Добавил:
Upload Опубликованный материал нарушает ваши авторские права? Сообщите нам.
Вуз: Предмет: Файл:

БИОИНЖЕНЕРИЯ

.pdf
Скачиваний:
123
Добавлен:
23.03.2016
Размер:
12.07 Mб
Скачать

LCR, ligase cycling

reaction

ВИЗУАЛИЗАЦИЯ ПРОЦЕССА ДОСТАВКИ РЕКОМБИНАНТНЫХ ДНК

Флуоресцентные метки

Флуоресценция – это излучение света веществом, которое поглотило свет.

Излучаемый свет имеет большую длину волны, чем поглощённый свет.

Сливание флуоресцентного белка с другим белком обычно не влияет на флуоресценцию первого.

Основное применение флуоресцентных белков:

Путем изменения интенсивности флуоресценции определять

уровень экспрессии (сила или специфичность промотора)

Сливая с интересующим белком, визуализировать его

локализацию

Основное применение флуоресцентных белков

Fusion tagging – присоединение флуоресцентного белка к N или C концу белка, для его пространственной и временной визуализации

Transcription Reporter – размещение гена флуоресцентного белка по исследуемый промотор с целью определения эффективности его работы

Förster resonance energy transfer (FRET) – используется для изучения взаимодействия двух белков. Для этого к каждому из белков пришиваются флуоресцентные белки с перекрывающимися спектрами поглощения\испускания света.

Split EGFP – используются для изучения взаимодействия двух белков. Для этого к каждому пришивается по половине флуоресцентного белка, который начинает светится, когда половины соединяются.

Cell marking/selection – ген, кодирующий флуоресцентный белок, вставляется в плазмиду (как под отдельным промотором, так и через 2A сайт или IRES), для маркирования процесса попадания плазмиды к клетку

Fluorescence-activated cell sorting (FACS) – флуоресцентная цитометрия,

основанная на разделении популяции клеток по наличию флуоресцентного белка

Purification – использование флуоресцентного белка в качестве эпитопа для очистки белка

Классификация флуоресцентных белков по спектру эмиссии

Цвет

Спектр

 

 

Blue

424 - 467 nm

 

 

Cyan

474 - 492 nm

 

 

Green

499 - 519 nm

 

 

Yellow

524 - 538 nm

 

 

Orange

559 - 572 nm

 

 

Red

574 - 610 nm

 

 

Far-Red

625 - 659 nm

 

 

Infra-Red

≥ 670 nm

 

 

Плазмидные таги (tags)

Направление белка в клеточные

компартменты

ЗАДАНИЕ

Линейную молекулу ДНК длиной 11250 пн обрабатывают отдельно рестриктазами А и В. Фрагменты разделяют электрофорезом.

Фермент А разрезал ДНК на 4 фрагмента размером 4725, 3150, 2250 и 1125 пн. Обработка рестриктазой В дала 3 фрагмента: 5625, 2925 и 2700 пн.

Для определения расположения сайтов рестрикции этих ферментов на следующем этапе применяют процедуру двойного расщепления – обрабатывают ДНК двумя рестриктазами. Обработка изучаемого фрагмента одновременно двумя рестриктазами дала 6 фрагментов:

4275, 2250, 1800, 1350, 1125, 450 пн.

Нарисуйте физическую карту линейной молекулы ДНК, обозначив длину фрагментов между сайтами узнавания рестриктаз в том порядке, в котором они реально располагаются.

Дополнительная информация:

Обработка каждого из 4-х А-фрагментов рестриктазой В дает следующую картину

4725 - 4275 и 450

3150 - 1800 и 1350

2250 - 2250 (изменений нет)

1125 - 1125 (изменений нет)

Обработка каждого из 3-х В-фрагментов рестриктазой А дает следующую картину

5625 - 4275 и 1350

2925 - 1800 и 1125

2700 - 2250 и 450

Соседние файлы в предмете [НЕСОРТИРОВАННОЕ]