулы РНК из 21–23 нуклеотидов, которые ассоциированы с различными белками РНК-индуцируемого

сайленсинг-комплекса (см. RISC и РНК-интер- ференция).

Микросателлитная нестабильность. Нестабильность микросателлитов при некоторых формах рака (особенно рака толстой кишки).

Микросателлиты ДНК. Короткие тандемные повторы примерно из 1–6 пн (например, CACACACA), их суммарная длина обычно не превышает100 пн. Иногда их называют короткими тандемными повторами.

Микрофиламент. Волокно цитоскелета диаметром около 7 нм, образующееся в результате полимеризации глобулярного (G) белка актина (актиновые филаменты).

Миксоплоидия (Немек, 1910; Хэмертон, 1971). Явление, при котором ткань или организм содержат клетки с разным числом хромосом (хромосомный мозаицизм).

Миозин. Класс моторных белков.

Миссенс-мутация. Мутация, которая меняет кодон, приводя к синтезу другой аминокислоты (см. Нонсенс-мутация).

Митоз (Флеминг, 1882). Процесс непрямого деления соматических клеток, состоящий из нескольких фаз: профазы, метафазы, анафазы и телофазы.

Митотический индекс (Мино, 1908). Доля клеток, находящихся в митозе.

Митохондрии. Содержащие ДНК нефотосинтезирующие органеллы клетки с собственным геномом.

Мобильный генетический элемент. Последовательность ДНК, которая может изменять свое положение в геноме (см. Транспозон).

Модальное число (Уайт, 1945). Число хромосом в организме или клетке.

Мозаицизм. Наличие в ткани или организме генетически различных клеток, скорее всего появившихся из одной зиготы (см. Химера).

Мозаичность зародышевой линии. Присутствие в гонадах некоторого количества несущих мутацию зародышевых клеток.

Монозиготные. Близнецы с идентичным геномом, возникшие из одной зиготы (см. Дизиготные).

Моноклональное антитело. Антитело, обладающее специфичностью по отношению к одному антигену, произошедшее от одной клет- ки-предшественника.

Монослой (Аберкромби и Гейсман, 1957). Один слой культивированных диплоидных клеток, образующийся на дне колбы с культурой.

Моносомия (Блейксли, 1921). Отсутствие в хромосомном наборе диплоидного организма одной из гомологичных хромосом (см. Трисомия).

Морфоген. Белок, который присутствует в эмбриональных тканях в определенной концентрации и индуцирует процесс развития.

мРНК (Бреннер, 1961; Жакоб и Моно, 1961) Матричная (информационная) РНК.

мтДНК. Митохондриальная ДНК.

Мультигенное семейство. Группа генов, имеющих общее эволюционное происхождение.

Мустьерская культура. Каменные инструменты среднего палеолита, изготовление которых приписывают неандертальцам (см. Ориньякская культура).

Мутаген. Химический или физический фактор, способный индуцировать мутацию.

Мутация (де Фриз, 1901). Наследуемые структурное и функциональное изменения последовательности ДНК. Мутации могут возникать вследствие замены, утраты или вставки оснований в пределах гена (см. Миссенс-мутация и Нонсенс-мутация).

Мутация с неполным блокированием функций. Мутация, вызывающая только частичную потерю функции.

Мутация с потерей функции. Мутация, вызывающая частичную или полную потерю функции продукта гена (см. Мутация с приобретением функции).

Мутация с приобретением функции. Мутация, приводящая к появлению новой функ-

ции, часто нежелательной (см. Доминантнонегативный эффект).

Мутация со сдвигом рамки считывания.

Мутация, приводящая к изменению рамки считывания мРНК. Из-за мутации синтезируется неправильная аминокислота или возникает стоп-кодон.

мяРНК. Малые ядерные РНК. Одни из многих находящихся в ядре малых РНК. Пять из них являются компонентами сплайсосомы.

Наследуемость (Лаш, 1950; Фальконер, 1960). Отношение генетической аддитивной дисперсии к суммарной фенотипической изменчивости. Фенотипическая изменчивость — это результат взаимодействия в популяции генетических и негенетических факторов.

Неаллельная гомологичная рекомбинация

(NAHR). Рекомбинация между невыровненными ДНК-повторами одной хромосомы или сестринских хроматид. Такая рекомбинация приводит к появлению делеций и дупликаций (см. Геномные заболевания).

Недостаточность (Бриджес, 1917). Утрата сегмента хромосомы в результате ошибки кроссинговера, например неравного кроссинговера, кроссинговера в пределах инверсии или кольцевой хромосомы. Может возникать одновременно с дупликацией (дупликация/недостаточность).

Нейротрансмиттеры. Внеклеточные сигнальные молекулы, обеспечивающие передачу импульса через синаптическое пространство.

Неклассифицированный вариант. Вариант последовательности ДНК, функция которого неизвестна.

Нековалентная связь. Непрочная химическая связь между отрицательно заряженным атомом (обычно атомом кислорода или азота) и атомом водорода (см. Водородная связь), при которой не возникает общая пара электронов.

Некодирующая РНК. РНК, которая не участвует в трансляции, но выполняет другие функции (см. Кодирующая РНК).

Некроз. Гибель клетки вследствие повреждения ткани.

Неполярные молекулы. Молекулы, у которых отсутствует дипольный заряд или наблюдается несимметричное распределение положительных и отрицательных зарядов. Большинство нерастворимо в воде.

Неравновесное сцепление (Кимура, 1956). Неслучайное распределение аллелей в тесно связанных генных локусах, которое не совпадает с ожидаемой частотой каждого аллеля и не соответствует уравнению Харди– Вайнберга.

Нерасхождение (Бриджес, 1912). Неправильное распределение гомологичных хромосом в мейозе или митозе.

Нервный гребень. Структура, расположенная параллельно дорcальной нервной трубке, содержащая популяции способных мигрировать клеток. Из таких клеток образуются различные клетки и анатомические структуры.

Нетранслируемые области. Области на 5'- или 3'-конце гена, которые не транслируются в продукт гена.

Ниже по цепи. Со стороны 3'-конца гена.

Нозерн-блот. Метод анализа молекул РНК на мембране, похожий на Саузерн-блот. Игра слов Southern-Nothern (см. Вестерн-блот).

Нокаут (гена). Преднамеренная инактивация гена модельного организма для получения информации о его функции (то же, что и направленное разрушение гена).

