Добавил:
kiopkiopkiop18@yandex.ru Вовсе не секретарь, но почту проверяю Опубликованный материал нарушает ваши авторские права? Сообщите нам.
Вуз: Предмет: Файл:

6 курс / Кардиология / Клинические_аспекты_вич_инфекции,_Джон_Бартлетт,_Джоел_Галант

.pdf
Скачиваний:
0
Добавлен:
24.03.2024
Размер:
6.16 Mб
Скачать

Клинические аспекты ВИЧ-инфекции

мал (Lancet 1992; 340:273; N Engl J Med 1993; 328:373; N Engl J Med 1993; 328:380; N Engl J Med 1993; 328:386; N Engl J Med 1993; 328:393; Clin Exp Immunol 1999; 116:322; Clin Infect Dis 2000; 3:E20; Clin Infect Dis 2001; 33: E125; Clin Infect Dis 2006; 42:e53). О случаях диагностики этого синдрома следует сообщать в местные органы здравоохранения (или органы здравоохранения штата), а не непосредственно в CDC, как предписывалось ранее.

Исследования вируса на резистентность

(см. N Engl J Med 2004; 350:1023)

Исследования штаммов ВИЧ, выделенных от получающих АРТ пациентов показали, что приблизительно в 50% случаев у вируса есть хотя бы одна основная («большая») мутация резистентности (Lancet 2002; 359:49; Nature Med 2001; 7:1016). По результатам исследований, проведенных в Северной Америке и Европе в 2000–2003 годах, распространенность вирусов с хотя бы одной основной мутацией резистентности среди недавно инфицированных пациентов, не получавших АРВ препараты, составляет 6–19%. Кроме того, продольные (лонгитудинальные) исследования показывают, что штаммы с мутациями резистентности, переданные при инфицировании, сохраняются в организме в течение более длительного времени, чем появившиеся на фоне терапии (Clin Infect Dis 2005; 41:233; Antivir Ther 2006; 11:173). Эти наблюдения стали основанием для текущей рекомендации проводить тестирование вируса на резистентность перед началом АРТ и подбирать схему АРТ с учетом результатов этого исследования (JAMA 2006; 296:827; клинические стандарты DHHS 2006 года, www.aidsinfo.nih.gov/guidelines). Тестирование вируса на рези-

стентность также обязательно при смене схемы АРТ из-за вирусологической неудачи лечения. На сегодняшний день можно выделить следующие недостатки методов исследования вирусной резистентности:

Тесты на резистентность выявляют только штаммы вируса, доминирующие на момент исследования. Резистентные штаммы, составляющие менее 20% от общей популяции вируса в крови, и штаммы, которые сохраняются в «скрытых резервуарах» (ЦНС, латентные клетки CD4, половой тракт и т.д.), не обнаруживаются.

Для проведения тестов на резистентность нужна достаточная вирусная нагрузка, не менее 500–1000 копий/мл. В настоящее время разработаны методы клонального анализа, позволяющие выявить мутации резистентности у недоминирующих штаммов, составляющих всего 0,1% от общего пула вирусов, однако они пока недоступны для клиницистов (J Acquir Immune Defic Syndr 2005; 40:24; J Infect Dis 2005; 192:1).

Результаты генотипирования бывает трудно интерпретировать, поскольку резистентность к антиретровирусным препаратам, за исключением ламивудина и ненуклеозидных ингибиторов обратной транскриптазы (ННИОТ), обеспечивается комбинацией из нескольких мутаций.

Результаты фенотипирования интерпретировать легче, поскольку они похожи на результаты исследований чувствительности бактерий к антибактериальным препаратам. Однако для интерпретации результатов фенотипирования часто используются произвольно установленные пороги чувствительности, особенно для некоторых усиливаемых ритонавиром препаратов; метод фенотипирования также менее чувствителен для выявления формирующейся резистентности.

28

medwedi.ru

2007 © Джон Бартлетт

Учитывая вышеперечисленные недостатки методов исследования вирусной резистентности, можно сделать следующие выводы:

 

Тесты на резистентность надежнее всего выявляют лекарствен-

 

 

ные препараты, к которым вирус устойчив, нежели препараты, ко-

 

 

торые с наибольшей вероятностью активны в отношении исследуемого

 

 

штамма вируса.

 

 

 

Результаты тестов на резистентность наиболее точны в отноше-

 

 

нии АРВ препаратов (или классов АРВ препаратов), которые па-

 

 

циент либо принимал на момент тестирования, либо прекратил

 

 

принимать незадолго до тестирования, поскольку после отмены АРТ

 

 

со временем снова появляется и размножается вирус дикого типа. По-

 

 

видимому, от момента прекращения АРТ до восстановления популяции

 

 

вируса дикого типа проходит не менее 4 недель, хотя этот период за-

 

 

висит от того, какие препараты входили в схему АРТ. Сообщалось об

 

 

исчезновении мутации 184V через 20 дней после прекращения терапии

 

 

(J Infect Dis 2005; 192:1537).

