4. Систематика прокариот, для представителей домена Bacteria.

Бактерии – составляют обширную группу микроорганизмов. В большинстве своем они являются одноклеточными организ­мами. По своим биологическим свойствам – прокариоты (доядерные).

Систематика (таксономия) — наука о многообразии и взаимосвязях между организмами. Одна из задач систематики —классификация множества организмов по группам (таксонам). Но, прежде чем осуществлять такое распределение, необходимо достаточно полно охарактеризовать объекты и на основании отобранной информации идентифицировать их. Последнее может привести к выявлению организмов с неизвестными или известными признаками и соответственно помещению их в новый таксон на определенном уровне или же отнесению к известным таксонам.

Таксон — группа организмов, обладающих заданной степенью однородности.

Специальный раздел таксономии — номенклатура — имеет дело с правилами присвоения наименований описанным объектам. В систематике бактерий для наименования объекта используют биномиальную номенклатуру К. Линнея, согласно которой биологическому виду присваивают название, состоящее из двух слов: первое определяет принадлежность организма к определенному роду, второе — виду. Названия бактериям присваивают в соответствии с правилами Международного кодекса номенклатуры бактерий.

Основной таксономической категорией является вид. По современным представлениям, вид — это группа близких между собой организмов, имеющих общий корень происхождения и на данном этапе эволюции характеризующихся определенными морфологическими, биохимическими и физиологическими признаками, обособленных отбором от других видов и приспособленных к определенной среде обитания.

В микробиологии употребляются такие термины, как "штамм" и "клон". Под штаммом понимают бактериальные культуры одного вида, выделенные, например, из разных мест обитания. Различия между штаммами не выходят за пределы вида. Клон — еще более узкое понятие, это культура, выделенная из одной клетки.

БЕРДЖИ В девятом издании определителя бактерий Берджи (1997) все бактерии объединены в царство Procariotae, которое разделено на четыре отдела по основному признаку - характеру пограничного слоя клеток:

Отдел Gracilicutes - бактерии с грамотрицательной клеточной стенкой.

Отдел Firmicutes - бактерии с грамположительной клеточной стенкой.

Отдел Tenericutes - бактерии без клеточных стенок.

Отдел Mendosicutes - бактерии с ригидной клеточной стенкой, не со­держащей пептидогликана.

Отдел	Краткая характеристика
Отдел I Gracilicиtes	Включает организмы с разной морфологией, имеющие грамотрицательную клеточную стенку. Размножаются в основном бинарным делением, в некоторых группах – почкованием, в одной – множественным делением. Спор не образуют. Многие подвижны с помощью жгутиков или скольжения. Аэробные, анаэробные или факультативно анаэробные формы. Отдел подразделяется на 3 класса, объединяющие нефотосинтезирующие (Scotobacteria) и фотосинтезирующие (Anoxyphotobacteria,Oxyphotobacteria) организмы.
Отдел II Firmicиtes	Входят организмы с грамположительной клеточной стенкой. Размножаются в основном бинарным делением. У некоторых образуются эндоспоры. У других – споры на гифах или в спорангиях. Перемещаются с помощью жгутиков. Большинство неподвижны. В состав отдела входят аэробные, анаэробные, факультативно анаэробные формы. В зависимости от морфологии предложено деление на 2 класса: Firmibacteria (кокки, палочки, неветвящиеся нити) и Тhallobacteria (ветвящиеся формы).
Отдел III Tenericиtes	Относятся прокариоты, у которых отсутствует клеточная стенка и не синтезируются предшественники пептидогликана. Клетки окружены ЦПМ, чрезвычайно плеоморфны. Размножение бинарным делением, почкованием, фрагментацией. Окрашивание по Граму отрицательное. Характерно образование мелких, врастающих в агарколоний. Могут быть сапрофитами, паразитами или патогенами. Представлены одним классом – Mollicutes.
Отдел IV. Mendosicиtes	Объединены прокариоты, по имеющимся данным претендующие на более раннее происхождение, чем формы, включенные в I и II отделы. Клетки разной формы: кокки, палочки, нити. Многие плеоморфны. Большинство имеют клеточную стенку, но она не содержит типичного пептидогликана. Клеточная стенка может быть построена только из белковых макромолекул или гетерополисахаридов. Окрашивaниe по Граму отрицательное или положительное. Большинство – строгие анаэробы. Многие имеют жгутики. Характеризуются экологическим и метаболическим разнообразием, способностью жить в экстремальных условиях. Объединены в класс Archaeobacteria