ДНК-содержащие вирусы

РЕТРОИДНЫЕ (ПАРАРЕТРО) ВИРУСЫ.

( СОДЕРЖАТ ДНК, НО КОДИРУЮТ ОБРАТНУЮ ТРАНСКРИПТАЗУ)

Эти вирусы используют матричную РНК, построенную на матрице ДНК не только для синтеза белков, но и для репликации дочерних геномов вируса.

Общие свойства параретровирусов:

Кольцевая частично двунитевая геномная ДНК: т е есть одно кольцо полностью и второе, комплементарное ему, незамкнутое и не соответствующее полностью по длине (-)ДНК.

• Небольшой размер генома – примерно 3000-8000 нуклеотидов.

• Обратная транскриптаза (RT) присутствует в составе вирионов.

• Нет необходимости встраиваться в хозяйскую хромосому для успешной репликации. Репликация происходит в цитоплазме, ДНК при этом образует в ядре зараженной клетки эписому – сверхспирализованную замкнутую 2-цепочечную структуру, которая необходима для транскрипции.

• Группа VII ( по Балтимору)

Обнаружены и у животных и у растений. Организованы в 2 семейства:

• Семейство Hepadnaviridae,(заражают только гепатоциты), передаются через кровь, половым путем и вертикально (от матери к ребенку)

род Orthohepadnavirus (млекопитающие) и

род Avihepadnavirus (птицы).

HBV, вирус гепатита B. Вирионы – икосаэдр,

покрытый липидной оболочкой.

• Семейство Caulimoviridae, 7 родов. CaMV,

cauliflower mosaic virus, вирус мозаики цветной капусты. Икосаэдрической или бацилловидной формы, липидная оболочка

отсутствует, заражают растения

род Badnavirus

3 Варианта вирусных частиц

• 1 – инфекционные частицы Дейна ~42 нм;(70% приходится на белок S). Австралийский ген, или HВsAg в крови говорит о носительстве вируса гепатита В и о риске образования карциномы печени.

К 5 концу (-)цепи присоединен белок Р (полимераза, по сути ревертаза). На 5 конце (+) цепи находится фрагмент РНК, т о + и – цепи используют различные затравки для своей репликации.

• 2 – неинфекционные сферические 20нм, это HВsAg (почти только S белок) и мембрана и все. Они накапливаютя, 10 тыс – 1 млн на 1 частицу Дейна, полезно для диагностирования.

• 3 -нитевидные различной длины диаметром 20нм.

Вирионы 2 и 3 содержат только поверхностный антиген HBsAg (S-белок) без геномной ДНК и белка сердцевины (core) и

присутствуют в большом избытке.

Еще раз о белках: HВsAg

3 Поверхностных антигена – l(39кДа),m(31кДа),s(24кДа).

• Антиген S – основной компонент оболочки: L и M составляют 2% и 5-10% от общего количества.

• Антиген L необходим для связывания с клеточным рецептором и для созревания вирусных частиц. Взаимодействует с коровой частью вириона и приводит к его переносу через мембрану эндоплазматической сети.

• После попадания в ядро неполная (+) нить ДНК достраивается до полного размера, рибонуклеотидный праймер удаляется с ее 5 конца.

• С 5 конца (-) ДНК удаляется молекула полимеразы

• Все разрывы в молекулах лигируются с помощью ферментов клетки

• Двуцепочечная ДНК вируса гепатита В сверхспирализуется тоже с помощью ферментов клетки, находящихся в ядре

• Итак, в виде такой эписомы ДНК служит матрицей для транскрипции

• Эта эписома в ядре может реплицироваться, но в незначительном количестве, основная репликация вирусного генома будет происходить в цитоплазме

ORF – открытая рамка считывания, HВsAg – зеленый

Есть несколько ORF:

ORF P - revertase.

ORF S/preS - гликопротеиды оболочки

ORF C - белок нуклеокабпсида, С-белок

ORF X HBX, 17 кда, неструктурный белок, трансактиватор экспрессии

генов, основной фактор онкогенного потенциала гепатита Б. Геном

вируса гепатита Б 3.5 кб - небольшой. Здесь опять используется

перекрывание генов - все гены перекрываются. Транскрипция на

эписоме идет с помощью клеточной РНК полимеразы. ранскрибируется

4 мРНК, все кэпировано, полиаденилировано.Промоторы, с которых идет образование этих матричных РНК ,находятся в разных участках генома, а 3 концы идентичны. Начинается их синтез в разных точках, но оканчивается в одной, они котерминальны.

С самой маленькой м-РНК транслируется белок Х.

АУГ белка S находится ближе всего к 5 концу и кэпу, а АУГ М белка находится чуть дальше в другой рамке считывания, а т к эукариотические рибосомы предпочитают 1ый АУГ , белка S на капливается очень много, а белок М инициируется от случая к случаю и его образуется меньше. Аналогично происходит при трансляции прегеномной РНК.

Итак, вот эта РНК является матрицей для белка кора и ревертазы и матрицей для репликации белка.

Оказывается, что длина прегеномной РНК больше самого генома! С нее транслируется тоже 2 белка НВс и полимераза.

В вирусную частицу входит около 200 копий корового белка и всего одна молекула полимеразы. АУГ С белка находится ближе к 5 концу и происходит нормальная кэп-зависимая инициация, эффективная, а АУГ полимеразы находится на некотором расстоянии, тоже со сбоем рамки, и полимеразы образуется очень мало, где-то 1 молекула на вирусную частицу.