Добавил:
Опубликованный материал нарушает ваши авторские права? Сообщите нам.
Вуз: Предмет: Файл:

БХ Экзамен 2021

.pdf
Скачиваний:
7
Добавлен:
02.07.2023
Размер:
11.44 Mб
Скачать

21.КЛАССИФИКАЦИЯ И НОМЕНКЛАТУРА ФЕРМЕНТОВ. ИЗОФЕРМЕНТЫ. ЕДИНИЦЫ ИЗМЕРЕНИЯ АКТИВНОСТИ И КОЛИЧЕСТВА ФЕРМЕНТОВ.

КЛАССИФИКАЦИЯ

1.по химическому строению:

алифатические (липоевая кислота);

ароматические (коэнзим Q – убихинон);

гетероциклические (тиаминпирофосфат, биотин-кофермент, пи-ридоксальфосфат);

нуклеотидные (ФМН и ФАД, НАД и НАДФ, КоА, АТФ, ЦТФ, УТФ, УДФГК, ФАФС).

2.по функциям:

переносчики электронов и протонов (липоевая кислота, ФМН, ФАД, НАД, НАДФ, коэнзим Q);

переносчики групп (ТПФ, ПФ, ТГФК, КоА, биотин-кофермент);

коферменты синтеза и изомеризации (АТФ, биотин-кофермент, коферментные формы В12, КоА).

3.по механизму действия:

с высоким потенциалом переноса энергии (переносчики энергии – АТФ);

коферменты, участвующие в окислительно-восстановительных реакциях (липоевая кислота, коэнзим Q, ФМН, ФАД, НАД, НАДФ);

коферменты, формирующие активный центр фермента (все ви-таминсодержащие коферменты).

4.по скорости синтеза

Конститутивные (синтезиртся клетками с постоянной скоростью и постоянно присутствующие в клетках

Индуцируемые (адаптивные) (скорость биосинтеза и количество которых изменяется в зависимости от функционального состояния организма, характера питания, условий внешней среды)

Онтогенез: отмечается разнообразие возрастных изменений индукции ферментов. Разные периоды индукции определяют необходимость синтеза определенных ферментов. Фактор, меняющий метаболизм детского организмаизменение условий питания (характер пищи). Например, на рационе, содержащем много белка в пище, наблюдается увеличение активности ферментов, синтезирующих мочевину и превращение аминокислот.

НОМЕНКЛАТУРА

1.Тривиальные названия ферментов (пепсин, трипсин, химотрипсин).

2.Рабочее: по типу катализируемой реакции (дегидрирование – дегидрогеназа, карбоксилирование – карбоксилаза).

3.Систематическое название (международная классификациия): 1972 г

Название субстрата + суффикс –аза

ИЗОФЕРМЕНТЫ -ферменты, катализирующие одну и ту же реакцию, но отличающиеся -по первичной структуре -локализованы в разных тканях

(Пр:, лактат: НАД+- оксидоредуктаза, ацетил-КоА: холин-О-ацетил-трансфераза; липиды – липаза, сахароза – сахараза)

Класс 1 – оксидоредуктазы,

Подкласс 1 – окисляет гидроксильную группу,

Подподкласс 1 – акцептором водорода является НАД: алкогольдегидрогеназа

КФ 1.1.1.1. – это оксидоредуктаза, действует на ОН-группу донора с НАД в качестве акцептора с первым порядковым номером в своем подподклассе;

Изоэнзимы отличаются сродством к субстрату, максимальной скоростью катализируемой реакции, чувствительностью к ингибиторам и активаторам, условиями работы (оптимум pH и температуры). Чаще всего -олигомерные белки и «собраны» из разных типов протомеров.

Например, димерный фермент креатинкиназа (КК) 3 изоферментными формы, составленные из двух типов субъединиц: M (англ. muscle – мышца) и B (англ. brain – мозг).(КК1) локализуется в головном мозге, (КК2) – по одной М- и В в миокарде,(КК3) специфична для скелетной мышцы.

КЛАССИФИКАЦИЯ

классы(6): – по типу катализируемой реакции подклассы – по природе атакуемой химической группы

подподклассы – по характеру атакуемой связи или по природе акцептора

1. ОКСИДОРЕДУКТАЗЫ– окислительно-восстановительные реакции(в основе

 

 

 

 

 

 

 

 

биологического окисления). Систематическое название -«донор-акцептор-

А

 

Н2 + В

 

 

А + В

 

Н2

 

 

 

 

 

 

 

 

 

оксидоредуктаза» (например, лактат:НАД+ оксидоредуктаза). -

 

 

 

 

 

 

 

 

- 22: дегидрогеназы, оксидазы, моно- и диоксигеназы, пероксидазы, каталазы, цитохромы

2. ТРАНСФЕРАЗЫ (от переносимой группы)–катализирующие межмолекулярный перенос атомов или функциональных групп (т.е. от донора к акцептору):

-9: аминотрансферазы, ацилтрансферазы, метилтрансферазы

3. ГИДРОЛАЗЫ (по типу гидролизуемой связи) гидролиз (расщепление химической связи с присоединением воды в ионной форме по месту разрыва):

-13:– пептидазы, фосфатазы, эстеразы (гидролизуют сложноэфирные связи), гликозидазы

4. ЛИАЗЫ негидролитический разрыв химических связей (С О, С С, C N и других

А

В + а-в

 

А

 

В

связей), обратимые реакции отщепления различных групп от субстратов

 

 

 

 

 

 

 

 

 

негидролитическим путем.