Номенклатура мутаций. Существует универсальная система записи мутаций, номенклатура HGVS (Human Genome Variation Society). Типы последовательностей обозначают буквами: «g.» — это геномная последовательность, «c.» — кодирующая последовательность, «n.» — некодирующая последовательность, «r.» — РНК, «p.» — белок. Все необходимо описывать, используя утвержденную эталонную последовательность. Замены на уровне ДНК обозначают как «>», делеции — как «del» после утраченного фрагмента, а вставки — как «ins», за которым следует нуклеотидная последовательность вставки. Это значит, что 1994G>T соответствует замене G (гуанин) на T (тимин) в нуклеотиде (nt) в позиции 1994. 1994–1996delTTC соответствует делеции из двух T и одного C (цитозин). 1994–1995insAG соответствует

вставке A (адентин) и G между нуклеотидами в позициях 1994 и 1995. Изменения интронов обозначают как «IVS», за которым следует номер интрона или обозначение позиции в кДНК. g.10G>C описывает замену G на C в позиции 10 в геномной ДНК; c.10g>c описывает аналогичную замену в кДНК, а m.10G>C — в митохондриальной ДНК. На уровне белка мутации обозначают как возможные последствия изменений ДНК, используя букву «р». Например, R25S соответствует замене аргинина (R) на серин (S) в позиции 25 полипептидной цепи. Делеции и вставки на уровне белка обозначают как «del» и «ins» после номеров соответствующих аминокислот. R98 — S101del обозначает делецию между R в позиции 98 и S в позиции 101. R98 — S99insR соответствует вставке R между R в позиции 98 и S в позиции 99. Следует отметить, что на белковом уровне описывают возможные последствия изменения ДНК, но не природу мутации. (См. Dunnen JT, Antonarakis SE. Mutation nomenclature. Hum Mutat 2000; 15: 7–12; Human Mutation Special Issue June 2016; 37: 499–615; Human Sequence Variant Nomenclature, доступно по ссылке http://varnomen.hgvs.org.)

Нонсенс-мутация. Мутация, приводящая к потере генетической информации, например при образовании стоп-кодона (см. Миссенсмутация).

Нонсенс-опосредованный распад мРНК.

Механизм расщепления молекул мРНК, содержащих преждевременные стоп-кодоны (обычно менее 50 нуклеотидов выше по цепи от последнего места соединения двух экзонов), до начала трансляции.

Нуклеиновая кислота. Молекула ДНК или РНК, в которой записана генетическая информация.

Нуклеозид. Молекула, состоящая из пуринового или пиримидинового основания и сахара (рибозы или дезоксирибозы) (см. Нуклеотид).

Нуклеосома (Навашин, 1912; Корнберг, 1974). Субъединица хроматина, представляющая собой ДНК, упакованную вместе с гистоновыми белками определенной конфигурации.

Нуклеотид. Мономер полинуклеотидной цепи, образующей нуклеиновую кислоту. Нуклеотид представляет собой фосфорный эфир нуклеозида, содержащий пуриновое или

пиримидиновое основание, углеводный остаток (рибозу или дезоксирибозу в форме пентозы) и фосфатную группу.

Обратная транскриптаза. Ферментный комплекс, присутствующий в РНК-содержащих вирусах, который обеспечивает синтез ДНК на РНК-матрице.

Однородительская дисомия. Наличие двух хромосом, полученных от одного родителя (хромосомы идентичны — изодисомия, хромосомы различаются — гетеродисомия).

Окрашивание хромосом. Метод окрашивания, позволяющий обнаружить отдельные хромосомы.

Онкоген (Хюбнер и Тодаро, 1969). Первоначально обнаруженная у вирусов последовательность ДНК, способная привести к малигнизации эукариотической клетки после встраивания в ее ДНК. Данный термин применяют к генам, принимающим участие в регуляции пролиферации клеток (ранее их называли протоонкогенами).

ОНП. Однонуклеотидный полиморфизм. Вариант последовательности ДНК, отличающийся одним нуклеотидом.

Опал-кодон. Стоп-кодон UGA (см. Охракодон, Амбер-кодон).

Оператор (Жакоб и Моно, 1959). Сайт узнавания оперона, в котором происходит негативная регуляция транскрипции за счет связывания с репрессором.

Оперон (Жакоб и др., 1960). У прокариот это группа функционально и структурно родственных генов с единой системой регуляции.

Органелла. Окруженная мембраной структура внутри эукариотической клетки (см. Клеточная органелла).

Ориньякская культура. Инструменты и произведения искусства, изготовленные жившими

вЕвропе предками современного человека. Получила свое название от пещеры Ориньяк

вПиренеях, где были найдены первые артефакты (см. Мустьерская культура.)

Ортологи. Гомологичные гены разных организмов, разошедшиеся в процессе видообра-

зования, например гены α- и β-глобина (см. Паралоги).

О-связанные олигосахариды. Присоединение гидроксильных групп к боковым цепям серина и треонина гликопротеинов (см. N-свя- занные олигосахариды).

Отбор (Дарвин, 1858). Преимущественное размножение или выживание определенных генотипов в различных условиях среды. Возможен как положительный, так и отрицательный отбор.

Открытая рамка считывания (ORF). Последовательность ДНК, внутри рамки считывания которой отсутствуют стоп-кодоны. Каждая открытая рамка считывания начинается со старт-кодона, ее длина обычно составляет 100 и более кодонов. Такая последовательность кодирует белок, т. е. является транслируемой.

Отстающая цепь ДНК. Новая цепь ДНК, реплицируемая в направлении от 3'- к 5'-концу. Она синтезируется в виде коротких фрагментов в направлении от 5'- к 3'-концу (фрагменты Оказаки), которые затем соединяются друг с другом.

Отталкивание (Бейтсон и др., 1905) Конфигурация, при которой два мутантных аллеля расположены в разных гомологичных хромосомах, транс-конфигурация (см. Цис/транс).

Охра-кодон. Стоп-кодон UAA (см. Амберкодон и Опал-кодон).

Палиндром (Уилсон и Томас, 1974). Азотистая последовательность ДНК, которая одинаково читается в 5'–3' и в 3'–5' направлениях. Такие фрагменты встречаются в последовательностях узнавания эндонуклеаз рестрикции, например 5'-CATG-3'.

Панмиксия (Вайсман, 1895). Свободное скрещивание особей в популяции (см. Ассортативное скрещивание).

Пара нуклеотидов (пн). В двухцепочечной ДНК пн — это два расположенных друг напротив друга и соединенных водородными связями азотистых основания (пуриновое и пиримидиновое). Обычно это пары AT и CG. В рибосомной РНК могут присутствовать другие пары.

Паракринная система. Секретируемые сигнальные молекулы, действующие на небольшом расстоянии от клетки.

Паралоги. Гомологичные последовательности ДНК или гены одного организма, которые возникают в результате дупликации и могут разойтись в процессе эволюции, например два генных локуса α-глобина у человека (см. Ортологи).

Парасексуальный процесс (Понтекорво, 1954). Генетическое комбинирование неполового характера, например гибридизация соматических клеток (см. Гибридизация).

Пахитена (де Винивартер, 1900). Стадия профазы мейоза I.

Пенетрантность (Фогт, 1926). Частота проявления конкретного аллеля (см. Экспрессивность).

Пептид. Молекула из двух или более аминокислот, соединенных пептидными связями.

Первичный транскрипт. РНК, транскрибируемая с эукариотического гена перед процессингом (сплайсингом, присоединением кэпа и полиаденилированием).

Плазмиды (Ледерберг, 1952). Автономно реплицирующиеся кольцевые ДНК, которые присутствуют в бактериальных клетках. Обычно они физически обособлены от хромосом, но иногда встраиваются в хромосомы хозяина.

Пластиды. Основные цитоплазматические органеллы растительных клеток, например хлоропласты.

