Dlya_ekzamena
.pdf
|
|
|
11 |
|
|
|
|
|
|
|
23. Цитоскелет, его организация и функции. |
|
|
|
|
Ц и т о с к е л е т к л е т к и п р е д с т а в л е н |
м и к р о т р у б о ч к а м и |
||
|
микрофиламентами. |
|
|
|
|
Микротру бочки – полые цилиндры диаметром |
20–30 нм , образованны |
||
|
белком тубулином. |
|
|
|
|
Микротрубочи играют роль цитоскелета , т . к . пронизывают всю цитоплаз- |
|||
|
му клетки. Кроме того, микротрубочки участвуют в создании клеточного |
|
||
|
центра, жгутиков, ресничек и в транспорте веществ внутри клетки. |
|
||
|
Микрофиламенты – это белковые нити толщиной около 4 нм . Большин- |
|||
|
ство из них образовано молекулами актинов, которых выявлено около 10 |
|||
|
видов. Они могут группироваться в пучки, образующие опорные структу |
- |
||
|
ры цитоскелета. |
|
|
|
|
(Ярыгин 2015 Т1, стр 140,151,153) |
|
|
|
|
|
|
||
|
24. Ядерная оболочка, особенности организации и функции. |
|
||
|
Ядро эукариотической клетки имеет собственную оболочку , отгранич- |
|||
|
вающую его от цитоплазмы. Ядерная оболочка ( кариолемма) состоит из |
|||
|
двух мембран , наружной мембраны и внутренней, |
разделенных около - |
||
|
|
|
|
|
|
ядерным (перинуклеарным) пространством. |
|
|
|
|
Перинуклеарное пространство сообщается с канальцами ЭндоПлазма- |
|||
|
тической Сети. |
|
|
|
|
Ядерная оболочка имеет отверстия – поры . Но они не сквозные , а -з |
|||
|
полнены специальными белками. Через поры из ядра в цитоплазму и на - |
|||
|
оборот осуществляется транспорт молекул крупных белков, молекул РНК |
|
||
|
и субъединиц рибосом. Сама же мембрана ядерной оболочки обеспечи |
- |
||
|
вает прохождение в обоих направлениях низкомолекулярных соединений |
|
||
|
(аминокислоты, сахара, ионы металлов, нуклеотиды, мелкие белки). Ко |
- |
||
|
личество пор в оболочке ядра зависит от его активности, в клетке чело |
- |
||
|
века обычно имеется 3-4 тыс. пор. |
|
|
|
|
Внутренняя мембрана ядерной оболочки имеет белковую подстилку |
|||
|
которой крепятся хромосомы. Это обеспечивает их упорядоченное рас |
- |
||
|
положение. |
|
|
|
|
|
Функции ядерной оболочки: |
|
1)отграничивает содержимое ядра от цитоплазмы;
2)обеспечивает взаимодействие ( обмен веществ ) между ядром и цитоплазмой;
3)организующая функция в отношении хромосом;
4)участвует в упорядочении пространственной организации генетичских структур и процессов.
(Ярыгин 2015 Т1, стр 113)
25. Что представляет собой по химическому составу ядерный сок.
Ядерный сок ( ядерный матрикс ,кариоплазма) заполняет всё простран-
ство ядра. Это бесцветная коллоидная слабокислая (рН = 6–6.5) масса. |
|
В основе ядерного сока лежат белки, липиды, углеводы, нуклеиновые |
|
кислоты, минеральные соли, ферменты синтеза и репарации. Карио |
- |
плазма осуществляет взаимосвязь всех ядерных структур. |
|
(Ярыгин 2015 Т1, стр 116) |
|
12
26. Назвать и кратко охарактеризовать механизмы ядерно-цитоплаз - матичеких транспортных потоков.
Существует два основных ядерно - цитоплазматических транспортных потока.
1. непосредственно через мембрану проникают ионы металлов , низкомолекулярные соединения (сахара, аминокислоты, нуклеотиды)
2. через ядерные поры проникают в ядро , или покидают его , крупн белковые молекулы, молекулы РНК, субъединицы рибосом
(Ярыгин 2015 Т1, стр 113)
27. Что представляет собой ядрышко-образующие районы хромосом. Перечислить хромосомы человека, имеющие эти районы.
