- •Краткий курс лекций по биологической химии для студентов, обучающихся по специальности Педиатрия
- •Строение и функции белков
- •1.1. Содержание белков в организме человека
- •1.2. Биологические функции белков
- •1.3. Химический состав белков
- •1.3. 1. Элементарный состав белков
- •1.3.2. Аминокислотный состав белков
- •1.4. Виды связей аминокислот в белках
- •1. 5. Структурная организация белков
- •1. 5. 1. Первичная структура белков
- •1. 5. 2. Вторичная структура белков
- •1. 5. 3. Третичная структура белков
- •1.5.4. Четвертичная структура белков
- •1. 5. 5. Доменные белки
- •1. 6. Физико-химические свойства белков
- •1.6. 1. Растворимость белков
- •1. 6. 2. Молекулярная масса белков
- •1.6.3. Размеры и форма белковых молекул
- •1.6.4. Свойства белков, сходные со свойствами коллоидных растворов
- •1.6.5. Оптические свойства белковых растворов
- •1.6.6. Свойства белков как истинных растворов
- •1.6.6. 1. Заряд белковой молекулы
- •1.6.6.2. Формирование гидратной (водной) оболочки
- •1.7. Осаждение белков из растворов
- •1.8. Методы количественного определения белков
- •1.9. Выделение, фракционирование и очистка белков
- •1.10. Классификация белков
- •1.10.1. Простые белки (протеины)
- •1.10.2. Сложные белки (протеиды)
- •2. Структура, свойства и механизм действия ферментов
- •2.1. Краткая история ферментологии
- •2.2. Структура ферментов
- •2.3. Механизм действия ферментов
- •2.4. Номенклатура ферментов
- •2.5. Классификация ферментов
- •2.6. Свойства ферментов
- •2.6.1. Высокая каталитическая активность ферментов
- •2.6.2. Высокая специфичность ферментов
- •2.6.3. Термолябильность ферментов
- •2.6.4. Фотолябильность ферментов
- •2.6.5. Зависимость активности ферментов от рН.
- •2.6. 6. Зависимость скорости ферментативной реакции от концентрации фермента и концентрации субстрата
- •2.6.7. Зависимость скорости ферментативных реакций от присутствия активаторов и ингибиторов.
- •2.6.7.1. Влияние активаторов ферментов
- •2.6.7.2. Влияние ингибиторов ферментов
- •2.8. Регуляция активности ферментов в процессе метаболизма
- •2.9. Структурная организация ферментов в клетке
- •2.10. Принципы обнаружения и количественного определения ферментов:
- •2.10.1. Количественное определение ферментов
- •3. Введение в обмен веществ. Биохимия питания. Витамины
- •3.1. Общие сведения об обмене веществ
- •3.2. Биохимия питания
- •3.2.1. Краткая характеристика питательных веществ
- •3.3.4. Обмен витаминов
- •3.3.5. Краткая характеристика некоторых витаминов
- •3.4. Биохимические основы рационального вскармливания грудных детей
- •3.4.1. Химический состав грудного молока
- •Биологически активные компоненты грудного молока.
- •4. Биологическое окисление
- •4.1. Функции биологического окисления
- •4.2. Краткая история учения о биологическом окислении
- •4.3. Виды биологического окисления
- •4.4. Ферменты и коферменты биологического окисления
- •4.4.1. Никотинамидзависимые дегидрогеназы (над, надф-зависимые)
- •4.4.1.1. Витамин рр
- •4.4.2. Флавопротеиды (флавиновые дегидрогеназы)
- •4.4.2.1. Витамин в2
- •4.4.3. Убихинон (КоQ)
- •4.4.4. Цитохромы
- •4.4. 5. Оксигеназы
- •4.4.6. Пероксидазы
- •4.5. Внутримитохондриальное окисление
- •4.5.1. Длинная дыхательная цепь
- •4.5.2. Короткая дыхательная цепь
- •4.5.3. Окислительные комплексы и их ингибиторы
- •4.6. Энергетический обмен
- •5.6.1. Окислительное фосфолирирование
- •4.6.1. 1. Регуляция окислительного фосфолирирования
- •4.6.2. Особенности энергетического обмена у детей
- •4.6.3. Нарушение энергетического обмена.
- •4.7. Внемитохондриальное окисление
- •4.7.1. Окисление с участием оксидаз. Активные формы кислорода
- •4.7.2. Окисление с участием оксигеназ.
