7. Определение конформации молекул.
Наибольшее
применение нашли два метода –
рентгеноструктурный
анализ для
кристаллических соединений и ядерный
магнитный резонанс для
соединений, находящихся в растворе.
Рентгеноструктурный
анализ третичной структуры белков
основан на дифракции рентгеновских
лучей на хорошо сформированных белковых
кристаллах. На основании дифракционных
картин рассчитывают распределение
электронной плотности в кристалле, а
по электронной плотности восстанавливают
пространственную структуру молекул
белка с атомным разрешением. В настоящее
время определены трехмерные структуры
сотен белков. Однако многие белки пока
нельзя изучить этим методом, поскольку
их не удается получить в виде хорошо
сформированных кристаллов достаточно
крупных размеров.
8. Синтез пептидов.
В лабораторных
условиях пептиды могут быть получены
разнообразными методами, общей чертой
которых является обязательная защита
в одной из реагирующих аминокислот
аминной, а в другой – карбоксильной
группы. При выборе блокирующего агента
руководствуются возможностью его
легкого отщепления без изменения
структуры пептида.
Наибольшую
известность приобрел метод твердофазного
синтеза пептидов Р.Меррифилда.
Карбоксигруппу исходной аминокислоты
защищают присоединением к полимеру, а
аминогруппу присоединяемой кислоты –
трет-изобутилоксикарбонильным (БОК)
радикалом.
Твердофазный
синтез удалось автоматизировать, в
результате появились автоматизированные
синтезаторы пептидов, которые с успехом
используются в промышленности и в
лабораторной практике.