Участки хромосом « ядрышковые организаторы » обычно соответству участкам вторичных перетяжек хромосом . У человека – это хромосомы 13,14,15,21,22. В области организаторов формируются ядрышки.
(Ярыгин 2015 Т1, стр 118)∆
28. В чем сущность полярности, антипараллельности цепей молеку - лы ДНК.
ДНК – полимер , состоящий из мономеров – дезоксирибонуклеотидо
Нуклеотиды ДНК соединены последовательно в цепочку за счет остатка фосфорной кислоты, который связывает углеводы соседних нуклеотидов. Читать последовательность нуклеотидов в ДНК принято от пятого атома углевода к третьему атому. Поэтому в цепочке ДНК первым будет стоять 5' нуклеотид, а последним 3'нуклеотид. Поэтому полинуклеотидная цепь является полярной.
ДНК – это две цепочки , закрученные вправо . Так как напротив 5' нуклеотида одной цепочки всегда располагается 3' нуклеотид второй цепочки, молекула ДНК является антипараллельной.
(Ярыгин 2015 Т1, стр ___) (Лучше Ярыгин 2004, Т1, стр 68)
29. Можно ли говорить о первичной, вторичной и третичной структу - ре ДНК. Если можно, как они представлены.
Первичная структура – последовательное расположение нуклеотидов в полинуклеотидной цепи ДНК.
Вторичная структура ДНК – это две цепочки , комплементарные и ан - типараллельные (напротив 5' нуклеотида одной цепочки расположен 3' нуклеотид второй цепочки).
Третичная структура – двойная спираль ДНК , обычно правозакрученная.
(Ярыгин 2015 Т1, стр 157)
13
30. Что такое геном организма. Перечислить компоненты генома че - ловека.
Геном – суммарная ДНК гаплоидного набора хромосом клеток организма.
Вгеном человека входят ≈ 3,3х109 п.н., а также:
1)редко повторяющиеся последовательности нуклеотидов, или уникальные гены (составляют 60-70%)
2)умеренно повторяющиеся последовательности нуклеотидов (10-15%)
3)высоко ( или многократно ) повторяющиеся последовательности н- леотидов (25-28%)
(Ярыгин 2015 Т1, стр 156,296,133)
31. Дать определение кариотипа. Что представляет собой кариотип человека?
Кариотип – это дипл оидный набор хромос ом (2n), свойствен соматическим клеткам организмов данного вида и характеризующийся определенным числом, строением и генным составом хромосом.
Вкариотипе человека 23 пары хромосом . 22 пары хромосом одинаковы
умужчин и женщин, они называются аутосомами. Одна пара хромосом – половые хромосомы, у мужчин это хромосома Х и хромосома У, у женщин это две Х хромосомы.
(Ярыгин 2015 Т1, стр 263,317,356)
32. Представить классы белков-гистонов и определить их значение в организации и функционировании хромосом.
Выделяют пять классов гистонов: Н1, Н2А, Н2B, Н3, Н4.
Белки гистоны H2A, H2B, H3, H4, по 2 молекулы каждого образуют бел-
ковые тела ( коры), составляющие остов нуклеосомы (катушку), вокруг |
|
этой основы ДНК делает примерно 2 витка (146 п.н.). Это становится |
|
возможным благодаря тому, что белки гистоны имеют положительный за |
- |
ряд, обусловленный высоким содержанием аминокислот аргинина и ли |
- |
зина. В результате этого образуются ионные связи с отрицательно заря |
- |
женными фосфатными группами внешней стороны двойной спирали ДНК. Гистон H1, связывает соседние нуклеосомы , так образуется нуклеосомная нить. Диаметр нуклеосомной нити 11нм, на этом уровне спирализа -
ции ДНК размер молекулы уменьшается в 7 раз.
