Добавил:
Опубликованный материал нарушает ваши авторские права? Сообщите нам.
Вуз: Предмет: Файл:

Биоорганическая химия. Справочник, словарь

.pdf
Скачиваний:
15
Добавлен:
05.03.2021
Размер:
3.2 Mб
Скачать

Обладает амфотерными свойствами - образует соли с сильными кислотами и основаниями. Получается при дезаминировании аденина. Нуклеозид гипоксантина называется инозин. Нуклеотид инозинмонофосфат является начальным (исходным)

веществом

при синтезе

адениловых

и гуаниловых нуклеотидов АМФ и ГМФ

в клетках

человека: в

составе инозинмонофосфатагипоксантин

превращается

в аденин и гуанин.

 

 

 

 

 

Гликолиз. Биохимическийпроцесс

 

превращения глюкозы до пировиноградной

кислоты: в

анаэробных условиях из ПВК образуется молочная кислота, в аэробных

условиях ПВК превращается в АцКоА,

который далее принимает участие в цикле

Кребса, в синтезе медиатора ацетилхолина.

Гликолиз имеет энергетическое значение

(синтез АТФ) и пластическое (образование промежуточных соединенийдля

других

метаболических процессов).

 

 

 

 

Гликоген 6Н10О5)n. Гомополисахарид , запасной полисахарид животных тканей, обнаружен также в грибах. Присутствует в клетках любых тканей организма: печени, почек, мышц, костей и других. В печени содержание может достигать 5% (от сухой массы ткани). Строение и состав аналогичны амилопектину. Основная цепь образована гликозидными связями (а-1,4), в местах ветвления гликозидные связи(а – 1,6).

 

1-остатки глюкозы,

 

соединенные α-1,4-

 

гликозидной связью

 

2- остатки глюкозы,

 

соединенные α-1,6-

 

4 гликозидной связью

2

3- нередуцирующие

1

 

концевые мономеры

3

4-редуцирующий

 

концевой мономер

Рисунок условно изображает строение

порядок соединения ветвей гликогена.

Образует в цитозоле клетки гранулы размером 1040нм . Молекулярная масса

соответствует общему количеству остатков глюкозы около50 000С.

йодом образует

коричневобурые растворы. Определение интенсивности окраски оптическими регистрирующими приборами используют для количественного определения гликогена в тканях.Следует отметить некоторые особенности в строении гликогена:

61

точки ветвления расположены часто, примерно у каждого десятого атома углерода в основной цепи

в боковых цепях содержится примерно до 16-18

моносахаридных

остатков

 

количество ветвлений значительно больше по сравнению с амилопектином

Распад гликогена в тканях печени, почек, мышцосуществляется особым ферментом фосфорилазой гликогена,а в костной ткани и одонтобластах амилазой.

Гликозилирование. Нефе рментативный химический процесс в организме, заключающийся во взаимодействии моносахаридов (в основном, глюкозы) с амино-, гидрокси-, тиольнымигруппами белков гемоглобина , плазмы крови , мембран эритроцитов, стенок сосудов, нефрона, глаза, миелиновых оболочек нервных структур. Образуются N-, S-, O- гликозидные, азометиновые и другие нехарактерные связи между моносахаридом и белком. Типично для длительного состояния гипергликемии( высокого уровня глюкозы в крови) при диабете. Является причиной развития тяжелых осложнений, проявляющихся в виде ангио-, нефро-, ретино–, нейропатий. Определение доли гликозилированного гемоглобина используют для оценки выбранной дозы инсулина.

Гликолевая кислота (гидроксиуксусная) С2Н4О3. Начинает гомологический ряд моногидроксикарбоновых кислот. Твердое кристаллическое вещество. Растворима в воде, спирте. Обнаружена в свекловичном соке, репе, незрелом винограде. Образует соли, простые эфиры с участием гидроксигруппы, сложные – с участиемобеих групп. Окисляется в глиоксалевую кислоту, которая образуется в организме человека из аминокислоты глицина.

