0. Первичный синтез углеводов у с₃- и с₄-растений.

В ходе темновых реакций фотосинтеза происходит эндергонический процесс образования углеводов из диоксида углерода (СО₂) и воды, в котором в качестве энергетических источников используются продукты световых реакций НАДФ×Н и АТФ. Последовательность химических превращений в темновой стадии фотосинтеза была выяснена американскими биохимиками М Кальвином, А. Бенсоном и Д. Басхемом в 1946-53 г.г. и впоследствии названа циклом Кальвина вследствие того, что открытые ими превращения имели циклический механизм. Все эти реакции протекают в строме – жидкой дисперсионной среде хлоропластов.

Для установления первичных продуктов, которые образуются при фотосинтезе из СО₂ и Н₂О, М. Кальвин и его сотрудники использовали культуру водорослей хлореллы, в которую вводили на свету меченный ¹⁴С СО₂ в виде Н₂¹⁴СО₃ и через короткие промежутки времени отбирали пробы клеток суспензии водорослей и фиксировали их метанолом. После этого из клеток хлореллы выделяли углеводы и другие органические вещества и в них определяли наличие радиоактивной метки, обусловленной включением в эти продукты ¹⁴С. При этом было установлено, что при коротких экспозициях (0,1-5 сек.) клеток водорослей в суспензионной среде, содержащей ¹⁴СО₂, большая часть радиоактивной метки обнаруживалась в карбоксильной группе 3-фосфоглицериновой кислоты. Последнее свидетельствовало о том, что фосфоглицериновая кислота является первичным продуктом фотосинтеза.

В дальнейшем с использованием радиоактивной метки в виде ¹⁴С и ³²Р было показано, что первичным акцептором, с которым взаимодействует СО₂ служит рибулозо-1,5-дифосфат. И эту реакцию катализирует фермент рибулозодифосфаткарбоксилаза (4.1.1.39). Учитывая, что для образования карбоксильной группы кроме СО₂ требуется еще молекула воды, первую реакцию цикла Кельвина можно записать следующим образом:

СН₂О(Р) СН₂О(Р) СООН (1)

| | |

С=О НО-С-Н + Н-С-ОН

| + ^*СО₂ + Н₂О ¾¾® | |

Н-С-ОН à СН₂О(Р) ^*СООН СН₂О(Р)

| Ý | 2 молекулы

Н-С-ОН С-ОН 3-фосфоглицериновой

| || кислоты

СН₂О(Р) С-ОН

рибулозо-1,5- |

дифосфат Н-С-ОН

|

СН₂О(Р)

енольная

форма

2 молекулы

3-фосфоглицериновой

рибулозо-1,5- енольная форма кислоты

дифосфат

Диоксид углерода в ходе реакции взаимодействует с енольной формой рибулозо-1,5-дифосфата, при этом образуется неустойчивый продукт – β–кетокислота, который под действием фермента гидролизуется, превращаясь в 3-фосфоглицериновую кислоту. При этом радиоактивный углерод обнаруживается в карбоксильной группе одной из двух синтезирующихся молекул 3-фосфоглицериновой кислоты.

Фермент рибулозодифосфаткарбоксилаза в большом количестве содержится в хлоропластах растений (до 16 % от общего количества белков), а также в клетках зелёных и пурпурных бактерий. Он состоит из восьми пар неидентичных субъединиц и имеет большую молекулярную массу (560000). Для проявления каталитической активности этого фермента необходимо присутствие катионов Mg²⁺.

Рибулозодифосфаткарбоксилаза аллостерически активируется фруктозо-6-фосфатом и аллостерически ингибируется фруктозо-1,6-дифос-фатом, которые образуются при последующих превращениях в цикле Кальвина 3-фосфоглицериновой кислоты, являющейся продуктом действия данного фермента. Образовавшаяся под действием рибулозодифосфаткарбоксилазы 3-фосфоглицериновая кислота в последующих реакциях восстанавливается до альдегида.

