38. В межах яких динуклеотидів здійснюється метилування днк (ApT, TpA, GpT, CpG, CpA, GpC)?

39. CpG-острівці з’являються внаслідок: а) метилування ДНК; б) підтримання деметильованого стану ДНК; в) мутацій; г) активності мобільних елементів.

40. Типова послідовність зв’язування елементів при активації транскрипції: а) транскрипційний фактор ТF – гістон ацетилтрансфераза НАТ – комплекс ремоделювання хроматину СR – преініціаторний комплекс PIC; б) ТF – СR – НАТ – PIC; в) ТF – PIC – НАТ – СR; г) ТF – PIC – СR – НАТ; д) реалізуються всі названі сценарії.

Модуль 1. Білет 6.

Дата ________ Група________________

Прізвище ______________________

1. Яка хімічна група в складі кожної амінокислоти несе на собі позитивний заряд за фізіологічних умов?

2. Пептидна група по відношенню до водневого зв’язку є: а) донором; б) акцептором; в) і донором, і акцептором; г) не формує водневих зв’язків.

3. Чи можливі ван-дер-ваальсові взаємодії між гетероциклічними сполуками?

4. Одна з двох груп, що формують водневий зв'язок, містить пару електронів, що не формують ковалентного зв'язку. Як називається ця група?

5. До чого призводить занурення неполярної групи чи молекули у водне середовище (зниження вільної енергії, зростання ентропії, зниження ентропії, зростання ентальпії, зниження ентальпії)?

6. Дайте повну назву амінокислоти, що позначається Trp.

7. Дайте повну назву амінокислоти, що позначається Arg.

8. Як називається така властивість генетичного коду, що одній амінокислоті відповідає кілька кодонів?

9. Яка позиція в складі кодону (перша, друга третя) є найбільш важливою у визначенні амінокислоти?

10. Якого хімічного елементу немає в складі нуклеотидів (азот, сірка, кисень, фосфор, вуглець)?

11. Тип вторинної структури білків, яка стабілізується водневими зв'язками між пептидними групами витягнутих поліпептидних ланцюгів?

12. Як називається сполука, що містить азотисту основу, пентозний цукор та фосфатний залишок?

13. Як називається пентоза, що містить он-групу при атомі с2'?

14. Амінокислотну послідовність білка прийнято зчитувати в певному напрямі. Як позначається його кінцева точка?

15. Як називається пентоза, що входить до складу ДНК?

16. Подвійна спіраль ДНК в А-формі є правою чи лівою?

17. Які динуклеотидні контакти можуть утворитися між двома сусідніми АТ парами в ДНК?

18. В ДНК реалізуєтся динуклеотидний контакт AG. Яке позначення контакту є еквівалентним до наведеного?

19. Послідовність одного з ланцюгів ДНК – ATTAGGT. Напишіть послідовність комплементарного ланцюга.

20. Незалежні від нуклеотидної послідовності білково-нуклеїновї взаємодії здійснюються переважно через цукрофосфатний остов чи жолобки подвійної спіралі ДНК?

21. Негативна надспіралізація циркулярної ДНК еквівалентна до розкручування чи закрутки подвійної спіралі?

22. Як називаються основні білки хроматину?

23. Яку природу мають взаємодії між гістонами та ДНК в нуклеосомі (іонні, гідрофобні, ван-дер-ваальсові, водневі зв’язки)?

24. Яка ділянка в складі корових гістонів має нерегулярну структуру (N-кінцева, центральна, С-кінцева, нема такої ділянки)?

25. Як називається частина хроматину, яка зберігає високий ступінь компактності і є повністю репресованою в інтерфазі?

26. Середня густина генів на ділянках геному людини корелює з GC-вмістом: а) позитивно; б) негативно; в) в залежності від хромосоми; г) не корелює.

27. Підкреслити термін, який не має відношення до класифікації послідовностей, що повторюються в геномі: транспозони, тандемні повтори, псевдогени, стробозони, прості повтори.

28. Як називається (змістовний чи антизмістовний) ланцюг ДНК, послідовність якого співпадає з послідовністю мРНК?

