Содержание

ВВЕДЕНИЕ 2

1 Характеристика рода Rhodococcus 5

1.1 Дополнительная описательная информация 6

2 Материалы и методы 13

2.1.1 Определение физиологических признаков 14

2.1.2 Рост на плотной питательной среде на чашках Петри 16

Амилолитическая активность 18

Протеолиз казеина 18

18

2.1.3 Использование соединений углерода: 19

22

2.1.4 Использование кислот: 22

Индикатор- фенолрот (феноловый красный) 22

ЗАКЛЮЧЕНИЕ 23

СПИСОК ИСПОЛЬЗОВАННЫХ ИСТОЧНИКОВ 25

Введение

Родококки, обладающие необъятным функциональным разнообразием и характерным комплексом реализуемых стратегических приемов выживания, приобретают все большую экологическую значимость, ибо на фоне современного кризиса состояния окружающей среды увеличивается число местообитаний, в которых организмы находятся в экстремальных условиях. Несмотря на то, что биология алканотрофных родококков в последнее десятилетие находится в центре внимания исследователей, биологическое разнообразие этой практически значимой группы микроорганизмов до сих пор охарактеризовано неполно. Без особого внимания остаются вопросы адаптации родококков к изменяющимся условиям внешней среды, переключения с использования одних источников углерода и энергии на другие.

Среди Rhodococais sp. известны возбудители инфекционных заболеваний человека, животных и растений. В 1991 г. описано тридцать случаев выявленш R.equi в крови больных СПИД (Emmons et al., 1991; Prescott, 1991). Представители данного вида входят в "Список распределения известных бактерий по степени потенциальной опасности при работе с ними", подготовленный экспертами Европейского экономического общества (Council Directive 93/88/ЕЕС, 1993). В этой связи перспективность родококков для эксплуатации их в условиях открытых систем (почв, вод, очистных сооружений) ставит неотложную задачу изучения патогенности Rhodococcus spp. с целью определения уровня риска при интродукции их в природные среды.

Систематика родококков - объект непрерывной оценки. Разрабатываются новые схемы классификации (Головлсв, 1983; Нестеренко и др., 1985), утверждаются новые виды Rhodococcus (Klatte et al., 1994а; Stoecker et al., 1994, Briglia et al, 1996), идет процесс редукции видов в результате перевода видовых названий в категорию синонимов (Klatte et al., 1994; Rayney et al., 1995), а также объединения отдельных видов в новые роды (Collins et al, 1988, Stackebrandt et al, 1988, Rayney el al, 1995a). Выделение новых родов Dietzia, Gordona и Tsukamurella для организмов, ранее считавшихся родококками, делает труднодифференцируемый таксон Rhodococcus более однородным и относительно стабильным. Тем не менее приходится констатировать существенный разрыв между современной таксономией и практической идентификацией данной группы организмов. Общепринятая дифференциация нокардиоформ по совокупности генетических, хемотаксоно-мических и фенотипических признаков длительна, трудоемка, неприемлема в экологических исследованиях и при скрининге практически ценных культур. Число доступных исследователю экспрессных, простых и надежных диагностических тестов невелико. В арсенале исследователя нокардиоформ до настоящего времени не существует достоверного метода, пригодного для массового анализа однородности бактериальных культур в пределах таксонов низкого уровня. Плеоморфизм, чрезвычайная фенотипическая изменчивость нокардиоформ приводит к обилию нечетких формулировок дифференцирующих признаков в приводимых диагнозах таксонов. Поэтому остается актуальным поиск объективных дифференцирующих тестов родококков, хорошо воспроизводимых при практической диагностике и определяемых доступными методами; разработка новых подходов в изучении родства этих культур на уровне вида; новых методов детекции и ускоренной идентификации конкретных штаммов не только в чистых культурах, но и в составе сообществ; накопление дополнительных сведений о свойствах уже известных видов и описание новых с обязательным привлечением не только коллекционных штаммов, но и природных изолятов. Валено изучение биологических особенностей широкого набора "диких" штаммов, ибо это дает возможность не только подтвердить на их примере объективность предложенных ранее и новых дифференцирующих критериев, но и выявить признаки, связанные с экологической специализацией исследуемых микроорганизмов и коррелирующие с их поведением in situ.

Данные, основанные на определении последовательностей 16S рРНК ряда представителей Rhodococcus spp. и подтвержденные комплексом хемотаксономических признаков (содержание ГЦ-оснований в ДНК, состав миколовых кислот и менахинонов, наличие индивидуальных липидов), показали их обособленное положение в родовой структуре сем. Nocardiacea (Stackebrandt et al, 1988; Goodfellow, 1989). Однако немотивированный выбор модельных штаммов не позволяет распространить полученные выводы на все множество описанных видов родококков. Охват в рамках единого метода всего разнообразия видов Rhodococcus, представленных в коллекциях мира, не осуществлен до настоящего времени. В отоге систематика данной группы организмов носит незавершенный характер. Насущной задачей остается поиск универсального подхода в изучении родства бактериальных культур на уровне вида, предварительного выявления внутривидовых группировок и объективного выбора штаммов - представителей конкретных видов (групп) для последующего детального генетического анализа.