ОН-СН 2– СООН

Применяется в промышленности для дубления кож, а в косметологиисамостоятельно или в составе «фруктовых кислот» в качестве химического пилинга для удаления части наружного мертвого эпителиального слоя кожи (см.

Моногидроксикарбоновые кислоты).

Гликолипиды. Сложные липиды, содержащие углеводные и липидные составляющие,Образованы с участием сложноэфирных и гликозиднойсвязей.

Гидрофобная

часть образована церамидом, который

представляет собой

3-алкил-2- амино-1,3-пропандиол. Аминогруппа

ацилирована

жирной

кислотой,

а гидроксигруппа

в положении-1образует

гликозидную

связь с

моноили

олигосахаридом. От вида углевода различают цереброзиды и ганглиозиды, в составе ганглиозидов -ацетилнейраминовая кислота.

62

СН3(СН2)n СН- -ОН

 

|

гидрофобная часть

СН3- СН2)n –СО- N Н -СН

|

СН2-О-R ( углевод,нейраминовая кислота)

Много в составе нервной ткани. Обеспечивают структуру мембран, взаимодействие между клетками и клеток с межклеточным матриксом, выполняют регуляторные функции.

Глиоксалевая кислота (оксоуксусная) С2Н2О3. Первый представитель гомологического ряда. Содержит две функциональные группы – альдегидную и карбоксильную, обе группы обладают всеми типичными химическими свойствами, усиливая реакционную способность друг друга( обе группы обладают акцепторными свойствами),рКа 3,18.

Известна только в виде гидрата вследствие высокой активности карбонильной группы в реакции нуклеофильного присоединения АNu (аналогично образуется

хлоральгидрат).

 

 

 

 

 

НООС

–СНО + Н 2О ———> НООС - СН–

ОН

 

 

 

 

 

 

|

 

 

 

 

 

 

 

ОН

 

 

Обнаружена в клетках некоторых бактерий,

грибов, растений,

много в незрелых

фруктах,

по

мере созревания содержание

снижается. Находится

в особых

внутриклеточных образованиях глиоксисомах, где протекают реакции,

приводящие

к включению глиоксалевой кислоты в цикл Кребса(

этот путь в животных тканях не

обнаружен).

 

и человекароль в обмене веществ не доказана, хотя в

В организмеживотных

последнее время выявлены некоторые процессы с ее участием.

Возможно in vivo

образование из аминокислоты глицина.

 

 

 

 

Глицерин (глицерол, пропантриол-1,2,3) С3Н8О. Трехатомный спирт,

сладкая густая, вязкая сиропообразная гигроскопичная жидкость. Тщательно высушенный глицерин кристаллизуется, Тплавл. 17,9 0С. Получен впервые в 1779 г. Шееле при омылении природных жиров. Химические свойства связаны с присутствием трех гидроксильных групп: две первичные группы более активны, чем вторичная.

СН

2 – СН – СН2

|

|

|

ОН ОНОН

63

Образует соли, окисляется различными окислителями, при нагревании при высокой температуре дегидратируется и превращается в токсичный непредельный

альдегид акролеин СН2=СН – СНО, который может получаться из пищевых жиров при неправильном приготовлении еды.

В организме человека присутствует в клетке в виде фосфорного эфира глицерол- 3-фосфата, который участвует в образованлипидов (их представителями являются сложные эфиры триглицериды и фосфатиды). Окисляется до

3-фосфоглицеринового альдегида, который вместе с фосфодиоксиацетоном является продуктомобмена глюкозы в гликолизе и пентозофосфатном цикле, Превращается in vivo в пировиноградную кислоту.

Глобулины. Белки, хорошо растворимые в разбавленных кислотах, щелочах, растворах нейтральных солей. Первоначально глобулинами называли белки, которые в отличие от альбуминов, осаждаются полунасыщенным раствором сульфата

аммония.

Глобулины разделяют на эоглобулины и

псевдоглобулины.

Четкого

различия

между ними по способам высаливания

нет. В настоящее время

глобулинами считают белки, мигрирующие при электрофорезе в щелочном буфере

(рН 8,6) медленнее,чем

альбумины.