Таким образом , гистоны выполняютструктурную функцию , участвуя в процессе компактизации хроматина. Защитную функцию , так как в соста - ве нуклеогистонового комплекса ДНК менее доступна ферментам нукле - азам, вызывающим ее гидролиз. Регуляторную функцию , так как нуклео -
гистоновый комплекс ограничивает доступ к ДНК и использование гене |
- |
тической информации. Кроме того, формирование инициаторного (стар |
- |
тового) комплекса перед началом транскрипции включает ацетилирова |
- |
ние гистонов в промоторной области транскриптона, что облегчает до |
- |
ступ соответствующих ферментов к ДНК. |
|
(Ярыгин 2015 Т1, стр 123) |
|
14
33. Охарактеризовать умеренно повторяющиеся последовательности генома человека. Гены каких молекул находятся в этих последова - тельностях.
Умеренно повторяющиеся последовательности нуклеотидов: а) составляют 10–15% ядерной ДНК б) повторяются в геноме сотни и тысячи раз
в) представлены генами рРНК и белков гистонов кластер генов рРНК межгенный спейсер кластер генов рРНК
межгенный спейсер Особенностью умеренно повторяющихся последовательностей является
то, что кодирующие участки чередуются с некодирующими участками – спейсерами.
(Ярыгин 2015 Т1, стр ___)
34. Как понимать экзонно-интронное строение уникальных генов. Что представляет собой экзон и сколько их может быть в уникальной последовательности.
Уник альные гены ( или редк о повторяющиеся последовательн нуклеотидов:
а ) составляют 60-70% ядерной ДНК , это гены подавляющего ч белков клеток человека,
б) встречаются один или несколько раз в геноме,
в) представлены структурными генами и внутригенными некодирующими областями.
Д л я у н и к а л ь н ы х ге н о в х а р а к т е р н о э к з о н н о - и н т р о н н о е с т р о кодирующий участок – экзон чередуется с не кодирующим участком – интроном. Количество экзонов в уникальном гене различно: от 1 до 364, но в среднем 8.
экзон интрон экзон интрон ген
(Ярыгин 2015 Т1, стр ___)
35. Что представляет собой физический размер генома человека и каков он в числовом выражении.
Геном – совокупность нуклеотидных последовательностей ДНК гаплоидного набора хромосом всех клеток организма.
Физический размер генома человека ~ 3,3 х 109 п.н. (пар нуклеотидов). (Ярыгин 2015 Т1, стр 133, 156, 296)
36. Каковы принципиальные отличия генома про- и эукариот. Прокариоты Эукариоты
На гены приходится 90% ДНК на гены приходится 30% ДНК кодирующая область гена непрерывна (нет интронов) экзон-интронная
структура ген следует за геном кодирующая область составляет 3%
Нет повторяющихся последовательностей повторяющиеся
последовательности есть (у человека до 50%) (Ярыгин 2015 Т1, стр ___)
15
37. Что представляет собой хроматин. Его химическая природа.
Основное вещество хромосомы – хроматин. Он состоит из ДНК (~35%), белков (~65%). Белковая часть хроматина представлена гистоновыми белками (60-80%) и негистоновыми.
Таблица соотношения веществ входящих в хроматин.
ДНК гистоновые негистоновые РНК липиды Полисахариды, ионы металлов
1 |
1 |
0,2-0,5 |
0,1-0,15 0,01-0,03 <1% |
Таким образом , химическая природа хроматина включает в себя : ДН белки (гистоновые/негистоновые), РНК, липиды, углеводы, ионы метал - лов. Или кратко, хроматин это ДНК и белки хромосом.
(Ярыгин 2015 Т1, стр 119)
16
38. Какие белки входят в состав хроматина и какие функции они там выполняют.
В состав хроматина входят белки гистоновые и негистоновые.
Белки хромосом выполняют функции : защитную , структурную , регулторную, каталитическую, сервисную, опознавательно-сигнальную и ряд других.
функции белков хромосом Функция Дополнительно
Защитная В химическом отношении гистоны проявляют основные свой - ства и характеризуются в целом положительным зарядом (благодаря вы - сокому содержанию аминокислот – аргинина и лизина), они образуют ионные связи с отрицательно заряженными фосфатными группами внеш - ней стороны двойной спирали ДНК. В составе комплекса с гистонами ДНК менее доступна ферментам нуклеазам, вызывающим ее гидролиз. Структурная Гистоны участвуют в процессе компактизации хроматина на нуклеосомном уровне компактизации (2.4.3.4.б стр 124).