29. Скільки консенсусних послідовностей містить стандартний промотор E coli?

30. Яка субодиниця бактеріальної РНК-полімерази видаляється з неї під час очистки промотору (α, β, β', σ)?

31. Білок – транскрипційний фактор називається trans- чи cis-регулятором?

32. Спорідненість певного білка до ДНК залежить від того, чи зв'язана на сусідньому сайті інша молекула цього чи іншого білка. Як називається такий феномен?

33. Як називається стандартний елемент багатьох еукаріотичних промоторів, що має консенсусну послідовність ТАТААА?

34. Що означає абревіатура ТВР?

35. Який транскрипційний фактор РНК-полімерази ІІ має кілька ферментативних активностей (TFII A, TFII B, TFII D, TFII E, TFII F, TFII H)?

36. Ацетильованими чи деацетильованими є гістони в гетерохроматині?

37. Один зі стандартних структурних блоків білків – бромодомен – впізнає: а) ацетатні залишки в гістонах; б) метильні залишки в гістонах; в) фосфатні залишки в гістонах; д) метильні залишки в ДНК.

38. В межах яких динуклеотидів здійснюється метилування ДНК (ApT, TpA, GpT, CpG, CpA, GpC)?

39. Як називається фермент, що здійснює метилування ДНК?

40. В транскрипційно активних генах: а) гістони присутні завжди; б) гістони відсутні завжди; в) 50:50; г) частіше гістони присутні; д) частіше гістони відсутні.

Модуль 1. Білет 7.

Дата ________ Група________________

Прізвище ______________________

1. Яка хімічна група в складі кожної амінокислоти несе на собі позитивний заряд за фізіологічних умов?

2. Пептидна група по відношенню до водневого зв’язку є: а) донором; б) акцептором; в) і донором, і акцептором; г) не формує водневих зв’язків.

3. Як називаються нековалентні взаємодії, які реалізуються між будь-якими групами чи молекулами на маленьких відстанях?

4. Як називається міра невпорядкованості термодинамічної системи?

5. Зростання чи зниження вільної енергії є умовою здійснення будь-якого процесу?

6. Дайте повну назву амінокислоти, що позначається Ile.

7. Дайте повну назву амінокислоти, що позначається Asp.

8. Скільки існує змістовних кодонів, що відповідають амінокислотам?

9. Якого хімічного елементу немає в складі амінокислот (азот, сірка, кисень, фосфор, вуглець)?

10. Тип вторинної структури білків, яка стабілізується водневими зв'язками між пептидними групами амінокислот, що відстоять на 3 амінокислоти одна від одної вздовж ланцюга?

11. Нехай білок може існувати в двох конформаційних станах – І та ІІ. Стан ІІ, на відміну від І, має спорідненість до ліганду Х. У якому стані перебуває білок у відсутності ліганду?

12. Як називається сполука, що містить азотисту основу та пентозний цукор?

13. Підкреслити атом вуглецю пентози, до якого приєднані різні групи у рибози та дезоксирибози: С1', С2', С3', С4', С5'.

14. Нуклеотидну послідовність нуклеїнової кислоти прийнято зчитувати в певному напрямі. Як позначається його початок?

15. Між якими елементами нуклеотидів (азотисті основи, пентози, фосфати) реалізуються стекінг-взаємодії в полінуклеотидах?

16. В якій формі існує подвійна спіраль РНК за фізіологічних умов (A, B, C, D, E, F, X, Z)?

17. Скільки водневих зв'язків утворюється між А і Т в АТ-парі?

18. В ДНК реалізуєтся динуклеотидний контакт CT. Яке позначення контакту є еквівалентним до наведеного?

19. Послідовність одного з ланцюгів ДНК – AAGTATG. Напишіть послідовність комплементарного ланцюга.

20. Незалежні від нуклеотидної послідовності білково-нуклеїновї взаємодії здійснюються переважно через цукрофосфатний остов чи жолобки подвійної спіралі ДНК?