 

 

 

а

 

в

Эти реакции могут сопровождаться образованием двойной связи или присоединением групп к месту двойной связи.

-7 подклассов

5. ИЗОМЕРАЗЫ - реакции изомеризации, взаимопревращения оптических и геометрических изомеров, а также внутримолекулярный перенос групп (в этом случае они называются также «мутазы»).

-5 подклассов

6.ЛИГАЗЫ (синтетазы) –присоединение друг к другу 2 молекул с использованием АТФ (или нуклеозидтрифосфатов):

7.ТРАНСЛОКАЗЫ

ЕДИНИЦЫ ИЗМЕРЕНИЯ КОЛИЧЕСТВА И АКТИВНОСТИ ФЕРМЕНТОВ.

цис транс, DL

Содержание -глюкозооксидаза используется - содержание глюкозы в крови

-уреаза –определение концентрации мочевины липаза – липидов

Активность

–измерение скорости превращения субстрата в продукт, т.е. количество превращѐнного субстрата в единицу времени.

Типы единиц

1)Международная (стандартная) Единица активности – это количество фермента, которое катализирует превращение 1 мкмоля субстрата в минуту в оптимальных условиях:

2)Катал – количество фермента, которое катализирует превращение в оптимальных условиях 1 моля субстрата за одну секунду

3)Другие -активность протеиназ - «тирозиновые единицы»

-активность амилазы – в амилокластических

-активность аминотрансфераз – условных

22.КОФАКТОРЫ ФЕРМЕНТОВ: ИОНЫ МЕТАЛЛОВ И КОФЕРМЕНТЫ. КЛАССИФИКАЦИЯ КОФЕРМЕНТОВ. КОФЕРМЕНТНЫЕ ФУНКЦИИ ВИТАМИНОВ (НА ПРИМЕРЕ ВИТАМИНОВ В6, РР, В2).

КОФАКТОРЫ ФЕРМЕНТОВ: ИОНЫ МЕ

Алкогольдегидрогеназа,

Zn

карбоангидраза

 

 

 

Аргиназа, аминопептидаза

Mn

 

 

Дипептидаза

Co

 

 

Фосфатаза, фосфокиназа

Mg

 

 

Тирозиназа

Cu

 

 

Сукцинатдегидрогеназа

Fe

 

 

Ксантиноксидаза

Mo

 

 

Большинство ферментов для проявления ферментативной активности нуждается в низкомолекулярных органических соединениях небелковой природы (коферментах) и/или в ионах металлов (кофакторах).

Кофакторы выполняют функцию стабилизаторов молекулы субстрата, активного центра фермента и конформации белковой молекулы фермента, а именно третичной и четвертичной структур. В некоторых случаях ионы металла служат "мостиком" между ферментом и субстратом. Они выполняют функцию стабилизаторов активного центра, облегчая присоединение к нему субстрата и протекание химической реакции. В ряде случаев ион металла может способствовать присоединению кофермента. Перечисленные выше функции выполняют такие металлы, как Mg2+, Mn2+, Zn2+, Co2+, Мо2+. В отсутствие металла эти ферменты активностью не обладают. Такие ферменты получили название "металлоэнзимы".

Кофактор – небелковая часть ферментов, которая может быть:

-простетической группой, в том случае, когда она прочно связана с белковой частью (ионы металлов, гем и т.д.), и ее невозможно отделить от апофермента, не разрушив при этом фермент;

-коферментом, если связи с апоферментом непрочные, соединение белковой и небелковой частей происходит только на время биокатализа, и затем образованный комплекс легко разрушается.

E-Me-S

КОФЕРМЕНТ, локализуясь в каталитическом участке активного центра, принимает непосредственное участие в химической реакции, выступая в качестве акцептора и донора химических группировок, атомов, электронов. Кофермент может быть связан с белковой частью молекулы ковалентными и нековалентными связями. В первом случае он называется простетической группой (например, FAD, FMN, биотин, липоевая кислота). Вместе с тем известны примеры, когда кофермент

присоединяется к ферменту нековалентными связями настолько прочно, что не диссоциирует от белковой молекулы, например тиаминдифосфат. Во втором случае кофермент взаимодействует с ферментом только на время химической реакции и может рассматриваться в качестве второго субстрата. Примеры - NAD+, NADP+. Апофермент обеспечивает специфичность действия и отвечает за выбор типа химического превращения субстрата. Один и тот же кофермент, взаимодействуя с различными апоферментами, может участвовать в разных химических превращениях субстрата. Например, пиридоксальфосфат в зависимости от того, с каким апоферментом взаимодействует, участвует в реакциях трансаминирования или декарбоксилирования аминокислот.

Химическая природа коферментов, их функции в ферментативных реакциях чрезвычайно разнообразны. Традиционно к коферментам относят производные витаминов, хотя помимо них есть значительный класс небелковых соединений, принимающих участие в проявлении каталитической функции ферментов.