Вначале молекула 3-фосфоглицериновой кислоты активируется путём фосфорилирования с участием АТФ. Эту реакцию катализирует фермент фосфоглицераткиназа (2.7.2.3), включающий 355 аминокислотных остатков и активируемый катионами Мg²⁺:

СООН О

½ фосфоглицерат- ‖ (2)

Н–С–ОН + АТФ ¾¾¾¾¾® С– О~(Р) + АДФ

½ киназа |

СН₂О(Р) Н–С–ОН

|

СН₂О(Р)

3-фосфоглицериновая 1,3-дифосфоглицериновая

кислота кислота

Продукт реакции 1,3-дифосфоглицериновая кислота представляет собой макроэргическое соединение, имеющее высокое значение потенциала переноса фосфатной группы ( при гидролизе DGºˈ= -49 кДж×моль^-1), в связи с чем оно уже легко подвергается восстановлению в следующей реакции под действием фермента триозофосфат-дегидрогеназы (1.2.1.9) с участием восстановленной формы динуклеотида НАДФ×Н:

О О (3)

‖ триозофосфат- ‖

С–О~(Р) дегидрогеназа С–Н

½ + НАДФ·Н + Н⁺ ¾¾¾¾¾® ‌ + НАДФ⁺ + Н₃РО₄

Н–С–ОН Н–С–ОН

| ½

СН₂О(Р) СН₂О(Р)

1,3-дифосфоглице- 3-фосфоглице-

риновая кислота риновый альдегид

В ходе восстановительной реакции происходит синтез 3-фосфоглицерино-вого альдегида и отщепление от 1,3-дифосфоглицериновой кислоты минерального фосфата. Участвующие в синтезе 3-фосфоглицеринового альдегида АТФ и НАДФ×Н являются продуктами световой стадии фотосинтеза.

Как было показано ранее, в результате связывания одной молекулы СО₂ в первой реакции цикла Кальвина образуются 2 молекулы 3-фосфо-глицериновой кислоты, которые в ходе реакций 2 и 3 превращаются в две молекулы 3-фосфоглицеринового альдегида, а последние довольно легко изомеризуются в фосфодиоксиацетон. Реакцию изомеризации катализирует фермент триозофосфатизомераза (5.3.1.1):

Н

½

С=О триозофосфат- СН₂ОН (4)

| ^¾¾¾¾® |

Н–С–ОН ^¬¾¾¾¾ С=О

| изомераза |

СН₂О(Р) СН₂О(Р)

3-фосфоглице- фосфодиокси-

риновый альдегид ацетон

Представленная реакция легко обратима, так как сопровождается небольшим изменением свободной энергии. Фермент триозофосфатизомераза отличается высокой молярной активностью (2800 кат×моль^-1 фермента для превращения в фосфодиоксиацетон).

Образовавшиеся триозофосфаты не накапливаются в хлоропластах. Под действием фермента альдолазы (4.1.2.13) они конденсируются, превращаясь во фруктозо-1,6-дифосфат:

Н СН₂О(Р)

‌ ‌ (5)

СН₂ОН С=О С=О

| | альдолаза ½

С=О + Н–С–ОН ¾¾® НО–С–Н

| | |

СН₂О(Р) СН₂О(Р) Н–С–ОН

фосфодиокси- 3-фосфоглицери- |

ацетон новый альдегид Н–С–ОН

|

СН₂О(Р)

фруктозо-1,6-дифосфат

После этого от фруктозо-1,6-дифосфата происходит гидролитическое отщепление остатка фосфорной кислоты. Реакцию катализирует фермент фруктозо-1,6-дифосфатаза (3.1.3.11). В ходе этой реакции фруктозодифосфат превращается во фруктозо-6-фосфат:

СН₂О(Р) СН₂ОН (6)

| |

С=О фруктозо- С=О

| 1,6-дифос- |

НО–С–Н + Н₂О ¾¾¾® НО–С–Н + Н₃РО₄

| фатаза |

Н–С–ОН Н–С–ОН

| |

Н–С–ОН Н–С–ОН

| |

СН₂О(Р) СН₂О(Р)