Плейотропия (Плейт, 1910). Экспрессия гена, способного влиять на несколько фенотипических признаков.

Позиционное клонирование (картирование). Идентификация гена на основании его положения в геноме.

Позиционный эффект (Стертевант, 1925). Влияние на экспрессию гена его расположения на хромосоме.

Полиаденилирование. Присоединение множественных адениновых оснований к 3'-концу эукариотической мРНК после транскрипции.

Полигенный (Плейт, 1913; Мезер, 1941). Данный термин применяют к признакам, контролируемым многими генами, при этом эффект каждого гена в отдельности вычленить невозможно. Иногда такие признаки называют мультигенными.

Полимеразы. Ферменты, катализирующие полимеризацию нуклеотидов новых цепей ДНК или РНК при транскрипции и репликации ДНК.

Полиморфизм длин рестриктных фрагментов (ПДРФ). Вариант последовательности ДНК (полиморфизм), в котором присутствует или отсутствует рестрикционный сайт. Такие последовательности можно использовать для определения происхождения исследуемого фрагмента ДНК в генетической диагностике.

Полиморфизм генетический (Форд, 1940). Существование двух или более наследственных форм нормального аллеля. Частота в популяции должна превышать 1%. Полиморфизм может присутствовать на разных уровнях, таких как последовательности ДНК, последовательности аминокислот, отдельные структуры хромосом или фенотипические проявления.

Полипептид. Линейный полимер из аминокислот, образующий белок.

Полиплоидия (Страсбургер, 1910). Кратное увеличение числа наборов хромосом в клетке, ткани или организме (например, триплоидия — три копии, тетраплоидия — четыре копии).

Политенные хромосомы (Кольцов, 1934; Бауэр,1935). Гигантские хромосомы, возникающие в результате многократной репликации ДНК одной хромосомы (см. Хромосома).

Полицистронная мРНК. мРНК, которая содержит кодирующие области более чем одного гена (у прокариот).

Полногеномный поиск ассоциаций (GWAS). Поиск локусов, ассоциированных с предрасположенностью к заболеваниям в масштабах всего генома с использованием полимофных ДНК-маркеров (обычно ОНП).

Половая клетка. Клетка, способная дифференцировать в гаметы посредством мейоза (см. Соматические клетки).

Полуконсервативная репликация ДНК

(Мезельсон и Сталь, 1958). Нормальный тип репликации ДНК. Одна цепь ДНК выступает матрицей, на которой другая цепь синтезируется заново.

Полярное (редукционное) тельце (Робин, 1862). Клетка, которая отделяется от ооцита в процессе оогенеза и не образует ооцит.

Полярные молекулы. Молекулы, у которых присутствует дипольный заряд или симметричное распределение положительных и отрицательных зарядов.

Популяция (Иогансен, 1903). Представители вида, которые скрещиваются между собой и имеют общий генофонд (см. Раса).

Потенциалзависимый ионный канал. Ионный канал, который открывается и закрывается в ответ на изменение мембранного потенциала.

Поток генов (Бердселл, 1950). Перемещение генов между популяциями.

Правило Холдейна. Стерильность и нежизнеспособность гибрида чаще наблюдается у гетерогаметного пола.

Праймер (затравка). Короткий олигонуклеотид ДНК или РНК примерно из 15–25 нуклеотидов, который связывается с последова- тельностью-мишенью (или синтезируется праймазой) и инициирует синтез комплементарной цепи.

Предковое происхождение. Термин применяют к общему генетическому материалу, унаследованному от предыдущих поколений.

Преждевременная конденсация хромосом

(Джонсон и Рао, 1970). Индукция конденсации хромосом в интерфазном ядре после слияния с клеткой в митозе. Конденсированные хромосомы в S-фазе выглядят пульверизированными (пульверизация хромосом).

Премутация. Изменение генетического аппарата, которое может привести к мутации (см. Динамические мутации и Болезни экспансии).

Прибнов-бокс. Фрагмент промотора (последовательность TATAAT в 10 пн выше по цепи от гена) у прокариот.

Признак. Наблюдаемый фенотип.

Примордиальные клетки. Клетки гонад, из которых образуются половые клетки.

Прионы. Белковые инфекционные частицы, вызывающие дегенеративные заболевания ЦНС.

Приспособленность биологическая. Вероятность (между 0 и 1) передачи гена следущему поколению. Для данного генотипа и данной среды биологическую (или репродуктивную) приспособленность определяют выживаемость и фертильность.

Пробанд. Пациент, который первым привлек внимание в семье с определенным генетическим заболеванием (то же самое, что и пропозита и индексный пациент).

Провирус. Дуплексная ДНК, полученная из РНК-ретровируса, которая интегрировала в геном эукариотической клетки.

Прогулка по хромосоме. Последовательное выделение перекрывающихся участков ДНК для обнаружения гена на исследуемой хромосоме.

Продукт гена. Кодируемый геном полипептид или рибосомная РНК (см. Белок).

Прокариоты. Одноклеточные микроорганизмы, такие как бактерии и археи, у которых отсутствуют клеточное ядро и органеллы (см. Эукариоты).

Промотор. Определенная область ДНК, расположенная на 5'-конце гена, которая связывается с факторами транскрипции и РНКполимеразой при инициации транскрипции. Последовательность примерно из 6–7 пн представляет собой консенсусную последовательность TATAATG, расположенную примерно в 10 пн выше по цепи от прокариотического гена (см. Прибнов-бокс).

Пропозита. Пациент, с которого начинается составление родословной для изучения процесса наследования какого либо заболевания среди членов одной семьи (см. Пробанд).

Протеом. Совокупность всех белков, синтезируемых в клетке, ткани или организме.

Протеомика. Область молекулярной биологии, посвященная исследованию всех белков клетки, ткани или организма.

Протоонкоген. Нормальный ген, который изза мутации может трансформироваться в вызывающий злокачественную опухоль онкоген.

Прототрофы. Клетки и клеточные линии, которые не требуют добавления определенного питательного вещества в среду для культивирования (см. Ауксотрофы).

Профаг. Геном вируса (фага), интегрировавший в геном хозяина (бактерии).

Профаза. Первая фаза митоза или мейоза.

Прямые повторы. Повторяющиеся последовательности ДНК, ориентированные в одном направлении (см. Инвертированные повторы).

Псевдоаутосомные области (PAR). Области на концах X- и Y-хромосом, участвующие в рекомбинации как аутосомы.

Псевдогены. Последовательности ДНК, сходные со структурными генами, утратившими способность кодировать белок из-за структурных перестроек (образования стоп-кодонов, делеций, вставок и других структурных изменений). Процессированный псевдоген содержит последовательности ДНК, похожие на мРНК-копию родительского гена, т. е. не содержащие интронов.

Псевдогермафродитизм. Данный термин применяют к индивидам, гонады у которых соответствуют одному полу, а фенотипические проявления — другому.

ПЦР (полимеразная цепная реакция) (Мюллис, 1985). Метод увеличения концентрации (амплификации) исследуемой последовательности ДНК in vitro. Каждый из множества циклов нагревания–охлаждения состоит из трех стадий: денатурации исходной ДНК, связывания ДНК с соответствующими олигонуклеотидными праймерами и репликации комплементарного праймеру сегмента ДНК.