Ккоферментам относят следующие соединения:

производные витаминов;

гемы, входящие в состав цитохромов, каталазы, пероксидазы, гуанилатциклазы, NO-синтазы и являющиеся простетической группой ферментов;

нуклеотиды - доноры и акцепторы остатка фосфорной кислоты;

убихинон, или кофермент Q, участвующий в переносе электронов и протонов в ЦПЭ;

фосфоаденозилфосфосульфат, участвующий в переносе сульфата;

S-аденозилметионин (SAM) - донор метильной группы;

глутатион, участвующий в окислительно-восстановительных реакциях.

КОФЕРМЕНТНЫЕ ФУНКЦИИ ВИТАМИНОВ

Витамин В5 (РР) входит в состав кофермента НАД+ и НАДФ+, который принимает участие в ферментативных реакциях по последовательному механизму.

НАД- и НАДФ-зависимые дегидрогеназы обеспечивают отщепление двух атомов водорода (2Н++ 2е) от окисляемого субстрата в окислительно-восстановительных реакциях энергетического обмена.

Ферменты, содержащие НАД и НАДФ участвуют в реакциях:

синтеза и окисления карбоновых кислот, холестерола;

обмена глутаминовой кислоты и других аминокислот

обмена углеводов: пентозофосфатный путь, гликолиз

окислительного декарбоксилирования пировиноградной кислоты

цикла трикарбоновых кислот.

Витамин В6 – пиридоксальфосфат (ПФ) и пиридоксаминфосфат

-кофермент аминотрансфераз, переносящих аминогруппы между аминокислотами и α- кетокислотами;

-кофермент декарбоксилаз, участвующих в отщепление карбоксильных групп аминокислот.

Витамин В2 – принимает участие в формировании кофактора ФАД и ФМН. Флавинадениндинуклеотид — кофактор, принимающий участие во многих окислительно-восстановительных биохимических процессах. FAD существует в двух формах — окисленной и восстановленной, его биохимическая функция, как правило, заключается в переходе между этими формами. FAD может быть восстановлен до FADH2, при этом он принимает два атома водорода. Молекула FADH2 является переносчиком энергии и восстановленный кофермент может быть использован как субстрат в реакции окислительного фосфорилирования вмитохондрии.

Коферменты ФМН и ФАД входят в состав

оксидоредуктаз:

-дегидрогеназы обеспечивают

отщепление двух атомов водорода (2Н+ + 2е-) от окисляемого субстрата в окислительно-восстановительных реакциях энергетического обмена;

-окисидазы катализируют окисление субстратов с участием молекулярного кислорода.

23.ИНГИБИТОРЫ ФЕРМЕНТОВ. ОБРАТИМОЕ И НЕОБРАТИМОЕ ИНГИБИРОВАНИЕ. КОНКУРЕНТНОЕ ИНГИБИРОВАНИЕ. ЛЕКАРСТВЕННЫЕ ПРЕПАРАТЫ КАК ИНГИБИТОРЫ ФЕРМЕНТОВ.

ИНГИБИТОРЫ (снижают скорость реакции)

По прочности соединения ингибитора с ферментом

Обратимые ингибиторы –соединения, которые нековалентно взаимодействуют с ферментом и отщепляются от фермента.

Необратимые ингибиторы – соединения, которые образуют ковалентные, прочные связи с ферментом.

Специфическое--ингибиторы тормозят действие определенных ферментов, связывая отдельные функциональные группы активного центра. (Например, тиоловые яды ингибируют ферменты, в активный центр которых входят SН-группы; угарный газ (СО) ингибирует ферменты, имеющие в активном центре

Fe²+)

Неспецифические--ингибиторы тормозят действие всех ферментов. К ним относятся все

денатурирующие факторы (высокая температура, кислоты, соли тяжелых ме) По механизму действия:

1)Конкурентное ингибирование

-ингибитор имеет структурное сходство с субстратом и конкурирует с ним за место в активном центре фермента→уменьшение связывания субстрата с ферментом и нарушение катализа

-возможность усилить или ослабить ингибирование путѐм изменения концентраций субстрата и ингибитора

Клиника: многие лекарственные средства являются конкурентными ингибиторами ферментов.

2)Неконкурентное ингибирование

-вызывается веществами, не имеющими структурного сходства с субстратом.

-неконкурентные ингибиторы взаимодействуют с функциональными группами белка-фермента или в самом активном центре («выключая» активный центр – А), или вне активного центра (приводя к изменению конформации активного центра – В).

-образуются прочные ковалентные связи, что является причиной необратимости неконкурентного ингибирования.

степень ингибирования не зависит от концентрации субстрата;

ингибирование необратимо;

ингибирование наступает при малых количествах ингибитора Ингибиторы:

соли тяжѐлых металлов (вызывают денатурацию белка и разрушение АЦ – неспецифическое ингибирование)

яды (цианиды связываются с активным центром цитохром-оксидазы и нарушают образование АТФ)

фосфорорганические вещества, пестициды, инсектициды (ДФФ – диизопропилфторфосфат прочно и необратимо связывается с гидроксигруппой серина в активном центре фермента ацетилхолинэстеразы, гидролизующей ацетилхолин в нервных синапсах);

боевые отравляющие вещества (зарин, зоман, табун – ингибиторы холинэстеразы).