 

 

Интерпретация результатов тестов на резистентность у пациен-

 

 

тов, ранее принимавших антиретровирусные препараты, весьма

 

 

сложна по причине невозможности обнаружения штаммов, которые

 

 

сохраняются в «резервуарах» или составляют меньшинство в общей

 

 

популяции вируса в организме пациента. Поэтому при выборе схемы

 

 

лечения очень важно учитывать, какие АРВ препараты пациент прини-

 

 

мал в прошлом, и каковы были результаты предыдущих тестов на ре-

 

 

зистентность. Справедливость этого утверждения была подтверждена

 

 

результатами клинического испытания ACTG по протоколу 398, в кото-

 

 

ром у пациентов, в прошлом получавших эфавиренз, повторное назна-

 

 

чение эфавиренза оказалось неэффективным вопреки результатам

 

 

выполненных перед началом лечения тестов на резистентность, пока-

 

 

завших чувствительность вируса к ННИОТ. При секвенировании от-

 

 

дельных геномов были обнаружены мутации резистентности у вирусов,

 

 

составляющих меньшинство в общей популяции (Antivir Ther 2003;

 

 

8:S150).

 

 

 

Вирусная нагрузка для проведения теста на резистентность обыч-

 

 

но должна быть не менее 500–1000 копий/мл.

 

 

 

Предпочтительнее выполнять генотипирование, по крайней мере,

 

 

при тестировании вируса на резистентность для выбора начальной

 

 

схемы АРТ и в случаях рано обнаруживаемой вирусологической неэф-

 

 

фективности схем АРТ. Этот вывод сделан исходя из результатов кли-

инфекции

 

нических испытаний и более низкой стоимости. Относительные пре-

 

 

 

имущества и недостатки применяющихся методов исследований ви-

 

 

русной резистентности обсуждаются ниже (см. «Методы исследования

 

 

вирусной резистентности»).

 

ВИЧ-

Если интерпретация результатов исследования вируса на рези-

аспектыКлинические

 

стентность выполняется специалистом, то польза от такого ис-

 

следования намного выше.

 

 

 

 

 

2007 © Джон Бартлетт

29

 

Клинические аспекты ВИЧ-инфекции

Показания для проведения исследования вируса на резистентность

Клинические стандарты DHHS (http://www.aidsinfo.nih.gov/guidelines, 12 октября 2006 г.) и IAS-USA (http://www.iasusa.org; JAMA 2004; 292:251; Top HIVMed 2004; 12:119; Antivir Ther 2004; 9:829)

ВИРУСОЛОГИЧЕСКАЯ НЕЭФФЕКТИВНОСТЬ АРТ У ПАЦИЕНТОВ С ХРОНИЧЕСКОЙ ВИЧ-ИНФЕКЦИЕЙ

(Данное показание содержится практически во всех рекомендациях — см. таблицу 2.7)

В большинстве рекомендаций содержатся следующие показания для проведения теста на резистентность ВИЧ-инфицированным пациентам, получающим АРТ:

не удалось снизить вирусную нагрузку на >0,5–0,7 log10 копий/мл через 4 недели терапии;

не удалось снизить вирусную нагрузку на >1 log10 копий/мл через 8 недель терапии;

вирусная нагрузка >1000 копий/мл через 16–24 недель терапии.

Таблица 2.7. Сравнение показаний для проведения тестов на резистент-

ность (J Acquir Immune Defic Syndr 2001; 26:551)

 

Стадия ВИЧ-

Британская

 

Европейская

 

 

IAS-USA

 

 

USA-DHHS

 

 

 

 

 

 

 

 

 

инфекции

Ассоциация

 

Ассоциация**

 

 

 

 

 

 

 

 

 

по вопросам

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

ВИЧ*

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Острая ВИЧ-

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

инфекция

Рекомендуется

Рекомендуется

Рекомендуется

Рекомендуется

(в первые 6–12

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

месяцев после

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

инфицирования)

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Хроническая ВИЧ-инфекция

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Не получавшие АРТ

Рекомендуется

Индивидуально

Рекомендуется

Рекомендуется

Вирусологическая

Рекомендуется

Рекомендуется

Рекомендуется

Рекомендуется

неэффективность

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Только при наличии

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Беременность

Рекомендуется

Рекомендуется

Рекомендуется

показаний, приве-

 

 

 

 

 

 

 

 

 

денных выше

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

*HIV Med 2003; 4 (Suppl.1):1

**AIDS 2001; 15:309

Antivir Ther 2004; 9:829

http://www.aidsinfo.nih.gov, 1 сентября 2006 г.

