- •I. Физколлоидная химия
- •1. Физическая химия
- •1.1. Вода
- •1.1.1. Вода как уникальная молекула жизни
- •1.1.3. Буферные растворы
- •1.2. Биоэнергетика клетки
- •1.3. Термохимия
- •1.4. Химическая кинетика и катализ
- •2. Коллоидная химия
- •2.1. Классификация дисперсных систем
- •2.2. Классификация дисперсных систем по агрегатному состоянию дисперсной фазы
- •2.2. Поверхностные явления
- •2.3. Адсорбция
- •2.4. Коллоидные растворы (золи)
- •2.4.1. Характеристика коллоидных растворов
- •2.4.2. Растворы высокомолекулярных соединений
- •II. Биологическая химия
- •3. Белки
- •3.1. Общая характеристика белков
- •3.3. Методы выделения, фракционирования и очистки белков
- •3.3.1. Методы выделения белков
- •3.4. Физико-химические свойства белков
- •3.5. Аминокислоты
- •3.6. Структура белковой молекулы
- •I'm 1.8. Денатурация и ренатурация рибонукле- азы (по Анфинсену):
- •3.7. Классификация белков
- •3.7.1. Простые белки
- •3.7.2. Сложные белки
- •4. Нуклеиновые кислоты
- •4.1. Общая характеристика нуклеиновых кислот
- •4.2. Нуклеотиды и нуклеозиды
- •4.3. Дезоксирибонуклеиновая кислота
- •4.4. Рибонуклеиновые кислоты
- •5. Углеводы 5.1. Общая характеристика углеводов
- •5.2. Моносахариды
- •5.3. Олигосахариды
- •5.4. Полисахариды (глюканы)
- •6. Липиды
- •6.1. Общая характеристика липидов
- •6.2. Простые липиды
- •6.3. Сложные липиды
- •6.4. Двойной липидный слой клеточных мембран
- •Контрольные вопросы и задания
- •7. Витамины
- •7.1. Общая характеристика витаминов
- •7.2. Классификация и номенклатура витаминов
- •7.2.1. Жирорастворимые витамины
- •7.2.2. Водорастворимые витамины
- •8. Ферменты 8.1. Общая характеристика ферментов
- •8.3. Общие свойства ферментов
- •8.4. Активирование и ингибирование ферментов
- •8.2. Участие ионов металлов в активировании ферментов
- •8.5. Классификация и номенклатура ферментов
- •III класс. Гидролазы. Они разрывают внутримолекулярные связи путем присоединения
- •8.6. Применение ферментов
- •9. Гормоны
- •9.1. Уровни регуляции гормонов
- •9.2. Гормоны, выделяемые железами внутренней секреции
- •9.3. Гормоны местного действия
- •11. Обмен углеводов
- •11.1. Переваривание углеводов в пищеварительном тракте
- •11.2. Катаболизм глюкозы
- •11.3. Цикл трикарбоновых кислот
- •11.4. Пентозофосфатный путь окисления глюкозо-6-фосфата
- •11.5. Биосинтез углеводов
- •11.6. Регуляция обмена углеводов
- •12. Обмен липидов
- •12.1. Переваривание липидов в пищеварительном тракте
- •12.2. Промежуточный обмен липидов
- •2. Если синтезируется много сн3—со—КоА, а энергии для синтеза жира недостаточно, то образуется активированная ацетоуксусная кислота:
- •12.3. Биосинтез липидов
- •12.4. Метаболизм стеринов и стеридов
- •13. Обмен белков
- •13.2. Биологическая ценность белков
- •13.3. Особенности переваривания белков у моногастричных животных
- •13.4. Особенности переваривания белков у жвачных
- •13.5. Метаболизм белков в тканях
- •13.6. Особенности обмена отдельных аминокислот
- •13.7. Биосинтез белка
- •14. Обмен нуклеиновых кислот
- •14.1. Переваривание нуклеиновых кислот в пищеварительном тракте
- •14.2. Промежуточный обмен нуклеиновых кислот (распад нуклеиновых кислот в тканях)
- •14.3. Биосинтез нуклеиновых кислот
- •14.4. Рекомбинантные молекулы и проблемы генной
- •15. Обмен воды и солей
- •15.1. Содержание и роль воды в организме
- •15.2. Электролиты тканей
- •15.3. Потребность организма в минеральных веществах, их поступление и выделение
- •16. Взаимосвязь обмена белков, жиров и углеводов
- •17. Биохимия крови
- •18. Биохимия нервной ткани
- •18.1. Химический состав нервной ткани
- •18.2. Обмен веществ в нервной ткани
- •18.3. Химизм передачи нервного импульса
- •19. Биохимия мышечной ткани
- •19.1. Морфология и биохимический состав мышечной ткани
- •19.2. Механизм сокращения мышцы
- •19.3. Окоченение мышц
- •20. Биохимия молока и молокообразования
- •21. Биохимия почек и мочи
- •22. Биохимия кожи и шерсти
- •23. Биохимия яйца
- •Приложение
14.3. Биосинтез нуклеиновых кислот
Субстратом для синтеза нуклеиновых кислот в клетках и тканях могут служить продукты гидролиза ДНК и РНК, а также продукты обмена белков и углеводов.
