18. Виды днк проб. Применение в цитогенетический практике.

По своей диагностикой характеристике ДНК пробы подразделяются на:

• Центромерные зонды

• Локус-спецефические ДНК пробы (LSI)

• Субтеломерные зонды ДНК пробы

• Зонды полного окрашивания хромосом

Цетромерные ДНК пробы – состоят из высокоповторяющихся L-сотелитных повторов и используются для идентификации численных хромосомных аномалий, а также для исследования гетероморфизма хромосом при проведение количественного fish-анализа.

Наиболее часто центрометромерные ДНК пробы направлены на выявление численных аномалий хромосом – 1,2,3,6,7,8,10.11,12,15,16,17,18,20,Х,У.

Хромосомы 4 и 9, 5и 19, 13 и 21, 14 и 22 содержат практически одинаковые варианты альфоидной ДНК.

Центромерные ДНК пробы чаще всего используются при натальной диагностике, также при онкологии (выявление численных 3,7,17 – аномалий у хромосом при карциноме мочевого пузыря).

Недостатком является: они не способны отличать интактную хромосому от ее производной ( синдром Шершевского-Тернера), используется при контроле качества спермы донора, а также экспресс-диагностика ранних выкидышей и неразвивающей беременности и ЭКО.

Локус-специфические ДНК пробы – уникальные последовательности ДНК, локализованные в районе хромосомы, потеря которого приводит к развитию синдрома.

Применение данных зондов показано для идентификации структурных перестроек, т.е. для выявления сайтов разрыва при транслокацтт, инверсиях, делециях, инсерциях и микроделециях.

Субтеломерные ДНК пробы – к ним относят теломерные ДНК спецефичные к субтеломерным и теломерным участкам ДНК.

Они позволяют выделить субтеломерные, теломерные делеции и дупликации, а также маркировать индивидуальные хромосомы. Субтеломерные ДНК пробы используются для выявления причин умственной отсталости неясной этиологии.

Зонды полного окрашивания хромосом – переставляет собой набор уникальных последовательностей ДНК, равномерно распределенных вдоль всей длины определенной хромосомы.

Отличительная особенность: используется только на метафазных хромосомах (Не используется на интерфазных хромосомах).

Их применяют для идентификации маркерных хромосом, а также для идентификации сложных структурных перестроек с вовлечением нескольких хромосом.

Недостатки: не дают возможность регистрировать внутрихромосомные перестройки.

19. Понятие об импринтинге на примере синдромов Ангельмана и Прадера-Вилли.

Патогенез некоторых наследственных аномалий связан с импринтингом определенных хромосом и генов . Наиболее изученным примером заболеваний, этиологически связанных с импринтингом, являются синдромы Прадера-Вилли и Ангельмана. Оба синдрома обусловлены изменениями дозы и противоположным импринтингом одного и то же района длинного плеча хромосомы 15 . Делеция этого сегмента в материнской хромосоме, как и отцовская дисомия по хромосоме 15 (то есть когда обе хромосомы 15 у пациента от отца) приводят к синдрому Ангельмана (резкие судорожные движения, умственная отсталость неадекватная смешливость). Напротив, дисомия материнской хромосомы 15 и делеция отцовской копии сегмента приводят к синдрому Прадера-Вилли (умственная отсталость, ожирение, низкий рост и непропорционально малый размер рук и ног). Эти два сопряженных в цитогенетическом смысле заболевания могут быть связаны с реципрокными различиями в импринтинге двух соседних генов, расположенных в районе. Причины геномного импринтинга пока не установлены, возможно, он связан с разным типом укладки ДНК в мужских и женских гаметах.