Равновесие Харди–Вайнберга. Распределение частот генотипов в популяции.

Рамка считывания. Последовательность ДНК, состоящая из триплетов (см. Открытая рамка считывания).

Раса. Популяция, отличающаяся от другой популяции того же вида частотой некоторых аллелей (см. Dunn LC. Heredity and Evolution in Human Populations. Cambridge, MA: Harvard University Press, 1967). В эволюционной биологии существуют разные концепции расы. Термин «раса» ошибочно применяют для деления людей на категории по внешним фенотипическим признакам, таким как цвет кожи,

в ходе эволюции. У многих данный термин ассоциируется с дискриминацией, для которой нет никаких генетических оснований. Классификация людей по расовому принципу условна и имеет сомнительную биологическую ценность.

Распространенность. Показатель частоты встречаемости заболевания в популяции в определенный период (см. Заболеваемость).

Распространенные заболевания — гипотеза распространенного типа. Влияние генов на распространенные заболевания можно соотнести с распространенными вариантами, присутствующими у 1–5% населения.

Расстояние на генетической карте.

Расстояние между генными локусами на физической карте определяют как число нуклеотид пар (например, пн, тпн и 1 млн пн). Генетическое расстояние определяет частота рекомбинации, которую измеряют в сантиморганах (сМ). Один сантиморган соответствует частоте 1%.

Регуляторный ген. Ген, кодирующий белок, который регулирует активность других генов.

Редактирование РНК. Изменение последовательности РНК после транскрипции, один из механизмов регуляции генов.

Рекомбинантная ДНК. Искусственно полученная молекула ДНК, состоящая из фрагментов разного происхождения. Рекомбинантные ДНК широко используют в молекулярно-гене- тическом анализе.

Рекомбинация (Бриджес и Морган, 1923). Образование новых комбинаций хромосом и генов в результате кроссинговера между гомологичными хромосомами в мейозе. Рекомбинация — основная причина генетической изменчивости.

Ремоделирование хроматина. Энергозависимый процесс перемещения нуклеосом по ДНК для транскрипции или репликации.

Ренатурация. Гибридизация комплементарных одноцепочечных нуклеиновых кислот с образованием двухцепочечных молекул (ДНК с ДНК, РНК с РНК или ДНК с РНК).

Ренатурация ДНК. Воссоединение одиночных цепей ДНК с образованием двухцепочечной ДНК (см. Денатурация).

Репарация (Меллер, 1954). Устранение повреждений ДНК.

Репарация ошибок спаривания. Механизм репарации ДНК, который исправляет ошибки спаривания азотистых оснований.

Репликативнная вилка. Область расхождения цепей двойной спирали ДНК, в которой происходит репликация.

Репликация. Процесс получения копии двойной спирали ДНК перед делением клетки.

Репликон (Хуберман и Риггс, 1968). Отдельно реплецируемый фрагмент ДНК эукариот.

Репрессор. Белок, подавляющий функцию гена.

Рестрикционная карта. Сегмент ДНК, для которого характерена определенная очередность сайтов рестрикции.

Рестрикционный сайт. Определенная нуклеотидная последовательность, по которой определенная эндонуклеаза рестрикции разрезает молекулу ДНК.

Рестрикционный фермент или эндонуклеаза рестрикции (Мезельсон и Юэн, 1968). Эндонуклеаза, расщепляющая ДНК на определенном участке (сайт рестрикции или последовательность узнавания).

Ретровирус. Вирус, геном которого состоит из РНК, реплицируемой путем копирования РНК-генома в кДНК перед встраиванием в хромосому клетки-хозяина.

Ретротранспозон. Мобильный участок ДНК, способный встраиваться в другую область генома с помощью обратной транскриптазы (см. Транспозон).

Рецептор стероидных гормонов. Фактор транскрипции, обеспечивающий ответ на стероидный гормон.

Рецептор. Трансмембранный или внутриклеточный белок, участвующий в передаче клеточных сигналов.

Рецепторы с тирозинкиназной активностью. Мембранные белки (G-белки), участвующие в передаче сигнала.

Рецессивный (Мендель, 1866). Эффект аллеля проявляющийся только в гомозиготном состоянии (см. Доминантный).

Реципрокная транслокация. Взаимный обмен фрагментами хромосом.

Рибонуклеаза (РНКаза). Фермент (нуклеаза), способный расщеплять РНК.

Рибосома (Динцис и др., 1958; Робертс, 1958). Немембранная органелла внутри прокариотических и эукариотических клеток, состоящая из белков и рибосомной РНК, которые образуют две субъединицы. На рибосомах происходит трансляция.

РНК (рибонуклеиновая кислота). Полинуклеотид, по своей структуре похожий на ДНК, но содержащий рибозу вместо дезоксирибозы.

РНК-интерференция. Ингибирование транскрипции антисмысловой РНК.

РНК-полимераза. Фермент, обеспечивающий синтез РНК на ДНК-матрице.

РНК-сайленсинг. Подавление активности гена антисмысловой РНК. Способность двухцепочечной РНК подавлять экспрессию гена.

РНК-сплайсинг. Процессинг первичного транскрипта мРНК (у эукариот).

рРНК. Рибосомная РНК. Крупные молекулы РНК рибосом, составляющие каркас субъединиц рибосомы.

Сайленсер. Последовательность ДНК эукариот, блокирующая доступ к гену полимераз за счет конденсации хроматина в этой зоне.

Сантиморган. Единица измерения генетических расстояний между полиморфными

фрагментами генома. Расстояние между двумя генными локусами в сантиморганах соответствует их частоте рекомбинации, выраженной в процентах, т. е. 1 сМ соответствует частоте рекомбинации 1%. Названа в честь Томаса Г. Моргана (1866–1945), проводившего классические эксперименты на дрозофилах в 1910 г.

Сателлит (Навашин, 1912). Небольшое скопление хромосомного материала, которое соединено с коротким плечом акроцентрической хромосомы перетяжкой или тонкой хроматиновой нитью. Сателлиты могут быть связаны с ядрышком (см. Ядрышковый организатор).

Сателлитная ДНК (Кит, 1961; Суеока, 1961; Бриттен и Коне, 1968). ДНК, которая образует дополнительную полосу при градиентном ультрацентрифугировании, поскольку содержит более тяжелые (GC-богатые) или более легкие (AT-богатые) последовательности по сравнению с основной массой ДНК (см. ДНК). Сателлитную ДНК не следует путать с сателлитными областями акроцентрических хромосом. Ее можно отделить от остальной ДНК, используя градиентное центрифугирование в водном растворе хлорида цезия. При центрифугировании сателлитная ДНК образует одну или несколько дополнительных полос, отделенных от основной массы ДНК. У эукариот можно различить легкую (АТбогатую) и тяжелую (GC-богатую) сателлитные ДНК. Микросателлиты — это короткие (2–10) тандемные азотистые повторы ДНК. Мини-сателлиты — это тандемные повторы примерно из 20–100 пн. Типичная сателлитная ДНК состоит из длинных повторов размером 100–6500 пн.