фруктозо-1,6-дифосфат фрутозо-6-фосфат

Фруктозо-1,6-дифосфатаза – активируемый светом фермент. Его активирование происходит с участием восстановленного под действием света ферредоксина, который совместно со специфическим белком переводит фруктозо-1,6-дифосфатазу в активное состояние. От действия этого фермента зависит интенсивность включения СО₂ в первой реакции цикла Кальвина. Если активность фруктозо-1,6-дифосфатазы низкая, то повышается концентрация фруктозо-1,6-дифосфата, который аллостерически ингибирует фермент рибулозодифосфаткарбоксилазу, вследствие чего понижается скорость первой реакции цикла Кальвина, катализируемой данным ферментом. А если фруктозо-1,6-дифосфатаза находится в активной форме, то повышается концентрация фруктозо-6-фосфата, являющегося аллостерическим активатором рибулозодифосфаткарбоксилазы. При таких условиях связывание СО₂ проходит с максимальной скоростью.

На следующем этапе фотосинтеза фермент транскетолаза (2.2.1.1) катализирует перенос концевого двууглеродного радикала, содержащего кетонную группу, от фруктозо-6-фосфата на 3-фосфоглицериновый альдегид, который образуется в результате присоединения к рибулозо-1,5-дифосфату ещё одной молекулы СО₂ и повторения реакций 2 и 3. В результате взаимодействия гексозы и триозы синтезируются новые углеводные продукты – эритрозо-4-фосфат и ксилулозо-5фосфат:

Н (7)

СН₂ОН Н ½

| ½ С=О СН₂ОН

С=О С=О | |

| | транскето- Н–С–ОН + С=О

НО–С–Н + Н–С–ОН ¾¾® | |

| | лаза Н–С–ОН НО–С–Н

Н–С–ОН СН₂О(Р) | |

| СН₂О(Р) Н–С–ОН

Н–С–ОН 3-фосфоглицери- эритрозо-4- |

| новый альдегид фосфат СН₂О(Р)

СН₂О(Р) ксилулозо-5-

фруктозо-6-фосфат фосфат

Ещё одна молекула 3-фосфоглицеринового альдегида, синтезированная в результате связывания второй молекулы СО₂, изомеризуется далее в реакции 4 в фосфодиоксиацетон, который затем соединяется с эритрозо-4-фосфатом, образуя седогептулозо-1,7-дифосфат. Эту реакцию катализирует фермент трансальдолаза (2.2.1.2):

Н СН₂О(Р) (8)

½ |

СН₂О(Р) С=О С=О

| | трансальдо- |

С=О + Н–С–ОН ¾¾¾® НО–С–Н

| | лаза |

СН₂ОН Н–С–ОН Н–С–ОН

фосфодиоксиацетон | |

СН₂О(Р) Н–С–ОН

эритрозо-4-фосфат |

Н–С–ОН

|

СН₂О(Р)

седогептулозо-

1,7-дифосфат

В следующей реакции происходит гидролиз седогептулозо-1,7-ди-фосфата, который катализирует специфическая фосфатаза. В ходе реакции

от седогептулозо-1,7-дифосфата отщепляется остаток фосфорной кислоты и таким образом осуществляется синтез седогептулозо-7-фосфата:

СН₂О(Р) СН₂ОН (9)

| |

С=О С=О

| фосфатаза |

НО-С-Н + Н₂О ¾¾¾® НО-С-Н + Н₃РО₄

| |

Н-С-ОН Н-С-ОН

| |

Н-С-ОН Н-С-ОН

| |

Н-С-ОН Н-С-ОН

| |

СН₂О(Р) СН₂О(Р)

седогептулозо-1,7- седогептулозо-7-

дифосфат фосфат

После этого снова вступает в действие фермент транскетолаза, катализирующий перенос двууглероного радикала с кетогруппой от седогептулозо-7-фосфата на 3-фосфоглицериновый альдегид, который синтезируется за счёт связывания в первой реакции цикла Кальвина уже третьей молекулы СО₂. Продукты реакции, катализируемой транскетолазой, – пятиуглеродные производные моносахаридов ксилулозо-5-фосфат и рибозо-5-фосфат:

(10)