Выделяют пять классов (фракций) гистонов: Н1, Н2А, Н2B, Н3, Н4.
Белки гистоны H2A, H2B, H3, H4, ( по 2 молекулы каждого ) образу
остов нуклеосомы (кор, катушку), вокруг этой основы ДНК делает при |
- |
мерно 2 витка (146 п.н.). |
|
Гистон H1, связывает соседние нуклеосомы , так образуется нуклеосом- |
|
ная нить. Диаметр нуклеосомной нити 11нм, на этом уровне спирализа |
- |
ции ДНК размер молекулы уменьшается в 7 раз. |
|
Регуляторная Комплекс гистонов и ДНК ограничивает доступ к ДНК с целью использования заключенной в ней генетической информации. Формирование инициаторного (стартового) комплекса перед началом транскрипции включает ацетилирование гистонов в промоторной области транскриптона, что, предположительно, облегчает доступ соответствую - щих ферментов к ДНК.
Каталитическая С р ед и н е г и с то н о в ы х бел к о в вс т р еч а ютс я ф е р м е н т ы транскрипции РНК, репликации, репарации и химической модификации ДНК.
Структурно-регуляторная Приписывается негистоновым белкам хромо - сомного матрикса (скэффолд – 2.4.3.2. стр 116). Фиксируя участки двой -
ной спирали, такие белки удерживают «открытую» конфигурацию хрома |
- |
тина, «разрешающую» доступ к биоинформации ДНК, то есть ее тран |
- |
скрипцию. |
|
Сервисная Многие негистоновые белки обнаруживаются в составе хромосом лишь некоторое время в связи с той или иной функциональной зада - чей.
Так транскрипция фрагмента ДНК (структурный ген) у эукариот начинает - ся с образования в области промотора гетеробелкового инициаторного комплекса. Без этого невозможны ни «посадка» РНК-полимеразы на ДНК
в требуемом месте, ни определение стартовой точки транскрипции |
|
(2.4.5.5. стр 184). |
|
Опознавательно-сигнальная Начало процесса репликации ДНК состо |
- |
ит в присоединении к хромосоме инициирующих или «узнающих» белков |
|
(2.4.5.3. стр 165), помечающих стартовую точку репликонов. |
|
(Ярыгин 2015 Т1, стр 122) |
|
17
39. Перечислить уровни компактизации ДНК в хромосоме. |
|
В и н т е р ф а з н о м я д р е п р и н я т о в ы д е л я т ь с л е д у ю щ и е у р о в н и |
|
компактизации ДНК: |
|
Уровень Дополнительно Степень |
|
компактизации |
|
1) Нуклеосомный Белки гистоны (H2A,H2B,H3,H4 по 2 молекулы каж |
- |
дого) образуют белковые тела (коры). ДНК делает на них примерно |
2 |
витка (146 п.н.). Свободную от контакта с корами ДНК (15-100 п.н.) назы -
вают – линкерной (связующей). Отрезок ДНК порядка 200 п.н. вместе с |
|
белковым кором образует нуклеосому. Таким образом, в основе структу |
- |
ры хроматина находится фибрилла, напоминающая нитку бус и пред |
- |
ставляющая собой цепочку повторяющихся единиц (нуклеосомная нить) –
нуклеосом. |
6-7 |
|
|
|
|
2) Нуклеомерный |
Образование хроматиновой |
фибриллы |
|||
состоящей из упакованных нуклеосом (диаметром |
30нм) происходит с |
||||
участием гистона H1, который, связываясь с линкерной ДНК, скручивает |
|||||
нуклеосомную нить в |
спираль по типу соленоида |
с шагом в |
6-8 нукле- |
||
осом. |
25-30 |
|
|
|
|
3) Хромомерный |
Петельно-доменный уровень состоит в уклад - |
ке фибриллы в петли. В этом процессе активная роль отводится негисто - новым белкам. Основания петель «заякорены» в ядерном матриксе. Пет -
ля содержит от одного до нескольких геном. Длина участка ДНК, равного |
|
|||
петле, от 20 тыс.п.н. до 80 тыс.п.н. |
680 |
|
|
|
4) |
Хромонемный Конденсированный участок метафазной хромосомы |
|
||
(одной из хроматид) образуется в результате того, что фибриллы (диа |
- |
|||
метром 300нм) складываются по длине. Эти изменения происходят с |
|
|||
хромосомным материалом клеток, вступающих в митоз. |
1600 |
|
||
5) |
Хроматидный Целая метафазная хромосома (состоит из двух хроматид |
|||
– |
хромосом дочерних клеток). В этом состоянии ДНК выключена из про |
- |
||
цессов транскрипции и репликации. |
7000-10000 |
|
|
1)формирование нуклеосом
2)формирование соленоидоподобных фибрилл
3)формирование петель
4)формирование хроматид
5)образование хромосомы за счёт объединения хроматид
В конечном итоге размер ДНК уменьшается в 10.000 раз. (Ярыгин 2015 Т1, стр 125)
18
40. Что представляет собой нуклеосома и как она формируется.