Клиника: ацетилсалициловая кислота (аспирин) ингибирует циклооксигеназу – ключевой фермент синтеза простагландинов – веществ, вызывающих повышение температуры и болевой синдром при воспалениях. Эта кислота входит в состав средств, использующихся при воспалительных заболеваниях и лихорадочных состояниях. Пенициллин необратимо влияет на фермент транспептидазу, нарушая образование клеточной стенки бактерий.

3)Бесконкурентное ингибирование

-торможение ферментативной реакции, вызванное присоединением ингибитора только к комплексу фермент-субстрат с образованием тупикового продукта ESI.

-ингибитор вызывает такие конформационные изменения фермента, которые не дают возможности превращать субстрат в продукт реакции.

-снижена скорость реакции

4)Субстратное ингибирование – ингибирование избытком субстрата.

-между молекулами субстрата происходит своеобразная конкуренция за место в активном центре, в результате чего скорость реакции снижается

-ингибирование обратимо

5)Аллостерическое ингибирование.

-ингибиторы связываются с отдельными участками фермента вне активного центра.

-конформационные изменения в молекуле фермента, которые приводят к уменьшению его активности

ЛЕКАРСТВЕННЫЕ ПРЕПАРАТЫ КАК ИНГИБИТОРЫ ФЕРМЕНТОВ

аллостерический

центр

сульфаниламиды – структурные аналоги парааминобензойной кислоты (фрагмента фолиевой кислоты, витамина В9) используют для лечения бактериальных инфекций;

ловастатин – ингибитор синтеза холестерина (ингибирует ГМГ-S-КоА-редуктазу);

дикумарол и варфарин – антикоагулянты, конкуренты витамина К;

аллопуринол – средство для лечения подагры (ингибирует ксантиноксидазу);

этиловый спирт – может быть использован при отравлении метанолом (как антидот), так как между этими спиртами происходит конкуренция за активный центр алкогольдегидрогеназы.

средство для лечения подагры аллопуринол, ингибирующий ксантиноксидазу.

24.РЕГУЛЯЦИЯ ДЕЙСТВИЯ ФЕРМЕНТОВ, ТИПЫ. РЕГУЛЯЦИЯ КОЛИЧЕСТВА И АКТИВНОСТИ ФЕРМЕНТОВ.

Эффекторы (модификаторы) -вещества, которые оказывают действие непосредственно на фермент, изменяя его активность

По направлению влияния -положительные (активаторы) -отрицательные (ингибиторы).

Активаторы (увеличивают скорость ферментативных реакций):

-неорганические вещества (ионы металлов; кислоты, например, Fe²+, Mg²+, Mn²+, Cu²+, Zn²+, АТФ, липоевая кислота, соляная – активатор пепсина; анионы, например, Сl – активатор амилазы);

-низкомолекулярные органические вещества (например, соли жѐлчных кислот, активирующие панкреатическую липазу);

-белки-ферменты

механизмы действия активаторов:

-служат «площадкой» для взаимодействия фермента и субстрата;

-повышают сродство фермента и субстрата;

-отщепляют ингибитор

Ферменты желудочно-кишечного тракта вырабатываются в виде неактивных форм – зимогенов., предохраняет клетки ЖКТ от самопереваривания

РЕГУЛЯЦИЯ ФЕРМЕНТАТИВНОЙ АКТИВНОСТИ.

Возможность регулировать активность ферментов в соответствии с потребностями клетки и целостного организма относится к важнейшим свойствам этих веществ. Ферменты должны работать со строго определѐнной активностью и в строго определѐнных направлениях.

I.Компонентами самой клетки (температурой, рН, количеством субстрата, компартментализацией ферментов, наличием транспортных систем, наличием эффекторов); компартментализация – это сосредоточение ферментов и их субстратов в одном компартменте (одной органелле) – в

эндоплазматическом ретикулуме, митохондриях, лизосомах, ядре, плазматической мембране и т.п.

II.Аллостерическая регуляция: многие ферменты наряду с активным (каталитическим) имеют дополнительный аллостерический центр, к которому присоединяется не субстрат, а эффектор – активатор или ингибитор. Этот центр называют также регуляторным, а ферменты, обладающие таким центром – аллостерическими, или регуляторными, ферментами. Обычно аллостерические ферменты построены из двух и более субъединиц: одни субъединицы содержат каталитический центр, другие имеют аллостерический центр и являются регуляторными.

III. Химическая модификация (ковалентная и нековалентная):

фосфорилирование и дефосфорилирование (ковалентная модификация) – один из наиболее распространенных способов регуляции активности ферментов. Такая модификация заключается в обратимом присоединении или отщеплении фосфорной кислоты. Фосфорилирование фермента происходит по остаткам серина и тирозина. Присоединение фосфорной кислоты к белку осуществляют ферменты протеинкиназы, отщепление – протеинфосфатазы. Ферменты могут быть активны как в фосфорилированном, так и в дефосфорилированном состоянии.