Н

СН₂ОН Н ½

| ½ СН₂ОН С=О

С=О С=О | |

| | транскетолаза С=О Н–С–ОН

НО–С–Н + Н–С–ОН ¾¾¾® | + |

| | НО–С–Н Н–С–ОН

Н–С–ОН СН₂О(Р) | |

| 3-фосфоглицери- Н–С–ОН Н–С–ОН

Н–С–ОН новый альдегид | |

| СН₂О(Р) СН₂О(Р)

Н–С–ОН ксилулозо-5- рибозо-5-

| фосфат фосфат

СН₂О(Р)

седогептулозо-7-

фосфат

В последующих реакциях цикла Кальвина осуществляется изоме-ризация фосфорнокислых производных пентоз, которая обеспечивает регенерацию первичного акцептора СО₂ – рибулозо-1,5-дифосфата. Образовавшиеся в реакциях 7 и10 молекулы ксилулозо-5-фосфата превращаются в рибулозо-5-фосфат под действием фермента рибулозофосфатэпимеразы (5.1.3.1), который способен изменять на противоположную пространственную ориентацию водорода и гидроксильной группы у третьего углеродного атома пентозы:

СН₂ОН СН₂ОН (11)

| |

С=О ¾¾¾® С=О

| ¬¾¾¾ |

НО-С-Н Н-С-ОН

| |

Н-С-ОН Н-С-ОН

| |

СН₂О(Р) СН₂О(Р)

ксилулозо-5- рибулозо-5-фосфат

фосфат

Н (12)

‌ С=О СН₂ОН

| рибозофосфат- |

Н-С-ОН ¾¾¾® С=О

| ¬¾¾¾ |

Н-С-ОН изомераза Н-С-ОН

| |

Н-С-ОН Н-С-ОН

| |

СН₂О(Р) СН₂О(Р)

рибозо-5-фосфат рибулозо-5-фосфат

Превращение рибозо-5-фосфата в рибулозо-5-фосфат катализирует фермент рибозофосфатизомераза (5.3.1.6):

СН₂ОН СН₂О(Р) (13)

| |

С=О С=О

| фосфорибулокиназа |

Н-С-ОН + АТФ ¾¾¾® Н-С-ОН + АДФ

| |

Н-С-ОН Н-С-ОН

| |

СН₂О(Р) СН₂О(Р)

рибулозо-5-фосфат рибулозо-1,5-дифосфат

Окончательную регенерацию первичного акцептора СО₂ осуществляет фермент фосфорибулокиназа (2.7.1.19), катализирующий фосфорилирование от АТФ рибулозо-5-фосфата:

В ходе указанных выше тринадцати реакций происходит включение в состав углеводных производных трёх молекул СО₂ и потребление трёх молекул первичного акцептора рибулозо-1,5-дифосфата, при этом осуществляется синтез шести молекул 3-фосфоглицеринового альдегида, из которых пять затрачиваются на регенерацию трёх молекул рибулозо-1,5-дифосфата и одна молекула 3-фосфоглицеринового альдегида остаётся как продукт темновой стадии фотосинтеза. Её синтез сопряжён с использованием биоэнергетических продуктов световой стадии фотосинтеза АТФ и НАДФ×Н.

Восстановленные динуклеотиды НАДФ×Н участвуют в реакции 3 цикла Кальвина, которая в ходе синтеза 6 молекул 3-фосфоглицери-нового альдегида повторяется 6 раз и, следовательно, в этих реакциях потребляются 6 молекул восстановленных динуклеотидов НАДФ×Н. АТФ участвует в реакции 2, которая, как и реакция 3, повторяется 6 раз, и в реакции 13, которая при синтезе 3 молекул первичного акцептора СО₂ рибулозо-1,5-дифосфата повторяется 3 раза. Всего при связывании 3 молекул СО₂ и восстановлении их до уровня 3-фосфоглицеринового альдегида потребляется 9 молекул АТФ.