21. Як називаються ферменти, що змінюють топологічний стан циркулярної ДНК?

22. Позитивна надспіралізація циркулярної ДНК полегшує розкручування чи закрутку подвійної спіралі?

23. Чи входить гістон Н1 до складу корової частинки нуклеосоми?

24. Якій посттрансляційній модифікації не піддаються гістони (ацетилування, глікозилювання, фосфорилювання, метилування)?

25. Як називається частина хроматину, яка значно декомпактизується і є потенційно транскрипційно активною в інтерфазі?

26. Скільки пар основ ДНК міститься в геномі людини (3 тис, 3 млн, 3 млрд, 33 млрд)?

27. Зростає, знижується чи не змінюється спорідненість до промоторів бактеріальної РНК-полімерази при наявності σ-фактора в складі ферменту?

28. Як називається (змістовний чи антизмістовний) ланцюг ДНК, послідовність якого співпадає з послідовністю мРНК?

29. Яка субодиниця бактеріальної РНК-полімерази не входить до складу ферменту під час елонгації транскрипції (α, β, β', σ)?

30. Яка субодиниця бактеріальної РНК-полімерази видаляється з неї при переході від ініціації до елонгації транскрипції (α, β, β', σ)?

31. Білок – транскрипційний фактор називається trans- чи cis-регулятором?

32. Певний промотор є слабким. Активатор чи репресор є необхідним елементом регуляції транскрипції з цього промотору?

33. Підкреслити групи генів, які транскрибуються РНК-полімеразою ІІІ: високомолекулярна rRNA, 5S rRNA, білкові гени, snRNA, tRNA.

34. Який транскрипційний фактор РНК-полімерази відповідає за точну орієнтацію РНК-полімерази на промоторі (TFII A, TFII B, TFII D, TFII E, TFII F, TFII H)?

35. Який транскрипційний фактор РНК-полімерази ІІ забезпечує первинне розкручування подвійної спіралі при ініціації транскрипції (TFII A, TFII B, TFII D, TFII E, TFII F, TFII H)?

36. Ацетильованими чи деацетильованими є гістони в гетерохроматині?

37. Гістоновий код – це: а) співвідношення між послідовностями нуклеотидів в гістонових генах і амінокислот в гістонах; б) характер розташування гістонових генів в кластері; в) співвідношення між первинною і вторинною структурами гістонів; г) співвідношення між картиною посттрансляційних модифікацій гістонів і спорідненістю до певних білків.

38. Метилування гістонів корелює з активацією чи репресією транскрипції, або такої кореляції немає?

39. CpG-острівці частіше зустрічаються в промоторах генів: а) активних тканьоспецифічних; б) репресованих; в) генів “домашнього господарства”; г) псевдогенів.

40. В транскрипційно активних генах: а) гістони присутні завжди; б) гістони відсутні завжди; в) 50:50; г) частіше гістони присутні; д) частіше гістони відсутні.

Модуль 1. Білет 8.

Дата ________ Група________________

Прізвище ______________________

1. Яка хімічна група в складі кожної амінокислоти несе на собі негативний заряд за фізіологічних умов?

2. Пептидна група по відношенню до водневого зв’язку є: а) донором; б) акцептором; в) і донором, і акцептором; г) не формує водневих зв’язків.

3. Ван-дер-ваальсові взаємодії реалізуються між групами чи молекулами: а) зарядженими; б) гідрофобними; в) полярними; г) будь-якими; д) ароматичними.

4. Як називається міра невпорядкованості термодинамічної системи?

5. Деякий процес супроводжується зростанням ентальпії. Зростає чи знижується при цьому вільна енергія?

6. Дайте повну назву амінокислоти, що позначається Cys.

7. Дайте повну назву амінокислоти, що позначається Arg.

8. Скільки всього існує кодонів?

9. Якого хімічного елементу немає в складі амінокислот (азот, сірка, кисень, фосфор, вуглець)?

10. Якого хімічного елементу немає в складі нуклеотидів (азот, сірка, кисень, фосфор, вуглець)?