Пуриновые нуклеотиды синтезируются из диоксида углерода, глицина, муравьиной и аспарагиновой кислот и глутамина. В результате поэтапного синтеза из этих компонентов (всего 11 реакций) образуется инозиновая кислота, из которой затем — АМФ и ГМФ. Из указанных монофосфатов затем синтезируются соответствующие ди- и трифосфаты.
Синтез пиримидиновых нуклеотидов происходит также поэтапно. Вначале образуется карбомоилфосфат из NH3, СО2, АТФ. Затем с участием аспарагиновой кислоты образуется дигидрооротовая, затем оротовая кислоты.
Оротовая кислота далее взаимодействует с 5'-фосфорибозил-1- пирофосфатом, при этом синтезируется оротидин-5-фосфат, который затем декарбоксилируется с образованием уридинмонофосфата. Из уридиловой кислоты при аминировании углеродов за счет глутамина образуется цитидинмонофосфат, а при метилировании — тимилиловая кислота :
Эти монофосфаты затем фосфорилируются с участием АТФ до образования трифосфатов.
Синтез (или репликация) ДНК. В клетках животных синтез (репликация) ДНК происходит только в определенный период жизни клетки — в синтетической S-фазе. Эта фаза отделена от митоза (М) предсинтетическим (G,) и постсинтетическим (G2) периодами (рис. 14.3).
Репликация ДНК осуществляется в строго определенное время в клетках, готовящихся к делению. В S-фазе происходит полная и строго однократная репликация ядерной ДНК, по времени это занимает примерно 9 ч; за этот срок удваивается генетический материал диплоидной делящейся клетки. Репликация начинается сразу на многих участках молекулы ДНК, называемых точками начала репликации, обозначаемых ori (от англ. origin — начало). Биосинтез ДНК происходит с участием всех четырех дезоксирибо- нуклеозидтрифосфатов — АТФ, ГТФ, ЦТФ, ТТФ; ферментов синтеза ДНК: ДНК-полимераз, хеликазы — фермента, обеспечивающего раскручивание (расплетение) двойной спирали ДНК в реп- ликативной вилке, топоизомеразы — фермента, способствующего расщеплению спирали ДНК в области репликативной вилки, ферментов, «редактирующих» ДНК, т. е. вызывающих и удаляющих ошибочно включенные нуклеотиды или репарирующих повреждения ДНК.
Все этапы синтеза ДНК эукариот осуществляются при помощи репликативного мультиферментного комплекса (праймасомы), состоящего из ферментов и белковых факторов, который узнает точки ori, расплетает родительский дуплекс, удерживает материнские цепи ДНК на достаточном расстоянии друт от друга, осуществляет инициацию новых дочерних цепей, закручивание цепей в спираль и, наконец, выполняет терминацию репликации ДНК. В составе комплекса присутствуют вновь синтезированная ДНК, не менее 30 белков с молекулярной массой от 15 000 до 30 000, ДНК-полимеразы, праймаза, 3'...5'-экзонуклеаза, ДНК-лигаза I, РНКаза Н, ДНК-топоизомераза I, ДНК-хеликаза, белок ЯАПК (ядерный антиген пролиферирующих клеток) и другие факторы.