Саузерн-блот, Саузерн-гибридизация

(Саузерн, 1975). Метод переноса фрагментов ДНК из агарозного геля на мембрану после электрофоретического разделения (см. Southern E. Detection of specific sequences among DNA fragments separated by gel electrophoresis. J Mol Biol 1975; 98: 503–517).

Сегментарная дупликация. Удвоение блока ДНК с одинаковыми или родственными последовательностями.

Сегментация (исчерченность) хромосом

(Пейнтер, 1939). Методы дифференциального окрашивания хромосом позволяют получить рисунок из чередующихся светлых и темных

полос. Каждый хромосомный сегмент гомологичных хромосом имеет специфический рисунок полос, который можно использовать для идентификации сегмента. Термин был предложен в 1939 г. для политенных хромосом некоторых двукрылых (комаров, мух). Метод определяет положение каждой полосы относительно других полос. Промежутки между полосами называют междисковыми участками.

Сегрегация (Бейтсон и Саундерс, 1902). Разделение аллелей определенного генного локуса в мейозе и их распределение по разным гаметам. Соотношение аллелей генов в разных хромосомах составляет 1 : 1.

Секвенирование. Определение последовательности нуклеотидов в генах или аминокислотных оснований в белке.

Селективная среда. Среда, которая обеспечивает рост культивируемых клеток, содержащих определенный ген.

Семейство Bcl-2. Семейство митохондриальных белков, принимающих участие в регуляции апоптоза.

Семейство генов. Набор эволюционно родственных генов с похожими кодирующими последовательностями.

Серпентин. Белок с семью спиральными трансмембранными участками.

Сестринский хроматидный обмен (СХО)

(Тейлор, 1958). Обмен между двумя хроматидами метафазной хромосомы. После двух циклов репликации в клеточной культуре в присутствии галогенизированного аналога нуклеозида (например, 5-бромодезок- сиуридина) обе цепи ДНК одной хроматиды содержат модифицированные нуклеотиды, в то время как у другой хроматиды модифицированные нуклеотиды появляются только в одной цепи. Из-за этого после окрашивания одна из хроматид становится темнее другой, что позволяет определить, где имел место соматический кроссинговер. Повышенная частота сестринских хроматидных обменов характерна для синдрома Блума.

Сефарды. Еврейское население средневековой Испании, Северной Африки, некоторых областей Франции и Турции. Были изгнаны из Испании в 1492 г. Название произошло

от древнееврейского слова «Сфарад», отождествляемого с Испанией (см. Ашкенази).

Сигнальная последовательность. N-конце- вая аминокислотная последовательность секретируемого белка. Необходима для транспорта белка в определенную часть клетки.

Синапс. Область контакта между двумя нейронами или нейроном и мышечной клеткой.

Синапсис (Мур, 1895). Конъюгация гомологичных хромосом в профазе мейоза.

Синаптонемный комплекс (Мозес, 1958). Параллельные структуры, связанные с образованием хиазм в мейозе, их можно увидеть под электронным микроскопом.

Синдром. В генетике человека это набор этиологически связанных клинических и патологических характеристик, при этом точные сведения о природе их связи могут отсутствовать.

Синдромы «генных последовательностей».

Заболевания, возникающие из-за патологических изменений в соседних генах с различными функциями.

Синтения (Ренвик, 1971). Расположение генных локусов на одной хромосоме независимо от того, являются они сцепленными или нет.

Система CRISPR. Короткие последовательности ДНК бактерий и архей, продуцирующие небольшие некодирующие РНК для обнаружения и устранения вирусных геномов за счет спаривания и направленного расщепления нуклеазой.

Сканирование генома. Поиск по маркерным локусам на всех хромосомах на предмет наличия связи с некартированным локусом

СКЛ-реакция (Бах, Хиршхорн, Левенштейн, 1964). Реакция смешанной культуры лимфоцитов. Метод определения различий фенотипов.

Сложная гетерозиготность. Два разных мутантных аллеля в одном генном локусе.

Смысловая цепь. Цепь ДНК, транскрибируемая в РНК. Она комплементарна антисмысловой цепи. Последовательности генов всегда записывают в направлении от 5'- к 3'-концу смысловой цепи.

Соматическая клетка. Любая клетка организма, которая не вступает в мейоз и не образует гаметы (см. Половые клетки).

Соматический. Данный термин применяют к клеткам и тканям организма, которые не являются зародышевыми (см. Половые клетки).

Сопряжение (Бейтсон и др., 1905). Цис-кон- фигурация двойных гетерозигот.

Спираль–петля–спираль. Элемент третичной структуры ДНК-связывающих белков, в том числе некоторых факторов транскрипции.

Сплайсинг. Этап процессинга первичного транскрипта, на котором происходит удаление интронов и объединение экзонов.

Сплайсосома. Структура, которая состоит из различных молекул, обеспечивающих сплайсинг РНК.

Спорадическая форма. Случайно возникший фенотип, наследственный характер которого не установлен.

Сравнительная геномная гибридизация (CGH). Метод обнаружения делеций и дупликаций в геноме пациента, основанный на сравнительном анализе гибридизации образца ДНК пациента и контрольного образца (см. Сравнительная геномная гибридизация на микрочипах).

Сравнительная геномная гибридизация на микрочипах (см. Сравнительная геномная гибридизация). Метод обнаружения делеций и дупликаций в геноме, основанный на сравнительном анализе гибридизации большого числа образцов ДНК или РНК различного происхождения (тестовый образец и контроль) на субстрате малых размеров (микрочипе) (см. Изменение числа копий).

Старение. Старение культивируемых клеток или старение организма.

Стволовые клетки. Недифференцированные клетки, способные самообновляться путем деления и дифференцировать в специализированные клетки. Омнипотентные (тотипотентные) стволовые клетки могут дифференцировать в клетки любого типа. Плюрипотентные стволовые клетки происходят от тотипотент-

ных стволовых клеток. Они могут образовывать клетки многих, но не всех типов.

Стоп-кодон (или терминирующий кодон).

Кодон, который обеспечивает терминацию трансляции (UAG, UAA, UGA), раньше такие кодоны называли нонсенс-кодонами (см. Амберкодон, Охра-кодон).

Субметацентрическая хромосома. Данный термин применяют к хромосоме, которую центромера делит на короткое и длинное плечи (см. Метацентрическая, Акроцентрическая).

Суперсемейство. Набор эволюционно связанных генов или белков.

Суперспираль. Стабильная форма структуры белка, состоящая из двух или более альфаспиралей.

Сцепление генов (Морган, 1910). Близкое расположение генных локусов на одной хромосоме, приводящее к отклонению от независимого расщепления.

Тандемная дупликация. Расположенные друг за другом идентичные короткие сегменты ДНК.

Теломераза (Грейдер и Блекберн, 1987). Рибонуклеопротеиновый фермент, обеспечивающий наращивание нуклеотидной цепи в области теломеры.

Теломеры (Меллер, 1938). Терминальные участки на обоих концах хромосомы, содержащие специфичные последовательности.