11. Нехай білок може існувати в двох конформаційних станах – І та ІІ. Стан ІІ, на відміну від І, має спорідненість до ліганду Х. У якому стані перебуває білок у присутності ліганду?

12. Як називається сполука, що містить азотисту основу, пентозний цукор та фосфатний залишок?

13. Підкреслити атом вуглецю пентози, до якого приєднані різні групи у рибози та дезоксирибози: С1', С2', С3', С4', С5'.

14. Нуклеотид складається з азотистої основи, пентозного цукру та фосфатного залишку. Між якими елементами формується ковалентний зв'язок у полінуклетидному ланцюгу?

15. Між якими елементами нуклеотидів (азотисті основи, пентози, фосфати) реалізуються стекінг-взаємодії в полінуклеотидах?

16. Скільки існує типів динуклеотидних контактів у полінуклеотиді, що складається з залишків чотирьох типів?

17. Скільки водневих зв'язків утворюється між А і Т в АТ-парі?

18. В ДНК реалізуєтся динуклеотидний контакт CC. Яке позначення контакту є еквівалентним до наведеного?

19. Послідовність одного з ланцюгів ДНК – GGCGTGC. Напишіть послідовність комплементарного ланцюга.

20. Білково-нуклеїнове впізнання здійснюється переважно через цукрофосфатний остов чи жолобки подвійної спіралі ДНК?

21. Які нековалентні взаємодії майже завжди реалізуються в білково-нуклеїнових комплексах (іонні, гідрофобні, ван-дер-ваальсові, водневі зв’язки)?

22. Як називається елементарна структурна одиниця хроматину?

23. Яку природу мають взаємодії між гістонами та ДНК в нуклеосомі (іонні, гідрофобні, ван-дер-ваальсові, водневі зв’язки)?

24. Які амінокислотні залишки піддаються ацетилуванню в гістонах?

25. Підкреслить гістон, який відіграє провідну роль у конденсації хроматинової фібрили: Н1, Н2А, Н2В, Н3, Н4.

26. Яка приблизно частка геному прокаріотів приходиться на кодуючи послідовності (0.02, 0.10, 0.25, 0.50, 0.75, 0.95)?

27. Підкреслити термін, який не має відношення до класифікації послідовностей, що повторюються в геномі: транспозони, тандемні повтори, псевдогени, стробозони, прості повтори.

28. В якому напрямі здійснюється зчитування інформації з ДНК в ході транскрипції?

29. Скільки консенсусних послідовностей містить стандартний промотор E coli?

30. Яка субодиниця бактеріальної РНК-полімерази видаляється з неї під час очистки промотору (α, β, β', σ)?

31. Деякий білок блокує транскрипцію на певному гені. Позитивним чи негативним регулятором його називають?

32. Регуляція транскрипції, що залежить від ефективності впізнання термінуючого елементу, є: а) негативною; б) позитивною; в) атенюацією; г) аллостеричною.

33. Що означає абревіатура TFII?

34. Що означає абревіатура ТВР?

35. С-кінцевий домен РНК-полімерази ІІ: а) містить активний центр; б) забезпечує взаємодію між субодиницями; в) забезпечує розкручування подвійної спіралі ДНК; г) має невпорядковану структуру.

36. С-кінцевий домен РНК-полімерази ІІ піддається фосфорилюванню при: а) ініціації транскрипції; б) переході від інінціації до елонгації; в) елонгації; г) термінації.

37. Один зі стандартних структурних блоків білків – хромодомен – впізнає: а) ацетатні залишки в гістонах; б) метильні залишки в гістонах; в) фосфатні залишки в гістонах; д) метильні залишки в ДНК.

38. Ацетилування гістонів корелює з активацією чи репресією транскрипції, або такої кореляції немає?

39. CpG-острівці частіше зустрічаються в промоторах генів: а) активних тканьоспецифічних; б) репресованих; в) генів “домашнього господарства”; г) псевдогенів.

40. Гістон ацетилтрансфераза рекрутується в активні ділянки хроматину: а) транскрипційними факторами; б) ацетильованими гістонами; в) комплексами ремоделювання хроматину; г) білками ядерного матриксу; д) реалізуються всі можливості.