ОЦЕНКА ПОЛЬЗЫ ОТ ПРОВЕДЕНИЯ ТЕСТОВ НА РЕЗИСТЕНТНОСТЬ.

Был проведен метаанализ научных статей и тезисов конференций, опубликованных вплоть до февраля 2001 года, в которых сравнивалась вирусологическая эффективность схем «спасения» (по результатам обследования через 3–6 месяцев после начала схемы), назначенных с учетом результатов теста на резистентность и назначенных без проведения теста на резистентность, тоmedwediесть на усмотрение.врачаru или в соответствии

30

2007 © Джон Бартлетт

со стандартными рекомендациями (HIV Clin Trials 2002; 3:1). Было выявлено умеренное, но статистически значимое преимущество генотипирования. При этом польза от генотипирования была значительно выше, если результаты исследования оценивались специалистом. Не было выявлено никакого значимого преимущества схем, подобранных с учетом фенотипирования, по сравнению со схемами, подобранными в соответствии со стандартными рекомендациями (следует отметить, что фенотипирование проводилось до введения ныне принятых порогов резистентности). Подавление репликации вируса через 6 месяцев после изменения схемы лечения произошло у 168 (39%) из 432 пациентов, у которых терапия была изменена на основании совокупных результатов генотипирования, и у 115 (29%) из 400 пациентов, у которых терапия была изменена в соответствии со стандартными рекомендациями. Во многих исследованиях было установлено преимущество только в ближайшем от начала терапии периоде (AIDS 2002; 16:369). Возможно, наиболее ценные результаты в отношении пользы тестирования на резистентность при неудаче лечения были получены благодаря исследова-

ниям TORO-1 и TORO-2 (N Engl J Med 2003; 348:2175 и 2293). В ходе этих исследований была показана сильная корреляция между количеством препаратов в получаемой пациентом схеме АРТ, к которым чувствителен вирус (по результатам генотипирования или фенотипирования) и вирусологическим ответом.

В рекомендациях IAS-USA сделаны следующие выводы: 1) и фенотипирование, и генотипирование позволяют подобрать схему терапии, которая обладает некоторыми преимуществами по крайней мере в ближайшем периоде от начала ее приема, однако эти преимущества трудно доказать; 2) польза от проведения генотипирования доказана более строго; 3) если результаты тестов на резистентность оценивает специалист, то польза от проведения исследования гораздо выше (Clin Infect Dis

2003; 17:37).

На сегодняшний день все тест-системы для исследования вирусной резистентности стандартизованы для ВИЧ подтипа B; возможности их применения для исследования штаммов ВИЧ других подтипов неизвест-

ны (Scand J Infect Dis 2003; 35[Suppl 106]:75).

ПРОЧИЕ

ПОКАЗАНИЯ

К

ПРОВЕДЕНИЮ

ТЕСТОВ

НА

 

РЕЗИСТЕНТНОСТЬ

 

 

 

 

 

Первичная ВИЧ-инфекция (большинство рекомендаций). Результа-

 

ты исследований резистентности штаммов ВИЧ, выделенных от не по-

 

лучавших АРВ препараты пациентов с острой ВИЧ-инфекцией, значи-

инфекции

тельно различаются в зависимости от времени и географии проведе-

ния исследования. В Соединенных Штатах распространенность рези-

 

стентных штаммов резко возросла в конце 90-х годов, затем стабили-

 

зировалась. Самое крупное исследование было проведено С. Литтлом

ВИЧ-

(S. Little) и соавт., оно включало 377 жителей США с острой ВИЧ-

 

инфекцией. Забор образцов биоматериала проводился с 1995 по 2000

аспекты

год. Распространенность резистентных штаммов (хотя бы к одному

 

препарату) по данным фенотипического анализа (IC50 для исследуемо-

 

го штамма/IC50 для вируса дикого типа >10) составила 3,4% среди об-

Клинические

разцов, взятых с 1995 по 1998 год, и 12,4% среди образцов, получен-

 

ных с 1999 по 2000 год. Генотипический анализ выявленных резистент-

 

ных штаммов показал, что в гене обратной транскриптазы наиболее

 

часто наблюдались мутации резистентности в кодонах 103, 118, 184 и

 

 

 

 

 

 

 

2007 © Джон Бартлетт

 

 

 

31

 