 

Содержат участки глобулярного и фибриллярного строения. Глобулины крови

при электрофорезе разделяются на несколько фракций

а1, а 2, β, γ, большинство из

них сложные белки.

Глобулином является фибриноген,

входящий в свертывающую

систему крови,сократительный белок мышц миозин.

 

Глобулярные белки (лат - globulus - шарик).

Распространенные в природе

белки,отличающиеся

особыми физико-химическими свойствами и пространственным

строением: гидрофильные, хорошо растворимые в воде, сложная система укладки

а-спирали полипептидной цепи. Имеют

сферическое строение, отношение длины

к ширине меньше10

( эллипсоид или

цилиндр), высокая плотность упаковки

и

высокое содержание гидратационной воды.

Для них

наиболее типична плотность

1,4 г/ см3. Сделан

теоретический расчет

молекулы глобулина массой34 500

Д,

содержащей 300 аминокислот: объем 41нм

3, диаметр

такой сферы 4,3 нм (длина

вытянутой молекулы 100 нм). Можно сравнить с размерами других биологических структур: толщина клеточной мембраны8-10нм , диаметр жгутика бактерии13нм . а -Спиральный полипептид может пройти сквозь мембрану, выступая с обеих сторон:

рецепторы мембран относятся к глобулярным белкам.

У большинства глобулярных

белков внутри молекулы располагается недлинная «палочка»-

участок,

имеющий

β -стру ктуру, а вокруг него

«наматывается»

спиральная а –цепь. Глутаминовая

кислота, аланин, лейцин способствуют образованию а-спирали.

Метионин, валин,

изолейцин встречаютсячаще

в составе β -структуры,

а глицин, пролин,

аспарагин

обычно располагаются в местах изгиба цепи.

На поверхности глобулы (третичная

структура)

располагаются ионизирующиеся карбоксильные и аминогруппы группы,

гидроксигруппы, склонные к образованиюводородных

связей, много

тиольных

групп и дисульфидных мостиков. Более подвержены

денатурации

по

сравнению

с фибриллярными белками. Изучены состав и строение важнейших

глобулярных

 

 

64

 

 

 

 

 

белков: альбуминов и глобулинов крови, лизоцима , миоголобина , гемоглобина, карбоксипептидазы и других. Примечание( : не надо путать понятия «глобулярные белки» и «глобулины» -белки крови.)

Глутаровая кислота (пентандиовая) НООС- СН2-СН2-СН2-СООН.

Кристаллы, Т плавл. 99 0С, Т разл. 304 0С, растворима в воде, этаноле. Содержится в свекольном соке. Скелет глутаровой кислоты имеют многие биологически активные соединения, участвующие в различных видах обмена: аминокислота глутамино, вая

цикле Кребса( α –кетоглутаровая,

лимонная

кислоты), в

процессе синтеза

холестерина образуется 3-гидрокси- 3-

метилглутаровая кислота.

 

Глюкоза (гр.- glykysсладкий- ) С

6Н12 О6.

Моносахарид, оптически активное

соединение, одна из 16изомерных альдогексоз и одна из 8изомерных D-альдогексоз

Другие названия декстроза, виноградный сахар. Свободная глюкоза

встречается

в виноградном соке и соке спелых сладких фруктов, в

растениях она запасается

в составе олигосахарида сахарозыили

полисахарида крахмала.

 

 

Твердое

кристаллическое

вещество,

сладкое

на

вкус.

Является

восстанавливающим дисахаридом, при восстановлении образует спирт сорбит, при

окислении

три различные кислоты

в

зависимости от

условий: глюконовую,

глюкуроновую и глюкаровую. Образует

несколько форм: открытую альдегидную

и циклические (в

природных олиго

 

полисахаридах

встречаются только

а и β -пиранозные

).

В циклической

форме

образует гликозиды. В организме

человека

присутствует

D-глюкоза

(d

d

l

d). Участвует в энергетическом

и пластических обменах (синтез пентоз, гликозаминогликанов, заменимых

аминокислот),

запасается в виде гликогена. . В биологических жидкостях содержится

в свободном

виде, а в

клетках существует в виде фосфорных эфиров

глюкозо-6-фосфат и глюкозо-1- фосфат. Транспорт глюкозы в мышцы, жировую ткань зависит от наличия инсулина.