Телоцентрические хромосомы (Дарлингтон, 1939). Данный термин применяют к хромосомам или хроматидам с концевыми центромерами, у которых нет коротких плеч или сателлитов. Такие хромосомы не встречаются у человека.

Тельце Барра. См. Х-хроматин.

Теплокарта. Графическое отображение экспрессии генов в виде матрицы. Строка соответствует гену, а колонка — ткани или биообразцу. Цвет каждого гена отражает его экспрессию (высокую активность обычно обозначают красным цветом, а низкую синим).

Тератоген (Баллантайн, 1894). Химический или физический фактор, приводящий к нару-

шению эмбрионального развития и возникновению пороков.

Терминирующий кодон (или стоп-кодон).

Один из трех триплетов, сигнализирующих о завершении трансляции (UAG, UAA, UGA).

Тетраплоидия (Немек, 1910). Наличие двойного диплоидного набора хромосом, т. е. четырех копий каждой хромосомы (4n вместо 2n).

Т-клетки. Т-лимфоциты.

Топоизомераза. Представитель класса ферментов, обеспечивающих раскручивание двойной спирали ДНК и регулирующих трехмерную структуру ДНК при репликации за счет расщепления одной цепи ДНК, переноса цепи через разрыв и восстановления цепи (класс I) или за счет расщепления и восстановления двух цепей (класс II). Топоизомеразы необходимы для расплетания двойной спирали ДНК при транскрипции.

Точечная мутация. Изменение генетического кода в пределах одного кодона. Возможны следующие типы мутаций: транзиции (Фриз, 1959), т. е. замена пиримидина на другой пиримидин или пурина на другой пурин; трансверсии, т. е. замена пиримидина пурином и наоборот. Помимо двух типов замен, возможны вставки или делеции из одной или нескольких нуклеотидных пар.

Точка начала репликации (ORI). Фрагмент молекулы ДНК, с которого начинается репликация.

Точка разрыва. Сайт разрыва цепи при трансклокации, инверсии или делеции.

Транзиция. Мутация, представляющая собой замену пурина другим пурином или пиримидина другим пиримидином (см. Трансверсия).

Трансверсия. Мутация, представляющая собой замену пурина пиримидином или наоборот (см. Транзиция).

Трансген. Клонированный ген, внедренный в организм растения или животного, который передается следующим поколениям.

Трансгенный. Данный термин применяют к растениям и животным, содержащим интегрированный в геном чужеродный ген.

Трансгенные организмы позволяют изучить биологическую функцию гена.

Транс-действие. Воздействие регуляторного элемента на расстоянии.

Трансдукция (Циндер и Ледерберг, 1952). Перенос генов из одной клетки в другую (обычно бактериальную) с помощью специального вируса, бактериофага.

Транскрипт. РНК-копия активного гена.

Транскрипция. Синтез информационной РНК (мРНК), первый этап переноса записанной в ДНК генетической информации (см. Трансляция).

Транслокация. Перенос участка хромосомы на другую хромосому. Транслокация обычно бывает реципрокной, она приводит к обмену негомологичными хромосомными сегментами. Транслокацию между двумя акроцентрическими хромосомами, утратившими короткие плечи и слившимися в области центромер, называют робертсоновской транслокацией.

Трансляция. Второй этап передачи генетической информации. Последовательность триплетов мРНК транслируется в соответствующую аминокислотную последовательность полипептида — продукта гена (см. Транскрипция).

Трансмембранный белок. Белок клеточной мембраны, домены которого расположены и снаружи, и внутри клетки. Мембранные белки обычно участвуют в передаче сигнала.

Транспозиция. Перемещение последовательности, транспозона, из одной области генома в другую.

Транспозон. Последовательность ДНК, способная перемещаться и встраиваться в новую область генома.

Трансфекция. Введение ДНК в эукариотическую клетку (см. Трансформация).

Трансформация. В биологии данный термин может иметь разное значение. Генетика изучает три вида трансформации: 1) малигнизацию, или превращение нормальной клетки в злокачественную из-за утраты контроля над пролиферацией; 2) генетическую трансфор-

мацию (Гриффит, 1928; Эйвери и др., 1944), или изменение генома клетки путем переноса генетической информации; 3) бластную трансформацию, или реакцию лимфоцитов на митогенные соединения (например, фитогемагглютинин или некоторые антигены), приводящую к делению.

Триплет. Последовательность из трех нуклеотидов, соответствующая кодону аминокислоты (см. Кодон).

Трисомия (Блейксли, 1922). Наличие трех гомологичных хромосом вместо пары (см. Моносомия).

тРНК. Транспортная РНК, которая присоединяется к мРНК и обеспечивает доставку специфичной аминокислоты к месту синтеза белка на рибосому.

Тяжелая цепь. Цепи ДНК различаются из-за разницы между основаниями А и G, C и T (см. Легкая цепь).

Убиквитин. Небольшой белок, инактивирующий другие белки.

Убиквитинизация. Инактивация белка за счет присоединения к нему убиквитина.

Утрата гетерозиготности (LOH). Гемизиготность или гомозиготность клеток злокачественной опухоли, возникающая из-за утраты гена и окружающей его хромосомной области.

Фаг. Сокращение от «бактериофаг».

Фагоцитоз. Поглощение клетками других клеток, например бактериальных.

Фактор инициации. Белок, который присоединяется к малой субъединице рибосомы и обеспечивает запуск синтеза белка (IF у прокариот, eIF у эукариот).

Фактор роста. Белок, обычно небольшой пептид, который играет роль активирующего рецептор лиганда.

Фактор устойчивости. Ген на плазмидах, обеспечивающий устойчивость к антибиотикам.

Фактор элонгации (EF). Один из ассоциированных с рибосомой белков, который обе-

спечивает элонгацию полипептидной цепи при трансляции. EF у прокариот и eEF у эукариот.

Факторы транскрипции. ДНК-связывающие белки, обеспечивающие регуляцию транскрипции.

Фармакогенетика (Фогель, 1958; Веселл, 1959). Наука о влиянии отдельных генов на метаболизм и функцию лекарственных препаратов.

Фармакогеномика. Отрасль, исследующая влияние генетической вариации каждого человека в его ответе на действие лекарственного средства в масштабах всего генома.

Фенокопии (Голдшмидт, 1935). Изменения фенотипа под влиянием факторов среды, по своим проявлениям похожие на мутации.

Фенотип (Иогансен, 1909). Внешние проявления активности одного или более генов в организме или клетке.

Фермент (Бюхнер, 1897). Белок, который катализирует химическую реакцию. Ферменты состоят из белковой части (апофермента), обеспечивающей специфичность, и небелковой части (кофермента), обеспечивающей активность. Ферменты взаимодействуют с субстратами, изменяя их, или объединяются с другими веществами в ходе реакции. Большую часть ферментативных химических реакций можно разделить на шесть групп: 1) гидролиз (расщепление под действием H2O) с участием гидролаз; 2) перенос функциональных групп от одной молекулы к другой с участием трансфераз; 3) окисление и восстановление с участием оксидаз и редуктаз (перенос одного или нескольких электронов или атомов углерода от молекулы, которая должна быть окислена, к молекуле, которая должна быть восстановлена); 4) изомеризация с участием изомераз (изменение положения атома или функциональной группы внутри молекулы); 5) присоединение двух молекул субстрата друг к другу с участием лигаз (синтетаз); 6) негидролитическое расщепление с образованием двойной связи в одной или обеих молекулах с участием лиаз.