- •4.7.3. Пероксидазное окисление.
- •5. Общие пути катаболизма
- •5.1. Окислительное декарбоксилирование пировиноградной кислоты
- •5.1.1. Пируватдегидрогеназный комплекс
- •5.2. Цикл трикарбоновых кислот (цикл г. Кребса)
- •5.2.1. Химизм цикла Кребса (цикла трикарбоновых кислот)
- •5.2.2. Биологическое значение цикла Кребса
- •5.2.3. Регуляция активности цикла трикарбоновых кислот
- •6. Обмен и функции углеводов
- •6.1. Содержание углеводов в организме и их биологические функции
- •6.2. Классификация углеводов
- •6.2.1. Моносахариды и их производные
- •6.2.2. Олигосахариды
- •6.2.3. Полисахариды
- •6.2.3.1. Гомополисахариды
- •6.2.3.2. Гетерополисахариды (гликозаминогликаны)
- •6.2.3.3. Особенности содержания и обмена гликозаминогликанов и протеогликанов у детей.
- •6.3. Переваривание и всасывание углеводов
- •6.4.1. Биосинтез гликогена
- •6.4.2. Распад гликогена
- •6.5. Обмен глюкозы в тканях
- •6.5.1. Окисление глюкозы в тканях
- •6.5.1.1. Анаэробное окисление глюкозы
- •6.5.1.2. Аэробное окисление глюкозы
- •6.5. 2. Биосинтез глюкозы (глюконеогенез)
- •6.5.2.1. Витамин н
- •6.6. Пентозофосфатный путь окисления глюкозы
- •6.7. Утилизация фруктозы и её нарушения
- •6.8. Усвоение галактозы и его нарушения
- •6.9. Взаимные превращения углеводов (гексоз)
- •6.10. Особенности обмена глюкозы в различных тканях
- •6.11. Регуляция углеводного обмена
- •6.12. Патология углеводного обмена
- •6.12.1. Нарушение переваривания и всасывания углеводов
- •6.12.2. Нарушения содержания глюкозы в крови
- •6.12.3. Нарушения тканевого обмена углеводов
- •7. Обмен и функции липидов
- •7.1. Спиртовой и жирнокислотный состав основных липидов тканей человека
- •7.2. Классификация липидов
- •7.2.1. Глицеринсодержащие липиды
- •7.2.1.1. Триацилглицерины (таг)
- •7.2.1.2. Глицерофосфолипиды (фл)
- •7.2.2. Сфингозинсодержащие липиды
- •7.2.2.1. Сфингофосфолипиды (сфингомиелины)
- •7.2.2.2. Сфингогликолипиды
- •7.2.3. Холестеринсодержащие липиды
- •7.3. Содержание липидов в организме человека
- •7.4. Биологические функции липидов
- •7.5. Структура и функции клеточных мембран
- •7.6. Переваривание липидов
- •7.7. Всасывание продуктов расщепления липидов
- •7.8. Ресинтез липидов в слизистой тонкого кишечника
- •7.9. Особенности переваривания и всасывании липидов у детей
- •7.10. Транспорт липидов кровью
- •7.11. Обмен триацилглицеринов
- •7.11.1. Распад триацилглицеринов в тканях (липолиз)
- •7.11.1.1. Окисление жирных кислот.