Нуклеосома это повторяющаяся структурная единица хроматина . Нуклеосома формируется следующим образом. Белки гистоны H2A, H2B, H3, H4, (по 2 молекулы каждого) образуют остов нуклеосомы (катушку), во - круг этой основы ДНК делает примерно 2 витка (146 п.н.).
Гистон H1, связывает соседние нуклеосомы , так образуется нуклеосомная нить. Диаметр нуклеосомной нити 11нм, на этом уровне спирализа - ции ДНК размер молекулы уменьшается в 7 раз.
Таким образом , нуклеосома это отрезок ДНК ( порядка 200 п . н .) включающий в себя линкерную, а также накрученную на кор ДНК и сам белко - вый кор.
(Ярыгин 2015 Т1, стр 125)
41. Что представляет собой второй уровень компактизации ДНК в хромосоме.
Формирование соленоидоподобных фибрилл . Длина ДНК на этом уровне уменьшается в 50 раз.
Образование хроматиновой фибриллы состоящей из упакованных нулеосом (диаметром 30нм) происходит с участием гистона H1, который, связываясь с линкерной ДНК, скручивает нуклеосомную нить в спираль по типу соленоида с шагом в 6-8 нуклеосом.
(Ярыгин 2015 Т1, стр 127)
42. Что представляет собой третий уровень компактизации ДНК в хромосоме.
Формирование петель . Соленоидоподобные фибриллы складываются петли. ДНК человека образует до 2.000 петель. Длина ДНК уменьшается в 1.000 раз. Эти три уровня спирализации ДНК происходят во время ин - терфазы.
Петельно - доменный уровень состоит в укладке фибриллы в петл этом процессе активная роль отводится негистоновым белкам. Основа - ния петель «заякорены» в ядерном матриксе. Петля содержит от одного до нескольких генов. Длина участка ДНК, равного петле, от 20 тыс.п.н. до
80 тыс.п.н.
(Ярыгин 2015 Т1, стр 127)
43. Что представляют собой 4-й и 5-й уровни компактизации ДНК в хромосоме.
4 уровень – формирование хроматид ; петли ещё больше спирализуются , и диаметр хроматиды становится равным 700нм.
5 уровень – образование хромосомы за счёт объединения хромат диаметр хромосомы = 1400нм.
4 и 5 уровни спирализации ДНК происходит во время профазы митоза . В конечном итоге размер ДНК уменьшается в 10.000 раз.
(Ярыгин 2015 Т1, стр 127)
19
44. Что представляет собой центромера хромосом и какие функции она обеспечивает
Каждая хромосома состоит из двух хроматид , которые соединяются помощью первичной перетяжки ( центромеры). Центромера – это особым образом организованный участок хромосомы, который состоит из повто - ряющихся последовательностей нуклеотидов. Функции центромеры:
1)удержание хроматид
2)правильное выстраивание хромосом в метафазной пластинке
3)прикрепление хромосом к веретену деления
4)здесь находится участок , который контролирует переход клетки в стадию анафазы
(Ярыгин 2015 Т1, стр 131?) (Ярыгин 2004, Т1, стр 123)
45. Конститутивный гетерохроматин, его локализация в хромосомах
ифункциональное назначение.