Феромон. Сигнальная молекула, способная влиять на экспрессию генов других представителей того же вида.

Фибробласт. Вид клеток соединительной ткани, которые могут размножаться в колбах,

содержащих подходящую среду (культуры фибробластов).

Фиксация. Аллель, который постоянно присутствует у всех особей в популяции.

Фингерпринт генетический. Характерный профиль небольших полиморфных фрагментов ДНК или белков.

Фитогемагглютинин. Белковое соединение, выделенное из семян фасоли Phaseolus vulgaris. Новелл (1960) установил, что оно способно индуцировать бласттрансформацию (см. Трансформация) и деление лимфоцитов. Стимуляцию культивируемых лимфоцитов фитогемагглютинином используют для хромосомного анализа.

Флуоресцентная гибридизация in situ

(FISH). Метод идентификации фрагмента ДНК на субстрате (in situ) с использованием флуоресцентных маркеров.

Флуорофор. Флуоресцирующее соединение с определенной длиной волны, позволяющее обнаружить сайт гибридизации (см. FISH).

Фосфодиэфирная связь. Химическая связь, соединяющая соседние нуклеотиды ДНК или РНК.

Фрагменты Оказаки. Короткие (менее 1000 нуклеотидов) одноцепочечные фрагменты ДНК, которые синтезируются на отстающей цепи ДНК при репликации. ДНК-лигаза собирает из таких фрагментов новую цепь ДНК.

Хеликаза. Фермент, который раскручивает и разделяет две цепи двойной спирали ДНК, разрывая водородные связи при транскрипции или репарации.

Хиазма (Янссенс, 1909). Видимая на цитологических препаратах область кроссинговера внутри бивалента. У некоторых организмов хиазмы смещаются к концам хромосом (терминализация хиазм) в поздней диплотене и диакинезе (см. Мейоз). Среднее число хиазм аутосомных бивалентов составляет около 52 у мужчин и 25–30 у женщин. Число хиазм у человека было впервые определено в 1956 г. Фордом и Хэмертоном.

Химера (Уинклер, 1907). Организм или ткань, в которых присутствуют клетки с различными

генотипами, образовавшимися на презиготическом уровне.

Хроматида (Маккланг, 1900). Cтруктурный элемент хромосомы, формирующийся в результате удвоения хромосомы. Две хроматиды удерживает вместе центромера, их можно увидеть в ранней профазе и метафазе митоза, а также между диплотеной и второй метафазой мейоза. Сестринские хроматиды образуются из одной хромосомы. Несестринские хромосомы — это хроматиды гомологичных хромосом. После деления центромеры в анафазе сестринские хроматиды превращаются в дочерние хромосомы. Разрывы хроматид или хромосомные аберрации хроматидного типа затрагивают только одну из двух сестринских хроматид. Они возникают после репликации ДНК в S-фазе (см. Клеточный цикл). Разрыв, возникающий до перехода в S-фазу, затрагивает обе хроматиды, такие разрывы называют изолокусными.

Хроматин (Флеминг, 1882). Окрашенное вещество, присутствующее в интерфазном ядре. Данный термин применяют к упакованной ДНК, т. е. ДНК, основным хромосомным белкам (гистонам), негистоновым хромосомным белкам и небольшому количеству РНК.

Хромосома (Вальдейер, 1888). Состоящие из хроматина структуры, несущие гены. Во время деления клетки они выглядят как нитевидные или палочковидные образования (от греч. «окрашенная нить»).

Хромосомы типа ламповых щеток (Рюкерт, 1892). Особая форма хромосом, которую они приобретают в растущих ооцитах многих позвоночных и беспозвоночных на стадии диплотены мейотического деления, а также в сперматоцитах дрозофилы. На хромосомах образуется множество транскрипционно активных латеральных петель ДНК.

Х-сцепленный. Данный термин применяют к генам Х-хромосомы.

Х-хроматин (Барр и Бертрам, 1949). Темноокрашенный конденсированный участок в ядре интерфазной клетки, который соответствует инактивированной Х-хромосоме (ранее называли тельцем Барра).

Центриоль. Полый цилиндр, состоящий из микротрубочек.

Центромера (Вальдейер, 1903). Хромосомная область, к которой прикрепляются волокна веретена деления во время митоза или мейоза. В метафазе она выглядит как перетяжка. Центромерная область содержит специфические повторяющиеся последовательности ДНК.

Цикл разрыв–слияние–образование связи. После разрыва хроматида сливается с сестринской хроматидой, образуя мостик.

Циклин. Белок, участвующий в регуляции клеточного цикла.

Циклический АМФ (цАМФ). Циклический аденозинмонофосфат, вторичный мессенджер, возникающий в ответ на стимуляцию G-связанных рецепторов.

Цинковый палец. Похожая на палец область, которая присутствует у многих ДНКсвязывающих регуляторных белков. В центре «пальца» находится атом цинка.

Цис-действие. Данный термин применяют в тех случаях, когда регуляторная последовательность ДНК располагается на той же хромосоме (противоположно транс-действию, когда регуляторный элемент воздействует на расстоянии).

Цис-транс-формы (Холдейн, 1941). По аналогии с цис-транс-изомерией данный термин применяют, чтобы определить положения генов двойных гетерозигот (гетерозигот по двум соседним генным локусам) или гомологичных хромосом. Если два определенных аллеля (например, мутантных) расположены рядом друг с другом на одной хромосоме, то они находятся в цис-положении. Если они расположены на разных гомологичных хромосомах, то находятся в транс-положении. Цис-транс-тест (Lewis, 1951; Benzer, 1955) основан на использовании генетических методов (генетической комплементации) для определения положения двух мутантных генов (относительно цис- или транс-положения). Применительно к сцеплению генов термины «цис» и «транс» можно трактовать как «притяжение» и «отталкивание».

Цистрон (Бензер, 1955). Функциональная единица эффекта гена, определенная с помощью цис-транс-теста. Если фенотип мутантный с аллелями в цис-положении и аллели

не комплементарны (генетическая комплементация), их считают аллелями одного и того же цистрона. Это данное Бензером определение было расширено Финчемом в 1959 г. В пределах цистрона мутации в транс-позиции не комплементарны. Термин «цистрон» можно считать синонимом термина «ген».

Цитозоль. Жидкий матрикс, окружающий органеллы клетки.

Цитокин. Маленькая секретируемая молекула, способная связываться с поверхностными рецепторами определенных клеток, обеспечивая пролиферацию или дифференцировку клеток.

Цитоплазматическая наследственность.

Передача генетической информации, содержащейся в митохондриях. Поскольку сперматозоиды не содержат митохондрии, передаваемая информация имеет материнское происхождение.

Цитоскелет. Обеспечивающая поддержание формы клетки система белков цитоплазмы и клеточной мембраны.

Частота гена. Частота встречаемости в популяции расположенного в определенном локусе определенного аллеля (частота аллеля).

