Изомеразы
5. Изомеразы катализируют превращения одного изомера в другой. При этом могут быть внутримолекулярные перемещения какой-нибудь функциональной группы с одного положения на другое. Например фермент фосфоглюкомутаза превращает Гл-1-Ф в Гл-6-Ф. Другой фермент превращает Гл-6-Ф во Фр-6-Ф.
Есть изомеразы, которые превращают транс-формы вещества в цис-форму, т.е. производят пространственные перемещения.
Различают также стереоизомеразы и т.д.
Лигазы (синтетазы)
6. Лигазы (синтетазы) - ферменты, соединяющие две молекулы субстрата в присутствии аденозинтрифосфата или других нуклеозидтрифосфатов. В этой реакции происходит затрата энергии за счет распада ТФ, или каких-либо других соединений, содержащих высокоэнергетиескую связь (УТФ, ГТФ, СН3-СО~КоА).
АТФ + Н2О -----АДФ + Н3РО4 + Q
ОКСИДОРЕДУКТАЗЫ
Рассмотрим подробнее I класс - оксидоредуктазы.
Эти ферменты катализируют окислительно-восстановительные реакции с участием двух субстратов - S и S':
Sвосст + S'окисл == Sокисл + S'восст.
Вспомним, что в химии окисление определяется как удаление электронов (или протонов), а восстановление - как присоединение электронов (или протонов). Отсюда ясно, что специальностью окислительно-восстановительных ферментов является удаление или присоединение электронов.
Окислительно-восстановительные реакции играют очень важную роль в организме:
1. Прежде всего, надо назвать их энергетическую функцию. В ходе окислительно-восстановительных реакций образуется энергия.
2. Анаболическая функция, т.е. оксидоредуктазы могут участвовать и в процессах синтеза.
3. Обезвреживание вредных веществ, перекисей, продуктов перекисного окисления липидов, токсинов.
Различают несколько групп окислительно-восстановительных ферментов:
I. ДЕГИДРОГЕНАЗЫ. Это ферменты, которые катализируют отщепление или присоединение водорода. Дегидрогеназы бывают разные, различают несколько подклассов ДГ.
Прежде всего ДГ различают в зависимости от того, переносятся ли Н+ и е- на кислород или реакция идет без кислорода. ДГ разделяются на анаэробные дегидрогеназы и аэробные. Анаэробные дегидрогеназы удаляют водород из субстрата, без использования кислорода. Например,
алькогольДГ является анаэробной, т. к. эта реакция протекает без
участия О2. Другой пример:
СН3-С-СООН ======ЛДГ=====СН3-СН-СООН
!! !
О ОН
ПВК Мол. к-та
Анаэробные ДГ являются НАД и НАДФ-зависимыми дегидрогеназами, т.е., их коферментом является НАД (никотинамидадениндинуклеотид) или НАДФ (никотинамидадениндинуклеотидфосфат). Эти коферменты могут свободно диссоциировать из комплекса с апоферментом.
Водород, который отнимается этими ДГ, может использоваться в двух разных путях:
Пути использования водорода: а) используется в процессе тканевого дыхания; б) использование в восстановительном синтезе.
Следует запомнить, что НАД-зависимые дегидрогеназы катализируют окислительно-восстановительные реакции окислительных путей метаболизма и участвуют в производстве энергии в клетке. НАДФ-зависимые дегидрогеназы участвуют в процессах восстановительного синтеза, например, в синтезе высших жирных кислот, холестерина.
Кроме НАД и НАДФ, коферментами анаэробных дегидрогеназ могут быть также ФМН и ФАД. Эти дегидрогеназы либо переносят электроны в дыхательной цепи, либо поставляют электроны для нее.
Аэробные дегидрогеназы - катализируют отнятие (отщепление) водорода из субстрата с использованием кислорода. Продуктом реакции является перекись водорода, а не вода. Коферментом этих ферментов является ФАД (флавинадениндинуклеотид) или ФМН (флавинмононуклеотид):
S-Н2 + ФАД + О2 ---- S + ФАДН2 + О2 ---S + ФАД + Н2О2
Эти реакции имеют большое значение для белых клеток крови - лейкоцитов. Благодаря образованию в них Н2О2 они обладают большой бактерицидной силой, т.е. могут убивать бактерии. В этом случае Н2О2 играет защитную роль, если только не будет его излишка. В противном случае Н2О2 сама повреждает клетки, и тогда ее нужно удалять или обезвреживать. Для этого существуют специальные ферментные системы.
Еще раз запомним, что коферментами анаэробных ДГ могут быть как НАД и НАДФ, так и ФАД и ФМН. коферментами аэробных ДГ бывают только ФАД и ФМН.
2) Отсюда по химическому составу их коферментов различают флавиновые дегидрогеназы (содержат ФАД или ФМН в качестве кофермента) и пиридиновые (коферментом являются НАД+ или НАДФ).