D -глюкоза ( d d l d )

 

CHO

 

 

 

 

 

 

 

H

 

 

 

OH

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

HO

 

 

 

H

H

 

CH2OH

O OH

 

 

 

H

 

 

 

OH

 

 

 

 

 

H

 

 

 

 

 

H

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

H

 

 

 

OH

 

 

OH

 

 

 

 

 

 

 

 

 

H

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

OH

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

CH2OH

 

 

H

OH

Β- D- глюкопираноза

65

CH2OH

H O H

H

OH H

OH OH

H OH

полуацетальный гидроксил в а-форме направлен« вниз» а –D - глюкопираноза

В крови поддерживается определенный постоянный( гомеостатический) уровень глюкозы, которая быстро усваивается тканями и клетками крови: нервной тканью, эритроцитами. Без глюкозы все процессы жизнедеятельности в этих клетках

прекращаются. При недостатке кислорода (гипоксии) глюкоза

становится главным

веществом, обеспечивающим мышечную деятельность. В

крови содержится

3,3 -5,5мМоль /л (80 -120 мг в 100мл крови или4-6

гв объеме всей крови).

Качественные реакции обнаружения глюкозы и других редуцирующих

углеводов основаны на способности окисляться:

а) реакция «серебряного зеркала»,

б) нагревание со свежеосажденным осадком гидроксида меди(2) в щелочной среде. В биохимических исследованиях для количественного определения содержания глюкозы в крови и других биологических объектах применяют ферментативный

глюкозооксидазный метод, который в отличие от качественных реакций,

специфичен

только для глюкозы.

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Препараты

глюкозы

(Glucosum,

Dextrosum)используются

 

в

медицине,

выпускают в виде порошков, таблеток,

стерильных растворов, добавляют

 

в другие

лекарственные средства. Растворы

стерилизуют при температуре от 1000 до 1210 С,

для стабилизации добавляют 0,1Н раствор НСl. Для

внутривенного

введения

используют изотонические

растворы

4,0-4,5% (изотонический раствор

имеет

осмотическое давление

соответствующее

осмотическому

давлению

крови)

и гипертонические10—40% (

выше осмотического давления крови).

Изотонические

растворы применяют при кровопотере

для

возмещения

объема

циркулирующей

крови,

глюкоза

вызывает усиление

энергетических

процессов

в

тканях.

Гипертонические

растворы

повышают

осмотические давление,

усиливают отток

жидкости из тканей в кровь, способствуют выделению из органов токсических веществ и увеличивают поступление глюкозы в мозг, сердце, печень, мышцы. Глюкоза и многие гексозы, их олиго - и полисахариды подвергаются «брожению»- так называют процессы превращения углеводов с участием микроорганизмов. Различают спиртовое,молочнокислое,масляное и другие виды брожения.

66

Глюконеогенез. Биохимический процесс, заключающийся в ресинтезе глюкозы из молочной кислоты, конечного продукта обмена углеводов, или из неуглеводных компонентов (аминокислот, глицерина). Основной путь поддержания уровня глюкозы в крови, восполнения глюкозы в тканях при гипогликемии,голодании.

Глюкурониды. Гликозиды глюкуроновой кислоты. Твердые кристаллические вещества. В организме человека β -глюкурониды образуются при детоксикации гидрофильных эндогенных конечных продуктов (билирубина) и ксенобиотиков. Повторно из кишечника не всасываются.Выводятся с желчью или мочой.

