- •Общая микробиология, вирусология и иммунология
- •Тема 1: Правила работы в микробиологической лаборатории. Мир микробов.
- •I. Вопросы для самоподготовки:
- •II. Базовый текст
- •1. Правила работы в учебной бактериологической лаборатории
- •2. Мир микробов. Особенности строения про- и эукариотической клетки
- •3. Систематика и номенклатура микроорганизмов
- •4. Морфология и ультраструктура бактериальной клетки
- •6. Микроскопический метод диагностики инфекционных заболеваний
- •7. Простые и сложные методы окраски
- •8. Механизмы окрасок по Граму и Цилю-Нильсену
- •III. План практической работы
- •IV. Примеры ситуационных задач
- •Тема 2: Специальные методы окраски. Устройство биологического микроскопа. Виды микроскопии. Порядок проведения иммерсионной микроскопии
- •2. Методы окраски отдельных групп про- и эукариот
- •3. Изучение подвижности микроорганизмов
- •4. Виды микроскопии
- •5. Устройство биологического микроскопа
- •6. Порядок проведения иммерсионной микроскопии
- •III. План практической работы
- •IV. Примеры ситуационных задач
- •Тема 3: Морфология и ультраструктура отдельных групп микроорганизмов: риккетсий, хламидий, микоплазм, актиномицет, спирохет, грибов, простейших
- •I. Вопросы для самоподготовки:
- •4. Спирохеты
- •5. Грибы
- •6. Простейшие
- •III. План практической работы
- •IV. Примеры ситуационных задач
- •Тема 1: Питательные среды. Стерилизация, асептика, антисептика,
- •I. Вопросы для самоподготовки:
- •II. Базовый текст
- •2. Классификация питательных сред
- •3. Асептика и антисептика
- •4. Дезинфекция, методы и контроль эффективности дезинфекции
- •6. Методы определения эффективности стерилизации
- •8. Методы выделения чистых культур микроорганизмов
- •9. Бактериологический метод диагностики инфекционных заболеваний
- •10. Техника посева микроорганизмов
- •11. Особенности культивирования анаэробных бактерий
- •IV. Примеры ситуационных задач
3. Систематика и номенклатура микроорганизмов
Систематика (таксономия) бактерий является одним из наиболее важных и сложных разделов микробиологии. Задачами систематики являются классификация, номенклатура и идентификация организмов.
Классификация — распределение множества организмов по группам (таксонам). Любая классификация живых организмов призвана показать степень сходства и предполагаемую эволюционную взаимосвязь (при этом более высокие категории — емкие и широкие, а более низкие — конкретны и ограничены).
Образование и применение научных названий микроорганизмов регламентируют «Международный кодекс номенклатуры бактерий», «Международный кодекс ботанической номенклатуры» (грибы), «Международный кодекс зоологической номенклатуры» (простейшие) и решения Международного комитета по таксономии вирусов. Все изменения научных названий микроорганизмов возможны лишь решениями соответствующих международных конгрессов и постоянных комитетов по номенклатуре.
Наиболее приемлемой филогенетической системой классификации прокариот является система, основанная на сопоставлении последовательности нуклеотидов в 16S-рРНК. Эта система положена в основу 2-го издания многотомной энциклопедии прокариот Bergey’s Manual of Systematic Bacteriology (Руководство по систематике бактерий Берджи), первый том которой вышел в свет в 2001 г. В этом труде все прокариоты разделены на 26 филогенетических «ветвей» (групп) на основании строения их 16S-рРНК; 23 «ветви» представлены эубактериями, а три — архебактериями. Следует подчеркнуть, что большое количество этих филогенетических групп содержат виды прокариот, которые не выделены в виде чистых культур и поэтому еще детально не изучены. Для представителей данных видов известны в настоящее время только последовательности нуклеотидов в 16S-рРНК. Из 23 групп эубактерий две филогенетические группы представлены грамположительными бактериями, остальные группы — грамотрицательными.
Основные таксономические категории
Номенклатура — присвоение названий отдельным группам и видам микроорганизмов.
Для микроорганизмов приняты следующие таксономические категории (по нисходящей): Домен — Царство — Тип (Отдел) — Класс — Порядок — Семейство — Род — Вид.
Названия видов биномиальны (бинарны), то есть обозначаются двумя словами — названия рода и вида на латинском языке: первое определяет их принадлежность к конкретному ро-
ду, второе — к виду. Например, Еscherichia coli (кишечная палочка), Staphylococcus aureus (золотистый стафилококк), Streptococcus pyogenes (гноеродный стрептококк).
В микробиологии существуют также более мелкие таксономические единицы: подвид (subspecies), разновидность. Подвиды могут различаться по физиологическим (биовар). морфо-логическим (морфовар), по антигенным (серовар) свойствам. а также среде обитания (эковар). В таблице 3 представлены основные таксономические категории для С.tetani и Т pallidum.
Таблица 3 Основные таксономические категории
Таксономические категории |
||
Домен |
Васteria
|
Bacteria
|
Царство |
Prokaryotae
|
Prokaryotae |
Тип*
|
Firmicutes
|
Gracilicutes
|
Класс
|
Clostridia
|
Spirohaetes
|
Порядок
|
Clostridiales
|
Spirochetales
|
Семейство
|
Clostridiaceae
|
Spirochetaceae
|
Род
|
Clostridium
|
Тгерonema
|
Вид
|
tetani
|
pallidum
|
* Для таксонов высшего ранга предпочтительно название "Тип" (Phylum), а не "Отдел" (Division) |