3) В живой клетке ферменты работают, как правило не в отрыве один от другого, а в определенной взаимосвязи. При этом первый фермент может взаимодействовать с каким-то субстратом, а второй – с первым ферментом или с его коферментом. Создается цепочка реакций, в который каждый фермент имеет свое место. Поэтому выделяют первичные ферменты и вторичные. Что касается ДГ, то они также могут быть первичными или вторичными. Это зависит от от того, с чего они забирают Н+ и е-. От того, что они окисляют, различают первичные дегидрогеназы и вторичные. Первичные ДГ отнимают Н+ непосредственно от субстрата, от химического соединения, которое в результате окисляется. Например,
СН3СН2ОН -------алкогольДГ---- СН3-С-Н + НАДН2
(этанол) НАД+ !! (ацетальдегид - яд!!)
О
В плохих винах много альдегида, с чем связано их токсическое действие. АлкогольДГ - первичная дегидрогеназа, она отнимает Н+ непосредственно от сусбстрата. При этот НАД-ДГ сама восстановилась, и теперь ее тоже нужно окислить, т.е. отнять у нее Н+. Для этого существуют вторичные дегидрогеназы. Вторичные ДГ, как правило, флавиновые, т.е. у них коферментом будет флавиновое производное - ФАД или ФМН. Реакция будет протекать так:
НАДН2 + ФАД ------НАД+ + ФАДН2
Итак, еще раз повторим: ДГ бывают: 1) анаэробные (работают без кислорода) и аэробные(работают в присутствии кислорода, продуктом является Н2О22; 2) флавиновые дегидрогеназы (содержат ФАД или ФМН в качестве кофермента) и пиридиновые (коферментом являются НАД+ или НАДФ). 3)первичные и вторичные ДГ.
II. Следующий подкласс окислительно-восстановительных ферментов
- ОКСИДАЗЫ. Они удаляют водород из субстрата. Они также используют кислород, но в отличие от аэробных дегидрогеназ, их продуктом является молекула воды. Эти ферменты обязательно содержат медь или железо, т.е. металлы с переменными валентностями. Благодаря этому они легко связывают е- и переносят их субстрата или какой-либо из ДГ на кислород.
Главными представителями этого подкласса являются ферменты, локализованные в митохондриях и катализирующие реакцию, в результате которой е- переносится на О2. Это цитохромы и цитохромоксидазы. Они содержат две молекулы гема, в каждой из которых атом железа может переходить из Fe2+ в состояние Fe3+. Эти ферменты являются важнейшей составной частью так называемой дыхательной цепи. Т.е. мультиферментного комплекса, расположенного во внутренней мембране митохондрий. С помощью этих ферментов и происходит образование энергии, которая потом переходит в энергию макроэргических связей АТФ. Подробнее о строении и функции цитохромов мы поговорим попозже, когда будем разбирать энергетический обмен и тканевое дыхание.
III. Следующий подкласс окислительно-восстановительных ферментов - это ГИДРОКСИПЕРОКСИДАЗЫ. Эти ферменты используют в качестве субстрата перекись водорода или органические перекиси, например перекиси липидов. Т.е. это как раз те ферментные системы, которые обезвреживают Н2О2 и другие перекиси. Рассмотрим подробнее, как эти системы работают.
Перекисному окислению в организме подвергаются прежде всего фосфолипиды клеточных мембран. Продукты перекисного окисления липидов: образующиеся гидроперекиси, и, особенно, супероксидный радикал О2-. обладают сильной разрушительной силой на клеточные мембраны. В клетках-фагоцитах этот процесс имеет положительное значение, т.к. определяет микробицидную способность фагоцитирующих клеток: макрофагов и лейкоцитов. Их пероксидазы, играющие огромную роль в защитной функции фагоцитирующих клеток, в их микробицидной функции.
Но с другой стороны, очень часто именно ПОЛ является тем процессом, который запускает воспалительные, деструктивные явления в тканях.
Поэтому в организме существуют системы защиты от ПОЛ. Частичная детоксикация Н2О2 и О2-. происходит при участии природных антиоксидантов, например, аскорбиновой кислоты, витамина Е, глутатиона.
Детоксикация О2-. представляет собой ферментативную реакцию, которую катализирует фермент супероксиддисмутаза. При этом образуется Н2О2:
О2-. + О2-. + 2Н+ ---супероксиддисмутаза -- Н2О2 + О2
Далее Н2О2 обезвреживается также под действием ферментов - каталаз и пероксидаз. Так, в эритроцитах имеется глутатионпероксидаза, катализирующая разложение перекиси водорода и защищающая липиды мембран и гемоглобин от окисления перекисями.
Н2О2 + ГТ-Н2 --пероксидаза---2Н2О + ГТ
В эритроцитах имеется также фермент каталаза. Каталаза способствует разрушению перекисей и, таким образом, защищает клетки от повреждающего действия перекисных радикалов:
2Н2О2---каталаза---2Н2О + О2