D-Глюкуроновая кислот (2,3,4,5 –дигидрокси-6-оксогексановая кислота,

d d l d ) ОНС- (СНОН)4-СООН. Одна из изомеров гексуроновых кислот. Твердое кристаллическое вещество, хорошо растворима в воде, растворах щелочей, гидрокарбонатов и карбонатов. Обладает свойствами карбоновых кислот и альдогексоз, склонна к цикло-оксотаутомерии (кольчато-цепной изомерии), образуя а и β-аномеры, а также циклические сложные эфиры лактоны

COOH

 

 

 

H

 

O

H

 

H

H

 

OH

OH

OH

 

 

 

 

 

 

H

OH

α-пиранозная форма D-глюкуроновой кислоты

Для получения глюкуроновой кислоты из глюкозы необходимо защитить альдегидную группу от окисления, с этой целью используют гликозиды β – D - глюкопиранонозы, после окисления спиртовой группы проводят гидролиз гликозиднойсвязи.

Распространена в природе, биологическая активность связана с образованием УДФ-глюкуроновой кислоты,которая образуется in vivo окислением УДФ-глюкозы.

Гл -6-ф —> Гл-1-ф —>УДФ- глюкоза—>УДФ-глюкуроновая кислота

Структурная формула УДФ-глюкуроновой кислоты

демонстрирует, что в

соединении УДФ-глюкоза альдегидная группа( в виде гликозидного

гидроксила)

была защищена от окисления, а окисляется спиртовая группа СН2ОН в

положении

6 пиранозного цикла,превращаясь в карбоксильную группу

–СООН.

 

67

 

 

 

 

 

 

 

O

 

COOH

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

O O

 

 

 

 

 

O

H

 

P

 

 

 

 

 

 

 

H

 

 

 

 

 

 

 

 

OH

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

OH

OH

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

H

 

OH

O

 

 

O

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

OH

 

 

 

 

 

 

 

 

P

 

 

 

 

 

 

 

NH

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

O

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

CH2

 

 

N

 

O

 

 

 

 

O

 

 

 

 

 

 

 

 

 

H

 

H

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

H

 

 

 

 

H

 

 

 

 

 

OH

 

 

OH

 

 

УДФ-глюкуроновая кислота

Биологическая роль глюкуроновой кислоты в организме человека: образует УДФ-глюкуроновую кислоту, которая участвует в обезвреживании токсических соединений эндогенного происхождения (билирубин, спирты) или экзогенных, попадающих извнексенобиотиков (фенолы, лекарственные препараты), входит в состав гетерополисахаридов (гиалуроновой кислоты, хондроитинсульфата ), формирующих межклеточное вещество соединительной ткани и антисвертывающую систему крови (гепарин).

Гомолитический (радикальный) тип разрыва связи (греч homos-равный).

Характерен для неполярных или малополярныхковалентных связей при воздействии высокой температуры, электромагнитного неионизирующего излучения (ультрафиолетовое, рентгеновское) или других свободных радикалов. Приводит к образованию активных частиц радикалов.

Радикал ( R) -частица вещества, имеющая неспаренный электрон. Радикалы могут быть нейтральными или заряженными частицами. При гомолитическом разрыве общая электронная пара связи разрывается поровну (по одному электрону на каждую новую частицу).

С12 —> 2 С1

С 1 -|С-

1

—> C1•

+ C1•

неспаренныйэлектрон

принято обозначать ( • )

Диаграмма распределения электронов в атоме хлора на 3-ем энергетическом

уровнев

невозбужденном состоянии.

 

 

 

 

--↑↓--

↑↓----- --

↑---

 

 

С 1

--↑↓---

 

неспаренный электрон

 

 

3 s

р

3

 

 

В

процессе

биохимических реакций образуются

свободные радикалы при

восстановлении кислорода (супероксид, пероксид), особом ферментативном

окислении аминокислоты аргинина(

оксид азота

NO) и из органических молекул

(полиненасыщенных кислот и др.)с

участиемдругих

радикалов.

68

Гомополисахариды. Образованы только одним видом моносахаридов.

Крахмал, гликоген,

декстран состоят из а-D-глюкопиранозы,

целлюлоза из

β- D- глюкопиранозы,инулин из фруктозы.

 

 

Гомоцистеин

(2-амино-4-меркаптобутановя

кислота)

С4Н92S.

Аминокислота,кристаллическое вещество.