Модуль 1. Білет 9.

Дата ________ Група________________

Прізвище ______________________

1. Підкреслити хімічну групу, яка не зустрічається в складі амінокислот: аміногрупа, фенольна, карбоксильна, фосфатна, гуанідінова, амідна.

2. В які міжмолекулярні взаємодії може вступати пептидна група?

3. Чи можливий водневий зв’язок між групами –ОН та –СН3?

4. Як називаються нековалентні взаємодії, які призводять до агрегації неполярних груп чи молекул?

5. Деякий процес супроводжується зростанням ентропії. Зростає чи знижується при цьому вільна енергія?

6. Дайте повну назву амінокислоти, що позначається Pro.

7. Дайте повну назву амінокислоти, що позначається Gly.

8. Скільки існує змістовних кодонів, що відповідають амінокислотам?

9. Як називають регулярну структуру в білках, що вона стабілізована водневими зв’язками між пептидними групами?

10. Як називають просторову структуру білка, що складається з кількох субодиниць?

11. Головний механізм ферментативного каталізу полягає в: а) зниженні вільної енергії продуктів реакції; б) зниженні вільної енергії субстратів реакції; в) зниженні вільної енергії інтермедіатів; г) зниженні вільної енергії ферменту.

12. Скільки атомів вуглецю містить цукор в складі нуклеотиду?

13. Амінокислотну послідовність білка прийнято зчитувати в певному напрямі. Як позначається його початок?

14. Нуклеотидну послідовність нуклеїнової кислоти прийнято зчитувати в певному напрямі. Як позначається його кінцева точка?

15. Як називається пентоза, що входить до складу ДНК?

16. В якій формі існує подвійна спіраль РНК за фізіологічних умов (A, B, C, D, E, F, X, Z)?

17. Скільки водневих зв'язків утворюється між G і C в GC-парі?

18. В ДНК реалізуєтся динуклеотидний контакт TC. Яке позначення контакту є еквівалентним до наведеного?

19. Послідовність одного з ланцюгів ДНК – TTAGGCC. Напишіть послідовність комплементарного ланцюга.

20. Чи завжди взаємодія білка з великим жолобком подвійної спіралі потребує значних конформаційних змін ДНК?

21. Позитивна надспіралізація циркулярної ДНК еквівалентна до розкручування чи закрутки подвійної спіралі?

22. Негативна надспіралізація циркулярної ДНК полегшує розкручування чи закрутку подвійної спіралі?

23. Чи входить гістон Н1 до складу корової частинки нуклеосоми?

24. Яка ділянка в складі корових гістонів має нерегулярну структуру (N-кінцева, центральна, С-кінцева, нема такої ділянки)?

25. До ядерного матриксу прикріплюються: а) кінці хромосом; б) центромери; в) петлі хроматину; г) кожна нуклеосома; д) не прикріплюється інтерфазний хроматин.

26. Скільки пар основ ДНК міститься в геномі людини (3 тис, 3 млн, 3 млрд, 33 млрд)?

27. Кластери генів еукаріотів, як правило, є: а) єдиними транскрипційними одиницями; б) гени в кластерах транскрибуються окремо; в) в еукаріотів немає кластерів генів.

28. В якому напрямі здійснюється синтез мРНК?

29. Яка субодиниця бактеріальної РНК-полімерази є необхідною для ініціації транскрипції (α, β, β', σ)?

30. Підкреслити субодиниці, які входять до складу голо-ферменту бактеріальної РНК-полімерази: α, β, β', σ.

31. Деякий білок блокує транскрипцію на певному гені. Позитивним чи негативним регулятором його називають?

32. Регуляція транскрипції, що залежить від ефективності впізнання термінуючого елементу, є: а) негативною; б) позитивною; в) атенюацією; г) аллостеричною.

33. Як називається стандартний елемент багатьох еукаріотичних промоторів, що має консенсусну послідовність ТАТААА?