- •Химизм β - окисления насыщенных жирных кислот
- •7.11.2.3. Синтез триацилглицеринов
- •7.12. Обмен глицерофосфолипидов
- •7.12.1. Синтез глицерофосфолипидов
- •7.12.2. Распад глицерофосфолипидов
- •7.13. Обмен сфинголипидов
- •7.13.1. Синтез сфинголипидов
- •7.13. 2. Распад сфинголипидов
- •7.14. Обмен холестерина
- •7.14.1. Биосинтез холестерина
- •7.14.2. Использование холестерина в тканях
- •7.14.3. Выведение холестерина из организма
- •7.14.4. Нарушение обмена холестерина
- •7.15. Взаимосвязь липидного и углеводного обменов
- •7.15.1. Ацетоновые тела
- •7.16. Регуляция липидного обмена
- •7.17. Патология липидного обмена
- •7.18. Перекисное окисление липидов (пол)
- •7.18.1. Витамин е
- •7.19. Эйкозаноиды
- •7.19.1. Синтез и краткая характеристика эйкозаноидов
- •8. Обмен белков и аминокислот
- •8.1. Общие сведения об азотистом обмене
- •8.2. Переваривание белков
- •8.3. Всасывание аминокислот
- •8.4. Гниение белков в толстом кишечнике
- •8.4.1. Обезвреживание продуктов гниения белков в печени
- •8.5. Динамическое состояние белков в тканях организма
- •8.5.1. Пути образования и использования аминокислот в тканях
- •8.6. Катаболизм аминогруппп аминокислот
- •8.6.1. Трансаминирование аминокислот
- •8.6.1.1. Витамин в6
- •8.6.2. Дезаминирование аминокислот
- •8.6.2.1. Окислительное дезаминирование
- •8.6.2.2. Непрямое дезаминирование
- •8.6.2.3. Внутримолекулярное дезаминирование
- •8.7. Декарбоксилирование аминокислот. Биогенные амины
- •8.8. Образование и обезвреживание аммиака в организме
- •8.8.1. Пути временного (экстренного) связывания аммиака в тканях
- •8.8.1.1. Восстановительное аминирование альфа-кетокислот
- •8.8.1.2. Амидирование тканевых белков
- •8.8.1.3. Биосинтез глютамина
- •8.8.2. Конечные продукты азотистого обмена
- •8.8.2.1. Синтез аммонийных солей в почках
- •8.8.2.2. Биосинтез мочевины и его нарушения
- •Особенности выведения конечных азотистых продуктов у детей
- •Аферментозы биосинтеза мочевины
- •8.9. Обмен безазотистых радикалов аминокислот
- •8.10. Особенности обмена отдельных аминокислот
- •8.10.1. Обмен глицина и серина
- •8.10. 1.1. Фолиевая кислота
- •8.10. 2. Обмен серосодержащих аминокислот цистеина и метионина
- •8.10. 2.1. Витамин в12
- •8.10.2.2. Нарушения обмена серосодержащих аминокислот
- •8.10.3. Обмен фенилаланина и тирозина и его нарушения
- •8.11. Регуляция белкового обмена
- •8.12. Патология белкового обмена
- •9. Обмен и функции нуклеиновых кислот
- •9.1. Химический состав и строение нуклеиновых кислот
- •9.2. Обмен нуклеиновых кислот
- •9.2.1. Переваривание нуклеиновых кислот
- •9.2.2. Распад нуклеиновых кислот в тканях
- •9.2.2.1. Распад пуриновых нуклеотидов и его нарушения
- •9.2.2.2. Распад пиримидиновых нуклеотидов
- •9.2.3. Биосинтез пуриновых нуклеотидов и его нарушения
- •9.2.4. Биосинтез пиримидиновых нуклеотидов
- •9.3. Биосинтез днк
- •9.4. Биосинтез рнк (транскрипция)
- •9.5. Биосинтез белков (трансляция)
- •9.5.1. Характеристика генетического кода
- •9.5.2. Трансляция
- •9.5.3. Посттрансляционная модификация белков
- •9.5.4. Ингибиторы биосинтеза белка
- •9.5.5. Регуляция биосинтеза белка
- •10. Биохимия гормонов
- •10.1. Классификация гормонов по их химической природе
- •10.2. Общие сведения об обмене гормонов
- •10.3. Механизмы действия гормонов
- •10.3.2. Мембранный механизм действия водорастворимых гормонов
- •10.3.2.1. Циклические нуклеотиды - цАмф, цГмф - вторичные посредники
- •10.4. Краткая характеристика гормонов
- •10.4.1. Белково-пептидные гормоны
- •10.4.1.1. Гормоны гипофиза
- •10.4.1.2. Гормоны паращитовидных желез
- •10.4.1.3. Гормоны поджелудочной железы
- •10.4.1.4. Гормоны вилочкой железы
- •10.4.2. Гормоны- производные аминокислот
- •10.4.2.1. Гормоны щитовидной железы
- •10.4.2.2. Гормоны мозгового слоя надпочечников (катехоламины)
- •10.4.2.3. Гормоны эпифиза
- •10.4.3. Стероидные гормоны
- •10.4.3.1. Гормоны коры надпочечников
- •10.4.3.2. Мужские половые гормоны (андрогены)
- •10.4.3.3. Женские половые гормоны (эстрогены)
- •10.5. Гормоны плаценты
- •10.7. Особенности гормонального статуса у детей
- •11. Биохимия крови
- •11.1. Биохимия эритроцитов.
