- •А.С. Спирин
- •Происхождение жизни из древнего мира РНК
- •Древний мир РНК
- •Схема развития жизни на Земле
- •Схема развития жизни на Земле
- •УДЛИНЕНИЕ ОЛИГОНУКЛЕОТИДОВ ПУТЕМ ТРАНСЭСТЕРИФИКАЦИИ
- •Компартментализация как необходимое условие естественного отбора и эволюции
- •Колонии РНК на влажной поверхности геля:
- •КОЛОНИИ РНК КАК ПЕРВИЧНЫЕ ОСОБИ
- •Схема экспоненциального усиления (улучшения) искомого признака молекул РНК
- •Схема получения аптамера – РНК со специфическим сродством к некоему веществу Х
- •Гипотетическая схема первобытного SELEX’a
- •Высокая скорость эволюции древнего мира РНК
- •Эволюция древнего мира РНК:
- •Эволюция древнего мира РНК:
- •Возникновение и эволюция мира РНК:
- •RNA world
- •Митохондриальные рибосомы
- •Рибосомы митохондрий («миторибосомы)» млекопитающих
- •Рибосомы митохондрий («миторибосомы)» млекопитающих
- •Большая митохондриальная рРНК (серое ядро в контуре справа)
- •Структурная компенсация дефицита митохондриальной РНК увеличением белковых компонентов в рибосоме
- •“The mitoribosome thus serves … for an experimental verification of the concept of
- •мРНК и универсальный генетический код
- •КОДОВАЯ ТАБЛИЦА (1966 г.)
- •КОДОВАЯ ТАБЛИЦА (1966 г.)
- •Отклонения генетического кода эубактерий и простейших от «универсального» генетического кода
- •Отклонения митохондриального генетического кода
- •Основные участники процесса трнсляции
- •РАБОЧИЙ (ЭЛОНГАЦИОННЫЙ) ЦИКЛ РИБОСОМЫ: ОСНОВНЫЕ УЧАСТНИКИ ПРОЦЕССА –
- •тРНК и ее аминоацилирование
- •Три последовательные химические реакции биосинтеза белка
- •Реакция активации аминокислоты
- •Реакции активации и акцептирования аминокислоты
- •Классификация аминоацил-тРНК-синтетаз E. coli
- •Схематическое изображение третичной структуры тРНК
- •Два типа комплексов аминоацил-тРНК-синтетазы с тРНК
- •Два типа комплексов аминоацил-тРНК-синтетазы с тРНК
- •Антипараллельное кодон-антикодоновое спаривание
- •Схематическое изображение третичной структуры тРНК
- •ЧТО ВЫЯВИЛОСЬ В ЭКСПЕРИМЕНТАХ К 1966 ГОДУ?
- •Антипараллельное кодон-антикодоновое спаривание
- •Спаривание
- •ЧТО ВЫЯВИЛОСЬ В ЭКСПЕРИМЕНТАХ К 1966 ГОДУ?
- •Спаривание
- •Гипотеза Крика о “вихлянии” положений азотистых оснований при спаривании положения 1 антикодона с
- •Антипараллельное кодон-антикодоновое взаимодействие
- •Спаривание 1-го основания антикодона с 3-им основанием
- •Спаривание
- •WOBBLE RULES
- •WOBBLE RULES
- •КОНЕЦ ЛЕКЦИИ
- •ОСОБЕННОСТИ ЭУКАРИОТИЧЕСКИХ мРНК:
- •Prokaryotes: Coupled transcription-translation
- •Eukaryotes: Transcription and translation are uncoupled being performed in different compartments
- •ОСОБЕННОСТИ ЭУКАРИОТИЧЕСКИХ мРНК:
- •Функциональные области цепи эукариотической мРНК
А.С. Спирин
Молекулярная биология:
Лекция 4.
Эволюция древнего Мира РНК. Генетический код, мРНК и тРНК. Митохондриальные рибосомы.
4 марта 2015 г.
Происхождение жизни из древнего мира РНК
Gilbert, W. (1986). Origin of life: The RNA world. Nature 319, 618.
А Б И О Г Е Н Н Ы Е Р И Б О Н У К Л Е О Т И Д Ы
О Л И Г О Р И Б О Н У К |
Л Е О Т И Д Ы , |
т р а н с э с т е р и ф |
и к а ц и я |
П О Л И Р И Б О Н У К Л Е О Т И Д Ы
К а т а л и т и ч е с к и е а к т и в н о с т и ( р и б о з и м ы )
С а м о п р о ц е с с и р у ю щ и е с с а м о р е п л и ц и р у ю щ и е
м о л е к у л ы Р Н К С и н т е з б е л к а
К Л Е Т К И
Древний мир РНК
•Возникновение и существование мира РНК на Земле требовало жидкой водной среды с нейтральной рН и растворенными солями одновалентных металлов (в первую очередь K+ и Na+) и Mg2+.
•Скорее всего, мир РНК мог возникнуть и существовать в мелких водоемах (лужах, «дарвиновских прудах»), где могли концентрироваться абиогенно возникающие органические вещества (океанские просторы едва ли годились для этого).
•Появление и присутствие РНК-репликазной активности в водной среде РНК-содержащей лужи или пруда должно было давать в результате эффект амплификации всех олиго- и полирибонуклеотидов этого водоема, т.е. рост общей популяции молекул РНК.
Схема развития жизни на Земле
Схема развития жизни на Земле
Ancient RNA world
as precursor of life
on the Earth
DNA RNA Proteins
RNA Proteins
RNA
Мир РНК:
Зарождение и эволюция в первобытном «дарвиновском пруду» или луже?
Полирибонуклеотидные цепи (РНК) в растворе при температурах от 5° до 37°C обладают внутренне присущим им свойством время от времени обмениваться частями своих последовательностей
(H.V. Chetverina, A.A. Demidenko, V.I. Ugarov and A.B. Chetverin . Spontaneous rearrangements in RNA sequences. FEBS Letters 450: 89-94,1999),
В результате
(1)некоторые полирибонуклеотидные цепи удлиняются за счет укорочения других , и
(2)происходит непрерывная генерация вариантов нуклеотидных последовательностей.
УДЛИНЕНИЕ ОЛИГОНУКЛЕОТИДОВ ПУТЕМ ТРАНСЭСТЕРИФИКАЦИИ
G-A + G-A G-G-A + A,
G-G-A + U-C-U G-G-U-C-U + A,
G-G-U-C-U + G-C-A-A -U G-G-U-C-G-C-A-A-U + U.
Мир РНК:
Зарождение и эволюция в первобытном «дарвиновском пруду» или луже?
Достаточная длина полирибонуклеотидов и непрерывная генерация вариантов –
Появление полирибонуклеотидов-рибозимов с различными каталитическими активностями, включая:
•рибозимы, катализирующие реакции синтеза предшественников нуклеотидов и самих нуклеотидов (нуклеозидтрифосфатов), и
•рибозимы, катализирующие комплементарную репликацию
полирибонуклеотидов (РНК-полимеризующие рибозимы).
Реплицирующаяся («размножающаяся») популяция
разнообразных и разнообразящихся полирибонуклеотидов – «прудовая коммуна РНК».
Мир РНК:
Зарождение и эволюция в первобытном «дарвиновском пруду» или луже?
Результат:
Прудовая коммуна полирибонуклеотидов! («РНК-Солярис»).
«От каждого – по способностям, каждому – по потребностям»!
Проблема:
Идентификация функционально лучших?
Отсев «негодных»? отбор нужных и лучших? дальнейшая эволюция?