Клинические аспекты ВИЧ-инфекции

215; наиболее распространенными мутациями резистентности в гене протеазы были мутации в кодонах 82 и 90 (N Engl J Med 2002; 347:385). В течение пяти лет наблюдения в наибольшей степени увеличилась распространенность мутаций резистентности к ННИОТ — с 1,9% до 7,1%. Впоследствии та же группа исследователей не выявила существенного повышения распространенности резистентных штаммов среди недавно инфицированных пациентов в Соединенных Штатах (Antivir Ther 2002; 7:S188). По данным других исследователей, штаммы, обладающие резистентностью по крайней мере к препаратам одного класса, обнаруживаются у 10–12% недавно инфицированных пациентов. Эти показатели стабилизировались; близкие результаты были получены в Северной Америке и Европе (см. таблицу 2.8).

Исследование вируса на резистентность методом генотипирования пере началом АРТ в настоящее время включено в стандарты оказания медицинской помощи ВИЧ-инфицированным. Поскольку мутации резистентности, которые присутствовали в генотипе передавшихся при инфицировании вирусов, имеют свойство сохраняться в течение длительного времени, их (теоретически) следует учитывать при выборе начальной схемы АРТ. Сейчас получены по крайней мере предварительные данные, подтверждающие пользу от проведения тестов на резистентность перед началом АРТ (J Acquir Immune Defic Syndr 2006; 41:573; J Acquir Immune Defic Syndr 2004; 37:1665). Необходимо пом-

нить, что тесты на резистентность надежнее всего выявляют препараты, которые не следует включать в схему терапии. Например, пациентам, у которых перед началом АРТ выявлена резистентность вируса к ННИОТ, не следует назначать препараты этого класса.

Таблица 2.8. Результаты проведения тестов на резистентность пациентам с острой ВИЧ-инфекцией или недавно инфицированным

 

Источник

Годы

N

Любые

НИОТ

ННИОТ

ИП

 

 

 

 

 

мутации

 

 

 

 

CPCRA-US1

1999–2001

491

11,6%

7,8%

3,0%

0,7%

 

Европейская

2002–2003

1083

9,1%

5,4%

2,6%

3,0%

 

Комиссия2

 

 

 

 

 

 

 

 

Канада3

2000–2001

494

6,1%

3,1%

1,2%

1,2%

 

10 североамери-

1995–2001

377

11,6%

7,8%

3,0%

0,7%

 

канских городов4

 

 

 

 

 

 

 

Великобритания5

2002–2003

171

19,2%

12,4%

8,1%

6,6%

1.Clin Infect Dis 2005; 40:468; CPCRA-US (Community Programs for Clinical Research on AIDS) — Совместные програм-

мы проведения клинических исследований в области СПИДа.

2.Wensing, A. XVI Международная конференция по СПИДу, август 2006 года, тезисы TUAB 0101

3.J Acquir Immune Defic Syndr 2006; 42:86

4.N Engl J Med 2002; 347:385

5.BMJ 2005; 331:1368

Беременность. В некоторых руководствах содержится рекомендация проводить тесты на резистентность ВИЧ всем беременным, хотя целесообразность такой рекомендации в отношении беременных, не имеющих приведенных выше показаний, не установлена (см. таблицу 2.7).

medwedi.ru

32

2007 © Джон Бартлетт

Методы исследования резистентности (устойчивости) вируса: существует два метода: генотипирование и фенотипирование. Их сравнение приве-

дено в таблице 2.9 на стр. 35 (J Antimicrob Chemother 2004; 53:555).

ГЕНОТИПИРОВАНИЕ. Исследование генотипа вируса выявляет мутации, лежащие в основе фенотипической резистентности. Тестирование можно проводить с помощью готовых диагностических наборов (тест-систем) или полностью силами лаборатории. При проведении генотипирования одинаковых образцов с помощью двух тест-систем в одной и той же лаборатории результаты совпадали в 98% случаев (Antivir Ther 2000; 5 suppl 4:60; Antivir Ther 2000; suppl 3:53). По результатам другого исследо-

