Молекулярная биология

Лекция 8 курс А.С. Спирина

Регуляция трансляции у прокариот

1 апреля 2015 г.

ЭПИЦИКЛ ТРАНСЛЯЦИИ

ИНИЦИАЦИЯ ТРАНСЛЯЦИИ:

Назначение инициации трансляции:

(1) Установка первого кодирующего триплета мРНК на рибосоме = = установка рамки считывания кодирующей последовательности мРНК.

(2)Установка инициаторной аминоацил-тРНК в Р-участке рибосомы = = установка донорного субстрата для первой реакции транспептидации.

(3)Мишень для регуляции белкового синтеза на уровне трансляции.

КОНСТИТУТИВНЫЙ КОНТРОЛЬ ТРАНСЛЯЦИИ

«Сила» мРНК

” с л а б а я ” м Р Н К

5 ' 3 '

ФАКТОРЫ, ОПРЕДЕЛЯЮЩИЕ «СИЛУ» мРНК

(1)Инициаторный кодон: AUG > GUG > UUG > AUA, etc.

(2)SD: сила спаривания с рРНК.

(3)Расстояние между AUG и SD (4 – 12 нуклеотидов – оптимально).

Взаимодействие пред-инициаторной полипуриновой последовательности мРНК

с концевой полипиримидиновой последовательностью 16S рибосомной РНК

Shine-Dalgarno sequence (SD)/anti-Shine-Dalgarno (ASD, or CCUCCU) interaction

ФАКТОРЫ, ОПРЕДЕЛЯЮЩИЕ «СИЛУ» мРНК

(1)Инициаторный кодон: AUG > GUG > UUG > AUA, etc.

(2)SD: сила спаривания с рРНК.

(3)Расстояние между AUG и SD (4 – 12 нуклеотидов – оптимально).

(4)«Энхансерные» последовательности «вверх» от SD.

Известной усиливающей последовательностью, расположенной по направлению к 5 -концу от последовательности Шайна-Дальгарно, является так называемый «эпсилон-мотив»

UUUAACUUUA

высокоэкспрессируемых поздних мРНК бактериофага Т7 и некоторых других фагов,

а также эпсилон-подобные последовательности некоторых бактериальных мРНК - например,

UUUUAACU и

UAAUUUAC

в высокоэкспрессируемом цистроне atpE полицистронной atp-мРНК у E. сoli.

ФАКТОРЫ, ОПРЕДЕЛЯЮЩИЕ «СИЛУ» мРНК

(1)Инициаторный кодон: AUG > GUG > UUG > AUA, etc.

(2)SD: сила спаривания с рРНК.

(3)Расстояние между AUG и SD (4 – 12 нуклеотидов – оптимально).

(4)«Энхансерные» последовательности «вверх» от SD.

(5)Вовлеченность AUG и SD во вторичную и /или третичную структуру.