Добавил:
kiopkiopkiop18@yandex.ru Вовсе не секретарь, но почту проверяю Опубликованный материал нарушает ваши авторские права? Сообщите нам.
Вуз: Предмет: Файл:

2 курс / Биохимия / Биохимия Лекции

.pdf
Скачиваний:
1
Добавлен:
23.03.2024
Размер:
66.85 Mб
Скачать

При изменении pH среды в сторону от оптимума активность E уменьшается:

Причины:

изменяется ионизация ионогенных групп =>рвутся

ионные и некоторые водородные связи в молекуле фермента =>меняется конформация E =>

нарушается структура активного центра E =>

уменьшается активность E.

COO- COO-

HO

CH3

...

...

+

H3N HO

HO H3C

ион. связь + H+ вод. связь вод. связь

гидрофобная

связь

+

COOH H3N COOH HO

Кофакторы ферментов и их роль в катализе.

Если фермент является сложным белком, то в его состав всегда входит небелковый компонент, который называется: Кофактор.

Белковая часть такого фермента называется:

Апофермент.

А комплекс апофермента с кофактором получил название: Холофермент:

Апофермент + Кофактор Холофермент

Каталитическую активность в этом случае проявляет только Холофермент.

Кофакторы

Коферменты

Ионы металлов

Роль ионов металлов в катализе:

1)участвует в присоединении субстрата (Mg2+, Mn2+, Zn2+)

2)принимают участие в катализе (Zn2+, Cu2+, Fe2+)

3)принимают участие в стабилизации третичной и четвертичной структуры фермента (K+, Ca2+, Zn2+)

4)активаторы ферментов (Ca2+)

Коферменты:

1)органические вещества, предшественниками которых, как правило, являются витамины;

2)принимают непосредственное участие в катализе, наряду с радикалами аминокислот.

Некоторые коферменты непрочно связаны с апоферментом (NAD+, NADP+, HS-KoA, H4-фолат).

Есть коферменты, прочно связанные с апоферментом, т.е. представляют с собой простетическую группу (гем, FAD, FMN, биотин).

Примерыкоферментов

Тиаминдифосфат (ТДФ):

Биотин (витамин H):

КоферментA:

Классификация ферментов.

В основе классификации ферментов лежит тип катализируемой ими реакции.

Все ферменты делятся на 6 классов:

I. Оксидоредуктазы – катализируют окислительно-восстановительные реакции.

Основные подклассы:

1.Оксидазы

2.Гидроксилазы

3.Дегидрогеназы – катализируют реакции присоединения / отщепления атомов водорода (дегидрирования).

По типу кофермента различают:

1)NAD+ и NADP+ – зависимые дегидрогеназы (предшественник: витамин PP);

2)FAD и FMN – зависимые дегидрогеназы (предшественник: витамин B2)

Коферменты NAD+, NADP+, FAD и FMN

выполняют роль акцепторов атомов водорода.

Строение коферментов NAD+ и NADP+:

+

+

CO NH2

Активная часть коферментов

NAD+ и NADP+:

+

N

R

Витамин PP:

 

 

CO

 

NH2

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

N

1) Роль коферментов NAD+ и NADP+ в реакциях дегидрирования:

 

 

H

 

 

 

 

H H

 

 

 

 

Д . H2 +

 

 

 

 

 

 

CONH 2

 

 

 

Д +

 

 

 

 

 

 

CONH 2

+

H

+

 

+

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

N

 

 

 

 

 

 

N

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

R

 

 

 

 

 

 

R

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

НАД+

НАДH + H+

(или НАДФ+) –

(или НАДФH + H+) –

окисленная

восстановленная

форма

форма

Д . H2 + NAD+

Д + NADH + H+

(или NADP+)

(или NADPH + H+)

Пример реакции с участием NAD+:

 

 

COOH

 

Малатдегидрогеназа

COOH

 

 

 

 

 

 

+ NAD+

 

 

 

O + NADH+H+

HO

 

C

 

H

C

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

CH2

CH2

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

COOH

COOH

 

 

Малат

 

 

Оксалоацетат

Строение флавиновых коферментов (FMN и FAD):

2)Роль коферментов FAD и FMN в реакциях дегидрирования:

 

N

O

 

H

O

 

 

 

 

 

 

Д.H2 + H3C

NH

Д + H3C

N

 

NH

 

 

 

H3C

N N O

H3C

N N

O

 

R

 

 

R

H

 

 

 

 

 

ФАД

 

ФАДH2

(или ФМН) –

 

(или ФМН H2) –

окисленная

 

восстановленная

форма

 

форма

Д . H2 + FAD

Д + FADH2

.

(или FMN)

 

(или FMN H2)

Пример реакции с участием FAD:

 

 

COOH

 

Сукцинатдегидрогеназа

 

COOH

 

 

 

CH2

+ E-FAD

 

 

CH

+ E-FADH2

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

CH2

 

 

 

CH

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

COOH

 

 

 

COOH

Сукцинат

 

 

Фумарат