вания, частота ложноположительных результатов составила 0,3%, а ложноотрицательных — 6,4% (Antivir Ther 2001; 6 suppl 1:1). Методики генотипирования значительно отличаются по стоимости, количеству выявляемых мутаций, форме представления результатов и методике их интерпретации. Генотипирование включает следующие этапы: 1) амплификацию гена обратной транскриптазы (ОТ) и гена протеазы методом ОТПЦР; 2) секвенирование ампликонов ДНК, полученных от доминантных штаммов ВИЧ (выявляются только те мутации, которые есть у более 20% вирионов, присутствующих в плазме); 3) регистрацию мутаций для каждого гена с использованием стандарта «буква-число-буква», в котором первая буква означает аминокислоту, соответствующую данному кодону у вируса дикого типа, число — это номер кодона, а последняя буква — аминокислота, которая соответствует мутировавшему кодону. Таким образом, мутация гена обратной транскриптазы К103N означает, что последовательность нуклеотидов в кодоне 103 после мутации соответствует не лизину (К), как у вируса дикого типа, а аспарагину (N). В таблице 2.10 (стр. 36) приведены буквенные коды для всех аминокислот, используемые для описания мутаций при генотипировании. Для составления заключений по результатам генотипирования используют списки известных мутаций резистентности или компьютерные алгоритмы, основанные на наборах правил. Обновленную информацию, касающуюся проведения тестов на резистентность, можно найти на сайтах http://www.iasusa.org и http://www.hivdb.stanford.edu/. См. таблицы 2.11 (стр. 36–38), 2.12 (стр. 39), 2.13 (стр. 40), 2.14 (стр. 41–42), 2.15 (стр. 43).

ФЕНОТИПИРОВАНИЕ. При фенотипическом анализе оценивается способность ВИЧ к репликации при различных концентрациях лекарственных препаратов. Услуги по фенотипированию предлагают три коммерческие сети лабораторий; при сравнении результатов исследования одинаковых образцов, проведенных этими лабораториями, был установлен хороший уровень совпадения (конкордантности) результатов (Antivir Ther 2001; 6 suppl 1:129; Antivir Ther 2000; 5 suppl 3:49). Метод заключается в том, что гены обратной транскриптазы или протеазы, полученные путем амплификации из штамма ВИЧ, выделенного из крови пациента, встраивают в лабораторный штамм ВИЧ путем клонирования или рекомбинации. Оценивается скорость репликации вируса при разных концентрациях лекарственных препаратов и сравнивается со скоростью репликации вируса дикого типа (контроль). Эта методика похожа на классическое исследование микроорганизмов in vitro на чувствительность к антимикробным препаратам, когда микроорганизмы выращивают на средах, содержащих различные концентрации антимикробных препаратов. Чувствительность вируса к препарату оценивают по отношению IC50 (концентрации препарата, которая подавляет репликацию вируса на 50%) исследуемого штамма к IC50 контрольного штамма (вируса дикого типа). Раньше о резистентно-

2007 © Джон Бартлетт

33

Клинические аспекты ВИЧ-инфекции

Клинические аспекты ВИЧ-инфекции

сти судили исходя из вариабельности показателей чувствительности штамма дикого типа при различных исследованиях, но в настоящее время для интерпретации применяются либо биологические пороговые значения, основанные на нормальном распределении вируса дикого типа у пациентов, не получавших АРТ, либо клинические пороговые значения (для все большего числа АРВ препаратов), основанные на данных клинических испытаний.

ВИРТУАЛЬНОЕ ФЕНОТИПИРОВАНИЕ. Это моделирование фенотипа исследуемого штамма на основании анализа генотипа. Из банка данных, содержащего более 55 000 изолятов ВИЧ, выбираются штаммы с таким же или сходным профилем мутаций, и на основании результатов их фенотипирования делаются выводы о фенотипе исследуемого штамма. Приблизительно в 20% случаев результат получить не удается из-за отсутствия в банке данных достаточного количества пар «генотипфенотип», необходимых для виртуального фенотипирования исследуемого штамма (Antivir Therapy 2003; 8:S103). См. таблицу 2.15 на стр. 43.

ОТНОСИТЕЛЬНЫЕ ПРЕИМУЩЕСТВА КАЖДОГО МЕТОДА. Перед нача-

лом АРТ и в случаях рано обнаруживаемой вирусологической неэффективности назначенной схемы АРТ предпочтительнее выполнять генотипирование, поскольку на этих стадиях генотипы вирусов легче интерпретировать, генотипирование обладает большей чувствительностью в отношении обнаружения мутантных штаммов в смешанной популяции, содержащей значительное количество ВИЧ дикого типа, которая может присутствовать в крови пациентов, ранее не получавших АРТ. Кроме того, по данным клинических исследований, схемы, подобранные с учетом результатов генотипирования, превосходили схемы, назначенные в соответствии со стандартными рекомендациями (GART [AIDS 2000; 14:F83], VIRADAPT [Lancet 1999; 353:2195]; HAVANA [AIDS 2002; 16:209]),

а также схемы, подобранные с учетом результатов фенотипирования

(REALVIRFEN [Antivir Ther 2003; 8:577]; NARVAL [Antivir Ther 2003; 8:427]).

