Многочастичные потенциалы
Подобные потенциалы зависят от углов между связями. В системах с ковалентной связью потенциал взаимодействия должен моделировать наличие оптимальных валентных углов. Простейшим примером многочастичного взаимодействия является модель трехатомной молекулы, изображенная на рисунке.
Пунктирная дуга - пружина между связями N-O. |
Взаимодействие атомов в этой молекуле описывается с помощью трехчастичного потенциала и характеризуется двумя жесткостями: жесткостью связи N-O и жесткостью валентного угла. В металлических системах используют «модель погруженного атома»
. (40)
Первая сумма в (40) – т.н. «энергия погружения». Величина - электронная плотность в , создаваемая окружающими атомами.
Проблема применения многочастичных потенциалов
К сожалению, как правило, форма многочастичных потенциалов оказывается весьма сложной, а физический смысл входящих в них констант - туманным. Константы определяются из соответствия физическим свойствам моделируемых веществ, однако, при переходе от одной кристаллической структуры к другой (например, графит - алмаз) приходится полностью менять потенциал взаимодействия. Многочастичные потенциалы взаимодействия получили большое распространение и при описании молекулярных систем, однако, зачастую, этот подход оказывается сугубо эмпирическим, требующим подбора большого числа констант, справедливых только для данного конкретного соединения. Многочастичные потенциалы теряют физический смысл при диссоциации молекул и разрушении кристаллических решеток.
Численный метод
Алгоритмы интегрирования основаны на методах конечных разностей.
Здесь приведен в качестве примера т.н.скоростной алгоритм Верле, где положения, скорости и ускорения на шаге t вычисляются следующим образом:
,
.
Расчет термодинамических величин
Пусть мгновенное значение некоторой физической величины в момент
. (41)
Тогда ее среднее значение
, (42)
где пробегает шаги по времени до некоторого большого . Средняя потенциальная энергия в случае парных потенциалов
. (43)
Средняя кинетическая энергия равна
. (43)
Величина может испытывать небольшие флуктуации, обусловленными погрешностями при интегрировании уравнений движения
(обычно порядка или меньше от среднего значения). В реальных системах подобные флуктуации могут быть обусловлены квантовыми эффектами. Более точного сохранения энергии можно достичь уменьшением
величины . Рассмотрено МД моделирование микроканонического ансамбля ( -ансамбль), поэтому средние по времени будут соответствовать средним по ансамблю.