- •Список сокращений
- •Характеристика Генетического аппарата бактерий
- •Бактериальная хромосома
- •Плазмиды
- •Мобильные генетические элементы
- •Размер геномов медицински значимых микроорганизмов
- •1. Гены «домашнего хозяйства»:
- •4 Рис 2. Структура плазмиды множественнойРезистентности. Кодируемого фенотипического эффекта:
- •Мобильные генетические элементы
- •Р Is элемент Транспозоны ис. 3. СтруктураIs элементов и транспозонов
- •Обмен генетической информации
- •Трансформация
- •Р ис. 4. Каналы для поступления днк в процессе трансформации
- •Трансдукция
- •Конъюгация
- •3. Перенос генов фактором f'
- •Мутации
- •1. По причинам возникновения: спонтанные и индуцированные.
- •Мутации
- •И трансверзии (а т, тг, гц, ца)
- •3. По направленности: прямые и обратные.
- •Выделение мутантов
- •Геномика
- •Генетическая инженерия
- •Некоторые Молекулярные Механизмы Патогенеза Инфекционных болезней: Секреторные системы микроорганизмов
- •I III II IV Первый тип секреторной системы
- •Второй тип секреторной системы
- •Третий тип секреторной системы
- •Четвертый тип секреторной системы
- •Пятый тип секреторной системы
- •Сравнительная характеристика наиболее изученных секреторных систем I, II, III типов
- •Островки патогенности
- •Основные свойства островков патогенности:
- •Р ис. 10. Строение островка патогенности
- •Детерминанты вирулентности, кодируемые оп
- •1. Факторы адгезии и колонизации
- •Островки патогенности грамположительных бактерий
- •Оп и кластеры патогенности грамположительных микроорганизмов
- •Двухкомпонентная сигнальная трансдукция
- •Кворум сенсины
- •Хронических и персистирующих инфекций Методы молекулярной диагностики
- •1. Изучении различий нуклеиновых кислот
- •2. Днк гибридизации
- •4. Других видах амплификации нуклеиновых кислот
- •Полимеразная цепная реакция
- •Ингредиенты пцр
- •Биочипы
- •Этапы постановки микроэррэй-эксперимента
- •Секвенирование
- •1. Метод ферментативного секвенирования (метод Сэнджера)
- •Этапы ферментативного секвенирования
- •2. Метод секвенирования путем химической деградации (по Максаму- Гилберту)
- •По Максаму- Гилберту
- •Этапы секвенирования путем химической деградации:
- •Полиморфизм рестрикционных фрагментов (пдрф анализ)
- •1 2 3 4 5 1 2 3 4 5
- •Эволюционный анализ (дендрограммы)
- •1. Кладограммы и филограммы.
- •2. Корневые и некорневые.
- •3. Масштабированные и немасштабированные дендрограммы
- •Литература
Рис. 9. Секреторные системы I,
II, III,
IV типов
I III II IV Первый тип секреторной системы
Первая секреторная система (ПТСС) состоит из трех компонентов: белка-порина в наружной мембране, белка слияния мембран (MFP – membrane fusion protein), АТФ-связывающей кассеты в цитоплазматической мембране (АВС). Белки ПТСС секретируются во внешнюю среду через канал, насквозь пронизывающий оболочки клетки, и потому они не попадают в периплазматическое пространство и не образуют периплазматическийинтермедиат.
Секретируемая молекула подходит к АТФ-связывающей кассете (АВС) в цитоплазматической мембране, и в ответ на это белок слияния мембран MFPсоединяетАТФ-связывающую кассету и белок-порин наружной мембраны, что приводит к образованиюнепрерывного канал, диссоциирующего только после прекращения секреции. Взаимодействие 3-х компонентов канала осуществляется без участия АТФ, но прохождение белка-эффектора по каналу требует затрат энергии.
Посредством этой системы E. coliсекретирует -гемолизин (HlyA),Erwinia spp.–металлопротеазу, Pasteurella haemolytica–лейкотоксин, Bordetella pertussis –аденилатциклазу.
Второй тип секреторной системы
Секреция белков с помощью второго типа секреторной системы (ВТСС) осуществляется в две стадии: сначала белок через цитоплазматическую мембрану попадает в периплазматическое пространство, и только из него через наружную мембрану транспортируется во внешнюю среду. Все белки, секретируемые ВТСС имеют сигнальный пептид наN-конце. На генетическом и структурном уровне компоненты второй секреторной системы проявляют сходство с фимбриямиIVтипа.
Располагающийся в цитоплазматической мембране канал ВТСС, состоит из АТФ-азы — secA,сигнальной пептидазы и нескольких белков SecD,SecE,SecF,SecG,SecY. Цитоплазматический шаперонSecВ транспортирует секретируемый белок к этому каналу. Сигнальная пептидаза отщепляет сигнальную последовательность в секретируемом белке,SecAрасщепляет АТФ, благодаря чему белок поступает в периплазматическое пространство, где под действием некоторых шаперонов претерпевает конформационные перестройки, необходимые для транспорта через наружную мембрану.
Транспорт через наружную мембрану требует взаимодействия 12-16 дополнительных белков: мономеры протеина D,или секретина, полимеризуются с образованием кольцевидного канала, который стабилизируется липопротеиномS. С помощью белка Е (киназы) происходит транслокация протеинов G-Kи сборка из них поверхностных пилеподобных структур, псевдопилей,сходных с фимбриями IVтипа. ПротеиныG-Kимеют N-концевые повторы, которые отщепляются протеином О или препилиновой пептидазой.
Посредством ВТСС K. oxytocaсекретирует разрушающий крахмал протеин (PulA,),V. cholerae-холеротоксин, P. aeruginosa–экзотоксин А, другие микроорганизмы – белки, разрушающие клеточные стенки
Третий тип секреторной системы
Отличие третьего типа секреторной системы (ТТСС) состоит в следующем: 1) она доставляет секретируемые белки прямо в клетку-мишень и потому ее называют инжектосомой - “injectosome”; 2)активация секреции происходит только при соприкосновении бактерии с клеткой-мишенью, и потому ТТСС относят к контактной секреции (описаны исключения).
Секреция белков-эффекторов происходит через шприцеподобную структуру, состоящую из 20 различных по структуре белков. При контакте с клеткой-мишенью белки полимеризиуются и образуют канал, пронизывающий насквозь внутреннюю и наружную мембраны, а на поверхности формируют длинную пилеподобную структуру. Шприцеподобный канал в области наружной мембраны стабилизируется кольцеподобной структурой с большой центральной порой. Когда инжектосома сформирована, секретируемый белок с сигнальным пептидом (20 аминокислот) на N-конце связывается с цитоплазматическим шапероном, транспортируется по каналу ТТСС и впрыскивается в клетку-мишень.
Кодирующие ТТСС гены способны к одновременной горизонтальной внутривидовой и межвидовой передаче. Посредством ТТССYersinia pestis, Salmonella enterica, Shigella flexneri, Escherichia coli, Chlamydia trachomatis секретируют белки, играющие ведущую роль в патогенезе вызываемых ими заболеваний.