Генотипирование — более дешевый метод и, по-видимому, его применение в случаях вирусологической неэффективности первой или второй схемы АРТ экономически оправдано (Ann Intern Med 2001; 134:440; J Acquir Immune Defic Syndr 2000; 24:227). Пациентам с множественной резистентностью вируса к АРВ препаратам после вирусологической неэффективности нескольких схем терапии, по-видимому, предпочтительнее проводить фенотипирование вируса, в том числе в качестве дополнения к результатам генотипирования (клинические исследования

CERT [Clin Infect Dis 2004; 38:723] и TORO [N Engl J Med 2003; 348:2175]).

При фенотипировании получают количественные показатели, что дает возможность сравнить относительную чувствительность и резистентность вируса. Фенотипирование позволяет оценить результат взаимного влияния мутаций друг на друга и, возможно, по этой причине его предпочтительнее использовать для оценки чувствительности вируса к новым препаратам, для которых еще не установлены все нуклеотидные последовательности, коррелирующие с резистентностью к ним.

34

medwedi.ru

2007 © Джон Бартлетт

Таблица 2.9. Сравнительная характеристика генотипирования и фенотипирования

 

 

Генотипирование

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Преимущества

 

Недостатки

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Относительно низкая стоимость

 

• Выявляет резистентность только у

 

 

 

 

 

(300–480 долл. за тест)

 

 

преобладающих штаммов (>20%)

 

 

 

 

• Результаты готовы уже через 1–2 недели

 

Для интерпретации результатов

 

 

 

 

Метод достаточно стандартизован

 

 

требуется специальная подготовка

 

 

 

 

 

• Результат зависит от квалификации

 

 

 

 

Хорошая воспроизводимость результатов

 

 

 

 

 

 

 

лаборанта

 

 

 

 

Возможность виртуального фенотипиро-

 

• Алгоритм исследования может быть

 

 

 

 

 

вания*

 

 

неполным, особенно в отношении но-

 

 

 

 

• Метод более чувствителен в отношении

 

 

вых препаратов

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

формирующейся резистентности (при на-

 

• Результаты генотипирования могут не

 

 

 

 

 

личии смешанной популяции вируса)

 

 

совпадать с фенотипическими свойст-

 

 

 

 

• В ходе сравнительных исследований

 

 

вами вируса

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

было установлено преимущество схем

 

• Для проведения исследования вирус-

 

 

 

 

 

АРТ, подобранных с учетом генотипиро-

 

 

ная нагрузка должна превышать 500–

 

 

 

 

 

вания пациентам с вирусологической не-

 

 

1000 копий/мл

 

 

 

 

 

эффективностью первой или второй схе-

 

 

 

 

 

 

 

 

мы терапии

 

• Ограниченные данные по не-В-

 

 

 

 

 

 

 

 

подтипам ВИЧ

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Фенотипирование

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Преимущества

 

Недостатки

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

• Интерпретировать результаты проще и

Высокая стоимость (обычно 800–

 

 

 

 

 

привычнее

 

 

1000 долл.) Возмещение расходов может

 

 

 

 

• Оценивается суммарный эффект мутаций

 

 

быть ограничено

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

и их взаимодействий

• Для получения результатов требуется

 

 

 

 

• Не нужно знать, какие изменения генома

 

 

больше времени, чем при проведении

 

 

 

 

 

 

генотипирования

 

 

 

 

 

обеспечивают резистентность (преимуще-

 

 

 

 

 

 

 

 

ство при выявлении резистентности к но-

Пороговые значения чувствительности,

 

 

 

 

 

вым препаратам)

 

 

определяемые на основании результа-

 

 

 

 

Хорошая воспроизводимость результатов

 

 

тов клинических исследований, установ-

 

 

 

 

 

 

лены не для всех препаратов; пороговые

 

 

 

 

 

тельности к препаратам

 

 

значения, установленные для ИП, при

 

инфекции

 

 

 

 

 

отдельным препаратам, но не к комби-

 

 

 

Превосходит генотипирование при

 

 

усилении ритонавиром справедливы не

 

 

 

 

 

наличии множественных мутаций

 

 

во всех случаях

 

 

 

 

Дает количественную оценку чувстви-

• Выявляет резистентность только к

 

 

 

 

 

 

 

 

нациям

 

ВИЧ-

 

 

 

 

Выявляет резистентность только у

 

 

 

 

 

 

аспекты

 

 

 

 

 

 

преобладающих штаммов (>20%)

 

 

 

 

 

• Для проведения исследования вирусная

 

 

 

 

 

 

 

нагрузка должна превышать 500–1000

 

 

 

 

 

 

 

копий/мл

 

Клинические

 

 

 

 

 

 

 

 

 

* Виртуальное фенотипирование — быстрый, простой и недорогой метод, который можно рассматривать как

 

 

 

 

 

альтернативу фенотипированию; основной недостаток его состоит в том, что при отсутствии необходимой инфор-

 

 

 

 

мации в банке данных провести виртуальное фенотипирование не представляется возможным.

