БИОИНЖЕНЕРИЯ
.pdfМеханизм гидролиза фосфодиэфирной
связи с участием одного иона металла
Механизм гидролиза фосфодиэфирной
связи с участием двух ионов металла
Механизм гидролиза фосфодиэфирной
связи с участием трех ионов металла
РЕСТРИКТАЗЫ III ТИПА
•Специфично узнают неметилированные последовательности ДНК в непрямых повторах (5-6 пн) определенной ориентации и делают разрез на определенном расстоянии от одного из повторов (25-27 пн)
•В качестве ко-факторов требуют АФТ и Mg2+
•Состоят из двух субъединиц Res и Mod, в составе гомодимера M2 либо гетеродимера R2M2
•Известно порядка 140 систем рестрикции III типа
•Комплекс включает следующие активности: эндонуклеазную, метилтрансферазную и АТФазную
Сайт узнавания рестриктазой EcoP15I
Варианты системы рестрикции III типа
Доменная организация системы рестрикции III типа
Модель сборки системы рестрикции III типа
Модели разрезания ДНК системой рестрикции III типа
Хоминг-эндонуклеазы (мегануклеазы, эндонуклеазы генной конверсии)
•Узнают сайты ДНК длиной 12-40 пар
нуклеотидов
•Последовательность узнавания встречается крайне редко (от 0 до нескольких локусов –
например, I-SceI узнает один сайт на 13Mb генома дрожжей)
•Могут быть закодированы как в структуре белокодирующих генов, так и в межгенных участках
•Могут индуцировать гомологичную
рекомбинацию в различных типах клеток