активация путем диссоциации-ассоциации характерна для олигомерных ферментов, состоящих из каталитических и регуляторных субъединиц. В отсутствии активатора субъединицы соединены таким образом, что каталитические протомеры не могут проявлять свою активность. Появление активатора приводит к диссоциации олигомера и активации фермента, при отщеплении модификатора регуляторные и каталитические субъединицы вновь объединяются (ассоциируют) в неактивный комплекс. Такая модификация не является ковалентной.

Процессы диссоциации-ассоциации и фосфорилирования-дефосфорилирования начинаются только при поступлении гормонального сигнала.

IV. Частичный протеолиз: отщепление пептида от неактивного предшественника, в результате чего формируется правильная конформация белка-фермента, и он переходит в активное состояние.

В регуляции метаболизма принимают участие несколько факторов.

1. Количество фермента в клетке, которое определяется двумя факторами:

скоростью синтеза; скоростью распада.

2. Доступность фермента и субстрата (например, при отсутствии инсулина глюкоза не может проникнуть в клетки, где находятся ферменты еѐ метаболизма).

3. Регуляция активности самого фермента: компонентами самой клетки (температурой, рН, количеством субстрата, компартментализацией ферментов, наличием транспортных систем, наличием эффекторов);

ТИПЫ ФЕРМЕНТОВ

конститутивные (ферменты жизнеобеспечения – энергетического обмена, синтеза нуклеиновых кислот, белков, липидов и т.д.)синтезируются с постоянной скоростью и с постоянной скоростью разрушаются;

индуцибельные (адаптивные) – ферменты, обеспечивающие выполнение специфических функций; синтез этих ферментов возрастает при наличии соответствующих стимулов (индукторов).

25.АЛЛОСТЕРИЧЕСКАЯ РЕГУЛЯЦИЯ АКТИВНОСТИ ФЕРМЕНТОВ, АЛЛОСТЕРИЧЕСКИЕ ИНГИБИТОРЫ И АКТИВАТОРЫ. КАТАЛИТИЧЕСКИЙ И РЕГУЛЯТОРНЫЙ ЦЕНТРЫ.

АЛЛОСТЕРИЧЕСКАЯ РЕГУЛЯЦИЯ;

-К аллостерическому центру присоединяется не субстрат, а эффектор

-Аллостерические ферменты построены из двух и более субъединиц: одни субъединицы содержат каталитический центр, другие имеют аллостерический центр(регуляторные).

-Присоединение эффектора к аллостерическому центру регуляторной субъединицы изменяет конформацию белка и, соответственно, активность каталитической субъединицы

-Регуляторы – исходные вещества и конечные продукты, а также вещества, участвующие в сопряжѐнных реакциях, поэтому

аллостерическую регуляцию часто называют саморегуляцией, Конечные продукты (иногда промежуточные метаболиты) – ингибиторы, исходные субстраты – активаторы.

АЛЛОСТЕРИЧЕСКИЕ ИНГИБИТОРЫ И АКТИВАТОРЫ

Вроли аллостерических регуляторов очень часто выступают компоненты самого биохимического процесса – исходные вещества и конечные продукты, а также вещества, участвующие в сопряженных реакциях, поэтому аллостерическую регуляцию часто называют саморегуляцией.

Вживом организме многие процессы протекают многостадийно, т.е. являются

«метаболическими цепями», или «метаболическими путями» (гликолиз, распад и синтез жирных кислот, холестерина и т.д.) или «метаболическими циклами» (цикл Кребса, цикл мочевинообразования). В таких многостадийных процессах часто имеется регуляторный фермент, от которого зависит скорость всего метаболического пути. Конечные продукты (иногда промежуточные метаболиты) – ингибиторы, исходные субстраты – активаторы.

Такой фермент обычно катализирует одну из начальных стадий, например, в процессе окисления глюкозы – гликолизе, протекающем в зависимости от условий в 10 или 11 стадий, регуляторным ферментом является фосфофруктокиназа, катализирующая третью реакцию. В окислительных процессах, протекающих с образованием энергии, аллостерическими ингибиторами часто является АТФ, а активатором – АДФ, АМФ и фосфорная кислота.

КАТАЛИТИЧЕСКИЙ ЦЕНТР

Активный(каталитический) центротносительно небольшой участок молекулы фермента,

-отвечающий за распознавание, связывание и превращение субстрата,

-расположен в узком гидрофобном углублении (щели) поверхности молекулы фермента, участвующий в катализе

-точная пространственная организация больших ансамблей, построенных из аминокислотных остатков

-образуется на уровне третичной структуры белка-фермента

при образовании вторичной, третичной структур аминокислотные остатки сближаются, формируя активный центр.

Активный центр включает субстратсвязывающий участок, который отвечает за специфическое комплементарное связывание субстрата, и каталитический участок непосредственного химического взаимодействия

У однокомпонентных -представлен ФГ аминокислот (мб расположен не в соседних участках п-п цепи, но сближаются при формировании функционально активной конформации фермента)

У двухкомпонентных - гетероатомы кофакторов+ФГ аминокислот

Вактивном центре выделяют два участка:

-связывающий (контактный, якорный) – отвечает за связывание и ориентацию субстрата в АЦ -каталитический –отвечает за осуществление реакции.