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

2007 © Джон Бартлетт

 

 

35

 

 

Клинические аспекты ВИЧ-инфекции

Таблица 2.10. Буквенные обозначения аминокислот*

 

A

 

Аланин

I

Изолейцин

R

Аргинин

 

C

 

Цитозин

 

K

 

Лизин

 

S

 

Серин

 

D

 

Аспарагиновая

 

L

 

Лейцин

 

T

 

Треонин

 

 

кислота

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

E

 

 

Глутаминовая

 

 

M

 

 

Метионин

 

 

V

 

 

Валин

 

 

 

 

кислота

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

F

 

Фенилаланин

 

N

Аспарагин

W

 

Триптофан

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

G

 

 

Глицин

 

 

P

 

 

Пролин

 

 

Y

 

 

Тирозин

 

 

H

 

Гистидин

 

Q

Глутамин

 

 

 

 

 

 

*Однобуквенные коды, используемые для описания генотипов.

Таблица 2.11. Мутации

резистентности (данные IAS-USA, с изменениями)

 

 

 

(Top HIV Med 2006; 14:125–130). Обновления см. на сайте

 

 

 

http://www.iasusa.org и в электронной базе данных мутаций ре-

 

 

 

зистентности ВИЧ к лекарственным препаратам Стэнфордского

 

 

 

университета, расположенной на сайте http://hivdb.stanford.edu

 

Препа-

 

Мутации*

 

Примечания

 

 

рат

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Нуклеозидные и нуклеотидные ингибиторы обратной транскриптазы (НИОТ)

AZT

41L, 67N, 70R,

Мутации резистентности к аналогам тимидина (МРАТ); они

 

210W, 215Y/F,

снижают чувствительность ко всем НИОТ. МРАТ нечасто соче-

 

219Q/E

таются с мутацией 65R. Наиболее часто встречающиеся МРАТ

 

 

— 41L, 210W и 215Y, которые в наибольшей степени снижают

 

 

чувствительность к НИОТ. Мутации 67N, 70R и 219Q/E также

 

 

снижают чувствительность к НИОТ, но в меньшей степени.

 

 

Мутации 184V, 65R и 74V увеличивают чувствительность вируса

 

 

к AZT. МРАТ вызывают гиперчувствительность вируса к ННИОТ.

 

 

Мутации 44D и 118I при наличии МРАТ усиливают резистент-

 

 

ность к НИОТ.

 

 

 

d4T

41L, 67N, 70R,

В большинстве случаев резистентность к d4T обусловлена МРАТ

 

210W, 215Y/F,

(см. AZT). Мутации 75T/M/A, обеспечивающие резистентность

 

219Q/E, 75T/M/A

только к d4T, встречаются нечасто.

 

 

 

3TC

65R, M184V/I

Мутация 184V/I обеспечивает резистентность к 3TC высокого

 

 

уровня и одновременно повышает чувствительность к AZT, d4T и

 

 

TDF, однако этот эффект может не проявиться при наличии

 

 

МРАТ. Эта мутация снижает чувствительность к ddl и ABC,

 

 

однако при наличии у вируса только мутации M184V/I это

 

 

снижение чувствительности не приводит к клинически значимым

 

 

последствиям. На фоне приема 3TC не происходит селекции

 

 

штаммов с мутациями 44D и 118I, но тем не менее эти мутации

 

 

вызывают умеренную резистентность к 3TC.

 

 

 

FTC

65R, M184V/I

Профиль резистентности идентичен или близок к ламивудину.

 

 

 

ddI

65R, 74V

МРАТ обеспечивают резистентность к ddI. Мутации 74V и 65R как

 

 

поодиночке, так и в сочетании с мутацией 184V/I вызывают

 

 

резистентность к ddI и перекрестную резистентность к ABC (74V,

 

 

65R) и TDF (65R).

 

 

 

ABC

65R, 74V, 115F,

Резистентность зависит от количества МРАТ и их сочетания.

 

184V

Мутация 184V/I сама по себе не вызывает клинически значимой

 

 

резистентности к ABC, но усугубляет снижение чувствительно-

 

 

сти, обусловленное МРАТ или специфическими мутациями

 

 

резистентности к ABC.