Однако 3-фосфоглицериновый альдегид не накапливается в хлоропластах, он используется для синтеза гексозы. Часть молекул 3-фосфогли-церинового альдегида изомеризуется в фосфодиоксиацетон, который далее под действием альдолазы конденсируется с оставшимися молекулами 3-фосфоглицеринового альдегида и, таким образом, осуществляется синтез фруктозо-1,6-дифосфата. После гидролиза фруктозодифосфата с участием фруктозо-1,6-дифосфатазы образуется фруктозо-6-фосфат. Если учесть, что для синтеза фруктозо-6-фосфата потребуется связывание 6 молекул СО₂ в первой реакции цикла Кальвина и все выше указанные превращения, связанные с синтезом одной молекулы 3-фосфоглицеринового альдегида, должны повториться еще раз, суммарное уравнение темновой стадии фотосинтеза может быть записано в следующем виде:

ферменты

6СО₂ + 11Н₂О + 18АТФ + 12НАДФ×Н + 12Н⁺ ¾® фруктозо-6-фосфат + 18АДФ +

+ 12НАДФ⁺ + 17Н₃РО₄ цикла Кальвина

В опытах с использованием СО₂, меченного ¹⁴С, было показано, что в течение 1-3 минут после экспозиции растений в атмосфере ¹⁴СО₂ все промежуточные продукты цикла Кальвина насыщаются меченым углеродом, а при более длительных экспозициях ¹⁴С обнаруживается уже в составе сахарозы, крахмала, органических кислот, аминокислот, липидов, белков и других органических веществ хлоропластов.

Следует отметить, что из всех реакций цикла Кальвина только первая и последняя (13) специфичны для фотосинтезирующих клеток, тогда как другие реакции могут протекать в любых других клетках и тканях фотосинтезирующих организмов в ходе синтеза, распада и превращений углеводов. При этом промежуточные метаболиты, образующиеся в цикле Кальвина, выводятся из этого цикла и потребляются для синтеза различных органических веществ в хлоропластах и листьях растений. Конечный продукт цикла Кальвина фруктозо-6-фосфат также включается в биосинтетические реакции, происходящие в фотосинтезирующих тканях, или превращается в транспортные формы, которые по сосудам флоэмы поступают в акцепторные органы растений.

Фотодыхание. Изучение механизма действия фермента рибулозоди-фосфаткарбоксилазы показало, что конкурентным ингибитором этого фермента является кислород, который конкурирует с СО₂ при взаимодействии последнего с каталитическим центром ферментного белка. Поэтому при высокой концентрации кислорода и низкой концентрации СО₂ в воздухе карбоксилирующая активность рибулозодифосфат-карбоксилазы понижается, но усиливается её оксигеназная способность, вследствие чего к рибулозо-1,5- дифосфату присоединяется не СО₂, а кислород, в результате происходит расщепление рибулозо-1,5-дифосфата на 3-фосфоглицериновую и фосфогликолевую кислоты:

СН₂О(Р) СООН

| |

С-ОН СН₂О(Р) Н-С-ОН

|| | + |

С-ОН + О₂ ¾¾® СООН СН₂О(Р)

| 2-фосфогли- 3-фосфоглице-

Н-С-ОН колевая кислота риновая кислота

|

СН₂О(Р)

енольная форма

рибулозо-1,5-ди-

фосфата

фосфата

Образовавшаяся фосфогликолевая кислота под действием специфической

фосфатазы подвергается гидролизу с образованием неорганического фосфата и гликолевой кислоты:

СН₂О(Р) фосфатаза СН₂ОН

| + Н₂О ¾¾® | + Н₃РО₄

СООН СООН

гликолевая

кислота

Гликолевая кислота подвергается дальнейшим превращениям в пероксисомах – субклеточных органеллах, функциональная деятельность которых тесно связана с процессами, происходящими в хлоропластах и митахондриях. В пероксисомах гликолевая кислота окисляется с участием фермента гликолатоксидазы и превращается в глиоксиловую кислоту:

СН₂ОН гликолат- Н

| + О₂ ¾¾¾¾® ½ + Н₂О₂

СООН оксидаза С=О

½

гликолевая СООН

кислота глиоксиловая

кислота

Продукт данной реакции Н₂О₂ разлагается под действием каталазы на воду и кислород, а глиоксиловая кислота аминируется от глутаминовой кислоты, превращаясь в аминокислоту глицин:

