бышевский-биохимия для врача
.pdfПринимая во внимание, что в состоянии равновесия скорость образования и распада комплекса одинакова, записываем уравнение 2.
1. Е + S v — " =2 ES + Е
|
|
la . |
v , |
= |
Ц |
|
• |
|
|
[S] |
([Е] |
|
- |
ESJ) |
||
|
|
lb. |
v2 |
+ |
k2 |
|
• |
|
|
[ES] + |
k , |
• |
[ES] |
|||
2. k, • |
([Et - |
ES]) • |
[S] |
= |
k2 |
[ES] |
+ |
k , |
• |
[ES] |
||||||
3. ([Et - |
ES]) |
• |
[S] |
|
Ц |
+ |
k , |
|
|
|
|
|
||||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
= К |
|
|
|
|
|
|
|
|
[ES] |
|
|
|
|
|
k2 |
|
|
|
|
|
||
4. |
[ES] |
|
[Et] • |
[S] |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
||
= |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
||||
|
|
|
|
Km + [S] |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
||
5. |
v |
k2 |
• [EJ |
[S] |
|
Vmax [S] |
|
|
|
|
|
|||||
= |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
||
|
|
|
K m + IS] |
|
K m + |
[S] |
|
|
|
|
|
|||||
6. Vmax = k2 [ES] = к Д |
|
|
|
|
|
|
|
|||||||||
7. Km = |
|
f V |
— |
- 1 ^ |
|
|
|
|
|
|
|
|||||
|
[S] ^ |
------j |
|
|
|
|
|
|
|
|||||||
8- Km = |
[S] |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|||
9. v = |
Vm ax |
|
IS] |
|
|
|
|
|
|
|
|
|||||
|
И |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|||||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
1 |
= |
Km + |
[S] |
= |
|
K m |
|
|
[S] |
|
|||||
10, — |
|
|
|
|
|
|
|
+ -------- |
|
|||||||
|
V |
|
|
V |
|
[S] |
|
|
V |
|
[S] |
V |
|
[S] |
||
|
|
|
|
|
m ax L J |
|
|
|
m ax L J |
|
|
m ax L J |
||||
|
1 |
|
|
1 |
|
К |
|
|
|
1 |
|
|
|
|
|
|
10. — |
= |
7--------+ — — |
• |
— |
|
|
|
|
|
|||||||
|
V |
|
|
V |
m ax |
|
V |
m ax |
|
[S] |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
L |
J |
|
|
|
|
|
Преобразуя уравнение 2, получаем выражение, правый член которого содержит только значения констант скорости (уравнение 3). Их соотношение
впредставленном виде — константы Михаэлиса:
Ц+ Ц
К= ------------
k-i
Как видно из левого члена уравнения 3, Km выражена через произведение концентрации свободного фермента на концентрацию субстрата, отнесенную к концентрации связанной формы фермента. Скорость образования продукта реакции описывается уравнением 4. Подставив в него значение [Es] из уравнения 3, получаем уравнение 5. Так как Vm достигается при концентрации, насыщаю щей все молекулы фермента, ([EJ = [ES].
Следовательно, справедливо уравнение 6. Подставив значение Vmax из уравнения б в уравнение 5, получаем уравнение 7 для константы Михаэлиса. Из этого уравнения следует, что Km может быть рассчитана, если известна
концентрация субстрата, начальная и максимальная скорость реакции, т.е. величины, доступные экспериментальному исследованию.
Если скорость реакции равна половине максимальной V = V2Vmax, то уравнение
7 преобразуется в уравнение 8, из которого следует, что Кт имеет размернность
концентрации субстрата.
Скорость реакции выражается уравнением 9 (уравнение МихаэлисаМентена), которое может быть преобразовано в уравнение 10, затем в 11.
Уравнение 11 (уравнение Лайнуивера-Бэрка) описывает прямолинейную зави симость (у = а + Ьх), где у — величина, обратная скорости (І/v), а — величина, обратная 1/ ^ пшх, b равно отношению Km/V max, т.е. тангенсу угла наклона прямой, х равен величине, обратной концентрации субстрата (1/[S]).
Из уравнения Михаэлиса-Ментена (уравнение 9) следует, что если концентра-
ция субстрата точно равна значению скоростй (V), составляющему ‘/ 2^ 1пах, то [S]/ (Km + [S]) = 1/2 (из уравнений 10 и 11).
Таким образом, величина константы МихаэЛиса равна той концентрации
субстрата, при которой скорость реакции равна половине максимальной.
Из уравнения Лайнуивера-Бэрка следует, что при графическом изображе нии зависимости обратных величин (начальной скорости ферментативной реакции от концентрации субстрата) будет получена прямая линия (рис. 23).
Продолжение этой прямой влево пересечет ось ординат в точке 1/V max и ось абсцисс в точке 1/Km. При изображении экспериментальных данных в указанных координатах можно найти значения максимальной скорости и константы Миха элиса. Отношение константы Михаэлиса к максимальной скорости определяется тангенсом угла наклона экспериментальной прямой к абсциссе.