 

 

 

* Деление мутаций на первичные и вторичные для НИОТ и ННИОТ было отменено экспертным комитетом IASUSA; такая классификация мутаций оставлена для ИП, но теперь мутации подразделяются на основные

(«большие») и второстепенные («малые»).

medwedi.ru

36

2007 © Джон Бартлетт

Таблица 2.11. Мутации резистентности (продолжение)

Препарат Мутации* Примечания

Нуклеозидные и нуклеотидные ингибиторы обратной транскриптазы (НИОТ)

TDF

65R, 70E

 

Снижение чувствительности наблюдается при наличии мутации

 

 

 

65R или ≥3 МРАТ, включающих мутации 41L и 210W. Мутация

 

 

 

184V/I повышает чувствительность вируса к TDF, частично

 

 

 

уменьшая влияние мутаций 65R или МРАТ. Мутация 70E, также

 

 

 

снижающая чувствительность к TDF, обнаруживается нечасто.

 

 

 

 

 

 

 

Возникает нечасто на фоне приема схем АРТ, содержащих 3TC

Полирези-

151M плюс

стентность к

62V, 75I,

 

или FTC. Может сочетаться с МРАТ. «Комплекс мутаций 151M»

НИОТ —

77L, 116Y,

 

обеспечивает резистентность высокого уровня к AZT, d4T, ABC, и

комплекс

 

 

ddI, резистентность среднего уровня к TDF и резистентность

Q151M

 

 

низкого уровня к 3TC и FTC.

 

 

 

 

 

 

 

Возникает нечасто на фоне приема схем АРТ, содержащих 3TC

Полирези-

Инсерция

 

стентность к

69

 

или FTC. Обычно сочетается с МРАТ, обеспечивая резистентность

НИОТ —

 

 

высокого уровня ко всем НИОТ, включая TDF.

инсерция T69

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Наиболее частая причина полирезистентности к нуклеозидным

Полирези-

41L, 67N,

 

стентность к

70R, 210W,

 

аналогам. Селекция МРАТ происходит только на фоне приема

НИОТ —

215Y/F,

 

AZT и d4T. Мутации 44D и 118I дополнительно усиливают рези-

множествен-

219Q/E

 

стентность к НИОТ.

ные МРАТ

 

.

 

 

 

 

Ненуклеозидные ингибиторы обратной транскриптазы (ННИОТ)

 

 

NVP

100I, 103N,

 

При лечении невирапином (не в сочетании с зидовудином) чаще

 

 

 

 

 

106A/M,

 

всего появляется мутация 181C; при лечении зидовудином и

 

 

 

 

 

108I,

 

невирапином чаще всего возникает мутация 103N. Мутации 103N,

 

 

 

 

 

181C/I,

 

106M, 188L/C обеспечивают резистентность к NVP высокого

 

 

 

 

 

188C/L/H,

 

уровня. Мутация 188H вызывает резистентность к NVP низкого

 

 

 

 

 

190A

 

уровня.

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Некоторые мутации резистентности к ННИОТ (190A/S, 225)

 

 

 

DLV

103N,

 

 

 

106M,

 

снижают чувствительность к NVP и EFV, но при этом вызывают

 

 

 

 

181C, 188L,

 

повышение чувствительности к DLV (см. таблицу 2.13); клиниче-

 

 

 

 

236L

 

ская значимость этого феномена неясна.

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

На фоне лечения эфавирензом чаще всего закрепляется мутация

 

 

 

EFV

100I, 103N,

 

 

 

 

106M, 108I,

 

103N, которая вызывает резистентность к ННИОТ высокого

 

 

 

 

181C/I,

 

уровня. Мутации 188L и 106M также обеспечивают резистентность

 

 

 

 

188L,

 

к EFV высокого уровня. Хотя мутация 181C (и некоторые другие

 

 

 

 

190S/A,

 

мутации резистентности к ННИОТ) обеспечивают фенотипическую

 

 

 

 

225H

 

резистентность к EFV лишь низкого уровня, необходимо помнить,

 

 

 

 

 

 

что не преобладающие в популяции на момент исследования

 

 

 

 

 

 

штаммы вируса могут обладать другими мутациями резистентно-

 

 

 

 

 

 

сти к ННИОТ.

 

 

*

Деление мутаций на первичные и вторичные для НИОТ и ННИОТ было отменено экспертным комитетом IAS-

 

 

USA; такая классификация мутаций оставлена для ИП, но теперь мутации подразделяются на основные

 

 

(«большие») и второстепенные («малые»).

 

 

 

 

 

 

 

 

ВИЧ-инфекции

 

 

 

 

 

 

 

 

Клинические аспекты

 

 

 

 

 

 

 

 

 

2007 © Джон Бартлетт

37

 

 

 

Соседние файлы в папке Кардиология