34. Складовою частиною якого базального транскрипційного фактору РНК-полімерази ІІ є білок ТВР?

35. Що означає абревіатура CTD, яка має відношення до РНК-полімерази ІІ?

36. Ацетильованими чи деацетильованими є гістони в гетерохроматині?

37. Один зі стандартних структурних блоків білків – бромодомен – впізнає: а) ацетатні залишки в гістонах; б) метильні залишки в гістонах; в) фосфатні залишки в гістонах; д) метильні залишки в ДНК.

38. Як називається фермент, що здійснює деацетилування гістонів?

39. Нуклеосоми розташовані відносно послідовностей пар основ ДНК: а) лише на певних послідовностях; б) незалежно від послідовності; в) деякі послідовності мають перевагу щодо формування нуклеосом.

40. В транскрипційно активних генах: а) гістони присутні завжди; б) гістони відсутні завжди; в) 50:50; г) частіше гістони присутні; д) частіше гістони відсутні.

Модуль 1. Білет 10.

Дата ________ Група________________

Прізвище ______________________

1. Який заряд несе на собі кожна амінокислота за фізіологічних умов (плюс, мінус, обидва, жодного)?

2. В які міжмолекулярні взаємодії може вступати пептидна група?

3. Чи можливі ван-дер-ваальсові взаємодії між гетероциклічними сполуками?

4. Одна з двох груп, що формують водневий зв'язок, містить пару електронів, що не формують ковалентного зв'язку. Як називається ця група?

5. До чого призводить занурення неполярної групи чи молекули у водне середовище (зниження вільної енергії, зростання ентропії, зниження ентропії, зростання ентальпії, зниження ентальпії)?

6. Дайте повну назву амінокислоти, що позначається Phe.

7. Дайте повну назву амінокислоти, що позначається Ser.

8. Скільки існує змістовних кодонів, що відповідають амінокислотам?

9. Водневі зв'язки між якими хімічними групами стабілізують вторинну структуру білків (аміногрупи, гідроксильні, пептидні, метильні, фосфатні)?

10. Як називають просторову структуру білка, що складається з кількох субодиниць?

11. Нехай білок може існувати в двох конформаційних станах – І та ІІ. Стан ІІ, на відміну від І, має спорідненість до ліганду Х. У якому стані перебуває білок у відсутності ліганду?

12. Як називається сполука, що містить азотисту основу, пентозний цукор та фосфатний залишок?

13. Як називається пентоза, що містить ОН-групу при атомі С2'?

14. Нуклеотидну послідовність нуклеїнової кислоти прийнято зчитувати в певному напрямі. Як позначається його кінцева точка?

15. Заряд якого знаку має фосфатний залишок у нуклеїнових кислотах за фізіологічних умов?

16. Яка структурна форма ДНК є переважною за фізіологічних умов (A, B, C, D, E, F, X, Z)?

17. Які динуклеотидні контакти можуть утворитися між двома сусідніми GC парами в ДНК?

18. В ДНК реалізуєтся динуклеотидний контакт CC. Яке позначення контакту є еквівалентним до наведеного?

19. Послідовність одного з ланцюгів ДНК – ATTAGGT. Напишіть послідовність комплементарного ланцюга.

20. Чи завжди взаємодія білка з маленьким жолобком подвійної спіралі потребує значних конформаційних змін ДНК?

21. Позитивна надспіралізація циркулярної ДНК еквівалентна до розкручування чи закрутки подвійної спіралі?

22. Негативна надспіралізація циркулярної ДНК полегшує розкручування чи закрутку подвійної спіралі?

23. Підкреслить два гістони, які формують гетеротетрамер в складі нуклеосоми: Н2А, Н3, Н1, Н4.

24. Яка ділянка в складі корових гістонів піддається посттрансляційним модифікаціям (N-кінцева, центральна, С-кінцева, нема такої ділянки)?

25. Гени – це ділянки ДНК, які кодують амінокислотні послідовності білків. Чи є цей вислів вичерпним (так/ні)?

26. Як називається сукупність послідовностей ДНК в гаплоїдному наборі даного організму?