Значения константы Михаэлиса изменяются в широких пределах: от 10“б м оля/л для очень активных до 10'2 — для малоактивных ферментов. При высоком значении Km можно заключить, что фермент проявит в клетке достаточную активность лишь при высокой концентрации субстрата.
3.1.5. Ферментативные эффекторы
Эффекторы — химические соединения, которые тормозят (ингибиторы) или ускоряют (активаторы) ферментативные реакции. Эти соединения — регуляторы метаболизма в организме, их использование в исследовательской работе позволяет получать данные о механизме действия ферментов.
Ингибиторы в зависимости от механизма торможения ферментативной реак-
Рис. 23. График в координатах Лайнуивера-Бэрка пересекает ось ординат в точке l / V Max, ось абсцисс — в точке 1/ К т , тангенс угла наклона графика к оси абсцисс -К / V
m ' |
m ax |
ции можно разделить на конкурентные и неконкурентные.
Конкурентные ингибиторы представлены соединениями, структура которых сходна со структурой субстрата. Эго позволяет им связываться с активным центром фермента, причем степень их сродства к ферменту может быть как выше, так и ниже сродства между ферментом и субстратом.
Реакция в присутствии ингибитора (I) протекает следующим образом:
1) |
Е |
+ |
S ^ |
ES |
— Е + Р; |
2) |
Е |
+ |
I <=-~- |
EI |
|
Как видно из уравнения, часть молекул фермента занята в реакции с ингибитором. Это снижает концентрацию свободного фермента, а следователь но, снижает и скорость ферментативной реакции.
Результат действия конкурентного ингибитора четко проявляется при гра фическом изображении зависимости максимальной скорости реакции (V ) от концентрации субстрата [S] (рис. 24).
Анализ графика свидетельствует, что максимальная скорость ферментатив ной реакции без ингибитора (черная линия) такая же, как и при добавлении малого или большого количества ингибитора (кривые а и б соответственно). Наклон кривых в присутствии ингибитора увеличивается, в результате чего увеличивается значение константы Михаэлиса. Пользуясь кривой М ихаэлиса (рис. 24), можно по результатам эксперимента установить конкурентную природу ингибитора (по стабильности V и увеличению К т ).
Характер этой кривой свидетельствует и об обратимости ингибирования: увеличивая концентрацию субстрата, можно сократить время достижения максимальной скорости реакции.
Конкурентные ингибиторы — многие соединения. Например, малоновая кислота (ингибитор сукцинатдегидрогеназы) напоминает субстрат этого ф ер мента — янтарную кислоту; четвертичные аммониевые основания (ингибиторы холинэстеразы) подобны субстрату — ацетилхолину.
W . W . W W. . . . . «
а |
ь*” |
[S1 |
b |
|
Рис. 24. Конкурентное ингибирование (зависимость V max от (S). Небольшое (а) и большое (Ь) количество ингибитора не изменяет максимальной скорости, но эта скорость достигается при больших концентрациях субстрата. Кт , найденная через 1 /2 V max, тем больше, чем больше ингибитора.
Некоторые конкурентные ингибиторы образуются в процессе обмена ве ществ: аналоги аминокислот, пуриновых и пиримидиновых оснований. Такие соединения — конкуренты природных субстратов, их называют антиметабо литами. Антиметаболиты тормозят в организме определенные метаболические процессы, в связи с чем их используют в медицинской практике при лечении злокачественных образований (аналоги пуринов и пиримидинов блокируют превращение этих соединений, ведущих к синтезу ДНК, что задерживает рост клетки). Аналоги парааминобензойной кислоты — сульфаниламиды — исполь зуют как антимикробное средство, так как они тормозят синтез фолиевой кислоты, необходимой для роста микроорганизмов.
Конкурентное ингибирование могут осуществлять и продукты ферментатив ной реакции (или цепи реакций). Например, глюкоза тормозит глюкозо-6- фосфатазу, которая катализирует гидролиз глюкозо-6-фосфата:
Глюкозо-6-фосфат + Н20 --------------- |
Глюкоза + Н3Р 0 4. |
Биологический смысл такого ингибирования — регуляция образования глюкозы. Если глюкоза накопилась в достаточном количестве и дальнейшее ее образование нецелесообразно, высокие концентрации глюкозы тормозят ее дальнейшее высвобождение из глюкозо-6-фосфата. Приведем пример тормо жения фермента продуктом, образующимся в результате длинноцепочной реакции. Продукт Р расщепляет энзим Е до продукта Р , а Рр в свою очередь,
— энзимом Ej до продукта Р2 и т.д. до продукта Рп — конкурентного ингибитора энзима Е. Благодаря этому при избыточном образовании продукта Рп первая реакция, с которой начинается его образование, тормозится.
Неконкурентные ингибиторы присоединяются к ферменту вне активного центра. В связи с этим избыток субстрата не снимает торможения, а наряду с начальной скоростью реакции снижается и максимальная, тогда как сродство фермента к субстрату, т.е. Кш, не изменяется.
[S]
Рис. 25. Неконкурентное ингибирование. Меньшие (а) и большие (в) количес тва ингибитора снижают начальную и максимальную скорость ферментативной реакции, протекающей без ингибитора (с). Константа Михаэлиса во всех опытах одинакова.