В активный центр сложных ферментов входит участок для связывания кофактора. Регуляторные (аллостерические) ферменты помимо активного центра имеют аллостерический центр. К аллостерическому центру могут присоединяться гормоны или продукты реакции→изменение структуры активного центра. Эти вещества называются аллостерическими эффекторами (модификаторами)-мб положительными (усиливают действие фермента) и отрицательными (блокируют действие фермента)

Теории конформации активного центра:

1. Теория Фишера (теория жѐсткой матрицы, «ключа и замка»): в ферменте существует полностью сформированный активный центр, в котором по принципу комплиментарности происходит взаимодействие фермента и субстрата

2. Теория Кошленда (теория индуцированного соответствия, «руки и перчатки»): в ферменте существует активный центр, который полностью формируется только при взаимодействии фермента и субстрата, т.е. «подстраивается» под субстрат

РЕГУЛЯТОРНЫЙ ЦЕНТР

Многие ферменты наряду с активным (каталитическим) имеют дополнительный аллостерический центр, к которому присоединяется не субстрат, а эффектор – активатор или ингибитор. Этот центр называют также

регуляторным, а ферменты, обладающие таким центром – аллостерическими, или регуляторными,

ферментами. Обычно аллостерические ферменты построены из двух и более субъединиц: одни субъединицы содержат каталитический центр, другие имеют аллостерический центр и являются регуляторными. Присоединение эффектора к аллостерическому центру регуляторной субъединицы изменяет конформацию белка и, соответственно, активность каталитической субъединицы.

ФЕРМЕНТАТИВНАЯ РЕАКЦИЯ

В организме химическая реакция протекает на определенном энергетическом уровне, при определённой энергии активации

-снижение энергию активации путем увеличения числа активированных молекул, которые становятся реакционными на более низком энергетическом уровне.

-субстрат (S) -вещество, химические превращения которого в продукт (Р) катализирует фермент (Е).

Стадии

I происходит сближение и ориентация, а также устанавливается индуцированное комплементарное соответствие между ферментом и субстратом, в результате образуется фермент-субстратный комплекс (ЕS).

II возникает напряжение и деформация субстрата, в результате чего происходит сдвиг электронной плотности, изменение степени поляризации, связи в молекуле субстрата деформируются и легко распадаются.

26.ЧЕТВЕРТИЧНАЯ СТРУКТУРА АЛЛОСТЕРИЧЕСКИХ ФЕРМЕНТОВ И КООПЕРАТИВНЫЕ ИЗМЕНЕНИЯ КОНФОРМАЦИИ ПРОТОМЕРОВ ФЕРМЕНТА.

ЧЕТВЕРТИЧНАЯ СТРУКТУРА АЛЛОСТЕРИЧЕСКИХ ФЕРМЕНТОВ

Все аллостерические ферменты и белки имеют полимерную или четверичную структуру. Это значит, что типичный аллостерический белок будет состоять из ряда отдельных белковых цепей или субъединиц, которые связаны друг с другом слабыми взаимодействиями типа водородных связей и гидрофобного взаимодействия. Полимерная структура – ключевое свойство для функции аллостерического белка.

КООПЕРАТИВНЫЕ ИЗМЕНЕНИЯ КОНФОРМАЦИИ ПРОТОМЕРОВ ФЕРМЕНТА

Аллостерические ферменты обладают свойством кооперативности: взаимодействие аллостерического эффектора с аллостерическим центром вызывает последовательное кооперативное изменение субъединиц, приводящее к изменению конформации активного центра и изменению сродства фермента к субстрату, что снижает или увеличивает каталитическую активность фермента.

27.КОВАЛЕНТНАЯ МОДИФИКАЦИЯ ФЕРМЕНТОВ КАК СПОСОБ РЕГУЛЯЦИИ АКТИВНОСТИ. РЕГУЛЯЦИЯ ПУТЕМ ФОСФОРИЛИРОВАНИЯ И ДЕФОСФОРИЛИРОВАНИЯ. УЧАСТИЕ ФЕРМЕНТОВ В ПРОВЕДЕНИИ ГОРМОНАЛЬНОГО СИГНАЛА В КЛЕТКУ.

КОВАЛЕНТНАЯ МОДИФИКАЦИЯ ФЕРМЕНТОВ

заключается в обратимом присоединении или отщеплении определенной группы, благодаря чему изменяется активность фермента. Чаще всего такой группой является фосфорная кислота, реже метильные и ацетильные группы.

РЕГУЛЯЦИЯ ПУТЕМ ФОСФОРИЛИРОВАНИЯ И ДЕФОСФОРИЛИРОВАНИЯ Фосфорилирование и дефосфорилирование (ковалентная модификация) – один из наиболее

распространенных способов регуляции активности ферментов. Такая модификация заключается в обратимом присоединении или отщеплении фосфорной кислоты. Фосфорилирование фермента происходит по остаткам серина и тирозина. Присоединение фосфорной кислоты к белку осуществляют ферменты протеинкиназы,

отщепление – протеинфосфатазы.