27. Зростає, знижується чи не змінюється спорідненість до промоторів бактеріальної РНК-полімерази при наявності σ-фактора в складі ферменту?

28. В якому напрямі здійснюється синтез мРНК?

29. Скільки консенсусних послідовностей містить стандартний промотор E coli?

30. Яка субодиниця бактеріальної РНК-полімерази видаляється з неї при переході від ініціації до елонгації транскрипції (α, β, β', σ)?

31. Деякий білок сприяє зв'язуванню РНК-полімерази з промотором. Позитивним чи негативним регулятором його називають?

32. Певний промотор є слабким. Активатор чи репресор є необхідним елементом регуляції транскрипції з цього промотору?

33. Що означає абревіатура TFII?

34. Який транскрипційний фактор РНК-полімерази ІІ зв'язується з ТАТА-боксом (TFII A, TFII B, TFII D, TFII E, TFII F, TFII H)?

35. Який транскрипційний фактор РНК-полімерази ІІ забезпечує первинне розкручування подвійної спіралі при ініціації транскрипції (TFII A, TFII B, TFII D, TFII E, TFII F, TFII H)?

36. С-кінцевий домен РНК-полімерази ІІ піддається фосфорилюванню при: а) ініціації транскрипції; б) переході від інінціації до елонгації; в) елонгації; г) термінації.

37. Один зі стандартних структурних блоків білків – хромодомен – впізнає: а) ацетатні залишки в гістонах; б) метильні залишки в гістонах; в) фосфатні залишки в гістонах; д) метильні залишки в ДНК.

38. В межах яких динуклеотидів здійснюється метилування ДНК (ApT, TpA, GpT, CpG, CpA, GpC)?

39. Основним наслідком АТР-залежного ремоделювання хроматину є: а) деконденсація хроматину; б) руйнування нуклеосом; в) репозиціювання нуклеосом; г) зміна структури нуклеосом.

40. В транскрипційно активних генах: а) нуклеосоми присутні завжди; б) нуклеосоми відсутні завжди; в) 50:50; г) частіше нуклеосоми присутні; д) частіше нуклеосоми відсутні.

Модуль 1. Білет 11.

Дата ________ Група________________

Прізвище ______________________

1. Підкреслити хімічну групу, яка не зустрічається в складі амінокислот: аміногрупа, фенольна, карбоксильна, фосфатна, гуанідінова, амідна.

2. Як називається полімерний ланцюг, що побудований з амінокислотних залишків?

3. Чи можливий водневий зв’язок між групами –ОН та –СН3?

4. Як називається міра невпорядкованості термодинамічної системи?

5. Деякий процес супроводжується зниженням ентропії. Зростає чи знижується при цьому вільна енергія?

6. Дайте повну назву амінокислоти, що позначається Val.

7. Дайте повну назву амінокислоти, що позначається His.

8. Як називається така властивість генетичного коду, що одній амінокислоті відповідає кілька кодонів?

9. Як називають регулярну структуру в білках, що вона стабілізована водневими зв’язками між пептидними групами?

10. Якого хімічного елементу немає в складі нуклеотидів (азот, сірка, кисень, фосфор, вуглець)?

11. Нехай білок може існувати в двох конформаційних станах – І та ІІ. Стан ІІ, на відміну від І, має спорідненість до ліганду Х. У якому стані перебуває білок у присутності ліганду?

12. Як називається сполука, що містить азотисту основу, пентозний цукор та фосфатний залишок?

13. Як називається пентоза, що містить атом водню при атомі С2'?

14. Як називається ковалентний зв'язок між нуклеотидами в полінуклетидному ланцюзі (глікозидний, фосфодіефірний, пептидний, цукрофосфатний, полінуклеотидний)?

15. Між якими елементами нуклеотидів (азотисті основи, пентози, фосфати) реалізуються стекінг-взаємодії в полінуклеотидах?

16. Скільки існує типів динуклеотидних контактів у полінуклеотиді, що складається з залишків чотирьох типів?

17. Які динуклеотидні контакти можуть утворитися між двома сусідніми АТ та GC парою в ДНК?