- •11.2. Обмен гемопротеидов
- •11.2.1. Синтез гема и его нарушения
- •11.2.2. Переваривание и распад гемоглобина в тканях
- •11.2.3. Нарушения распада гемоглобина
- •11.3. Химический состав плазмы крови
- •11.3.1. Белки плазмы крови
- •11.3.1.1. Изменение белкового состава крови при заболеваниях
- •11.3.2. Небелковые азотсодержащие вещества крови
- •11.3.2.1. Кининовая система крови.
- •11.3.3. Безазотистые органические вещества крови
- •11.3.4. Минеральные вещества крови
- •11.4. Физико-химические свойства крови.
- •11.4.1. Нарушения кислотно-основного баланса
- •11.4.2. Особенности кислотно-основного состояния у детей.
- •11.5. Дыхательная функция крови
- •11.5.1. Транспорт кислорода и его нарушения
- •11.5.2. Транспорт со2
- •11.6. Регуляция агрегатного состояния крови
- •11.6.1. Свёртывающая система крови
- •11.6.1.1. Плазменные факторы свёртывающей системы крови
- •11.6.1.2. Схема свёртывания крови
- •11.6.1.3. Витамин к
- •11.6.2. Противосвёртывающая система крови
- •11.6.3. Детские особенности системы гемостаза
- •11.6.4. Нарушения гемостаза
- •12. Водно–минеральный обмен
- •12.1. Водно-солевой обмен
- •12.1.1. Обмен натрия и калия
- •12.1.2. Регуляция водно-солевого обмена
- •12.1.3. Нарушение водно-солевого обмена
- •12.1.4. Роль почек в водно-солевом обмене
- •12.1.5. Особенности водного обмена у детей
- •12.2. Кальций - фосфорный обмен
- •12.2.1. Регуляция кальций – фосфорного обмена.
- •13.2.1.1. Витамин d
- •12.2.2. Нарушения кальций – фосфорного обмена
- •12.3. Обмен железа и его нарушения
- •13. Тканевая биохимия
- •13.1. Биохимия соединительной ткани
- •13.1.1. Витамин с
- •13.2. Биохимия мышечной ткани
- •13.3. Биохимия нервной ткани
- •13.4. Биохимия печени
- •Оглавление
4.7.2. Окисление с участием оксигеназ.
Окисление с участие оксигеназ наиболее активно протекает в ЭПС. В нём участвуют диоксигеназы и монооксигеназы.
Диоксигеназы – катализируют окисление субстрата путём присоединения двух атомов кислорода по схеме: R + O2 → RO2. Примерами могут служить: окисление гомогентизиновой кислоты диоксигеназой гомогентизиновой кислоты, окисление триптофана трипотофанпирролазой с разрывом пиррольного кольца.
Монооксигеназы катализируют окисление субстратов путём присоединения одного атома кислорода. Данный вид окисления активно происходит в ЭПС печени, где на него тратится до 50% поглощаемого кислорода. В микросомальном окислении участвуют дополнительные вещества – косубстраты НАДН2 или витамин С, выполняющие функцию донора водорода для связывания второго атома кислорода. Микросомальное окисление в основном выполняет антитоксическую функцию (обезвреживаются продукты гниения белков, лекарственные вещества). Путём данного варианта окисления синтезируются некоторые аминокислоты (тир), биогенные амины. Благодаря микросомальному окислению происходит биотрансформация различных ксенобионтов. В них формируется гидроксильная группа, к которой в последующем присоединяются глюкуроновая кислота, Н2SО4, глютатион.
4.7.3. Пероксидазное окисление.
Пероксидазное окисление происходит по схеме:
RН2 + Н2О2 = R + 2 Н2О
Примеры пероксидаз: каталаза, глютатионпероксидаза, йодидпероксидаза (участвует в синтезе тиреоидных гормонов).
5. Общие пути катаболизма
Схема общих путей катаболизма
Катаболизм основных органических веществ протекает в несколько этапов. На первом этапе происходит распад сложных веществ до их составных компонентов: белков – до аминокислот, жиров – до глицерина и жирных кислот, углеводов - до моносахаридов. Эти реакции специфичны и не сопровождается высвобождением энергии.
На втором этапе образующиеся мономеры с помощью специфических реакций превращаются в два общих продукта распада: пировиноградную кислоту и ацетил-КоА. На втором этапе высвобождается четверть энергии, заключённой в исходных органических веществах.