Винтерфазных хромосомах выделяют менее спирализованные участки и б ол е е с п и р а л и зо ва н н ы е у ч а с т к и . Б ол е е с п и р а л и зо ва н н ы е у ч а с т к и хорошо окрашиваются красителями и выглядят в световой микроскоп в виде глыбок. Эти участки хромосом называются гетерохроматиновыми участками (или гетерохроматином), они не содержат активных генов. Выделяют 2 вида гетерохроматина: конститутивный (или структурный) и факультативный.
Конститутивный гетерохроматин находится на концах хромосомы и области центромеры . Он постоянно находится в спирализованном состоянии и выполняет структурную функцию.
(Ярыгин 2015 Т1, стр 130)
46.Что представляет собой факультативный гетерохроматин
Винтерфазных хромосомах выделяют менее спирализованные участки и
бол е е с п и р а л и зо ва н н ы е у ч а с т к и . Б ол е е с п и р а л и зо ва н н ы е у ч а с т к и хорошо окрашиваются красителями и выглядят в световой микроскоп в виде глыбок. Эти участки хромосом называются гетерохроматиновыми участками (или гетерохроматином), они не содержат активных генов. Выделяют 2 вида гетерохроматина: конститутивный (или структурный) и факультативный.
Факультативный гетерохроматин присущ только некоторым хромосомам Так в клетках женского организма в норме находятся 2 «Х» хромосомы, н о 1 « Х » х р о м о с о м а н а х од и т с я в н е а к т и в н о м с о с т о я н и и в в и д е гетерохроматина. В световой микроскоп в интерфазном ядре так ая
хромосома выглядит в виде плотного округлого тельца (тельце Барра или п о л о в о й х р о м а т и н ) . Т . о . у ж е н щ и н а к т и в н а л и ш ь о д н а п о л о в а я хромосома, а вторая переходят в состояние гетерохроматина уже в зиготе (на 16 день после оплодотворения).
(Ярыгин 2015 Т1, стр 130)
20
47. Какова структурная организация теломерных участков хромосом.
Теломерные участки ДНК человека от З '- конца образованы коротк тандемными повторами ТТАГГГ. За ними следуют более протяженные по - вторяющиеся последовательности и далее идет участок также повторя - ющихся последовательностей, уникальных для каждой хромосомы. Ком - плекс ДНК со специфическими белками на концах хромосом называется «теломера».
Или Теломера содержит специализированные последовательности , которые локализованы на обоих концах линейной хромосомы.
В теломерных районах локазиованы повторяющиеся последовательности нуклеотидов. Теломеры представляют собой в основном двунитевые не - к од и ру ю щ и е п о вто р ы ( Т ТА Г Г Г ) n , з а к а н ч и ва ю щ и е с я 3 ’ - од н о н и те в ы м участком.
(Ярыгин 2015 Т1, стр 132)
48. Какова функциональная значимость теломерных участков.
Функциональная значимость теломерных участков состоит:
1) Участвуют в прикреплении хромосом к ядерному матриксу или к внутреннему слою ядерной оболочки
2) Способствуют конъюгации гомологичных хромосом и кроссинговеру в профазу Мейоза I
3) Обеспечивают сохранение целостности хромосомы так как « защищают» молекулы ДНК от разрушающего действия ферментов.
4)Способствуют удержанию сестринских хроматид в метафазу митоза
5)Обеспечивают полную репликацию хромосомы
(Ярыгин 2015 Т1, стр 132)
49. Дифференциальное окрашивание хромосом, его сущность и воз - можности.
Для исследования хромосом человека у него берут лейкоциты крови , обрабатывают их специальными веществами, которые запускают митоз (митогенами). Через 48 часов клетки будут на стадии метафазы, и деление останавливают с помощью веществ, которые разрушают нити веретена деления (колхицин). Затем производят дифференциальное окрашивание хромосом – используют специальные красители, которые избирательно поглощаются определёнными участками хромосомы. При микроскопировании хромосом они выглядят полосатыми, более сильно окрашенные участки хромосом называются районами, или бэндами.
(Ярыгин 2015 Т1, стр 320, 379)