Н

½ + СН₂-СООН СН₂NH₂ СН₂-СООН

С=О | аминотранс- | + |

½ СН₂ ¾¾¾¾® СООН СН₂

СООН | фераза глицин |

глиоксиловая СНNH₂-СООН СО-СООН

кислота глутаминовая a-кетоглутаровая

кислота кислота кислота

Аминокислота глицин не накапливается в пероксисомах, а транспортируется из пероксисом в митохондрии, где участвует в синтезе аминокислоты серина (рис. …). Эту реакцию катализируют ферменты глициндекарбоксилаза и серинтрансгидрооксиметилаза, имеющая в активном центре в качестве кофермента тетрагидрофолиевую кислоту. В ходе реакции синтеза серина происходит также высвобождение СО₂ и NH₃, а также образование НАД×Н:

СН₂NH₂ +Н₂О СН₂ОН

| + НАД⁺ ¾¾® | + СО₂ + NH₃ + НАД×Н + Н⁺

CООН СНNH₂

глицин |

СООН

серин

Образовавшийся в митахондриях серин может далее транспортироваться в пероксисомы и под действием аминотрансферазы передавать аминогруппу на молекулы пировиноградной кислоты. В результате этой реакции серин превращается в гидроксипировиноградную кислоту, а пировиноградная кислота в аминокислоту аланин:

СН₂ОН СН₃ СН₂ОН СН₃

| | аминотранс- | |

СНNH₂ + С=О ¾¾¾® С=О + СНNH₂

| | фераза | |

СООН СООН СООН СООН

серин пировино- гидроксипи- a-аланин

градная ровиноградная

кислота кислота

СН₂ОН СН₂ОН

| |

С=О + НАДФ×Н +Н⁺ ¾¾® СНОН + НАДФ⁺

| |

СООН СООН

гидроксипиро- глицериновая

виноградная кислота

кислота

Гидроксипировиноградная кислота восстанавливается в глицериновую кислоту с участием дегидрогеназы:

Продукт этой реакции глицериновая кислота может затем в хлоропластах фосфорилироваться и, превращаясь в 3-фосфоглицериновую кислоту, включаться в реакции цикла Кальвина:

СН₂ОН СН₂О(Р)

| глицераткиназа |

СНОН + АТФ ¾¾¾¾¾¾® СНОН + АДФ

| |

СООН СООН

глицериновая 3-фосфо-

кислота глицериновая

кислота

Таким образом, при взаимодействии пероксисом, хлоропластов и митохондрий в фотосинтезирующих клетках растений осуществляется процесс, связанный с поглощением О₂ и высвобождением СО₂, который называют фотодыханием. Кислород принимает участие в первой реакции, где он связывается вместо СО₂ с молекулами рибулозо-1,5-дифосфата, и при окислении фосфогликолевой кислоты в пероксисомах. Выделение СО₂ происходит в митохондриях в ходе синтеза аминокислоты серина.

В связи с тем, что при фотодыхании осуществляются превращения гликолевой кислоты – продукта разложения первичного акцептора СО₂, синтезируемого в реакциях цикла Кальвина, за счёт таких превращений уменьшается количество связанной в ходе фотосинтеза СО₂, в результате чего понижается урожайность растений. В опытах установлено, что в естественных условиях произрастания при повышенных температурах, снижающих концентрацию СО₂ в хлоропластах, продуктивность растений вследствие интенсивного фотодыхания может понижаться на 30-40 %.

Исходя из этих данных, учёными–биохимиками сформулирована важнейшая задача для селекционеров и генетиков по выведению новых сортов сельскохозяйственных культур с пониженной скоростью фотодыхания. Одним из главных направлений такой работы является оптимизация структуры каталитического центра фермента рибулозодифосфаткарбоксилазы, направленная на усиление карбоксилазной и ослабление оксигеназной активности этого фермента. Для решения указанной проблемы большие надежды возлагаются на применение методов генетической и белковой инженерии.