НS- СН2-СН2 –СН(N Н2) –СООН

Образуется в организме человека в процессе обмена незаменимой аминокислоты метионина после удаления S-метильной группы. Участвует в синтезе аминокислоты цистеина из аминокислоты серина. Легко окисляется на воздухе кислородом, пероксидом водорода, превращается в дисульфид. Накопление в крови, тканях - патологический процесс, возникает при недостатке витаминов В12 и тетрагидрофолиевой кислоты. Является причиной развития сердечно -сосу дистой патологии, врожденных аномалий у плода.

Гуанин С 5Н5N5О.

Пуриновое

азотистое основание. Кристаллы , Тпл . 3650С

(разл.). Нерастворим в

воде, плохо

 

в

спиртах, хорошо в кислотах

и щелочах,

с которыми образует соли. Возможны

 

две

таутомерные

формы:

лактимная

(2-амино-6гидроксипурин-

) и лактамная (2-амино-6 –оксопурин).

Соли с сильными

основаниями образует лактимная

(гидрокси)

 

форма, но в составе нуклеиновых

кислот гуанинсуществует

 

в лактамной форме,

которая обеспечивает формирование

комплементарной пары с цитозином.

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

O

 

 

 

 

 

 

N

 

 

 

 

 

NH

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

N

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

N

 

NH2

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

H

 

 

 

 

 

2-амино-6 –оксопурин

Атом водорода в имидазольном цикле гуанина может занимать положения N7 или N9 , но в нуклеиновых кислотах реализуется форма N9 –Н и с этим атомом образуется N9 - гликозидная связь в нуклеозидах, нуклеотидах и нуклеиновых кислотах. Распространен в природе, обнаружен в клетках микроорганизмов, растений, животных, входит в состав нуклеиновых кислот. Биологической активностью обладают нуклеотиды ГТФ, ГДФ и внутриклеточный регулятор

циклический ГМФ (цГМФ).

69

Д

Дезоксирибонуклеиновые кислоты (ДНК). Вторичная структура ее–двойная спираль с антипараллельным расположением цепей. Открытию структуры ДНК способствовали исследования Э. Чаргаффа в отношении химического состава ДНК. Он установил:

количество пиримидиновых оснований равно количеству пуриновых

количество тимина равно количеству аденина,а количество цитозина– количеству гуанина .

А =Т

Г = Ц

А+ Г =Т + Ц

А+ Ц =Т +Г

Этиотношения

получили название правила Чаргаффа. Биохимик Д. Уотсон

и физик

Ф. Крик в 1953 году предложили модель структуры ДНК и механизм

процесса

репликации.

В 1962г.

им присуждена Нобелевская премия. Научное

описание

вторичной

структуры

ДНК относится к величайшим открытиям

человечества в ХХ веке. Молекула ДНК представляет собой две перекрученные

спирали.

Скелет каждой спиралицепочка

из чередующихся остатков

дезоксирибозы и фосфорной кислоты. Спирали

ориентированы таким образом , что

образуют два неодинаковых спиральных желобка,которые идут параллельно главной оси. Эти желобки заполнены белками гистонами. Азотистые основания располагаются внутри спирали, почти перпендикулярно основной оси и образуют между цепочками комплементарные пары А…Т иГ …Ц .

Суммарная длина молекул ДНК в каждой клетке достигает 3см . Диаметр клетки в среднем 10–5 м, диаметр ДНК всего 2 •10–9 м. Молекулярная масса ДНК

клеток человекадостигает

10 7 Д.

 

Основные параметры двойной спирали:

 

* диаметр 1,8 – 2нм,

 

 

* на одном витке10

нуклеотидов

 

* высота шага витка ~ 3,4 нм

 

* расстояние между двумя нуклеотидами0,34

нм.

Основания располагаются перпендикулярно оси цепи. Направления полинуклеотидных цепей антипараллельное. Связь между фуранозными циклами дезоксирибозыпосредством фосфорной кислоты осуществляется из положения 3` к положению 5`в каждой из цепей. В начале цепи фосфорилирована гидроксильная группа пентозы в положении - 5, в конце цепи в положении- 3`свободная– гидроксильная группа пентозы.

70