Ферменты могут быть активны как в фосфорилированном, так и в дефосфорилированном состоянии. Например, при фосфорилировании ферментов, участвующих в обмене гликогена, фермент распада гликогена (гликогенфосфорилаза) находится в активном состоянии, а фермент синтеза гликогена (гликогенсинтаза) – в неактивном.

УЧАСТИЕ ФЕРМЕНТОВ В ПРОВЕДЕНИИ ГОРМОНАЛЬНОГО СИГНАЛА В КЛЕТКУ У

1)осуществляется путем восприятия данного сигнала от сопрягающего белка и его дальнейшей передачи с последующей активацией; способствуют образованию вторичных посредников, так же участвующих в проведении сигнала (опосредованный механизм действия).

2)При взаимодействии гормона с рецептором происходит изменение конформации рецептора, что в свою

очередь сопровождается изменением структуры G-белка, вследствие этого фермент аденилатциклаза переходит в активное состояние.

3)Активированная при участии G-белка аденилатциклаза осуществляет гидролиз АТФ до цАМФ (выполняет функцию вторичного мессенджера).

4)цАМФ является аллостерическим активатором ферментов протеинкиназ, локализованных как в цитоплазме, так и в ядре клетки

5)Протеинкиназы фосфорилируют целый ряд белков, перенося на них остаток фосфорной кислоты от АТФ, что приводит к изменению конформации и активности белков. Они осуществляют:

фосфорилирование белков-ферментов, что в большинстве случаев приводит к их активации и, в отдельных случаях, к ингибированию.

фосфорилирование гистонов, входящих в состав хроматина, что активирует процессы транскрипции;

фосфорилирование рибосомальных белков, что активирует процессы трансляции, т.е. синтеза новых белков-ферментов.

28.РАЗЛИЧИЯ ФЕРМЕНТНОГО СОСТАВА ОРГАНОВ И ТКАНЕЙ. ОРГАНОСПЕЦИФИЧЕСКИЕ ФЕРМЕНТЫ. ИЗМЕНЕНИЕ ФЕРМЕНТОВ В ПРОЦЕССЕ ОНТОГЕНЕЗА.

РАЗЛИЧИЯ ФЕРМЕНТНОГО СОСТАВА ОРГАНОВ И ТКАНЕЙ ферменты жизнеобеспечения (одинаковые во всех клетках и участвующих в синтезе белков, ДНК и РНК, в

энергетическом обмене) и органоспецифические ферменты

ОРГАНОСПЕЦИФИЧЕСКИЕ ФЕРМЕНТЫ

– катализируют химические превращения, характерные только для одного или немногих органов. Такие ферменты особенно ценны в диагностике, поскольку, зная их место локализации и определив их повышенную активность, можно четко отграничить участок развития патологического процесса. а.

Органоспецифические ферменты:

секреторные (холинэстераза, церулоплазмин, про- и антикоагулянты);

индикаторные (ЛДГ, АЛТ, АСТ, ГлДГ, сукцинатДГ, малатДГ);

экскреторные (лейцинаминопептидаза, 5-нуклеотидаза, глюкоронидаза, глутаматтранспептидаза).

Лактатдегидрогеназа (ЛДГ) является тетрамером и состоит из субъединиц типа M (англ. muscle – мышца) и Н (англ. heart – сердце).

Существует пять типов ЛДГ с различным составом и локализацией.

ЛДГ 1 (Н4) и 2 (H3M1) присутствуют в тканях с аэробным обменом (миокард, мозг, корковый слой почек), обладают высоким сродством к молочной кислоте (лактату) и превращают его в пируват.

ЛДГ4 (H1M3) и ЛДГ5 (М4) находятся в тканях, склонных к анаэробному обмену (печень, скелетные мышцы, кожа, мозговой слой почек), обладают низким сродством к лактату и катализируют превращение пирувата в лактат.

ЛДГ3 (H2M2)-в тканях с промежуточным типом обмена (селезенка,

поджелудочная железа, надпочеч-ники, лимфатические узлы). Активность разных изоферментов ЛДГ в сыворотке крови имеет клинико-диагностическое значение

ИЗМЕНЕНИЕ ФЕРМЕНТОВ В ПРОЦЕССЕ ОНТОГЕНЕЗА

1)Внутриутробный период. Характеризуется высокой активностью ферментов синтеза белка, липидов, происходит увеличение массы организма. Плод находится в анаэробных условиях и для метаболизма характерно анаэробная направленность.

Основной источник энергии – жирные кислоты, поступающие из организма матери; ЖК также выполняют строительную функцию (фосфолипиды мембран), Активность липаз

Глюкоза утилизируется анаэробным путем (анаэробный гликолиз) и идет на развитие ЦНС.

У новорожденных - отсутствуют ферменты поджелудочной железы, но к двум годам жизни они уже синтезируются в адекватном количестве) и при болезнях (наследственные и вторичные энзимопатии).

2)Пренатальный период. Характеризуется изменением активности ферментов, происходит подготовка организма к пребыванию в аэробной среде. Изменяется спектр гемоглобина, уменьшается его сродство к кислороду, изменяется активность митохондриальных ферментов.