В праймасоме репликативный белок А (РБА) связывается с однонитевой ДНК и существует в виде комплекса из трех белков с молекулярной массой 70 000, 34 000 и 11 000. Репликативный фактор РФС состоит из пяти белковых единиц и играет важную роль при связывании репликативных полимераз во время образования репли- кативной вилки. Белок ЯАПК, так называемый ДНК-полимеразный зажим, функционирует как кофактор ДНК-полимеразы, образуя закрытое кольцо, окружающее ДНК, с каналом в центре. Репликативный фактор С совместно с ЯАПК продвигается вдоль ДНК по репликативной вилке. С участием праймасомы и других ферментов образуются новые полинуклеотидные цепи. Синтез новых цепей всегда идет в направлении от 5'-конца к 3'- концу. Поэтому на одной из ветвей репликативной вилки новая цепь наращивается непрерывно по мере раскручивания ДНК-матрицы, а на другой ветви образуются короткие фрагменты новой цепи ДНК, называемые фрагментами Оказакщ затем концы этих фрагментов соединяются между собой в результате действия фермента ДНК-лигазы (рис. 14.4).
тезируется непрерывно, на другой — прерывисто, с образованием фрагментов Оказаки, которые соединяются между собой в результате действия ДНК-лигазы. По мере роста новых цепей реплика- тивная вилка перемещается по ДНК и в результате происходит репликация (удвоение) молекулы ДНК. Последовательности нуклеотидов новой цепи ДНК строго комплементарны последовательностям родительской цепи, благодаря этому соблюдается передача наследственной информации из поколения в поколение. Точность репликации очень высока — возможна одна ошибка на десять трансферазных реакций.
Синтез ДНК на матрице РНК. Этот процесс происходит под действием фермента ревертазы, или обратной транскриптазы (РНК-зависимой ДНК-полимеразы), входящей в состав онковирусов. Доказано, что во многих РНК-содержащих онкогенных вирусах (онковирусы) этот фермент находится в составе покровных белков. При этом механизм синтеза ДНК на матрице РНК включает три этапа: на первом этапе фермент ревертаза синтезирует на матрице вирусной РНК комплементарную цепь ДНК, что приводит к формированию гибридной молекулы; на втором этапе исходная молекула РНК отделяется от ДНК и только после этого (на третьем этапе) на матрице ДНК синтезируется комплементарная цепь ДНК.
Биосинтез РНК. Происходит в клетках на матрице ДНК, т. е. синтезируемая РНК комплементарна к одной из цепей этой ДНК. Если при репликации ДНК происходит удвоение всей молекулы ДНК, то при синтезе РНК (транскрипции) копия с молекулы ДНК снимается лишь с отдельных генов, с отдельных участков одной из цепей ДНК. Синтез различных форм РНК осуществляется с участием соответствующих РНК-полимераз, которые катализируют синтез информационной (иРНК), рибосомальной (рРНК) и транспортной (тРНК) рибонуклеиновых кислот. В природе существует фермент РНК-зависимая РНК-полимераза, который обеспечивает в клетке репликацию РНК у РНК-содержащих вирусов. При этом РНК вируса выполняет две функции: роль носителя генетической информации (вместо ДНК) и информационной РНК. Вирусная РНК одноцепочечная. Эту цепь обозначают «плюс»- цепь РНК, а синтезируемую в присутствии РНК-полимеразы комплементарную ей цепь РНК — «минус»-цепь. Поступившая в клетку вирусная РНК выполняет роль информационной РНК, связывается с рибосомами клетки-хозяина и обеспечивает образование фермента репликазы и белков вирусной оболочки. После этого при помощи фермента репликазы синтезируется вирусная РНК на матрице исходной РНК. В свою очередь молекула «ми- нус»-цепи РНК является матрицей для синтеза «плюс»-цепей РНК.