На третьем этапе общие продукты катаболизма: пировиноградная кислота (ПВК) и ацетил - КоА включаются в дальнейшее окисление. На этом этапе высвобождается 2/3 всей энергии.
5.1. Окислительное декарбоксилирование пировиноградной кислоты
Если в процессе катаболизма белков, жиров, углеводов образуется ПВК, для дальнейшего окисления необходим переход её в ацетил КоА. Этот процесс называется окислительным декарбоксилированием пировиноградной кислоты. Он включает два вида реакций: окисление и образование СО2 путём разрушения карбоксильной группы. Окислительное декарбоксилирование пирувата осуществляется при участии пируватдегидрогеназного комплекса.
5.1.1. Пируватдегидрогеназный комплекс
Пируватдегидрогеназный комплекс (ПДК) молекулярной массой 6*106 д., включает в себя три вида ферментов (Е1-Е3) и пять видов коферментов. При этом 2 кофермента (НАД и HS-КоА) находятся в свободном состоянии и входят в состав комплекса только в момент реакции. Общий вид реакции окислительного декарбоксилирования пирувата:
Ферменты пируватдегидрогеназного комплекса
Е1 – пируватдегидрогеназа декарбоксилирующая;
Е2 – дигидролипоилацетилтрансфераза (трансацетилаза);
Е3 – дигидролипоилдегидрогеназа.
Коферменты пируватдегидрогеназного комплекса
Тиаминдифосфат (ТДФ, ТПФ), содержащий витамин В1, кофактор пируватдегидрогеназы.
Липоевая кислота, кофактор трансацетилазы.
Кофермент ФАД, содержащий витамин В2, кофактор дегидрогеназы дигидролипоевой кислоты.
Кофермент НАД, содержащий витамин РР.
Кофермент НS-КоА, содержащий аденин, рибозу, два остатка фосфорной кислоты, пантотеновую кислоту (витамин В3).
Окислительное декарбоксилирование ПВК протекает в несколько стадий, в процессе которых двухуглеродный фрагмент, образующийся из ПВК, переносится на липоевую кислоту, а затем на HS-КоА.
Витамины, входящие в состав пируватдегидрогеназного комплекса
В состав ПДК входит пять витаминов (РР. В2, липоевая кислота, В1, пантотеновая кислота).
Липоевая кислота
Липоевая кислота - витаминоподобное вещество, представляет собой восьмиуглеродную жирную кислоту с двумя -SH группами. Биологическая роль:является коферментом ПДК, участвует в окислении α - кетокислот.
Пантотеновая кислота, витамин В3
Пантотеновая кислота является витамином, который, в свою очередь, включает β - аланин и производное масляной кислоты. Она распространена в животных и растительных продуктах. Суточная потребность в пантотеновой кислоте составляет до 10 мг. Биологическая роль: входит в состав НS- КоА и участвует в окислительном декарбоксилировании α - кетокислот, участвует в активации жирных кислот. Авитаминоз проявляется дерматитом, депигментацией волос, поражением нервной системы.
Витамин В1, тиамин, антиневритный витамин
Витамин В1 включает в свой состав пиримидиновое кольцо, содержит аминогруппу. Суточная потребность в нём составляет 2 мг. Тиамин содержится в злаках, дрожжах. Биологическая роль: входит в состав кофермента ТДФ и участвует в окислительном декарбоксилировании α - кетокислот, а также является коферментом транскетолазной реакции в пентозофосфатном пути окисления глюкозы. Авитаминоз проявляется полиневритами (болезнь бери-бери).
Регуляция пируватдегидрогеназного комплекса осуществляется путём фосфолирирования - дефосфолирирования пируватдегидрогеназы
Активаторами ПДК служат АДФ и НАД окисленный. Ингибиторами этого комплекса являются АТФ и НАДН2..
5.1.2. Биологическая роль окислительного декарбоксилирования пирувата Биологическое значение процесса окислительного декарбоксилирования пировиноградной кислоты заключается в том, что оно является важным этапом катаболизма, позволяющим включаться в цикл Кребса тем веществам, при распаде которых образуется ПВК. Образовавшаяся молекула НАДН2 окисляется в длинной дыхательной цепи с образованием 3-х молекул АТФ. Окислительное декарбоксилирование пирувата протекает внутри митохондрий.