Молекулярная биология
Лекция 10 курс А.С. Спирина
Трансмембранная транслокация. Ингибиторы трансляции.
Ложное кодирование.
15 апреля 2015 г.
ТРАНСМЕМБРАННАЯ ТРАНСЛОКАЦИЯ РАСТУЩЕГО ПОЛИПЕПТИДА
СИГНАЛЬНЫЙ ПЕПТИД
Отщепляемая сигнальная последовательность (n – h – c):
N-конец растущего полипептида, 15 – 30 аминокислотных остатков. Короткий «+»-участок (группа Lys, Arg, His) –
–гидрофобный участок (7 - 13 остатков, Leu, Ile, Phe, Trp, Ala) –
–консервативный участок (5 – 7 остатков, место расщепления).
G. Blobel and D.D. Sabatini (1970) Controlled proteolysis of nascent polypeptides in rat liver cell fractions. J. Cell Biol. 45:130-145.
G. Blobel and B. Dobberstein (1975) Transfer of proteins across membranes. J. Cell Biol. 67: 835-851.
СИГНАЛЬНЫЙ ПЕПТИД
Отщепляемая сигнальная последовательность (n – h – c):
N-конец растущего полипептида, 15 – 30 аминокислотных остатков. Короткий «+»-участок (группа Lys, Arg, His) –
–гидрофобный участок (7 - 13 остатков, Leu, Ile, Phe, Trp, Ala) –
–консервативный участок (5 - 7остатков, место расщепления).
Не отщепляемая сигнальная последовательность: Внутренняя часть растущего полипептида.
Группа «+»-аминокислот (Lys, Arg, His) –
– гидрофобный участок (20 - 25 остатков).
ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ СОБЫТИЙ В ПРОЦЕССЕ КОТРАНСЛЯЦИОННОГО ПРИКРЕПЛЕНИЯ РАСТУЩЕГО ПОЛИПЕПТИДА К МЕМБРАНЕ ЭНДОПЛАЗМАТИЧЕСКОГО РЕТИКУЛУМА
Arrest of elongation!
Узнавание |
Остановка |
|
сигнального |
||
трансляции |
||
пептида и |
||
|
||
мембранного |
|
|
рецептора. |
|
|
ГТФ-связывающий |
|
|
домен |
|
Структура бактериальной SRP частицы в комплексе с рецептором (SR)
Белок-рецептор SR
Белок
SRP54
ГТФ
4,5S РНК
S.F. Ataide, N. Schmitz, K. Shen, A. Ke, S. Shan, J.A. Dudna and N. Ban (2011) Science 331, 881- 886.
ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ СОБЫТИЙ ИНИЦИАЦИИ ТРАНСМЕМБРАННОЙ ТРАНСЛОКАЦИИ
Белок Sec61p/SecY – трансмембранный пептид-проводящий канал (РСС) (или транслокон, или ТС)
– вид сбоку
B. van den Berg, W.M. Clemons, I. Collinson, Y. Modls, E. Hartmann, S.C. Harrison and T.A. Rapoport (2004) X-ray structure of a protein-conducting channel. Nature 427: 36-44.