18. В ДНК реалізуєтся динуклеотидний контакт AA. Яке позначення контакту є еквівалентним до наведеного?

19. Послідовність одного з ланцюгів ДНК – ATTAGGT. Напишіть послідовність комплементарного ланцюга.

20. Чи завжди взаємодія білка з маленьким жолобком подвійної спіралі потребує значних конформаційних змін ДНК?

21. Які нековалентні взаємодії, як правило, відіграють провідну роль у білково-нуклеїновому впізнанні (іонні, гідрофобні, ван-дер-ваальсові, водневі зв’язки)?

22. Позитивна надспіралізація циркулярної ДНК полегшує розкручування чи закрутку подвійної спіралі?

23. Чи входить гістон Н1 до складу корової частинки нуклеосоми?

24. Які амінокислотні залишки піддаються ацетилуванню в гістонах?

25. Як називається частина хроматину, яка зберігає високий ступінь компактності і є повністю репресованою в інтерфазі?

26. Середня густина генів на ділянках геному людини корелює з GC-вмістом: а) позитивно; б) негативно; в) в залежності від хромосоми; г) не корелює.

27. Зростає, знижується чи не змінюється загальна спорідненість до ДНК бактеріальної РНК-полімерази при наявності σ-фактора в складі ферменту?

28. В якому напрямі здійснюється зчитування інформації з ДНК в ході транскрипції?

29. Підкреслити субодиниці, які входять до складу кор-ферменту бактеріальної РНК-полімерази: α, β, β', σ.

30. До якого кінця мРНК приєднується черговий нуклеотид під час транскрипції?

31. Як називається кластер бактеріальних генів, який є єдиною одиницею транскрипції?

32. Підкреслити групи генів, які транскрибуються РНК-полімеразою І: високомолекулярна rRNA, 5S rRNA, білкові гени, snRNA, tRNA.

33. Підкреслити групи генів, які транскрибуються РНК-полімеразою ІІІ: високомолекулярна rRNA, 5S rRNA, білкові гени, snRNA, tRNA.

34. Складовою частиною якого базального транскрипційного фактору РНК-полімерази ІІ є білок ТВР?

35. Який транскрипційний фактор РНК-полімерази ІІ забезпечує фосфорилювання С-кінцевого домену полімерази при переході до елонгації транскрипції (TFII A, TFII B, TFII D, TFII E, TFII F, TFII H)?

36. Як називається транскрипційний фактор, який стає активним у відповідь на зв'язування зі стероїдним гормоном?

37. Один зі стандартних структурних блоків білків – бромодомен – впізнає: а) ацетатні залишки в гістонах; б) метильні залишки в гістонах; в) фосфатні залишки в гістонах; д) метильні залишки в ДНК.

38. Ацетилування гістонів корелює з активацією чи репресією транскрипції, або такої кореляції немає?

39. CpG-острівці з’являються внаслідок: а) метилування ДНК; б) підтримання деметильованого стану ДНК; в) мутацій; г) активності мобільних елементів.

40. В транскрипційно активних генах: а) гістони присутні завжди; б) гістони відсутні завжди; в) 50:50; г) частіше гістони присутні; д) частіше гістони відсутні.

Модуль 1. Білет 12.

Дата ________ Група________________

Прізвище ______________________

1. Який заряд в складі кожної амінокислоти несе на собі карбоксильна група за фізіологічних умов?

2. Як називається хімічний зв'язок, що з'єднує сусідні амінокислотні залишки в поліпептидному ланцюзі?

3. Як називаються нековалентні взаємодії між двома групами, кожна з яких містить електронегативний атом, причому одна з них містить атом водню, а інша – пару електронів, що не формують ковалентного зв'язку?

4. Як називається міра невпорядкованості термодинамічної системи?

5. До чого призводить екранування неполярних груп чи молекул від води (зростання вільної енергії, зростання ентропії, зниження ентропії, зростання енальпії, зниження ентальпії)?

6. Дайте повну назву амінокислоти, що позначається Cys.