Частота мутаций. Частота мутаций в определенном локусе, отнесенная к общему числу клеток или особей в одном поколении. Среднюю частоту мутаций у человека оценивают как ~2,5 10–8 (см. Nachman MW, Crowell SL, Genetics 2000; 156: 297–304).

Частота рекомбинаций. Частота рекомбинаций между двумя или более генными локусами. Ее определяют как долю рекомбинации тета (Θ). Значение Θ=0,01 (частота рекомбинаций 1%) соответствует одному сантиморгану (сМ).

Шаперон. Белок, обеспечивающий правильное сворачивание других белков.

Эвокатор. Молекула, индуцирующая экспрессию гена.

Эймса тест. Тест на мутагенность химических веществ, проводимый с использованием фракции крысиной печени и мутантных бактерий.

Экзом. Совокупность всех экзонов генома.

Экзон (Гилберт, 1978). Сегмент ДНК, который представлен в зрелой мРНК эукариот (см. Интрон).

Экзонуклеазы. Ферменты, способные гидролизовать связи на 5'- или 3'-концах полиазотистой цепи (см. Эндонуклеазы).

Экзоцитоз. Процесс перемещения веществ из клетки во внешнюю среду.

Экспрессивность гена (Фогт, 1926). Степень фенотипического проявления гена или генотипа. Отсутствие экспрессивности также называют неполной пенетрантностью.

Экспрессия. Наблюдаемый эффект активного гена.

Эксцизионная репарация. Репарация обширных повреждений ДНК, при которой фрагмент нуклеотидной цепи (~14 нуклеотидов у прокариот и ~30 у эукариот) вырезается из пораженной цепи и заменяется нормальной последовательностью (ресинтез).

Эктодерма. Наружный зародышевый листок эмбриона, из которого образуются эпидермис, нервная система и органы чувств (см. Эндодерма и Мезодерма).

Электрофорез (Тиселиус, 1937). Метод разделения молекул на основании скорости их миграции в среде под действием внешнего электрического пола. В качестве среды обычно используют гелеобразные вещества, такие как крахмал, агароза и акриламид. Другие молекулярные различия могут быть обнаружены с помощью модификаций метода, например двумерного электрофореза (электрическое поле развернуто на 90° для второй миграции) или изоэлектрическое фокусирование.

Элонгация. Присоединение аминокислот к полипептидной цепи либо нуклеотидов к ДНК или РНК.

Эмбриональные стволовые клетки. Выделенные из эмбриона недифференцированные плюрипотентные клетки.

Эндодерма. Внутренний зародышевый листок, из которого формируются пищевари-

тельная система и дыхательные пути (см. Эктодерма и Мезодерма).

Эндонуклеазы. Гетерогенная группа ферментов, способных разрушать связи между нуклеотидами одноцепочечных или двухцепочечных ДНК и РНК.

Эндоплазматический ретикулум. Разветвленная сеть мембранных структур в цитоплазме.

Эндоредупликация (Леван и Хаушка,1953). Форма эндомитоза, при которой редупликация хромосом происходит в интерфазе, а митоз не наступает. Эндоредупликация приводит к тому, что метафазные хромосомы состоят из четырех расположенных рядом хроматид, удерживаемых вместе двумя соседними центромерами.

Эндоцитоз. Процесс поглощения веществ клетками путем втягивания (инвагинации) участка клеточной мембраны и образования в цитоплазме мембранного пузырька с внеклеточным содержимым.

Энхансер (Банериджи, 1981). Цис-регулятор- ный сегмент ДНК, содержащий сайты связывания факторов транскрипции. Энхансер может располагаться на разном расстоянии от промотора. Он обеспечивает ускорение транскрипции (примерно в 10 раз).

Эпигенетика (Уоддингтон, 1942). Исследование наследуемых изменений экспрессии генов, вызванных механизмами, не затрагивающими последовательности ДНК (например, метилированием ДНК). Термин произошел от слов «эпигенез» и «генетика».

Эпигеном. Общее эпигенетическое состояние генома клетки.

Эписома (Жакоб и Вольман, 1958). Последовательность ДНК, например плазмида, которая может существовать независимо или встраиваться в геном бактерии-хозяина.

Эпистаз (Бейтсон, 1907). Нереципрокное взаимодействие генов в одном (аллельное) или разных (неаллельное) локусах, влияющее на экспрессию генов.

Эпитоп. Фрагмент молекулы антигена, который связывается с антителом.

Эубактерии. Подцарство прокариот.

Эукариоты (Шаттон, 1937). Клетки растений и животных, которые содержат ядро

иорганеллы в цитоплазме (см. Эубактерии

иПрокариоты).

Эуплоидия (Такхольм, 1922). Состояние клеток, тканей или организмов, при котором в них присутствует характерный для данного вида полный набор хромосом (см. Анеуплоидия, Гетероплоидия, Полиплоидия).

Эухроматин (Хайц, 1928). Хромосома или сегмент хромосомы, окрашивающийся в более светлый цвет, чем гетерохроматин. Эухроматин — это генетически активная часть хроматина, которая не полностью конденсируется в интерфазном ядре.

Эффект основателя. Присутствие в популяции определенного аллеля, появившегося в результате мутации у одного предка.

Эффективность клонирования. Показатель эффективности клонирования отдельных клеток млекопитающих в клеточной культуре.

Эффектор. Белок, обладающий специфическим эффектом.

Ядрышко. Область ядра, в которой происходит транскрипция рибосомной РНК.

Ядрышковый организатор. Участки хромосом 13, 14, 15, 21 и 22 человека, содержащие гены рибосомной РНК (окрашиваются нитратом серебра).

Литература

Alberts B, Johnson A, Lewis J, et al. Molecular Biology of the Cell. 6th ed. New York, NY: Garland Science, 2015.

King RC, Mulligan PK, Stansfield WD. A Dictionary of Genetics. 8th ed. Oxford: Oxford University Press, 2013.

Lodish H, Berk A, Kaiser CA, et al. Molecular Cell Biology. 8th ed. New York, NY: W.H. Freeman, 2016.

Passarge E. Color Atlas of Genetics. 4th ed. Stuttgart: Thieme Medical Publishers, 2013. Rieger R, Michaelis A, Green MM. Glossary of Genetics and Cytogenetics. 5th ed. Heidelberg: Springer-Verlag, 1979.

Strachan T, Read AP. Human Molecular Genetics. 4th ed. New York, NY: Garland Science, 2011.

Интернет-сайты

Genetics Home Reference (http://ghr.nlm.nih. gov/). По состоянию на 6 июля 2017 г. Glossary of Genetic Terms. Составлен Центром генетических ресурсов Медицинского центра университета г. Канзас (http://www.kumc. edu/gec/glossnew. html). По состоянию на 6 июля 2017 г.

Glossaries of genetic terminology WHO (http:// www.who.int/genomics/glossary/en/). По состоянию на 6 июля 2017 г.

National Cancer Institute. NCI Dictionary of Genetics Terms. (https://www.cancer.gov/ publications/dictionaris/genetics-dictionary). По состоянию на 6 июля 2017 г.