Лабораторна робота №№ 5, 6
Тема: Механізми самовідтворення та зберігання генетичної інформації. Рішення задач з молекулярної біології
План:
Мета:
Знати:
Характеризувати низько- та високомолекулярні органічні сполуки; виділяти серед них полімери.
Класифікувати полімери.
Будову, властивості та функції ДНК та РНК.
Властивості генетичного коду.
Етапи синтезу білка.
Організацію генома прокаріот та еукаріотів
Вміти:
Рішати задачі на визначення лінійних розмірів та маси біополімерів.
Рішати задачі на визначення якісного та кількісного складу нуклеїнових кислот.
Рішати задачі на етапи реалізації генетичної інформації.
Рішати задачі на екзонно-інтронну будову генома.
Література:
Барна Іван Загальна біологія. Збірник задач. – Тернопіль: Видавництво «Підручники і посібники», 2009 – 736 с.
Довідковий матеріал: Одиниці вимірювання
Біополімер |
Табличніданідля мономерів |
Амінокислоти Мономерибілків |
Лінійна довжинаодного амінокислотногозалишку у поліпептидному ланцюгц l ак = 0,35 нм = 3,5 ангстрем (Å) Середня молекулярна маса одного амінокислотногозалишку Mr ак ≈ 110 а.о.м. (Дa) |
Нуклеотиди Мономеринуклеїнових кислот (ДНК, РНК) |
Лінійна довжинаодного нуклеотидаунуклеиїновій кислоті l н = 0,34 нм = 3,4 ангстрем (Å) Середня молекулярна маса одного нуклеотида Mr н ≈ 345 а.о.м. (Дa) |
Довжини мономерів в білках і нуклеїнових кислотах виміряні достатньо точно і не залежать від радикала / азотистої основи. Молекулярні маси, що використовуються в розрахунках - результат округлення, середні значення, які є приблизними. Одиниця молекулярної маси - атомні одиниці маси, а.о.м., в англомовній науковій літературі називається Дальтон (скорочене позначення Da, або кирилицею - Да); для цієї величини використовуються десяткові приставки - кілодальтон (кДа), мегаДальтон (МДА) і т.п. 1 Да = 1 а.о.м.
Таблиця генетичного коду
Перший нуклеотид |
Другий нуклеотид |
Третій нуклеотид
| |||||||
У |
Ц |
А |
Г |
| |||||
У |
УУУ Фен УУЦ Фен УУА Лей УУГ Лей |
УЦУ Сер УЦЦ Сер УЦА Сер УЦГ Сер |
УАУ Тир УАЦ Тир УАА нонсенс УАГ нонсенс |
УГУ Цис УГЦ Цис УГА нонсенс УГГ Трип |
У Ц А Г | ||||
Ц |
ЦУУ Лей ЦУЦ Лей ЦУА Лей ЦУГ Лей |
ЦЦУ Про ЦЦЦ Про ЦЦА Про ЦЦГ Про |
ЦАУ Гіс ЦАЦ Гіс ЦАА Глн ЦАГ Глн |
ЦГУ Арг ЦГЦ Арг ЦГА Арг ЦГГ Арг |
У Ц А Г | ||||
А |
АУУ Іле АУЦ Іле АУА Іле АУГ Мет |
АЦУ Тре АЦЦ Тре АЦА Тре АЦГ Тре |
ААУ Асн ААЦ Асн ААА Ліз ААГ Ліз |
АГУ Сер АГЦ Сер АГА Арг АГГ Арг |
У Ц А Г | ||||
Г |
ГУУ Вал ГУЦ Вал ГУА Вал ГУГ Вал |
ГЦУ Ала ГЦЦ Ала ГЦА Ала ГЦГ Ала |
ГАУ Асп ГАЦ Асп ГАА Глу ГАГ Глу |
ГГУ Глі ГГЦ Глі ГГА Глі ГГГ Глі |
У Ц А Г |
Таблиця генетичного коду та умовні позначення амінокислот
Гліцин |
Глу |
Gly |
G |
Аланін |
Ала |
Ala |
A |
Валін |
Вал |
Val |
V |
Лейцин |
Лей |
Leu |
L |
Изолейцин |
Иле |
Ile |
I |
Серин |
Сер |
Ser |
S |
Треонін |
Тре |
Thr |
T |
Тирозин |
Тир |
Tyr |
Y |
Цистеїн |
Цис |
Cys |
C |
Метіонин |
Мет |
Met |
M |
Аспарагінова кислота |
Асп |
Asp |
D |
Аспарагін |
Асн |
Asn |
N |
Глутамінова кислота |
Глу |
Glu |
E |
Глутамін |
Глн |
Gln |
Q |
Аргінин |
Арг |
Arg |
R |
Лізин |
Лиз |
Lys |
K |
Гістидин |
Гис |
His |
H |
Фенілаланін |
Фен |
Phe |
F |
Триптофан |
Трп |
Trp |
W |
Пролін |
Про |
Pro |
P |
В біології використовуються основні та похідні одиниці міжнародної системи одиниць (СО): довжини, маси, енергії, роботи, теплоти тощо.
Одиниці довжини – метр (м).
1 м = 10 дм =100 см = мк = нм, 1 нм = м.
Одиниці маси – кілограми (кг).
1 кг = г (грамів); 1 г = нг (нанограмів);
1 дальтон – одиниця молекулярної маси, яка дорівнює масі атома Гідрогену.
Одиниця енергії, роботи та кількості теплоти - джоуль (Дж).
1 Дж = ерг = 0,2388 кал; 1 кал = 4,1868 Дж.
У процесі розв’язування будь-якої задачі виділяють певні етапи.
Аналіз задачі. Уважно прочитайте зміст задачі, осмисліть її та визначте:
до якого розділу чи теми належить задача,
знайдіть, що дано і що необхідно знайти.
Скорочений запис умови.
За допомогою умовних позначень коротко запишіть, що дано і що треба знайти.
Подумайте, які з постійних відомих вам величин ви можете використати при рішенні задачі, запишіть їх.
Оформлення запису задачі.
Місце, що залишилось після короткого запису умови задачі, умовно поділіть на дві частини. В лівій частині запишіть данні, які ви будете використовувати, справа – рішення. Дій у задачі може бути декілька. Записуйте їх так: 1) …; 2) …; 3) … тощо.
Розв’язування задачі.
Розв’язуйте задачу поетапно.
На кожному етапі стисло формулюйте запитання.
Ретельно перевіряйте результати розрахунків.
Перевірте, чи всю інформацію з умови задачі використано.
За необхідністю оберіть інший спосіб розв’язування.
Завершальний етап.
Перевірте правильність розв’язування в цілому, сформулюйте і запишіть остаточну відповідь.