3)Грудной период. Потребность в глюкозе резко возрастает, она начинает утилизироваться аэробно, но примерно до двух лет основным источником энергии является все же липиды, причина –соматотропин.

4)Ранний дошкольный период. С 3-х до 5-и лет. В этот период клетки начинают питаться углеводами. Происходит стабилизация обмена и интенсивная миелизация нервных волокон.

5)Школьный и пубертантный период. Обмен веществ модулируется под действием половых гормонов.

6)Зрелый период. Происходит стабилизация массы тела, репродуктивного гомеостаза. После 35-40 лет основным источником энергии являются опять липиды, что связано с ослаблением чувствительности тканей к Гл и изменение гормонального фона: гиперстресс (увеличивается уровень гормонов) заставляет клетку работать на пределе, т. е. использовать в качестве энергии жиры.

29.ИЗМЕНЕНИЕ АКТИВНОСТИ ФЕРМЕНТОВ ПРИ БОЛЕЗНЯХ. ЭНЗИМОПАТИИ: НАСЛЕДСТВЕННЫЕ И ВТОРИЧНЫЕ. ПРОИСХОЖДЕНИЕ ФЕРМЕНТОВ КРОВИ И ЗНАЧЕНИЕ ИХ ОПРЕДЕЛЕНИЯ ПРИ БОЛЕЗНЯХ.

Энзимология -раздел биохимии, изучающий строение, механизм действия и молекулярную структуру ферментов, нарушение их функционирования, а также выделение, процессы биосинтеза ферментов и их практическое применение в неѐ входят энзимодиагностика и энзи-мотерапия.

ИЗМЕНЕНИЕ АКТИВНОСТИ ФЕРМЕНТОВ ПРИ БОЛЕЗНЯХ

Клиническая энзимология = энзимодиагностика + энзимотерапия.

Энзимодиагностика – использование определения активности ферментов в диагностических целях. Практически любое заболевание сопровождается изменением ферментного спектра, поэтому определение активности ферментов – один из важнейших критериев для постановки диагноза и разработки тактики лечения. Как правило, для энзимодиагностики используют биологические жидкости – слюну, спинномозговую жидкость, и, чаще всего, кровь.

Поскольку все ферментативные процессы «привязаны» к определѐнным клеточным структурам, то нарушение локализации ферментов (компартментализации) приведѐт и к нарушению их функций.

В настоящее время для диагностики используют так называемый «диагностический ферментный спектр» – комплекс ферментов, изменения которых характерно для того или иного заболевания. Например, острые гепатиты характеризуются резким увеличением активности аланин- и аспартатаминотрансфераз и альдолазы. При механических желтухах характерным является нарастание содержания щелочной фосфатазы без большого увеличения активности аминотрансфераз и альдолазы

ПРОИСХОЖДЕНИЕ ФЕРМЕНТОВ КРОВИ И ЗНАЧЕНИЕ ИХ ОПРЕДЕЛЕНИЯ ПРИ БОЛЕЗНЯХ

Ферменты крови по происхождению:

1) собственные ферменты крови (синтезируются печенью для обеспечения функционирования крови – ферменты свѐртывающей, противосвѐртывающей, фибринолитической систем). Эти ферменты часто называют секреторными;

ферменты секретов и экскретов (попадающие в кровь из пищеварительных соков, жѐлчи и т.д.);

2) органспецифические (тканевые, индикаторные), синтезируемые клет-ками для собственных нужд, но в очень маленьком, строго постоян-ном количестве попадающие в кровь. Изменение их активности может свидетельствовать о нарушениях в тех или иных органах. Эти изменения могут носить различный характер:

повышение активности может быть результатом ускорения процессов синтеза (щелочная фосфатаза при рахите, гепатите), некроза клеток, понижения выведения, повышении проницаемости клеточных мембран;

снижение активности вызывается уменьшением числа клеток, секретирующих фермент (холинэстераза при циррозе печени), недостаточностью синтеза, увеличением выведения фермента, торможением активности (в результате действия протеиназ);

исчезновение фермента может быть вызвано некрозом ткани (при некрозе поджелудочной железы сначала активность ферментов в крови увеличивается, а затем падает до нуля).

ЭНЗИМОПАТИЯ (энзимопатология) – количественное или качественное нарушение ферментов, сопровождающееся болезнью. В большинстве случаев - приводят к снижению количества или активности ферментов→ нарушение метаболических процессов.

Первичные– заболевания, связанные с дефектом генетического аппарата и являющиеся наследственными

Вторичные(приобретенные) -возникают как следствие заболеваний органов, вирусных инфекций, токсических воздействий и т.п., что приводит к нарушению синтеза фермента или условий его работы, например,

гипераммониемия при заболеваниях печени, при которых ухудшается синтез мочевины и в крови накапливается аммиак, а при панкреатитах наблюдается уменьшение секреции пище-варительных ферментов и ухудшение пищеварения.

Пр:, ФКУ-фенилкетонурия – наследственная болезнь, связанная с отсутствием фенилаланинмонооксигеназы (фенилаланингидроксилазы), галактоземия – отсутствие ферментов метаболизма галактозы.

Соседние файлы в предмете Биохимия